Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4KNS6

Protein Details
Accession W4KNS6    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
237-259MQANVFHPEKKRRKRDGYADGDYHydrophilic
373-392KAAARTKRDRRRANEAKQKTBasic
494-516ERDSKFKVKEARRKNKEREEWHGBasic
759-780AEAKARKKFKAAQRLEKALKKAHydrophilic
798-823VEKVMRKGLSKAKREKKDIKVVVAKGHydrophilic
841-866MVDSRMKKEVRAKKRKEKENKKRKRPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
246-250KKRRK
373-386KAAARTKRDRRRAN
498-510KFKVKEARRKNKE
567-583KRSRPREAEEREKKKPR
744-779RAKQRALDARPIKKVAEAKARKKFKAAQRLEKALKK
802-866MRKGLSKAKREKKDIKVVVAKGVHKGVQGRPKGVKGRYAMVDSRMKKEVRAKKRKEKENKKRKRP
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 7, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002877  RNA_MeTrfase_FtsJ_dom  
IPR015507  rRNA-MeTfrase_E  
IPR012920  rRNA_MeTfrase_SPB1-like_C  
IPR024576  rRNA_MeTfrase_Spb1_DUF3381  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR028589  SPB1-like  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0070039  F:rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0008650  F:rRNA (uridine-2'-O-)-methyltransferase activity  
KEGG hir:HETIRDRAFT_153890  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11861  DUF3381  
PF01728  FtsJ  
PF07780  Spb1_C  
Amino Acid Sequences MGKAQKKTGKGRLDKYYKLAKEQGYRARSAFKLIQLNKKYNFLESARCCIDLCAAPGGWLQVASKYMPVNSVIVGVDLVSIKPIPRVATFAADITTSRCRNLLHDELKDWKADVVLHDGAPNVGTAWVQDAYSQSELVLMSLKLAVEFLIKGGTFVTKVFRSVDYNNLIWVFNQLFGKVEATKPPSSRNVSAEIFVVCRDFLAPKHIDPKFLDPKHVFKDLAASDPAGDKGSSANNMQANVFHPEKKRRKRDGYADGDYTLFTKVGIAEFVKSVDPIAVLGSANRIYFETEEEKEWAALDITTPEVKANLDDLKVLGKGDFKALLKWRTALREEIGLEVKTKHADEITETVEITEVVDEEEEIQKELERLHAKAAARTKRDRRRANEAKQKTIQRMQLQMVAPMDIGMEQTDAALGIGQEDIFDLGDAERGLKKGGVLKFAVRGEEDSESEEEAEIGESDYEALDSDEEREKKTRSLEVDMDGLYDAYRERLAERDSKFKVKEARRKNKEREEWHGIKEDGSGSEDEDSEEGGWEEVQQAKGRDDSSSSDEDSDEDGDEPMDTVGQKRSRPREAEEREKKKPRLVSKLEDPKTSASASRATDLWFSQDIFNGLDPLDDIKDEESDESDCDTSAKEEMSAGNDDDFEVVPQNSDTDTEMWDATEENEDEVKQKHIQKHGLLTAEAITLAQQLVNRERTKTSMINDGFTRYSLNSKDDLPSWFLDDESKHYVTNIPITKDAVRALRAKQRALDARPIKKVAEAKARKKFKAAQRLEKALKKAEGVTQTSDMSEREKAQQVEKVMRKGLSKAKREKKDIKVVVAKGVHKGVQGRPKGVKGRYAMVDSRMKKEVRAKKRKEKENKKRKRP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.75
3 0.76
4 0.69
5 0.66
6 0.66
7 0.62
8 0.62
9 0.66
10 0.68
11 0.62
12 0.62
13 0.57
14 0.57
15 0.5
16 0.49
17 0.45
18 0.42
19 0.47
20 0.51
21 0.59
22 0.6
23 0.68
24 0.64
25 0.67
26 0.61
27 0.54
28 0.53
29 0.46
30 0.48
31 0.44
32 0.49
33 0.44
34 0.43
35 0.4
36 0.35
37 0.36
38 0.29
39 0.27
40 0.23
41 0.21
42 0.21
43 0.21
44 0.22
45 0.17
46 0.15
47 0.13
48 0.11
49 0.13
50 0.13
51 0.15
52 0.15
53 0.16
54 0.17
55 0.18
56 0.16
57 0.15
58 0.16
59 0.13
60 0.12
61 0.11
62 0.1
63 0.09
64 0.09
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.09
69 0.11
70 0.13
71 0.15
72 0.15
73 0.19
74 0.2
75 0.23
76 0.24
77 0.22
78 0.21
79 0.19
80 0.18
81 0.18
82 0.24
