Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4JWI6

Protein Details
Accession W4JWI6    Localization Confidence Low Confidence Score 7.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
338-358QSEKLRIKKVKLQGRPKFIERHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cysk 10, cyto_nucl 9.833, nucl 9, cyto 7.5, mito_nucl 5.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001180  CNH_dom  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG hir:HETIRDRAFT_325970  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00780  CNH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50219  CNH  
Amino Acid Sequences MTSAPTKPVDVPPYQVQPLIDTVVESYGIPTVDVKCAQALGSEIYVGCSNGELLRFALQANGPEEPESYSLLSRQSLPNDKPVDEIVLAPSISRAFILSDHQIHFYTLPSLDAVSIKPMRNVVALAVDHQQLQLSAPPLTDPPLQAEQVEFCVVKRDSIMLCGLRERLYIEKSIPLRGAFFAKRSGRRLCIADRENYSMVDLDQAVQTPVMPINQAGDSGGPRIRPVITVIAENEFLILSWNGASTMGLFITGDGDPVRGTLEWPSHPIALCLDYPYITTLLPNQTIEVHNLDTQTIVQVIPAPPLPLPSASPTSFLAQERRTLTISLNGFLVPSQEQSEKLRIKKVKLQGRPKFIERVVVQEGLETLEKRMEDLEDNGQEIEVLPVET
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.43
3 0.37
4 0.33
5 0.33
6 0.29
7 0.22
8 0.16
9 0.15
10 0.13
11 0.14
12 0.11
13 0.1
14 0.1
15 0.1
16 0.1
17 0.11
18 0.12
19 0.16
20 0.17
21 0.17
22 0.16
23 0.16
24 0.16
25 0.14
26 0.14
27 0.12
28 0.12
29 0.12
30 0.11
31 0.12
32 0.13
33 0.12
34 0.1
35 0.08
36 0.09
37 0.09
38 0.1
39 0.09
40 0.1
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.14
45 0.13
46 0.16
47 0.18
48 0.18
49 0.16
50 0.17
51 0.17
52 0.16
53 0.16
54 0.15
55 0.14
56 0.13
57 0.14
58 0.16
59 0.16
60 0.17
61 0.2
62 0.25
63 0.32
64 0.33
65 0.4
66 0.41
67 0.4
68 0.39
69 0.36
70 0.32
71 0.25
72 0.23
73 0.17
74 0.15
75 0.14
76 0.12
77 0.12
78 0.1
79 0.09
80 0.09
81 0.07
82 0.06
83 0.07
84 0.11
85 0.14
86 0.18
87 0.19
88 0.21
89 0.21
90 0.21
91 0.2
92 0.18
93 0.16
94 0.12
95 0.11
96 0.1
97 0.09
98 0.09
99 0.1
100 0.09
101 0.13
102 0.17
103 0.17
104 0.18
105 0.19
106 0.19
107 0.19
108 0.19
109 0.14
110 0.13
111 0.12
112 0.13
113 0.15
114 0.14
115 0.14
116 0.13
117 0.13
118 0.09
119 0.1
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.1
125 0.1
126 0.13
127 0.14
128 0.12
129 0.14
130 0.16
131 0.17
132 0.16
133 0.16
134 0.14
135 0.14
136 0.15
137 0.11
138 0.08
139 0.14
140 0.14
141 0.14
142 0.14
143 0.15
144 0.13
145 0.15
146 0.18
147 0.13
148 0.13
149 0.14
150 0.15
151 0.13
152 0.13
153 0.13
154 0.13
155 0.13
156 0.14
157 0.14
158 0.18
159 0.18
160 0.2
161 0.19
162 0.17
163 0.16
164 0.16
165 0.2
166 0.15
167 0.15
168 0.21
169 0.25
170 0.29
171 0.33
172 0.35
173 0.33
174 0.35
175 0.37
176 0.34
177 0.37
178 0.35
179 0.35
180 0.34
181 0.34
182 0.32
183 0.29
184 0.26
185 0.18
186 0.15
187 0.11
188 0.09
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.08
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.11
214 0.13
215 0.13
216 0.14
217 0.14
218 0.15
219 0.15
220 0.14
221 0.12
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.04
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.05
247 0.06
248 0.09
249 0.12
250 0.12
251 0.16
252 0.17
253 0.18
254 0.18
255 0.18
256 0.16
257 0.15
258 0.15
259 0.13
260 0.12
261 0.1
262 0.11
263 0.12
264 0.11
265 0.09
266 0.09
267 0.11
268 0.14
269 0.15
270 0.15
271 0.15
272 0.17
273 0.18
274 0.2
275 0.18
276 0.17
277 0.16
278 0.17
279 0.16
280 0.14
281 0.13
282 0.11
283 0.1
284 0.08
285 0.06
286 0.1
287 0.11
288 0.12
289 0.13
290 0.13
291 0.12
292 0.14
293 0.15
294 0.12
295 0.13
296 0.16
297 0.21
298 0.2
299 0.22
300 0.22
301 0.23
302 0.26
303 0.27
304 0.29
305 0.25
306 0.31
307 0.31
308 0.32
309 0.31
310 0.29
311 0.28
312 0.28
313 0.28
314 0.23
315 0.22
316 0.19
317 0.17
318 0.16
319 0.17
320 0.11
321 0.11
322 0.13
323 0.14
324 0.17
325 0.21
326 0.3
327 0.35
328 0.38
329 0.46
330 0.48
331 0.53
332 0.6
333 0.65
334 0.66
335 0.69
336 0.77
337 0.76
338 0.81
339 0.81
340 0.77
341 0.75
342 0.66
343 0.65
344 0.55
345 0.53
346 0.47
347 0.43
348 0.38
349 0.3
350 0.3
351 0.23
352 0.25
353 0.18
354 0.15
355 0.16
356 0.16
357 0.16
358 0.17
359 0.17
360 0.17
361 0.2
362 0.27
363 0.25
364 0.27
365 0.26
366 0.25
367 0.22
368 0.2
369 0.17