Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4KDN5

Protein Details
Accession W4KDN5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
286-318RDRGRDRDREKDRGRDRNRDRDRERTSRRNGGQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
270-336PRTPPLPPPPAPRDRERDRGRDRDREKDRGRDRNRDRDRERTSRRNGGQGGGGRKGGRTGGGGGGGG
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033757  WTAP  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0080009  P:mRNA methylation  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0000381  P:regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG hir:HETIRDRAFT_123637  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17098  Wtap  
Amino Acid Sequences MDLPSARELELEELLRRRDVQLAELNDEVAHLRQYLSTQPGPSKTDPVSLPPALVSLLLPHINTIADDAHAGSRSSTVTTALTQRAKLLQEENDELYELLKSGETGRLKEEVRGLRRAVDRLEMALRESHLVITSLSDELDKSYDAIQSTGRHHNNTNAHPHLPTRQNFHSAAPAPVPAHPQSTSNGNAKPLPTGPRAHKKPRLSEPQISPANSTAALPRIQTQQTQRQGSAQTRGHSTASPERSPVLPPDHRKASGVKMEVDDDQRTRPRTPPLPPPPAPRDRERDRGRDRDREKDRGRDRNRDRDRERTSRRNGGQGGGGRKGGRTGGGGGGGGGRHDSGDRTLAERMGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.28
3 0.28
4 0.26
5 0.29
6 0.27
7 0.29
8 0.33
9 0.34
10 0.36
11 0.35
12 0.34
13 0.27
14 0.27
15 0.22
16 0.15
17 0.12
18 0.09
19 0.09
20 0.1
21 0.12
22 0.16
23 0.21
24 0.24
25 0.26
26 0.31
27 0.35
28 0.4
29 0.4
30 0.41
31 0.36
32 0.39
33 0.36
34 0.36
35 0.39
36 0.33
37 0.31
38 0.26
39 0.25
40 0.19
41 0.18
42 0.13
43 0.08
44 0.11
45 0.11
46 0.11
47 0.11
48 0.11
49 0.11
50 0.11
51 0.11
52 0.08
53 0.07
54 0.08
55 0.08
56 0.09
57 0.1
58 0.11
59 0.09
60 0.1
61 0.1
62 0.11
63 0.11
64 0.1
65 0.1
66 0.12
67 0.16
68 0.21
69 0.23
70 0.22
71 0.23
72 0.26
73 0.26
74 0.26
75 0.26
76 0.24
77 0.26
78 0.29
79 0.28
80 0.25
81 0.24
82 0.21
83 0.18
84 0.14
85 0.1
86 0.07
87 0.06
88 0.06
89 0.07
90 0.13
91 0.14
92 0.15
93 0.16
94 0.21
95 0.21
96 0.23
97 0.28
98 0.3
99 0.33
100 0.36
101 0.34
102 0.36
103 0.38
104 0.38
105 0.32
106 0.28
107 0.24
108 0.22
109 0.24
110 0.18
111 0.16
112 0.15
113 0.14
114 0.12
115 0.12
116 0.1
117 0.09
118 0.09
119 0.08
120 0.07
121 0.08
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.07
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.11
135 0.13
136 0.17
137 0.25
138 0.26
139 0.27
140 0.27
141 0.33
142 0.37
143 0.38
144 0.41
145 0.35
146 0.35
147 0.33
148 0.34
149 0.33
150 0.35
151 0.33
152 0.32
153 0.31
154 0.34
155 0.34
156 0.34
157 0.33
158 0.27
159 0.26
160 0.2
161 0.2
162 0.16
163 0.16
164 0.18
165 0.13
166 0.14
167 0.13
168 0.14
169 0.14
170 0.17
171 0.19
172 0.2
173 0.2
174 0.2
175 0.2
176 0.2
177 0.2
178 0.19
179 0.2
180 0.19
181 0.23
182 0.28
183 0.37
184 0.44
185 0.51
186 0.57
187 0.58
188 0.63
189 0.68
190 0.72
191 0.68
192 0.68
193 0.64
194 0.64
195 0.63
196 0.55
197 0.47
198 0.38
199 0.32
200 0.25
201 0.21
202 0.13
203 0.12
204 0.12
205 0.11
206 0.13
207 0.16
208 0.17
209 0.21
210 0.25
211 0.33
212 0.4
213 0.42
214 0.4
215 0.38
216 0.42
217 0.41
218 0.44
219 0.38
220 0.32
221 0.33
222 0.34
223 0.32
224 0.28
225 0.3
226 0.3
227 0.32
228 0.3
229 0.28
230 0.28
231 0.28
232 0.29
233 0.28
234 0.28
235 0.3
236 0.35
237 0.41
238 0.45
239 0.45
240 0.45
241 0.44
242 0.43
243 0.42
244 0.39
245 0.34
246 0.3
247 0.31
248 0.32
249 0.32
250 0.28
251 0.23
252 0.26
253 0.3
254 0.32
255 0.33
256 0.34
257 0.4
258 0.43
259 0.48
260 0.53
261 0.58
262 0.64
263 0.66
264 0.7
265 0.7
266 0.72
267 0.71
268 0.67
269 0.66
270 0.64
271 0.7
272 0.69
273 0.7
274 0.7
275 0.76
276 0.77
277 0.78
278 0.77
279 0.77
280 0.77
281 0.77
282 0.75
283 0.75
284 0.77
285 0.78
286 0.81
287 0.81
288 0.83
289 0.83
290 0.87
291 0.87
292 0.83
293 0.83
294 0.83
295 0.83
296 0.84
297 0.83
298 0.81
299 0.81
300 0.79
301 0.77
302 0.7
303 0.62
304 0.59
305 0.55
306 0.52
307 0.45
308 0.44
309 0.36
310 0.34
311 0.33
312 0.27
313 0.22
314 0.19
315 0.18
316 0.17
317 0.17
318 0.17
319 0.15
320 0.15
321 0.14
322 0.12
323 0.1
324 0.08
325 0.08
326 0.09
327 0.11
328 0.11
329 0.16
330 0.17
331 0.19
332 0.21