Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4K1R1

Protein Details
Accession W4K1R1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
344-368YKNIERKMVLKKKRTEPTERFRDKWBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
353-357LKKKR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito 10, cyto_nucl 8, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007133  RNA_pol_II-assoc_Paf1  
Gene Ontology GO:0016593  C:Cdc73/Paf1 complex  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG hir:HETIRDRAFT_441150  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03985  Paf1  
Amino Acid Sequences MSFKKSKLDLLVRVRYQNPLPAPPCPPKLLDIPTNPIRYTRPEFLDALANDTPLPMIVDAECGMPLDLGKWEALWEDGADDSALNPDKNNLPLLDPKDQFLLSDPSSSGGFGNGEFSRTGSGASTPLPAHVSWLRKTEYISREGSSSGPRATAMEIRSNHDTPDVSRDAQLRSVELSFAAANDNFDLAALRHPTKPHLTAESSYEILPDADIWANAYDLFRFSERPGDRPPDVEDPRLNCAIMRPMESDGDHFLAYYLTKEDEAVEQFQNARRAAGIDVTENEDEATDFHFVRDYEVVKVEQDVPNEFLLVFDEGNIKVEVQSTAGAATANGRARELRGRGAYYKNIERKMVLKKKRTEPTERFRDKWALVRVAHTPPSREEAEERAEALAEVVDPLYLLQRDADADGEEDLGPSVSVPPPAVENGMSGHSTAIKVDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.6
3 0.54
4 0.53
5 0.47
6 0.47
7 0.46
8 0.45
9 0.5
10 0.53
11 0.55
12 0.5
13 0.48
14 0.42
15 0.46
16 0.47
17 0.48
18 0.45
19 0.49
20 0.53
21 0.56
22 0.52
23 0.48
24 0.45
25 0.45
26 0.47
27 0.46
28 0.43
29 0.42
30 0.43
31 0.42
32 0.47
33 0.39
34 0.38
35 0.31
36 0.27
37 0.22
38 0.21
39 0.2
40 0.12
41 0.12
42 0.06
43 0.07
44 0.07
45 0.08
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.08
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.08
56 0.08
57 0.07
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.08
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.07
67 0.07
68 0.06
69 0.1
70 0.12
71 0.11
72 0.12
73 0.14
74 0.17
75 0.19
76 0.21
77 0.17
78 0.18
79 0.24
80 0.29
81 0.35
82 0.33
83 0.32
84 0.33
85 0.32
86 0.29
87 0.26
88 0.26
89 0.18
90 0.2
91 0.19
92 0.17
93 0.18
94 0.18
95 0.14
96 0.1
97 0.09
98 0.08
99 0.12
100 0.1
101 0.12
102 0.11
103 0.12
104 0.12
105 0.12
106 0.12
107 0.08
108 0.09
109 0.09
110 0.1
111 0.12
112 0.11
113 0.12
114 0.13
115 0.12
116 0.15
117 0.19
118 0.23
119 0.23
120 0.27
121 0.28
122 0.27
123 0.3
124 0.34
125 0.33
126 0.33
127 0.33
128 0.3
129 0.28
130 0.28
131 0.28
132 0.22
133 0.21
134 0.17
135 0.15
136 0.14
137 0.14
138 0.15
139 0.17
140 0.16
141 0.2
142 0.21
143 0.25
144 0.29
145 0.29
146 0.28
147 0.25
148 0.24
149 0.18
150 0.23
151 0.22
152 0.18
153 0.2
154 0.22
155 0.22
156 0.25
157 0.24
158 0.18
159 0.17
160 0.16
161 0.14
162 0.11
163 0.11
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.07
176 0.1
177 0.12
178 0.14
179 0.14
180 0.18
181 0.21
182 0.23
183 0.22
184 0.23
185 0.24
186 0.23
187 0.26
188 0.25
189 0.22
190 0.19
191 0.17
192 0.13
193 0.11
194 0.1
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.08
210 0.16
211 0.17
212 0.2
213 0.23
214 0.28
215 0.28
216 0.28
217 0.32
218 0.32
219 0.33
220 0.33
221 0.31
222 0.29
223 0.31
224 0.3
225 0.26
226 0.17
227 0.17
228 0.19
229 0.17
230 0.17
231 0.15
232 0.15
233 0.17
234 0.17
235 0.17
236 0.13
237 0.14
238 0.11
239 0.1
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.09
250 0.1
251 0.12
252 0.12
253 0.12
254 0.14
255 0.17
256 0.21
257 0.19
258 0.18
259 0.15
260 0.16
261 0.16
262 0.16
263 0.13
264 0.1
265 0.11
266 0.14
267 0.14
268 0.12
269 0.12
270 0.1
271 0.09
272 0.08
273 0.09
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.09
278 0.09
279 0.12
280 0.14
281 0.13
282 0.13
283 0.15
284 0.16
285 0.14
286 0.16
287 0.17
288 0.17
289 0.17
290 0.18
291 0.18
292 0.17
293 0.17
294 0.15
295 0.12
296 0.11
297 0.1
298 0.08
299 0.07
300 0.09
301 0.09
302 0.11
303 0.11
304 0.1
305 0.09
306 0.1
307 0.1
308 0.09
309 0.09
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.06
315 0.07
316 0.11
317 0.14
318 0.14
319 0.14
320 0.15
321 0.18
322 0.24
323 0.25
324 0.27
325 0.27
326 0.31
327 0.35
328 0.39
329 0.42
330 0.42
331 0.48
332 0.49
333 0.49
334 0.47
335 0.44
336 0.46
337 0.51
338 0.55
339 0.56
340 0.58
341 0.64
342 0.73
343 0.8
344 0.81
345 0.8
346 0.8
347 0.81
348 0.83
349 0.81
350 0.73
351 0.7
352 0.7
353 0.61
354 0.6
355 0.57
356 0.52
357 0.46
358 0.47
359 0.46
360 0.45
361 0.5
362 0.43
363 0.39
364 0.34
365 0.38
366 0.37
367 0.34
368 0.32
369 0.29
370 0.32
371 0.31
372 0.29
373 0.24
374 0.22
375 0.2
376 0.17
377 0.13
378 0.07
379 0.07
380 0.06
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.1
389 0.11
390 0.12
391 0.13
392 0.1
393 0.11
394 0.11
395 0.12
396 0.11
397 0.1
398 0.1
399 0.09
400 0.08
401 0.07
402 0.1
403 0.1
404 0.11
405 0.11
406 0.12
407 0.14
408 0.15
409 0.17
410 0.14
411 0.14
412 0.15
413 0.17
414 0.16
415 0.14
416 0.14
417 0.14
418 0.14