83 0.21
84 0.21
85 0.22
86 0.22
87 0.26
88 0.34
89 0.4
90 0.39
91 0.41
92 0.44
93 0.49
94 0.5
95 0.46
96 0.39
97 0.3
98 0.24
99 0.22
100 0.2
101 0.19
102 0.2
103 0.19
104 0.19
105 0.19
106 0.17
107 0.16
108 0.14
109 0.08
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.08
114 0.09
115 0.09
116 0.1
117 0.11
118 0.14
119 0.15
120 0.15
121 0.12
122 0.13
123 0.13
124 0.12
125 0.13
126 0.09
127 0.08
128 0.09
129 0.09
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.09
140 0.1
141 0.09
142 0.1
143 0.15
144 0.13
145 0.15
146 0.17
147 0.19
148 0.23
149 0.24
150 0.31
151 0.3
152 0.3
153 0.3
154 0.29
155 0.27
156 0.23
157 0.24
158 0.17
159 0.16
160 0.16
161 0.14
162 0.14
163 0.15
164 0.17
165 0.15
166 0.16
167 0.19
168 0.24
169 0.29
170 0.29
171 0.33
172 0.39
173 0.43
174 0.45
175 0.42
176 0.43
177 0.39
178 0.38
179 0.35
180 0.28
181 0.22
182 0.19
183 0.17
184 0.1
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.15
190 0.17
191 0.19
192 0.28
193 0.29
194 0.32
195 0.33
196 0.42
197 0.46
198 0.45
199 0.5
200 0.44
201 0.51
202 0.51
203 0.53
204 0.44
205 0.33
206 0.4
207 0.32
208 0.33
209 0.26
210 0.22
211 0.18
212 0.19
213 0.2
214 0.13
215 0.12
216 0.09
217 0.09
218 0.12
219 0.13
220 0.12
221 0.16
222 0.17
223 0.18
224 0.18
225 0.17
226 0.17
227 0.2
228 0.22
229 0.22
230 0.27
231 0.37
232 0.48
233 0.57
234 0.66
235 0.71
236 0.78
237 0.83
238 0.86
239 0.86
240 0.84
241 0.79
242 0.71
243 0.61
244 0.52
245 0.43
246 0.33
247 0.23
248 0.14
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.1
258 0.09
259 0.09
260 0.08
261 0.07
262 0.07
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.05
267 0.06
268 0.07
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.09
275 0.12
276 0.15
277 0.15
278 0.17
279 0.18
280 0.18
281 0.16
282 0.16
283 0.13
284 0.09
285 0.08
286 0.07
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.09
296 0.1
297 0.09
298 0.1
299 0.1
300 0.11
301 0.11
302 0.11
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.11
307 0.14
308 0.13
309 0.17
310 0.23
311 0.25
312 0.24
313 0.26
314 0.27
315 0.28
316 0.3
317 0.27
318 0.22
319 0.23
320 0.23
321 0.22
322 0.22
323 0.18
324 0.17
325 0.15
326 0.15
327 0.13
328 0.13
329 0.11
330 0.09
331 0.09
332 0.1
333 0.12
334 0.13
335 0.12
336 0.12
337 0.11
338 0.11
339 0.11
340 0.09
341 0.06
342 0.04
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.05
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.08
353 0.08
354 0.13
355 0.13
356 0.14
357 0.15
358 0.19
359 0.19
360 0.22
361 0.3
362 0.31
363 0.34
364 0.41
365 0.5
366 0.56
367 0.65
368 0.7
369 0.68
370 0.72
371 0.78
372 0.8
373 0.81
374 0.76
375 0.73
376 0.71
377 0.69
378 0.63
379 0.59
380 0.55
381 0.48
382 0.47
383 0.41
384 0.4
385 0.36
386 0.33
387 0.27
388 0.21
389 0.17
390 0.13
391 0.12
392 0.06
393 0.06
394 0.04
395 0.04
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.03
411 0.03
412 0.03
413 0.04
414 0.04
415 0.05
416 0.05
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.07
421 0.12
422 0.14
423 0.16
424 0.16
425 0.16
426 0.2
427 0.21
428 0.2
429 0.15
430 0.14
431 0.13
432 0.14
433 0.13
434 0.1
435 0.1
436 0.1
437 0.1
438 0.09
439 0.07
440 0.06
441 0.05
442 0.04
443 0.04
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.03
453 0.06
454 0.11
455 0.12
456 0.13
457 0.16
458 0.17
459 0.2
460 0.22
461 0.25
462 0.23
463 0.27
464 0.27
465 0.26
466 0.26
467 0.23
468 0.21
469 0.17
470 0.14
471 0.09
472 0.07
473 0.05
474 0.04
475 0.05
476 0.05
477 0.05
478 0.08
479 0.11
480 0.18
481 0.2
482 0.27
483 0.3
484 0.35
485 0.35
486 0.37
487 0.44
488 0.46
489 0.54
490 0.58
491 0.66
492 0.7
493 0.79
494 0.84
495 0.86
496 0.85
497 0.82
498 0.79
499 0.77
500 0.71
501 0.64
502 0.59
503 0.49
504 0.4
505 0.35
506 0.27
507 0.18
508 0.16
509 0.13
510 0.09
511 0.09
512 0.09
513 0.08
514 0.08
515 0.07
516 0.06
517 0.06
518 0.05
519 0.05
520 0.04
521 0.04
522 0.06
523 0.07
524 0.09
525 0.11
526 0.12
527 0.13
528 0.15
529 0.15
530 0.14
531 0.14
532 0.16
533 0.17
534 0.18
535 0.18
536 0.17
537 0.16
538 0.17
539 0.16
540 0.14
541 0.1
542 0.09
543 0.08
544 0.08
545 0.07
546 0.07
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.06
551 0.12
552 0.16
553 0.2
554 0.27
555 0.35
556 0.41
557 0.44
558 0.49
559 0.54
560 0.58
561 0.66
562 0.69
563 0.7
564 0.73
565 0.79
566 0.76
567 0.71
568 0.71
569 0.68
570 0.68
571 0.67
572 0.64
573 0.65
574 0.72
575 0.7
576 0.63
577 0.57
578 0.48
579 0.43
580 0.37
581 0.28
582 0.2
583 0.21
584 0.21
585 0.2
586 0.19
587 0.18
588 0.19
589 0.17
590 0.19
591 0.15
592 0.15
593 0.14
594 0.15
595 0.15
596 0.14
597 0.14
598 0.11
599 0.1
600 0.08
601 0.08
602 0.08
603 0.08
604 0.07
605 0.07
606 0.07
607 0.08
608 0.08
609 0.08
610 0.08
611 0.08
612 0.09
613 0.1
614 0.1
615 0.09
616 0.09
617 0.09
618 0.09
619 0.09
620 0.09
621 0.07
622 0.08
623 0.09
624 0.11
625 0.13
626 0.12
627 0.12
628 0.11
629 0.11
630 0.11
631 0.11
632 0.08
633 0.09
634 0.08
635 0.08
636 0.08
637 0.09
638 0.08
639 0.09
640 0.1
641 0.09
642 0.1
643 0.11
644 0.11
645 0.1
646 0.1
647 0.1
648 0.09
649 0.11
650 0.1
651 0.1
652 0.11
653 0.11
654 0.13
655 0.14
656 0.17
657 0.2
658 0.26
659 0.31
660 0.38
661 0.44
662 0.45
663 0.51
664 0.52
665 0.48
666 0.42
667 0.36
668 0.3
669 0.23
670 0.2
671 0.13
672 0.08
673 0.07
674 0.07
675 0.07
676 0.07
677 0.11
678 0.16
679 0.24
680 0.25
681 0.27
682 0.28
683 0.31
684 0.35
685 0.35
686 0.33
687 0.35
688 0.35
689 0.36
690 0.35
691 0.36
692 0.31
693 0.27
694 0.26
695 0.18
696 0.22
697 0.21
698 0.23
699 0.21
700 0.23
701 0.25
702 0.25
703 0.27
704 0.25
705 0.23
706 0.23
707 0.22
708 0.2
709 0.21
710 0.19
711 0.22
712 0.25
713 0.25
714 0.22
715 0.22
716 0.25
717 0.24
718 0.31
719 0.31
720 0.28
721 0.28
722 0.31
723 0.32
724 0.31
725 0.33
726 0.28
727 0.27
728 0.28
729 0.32
730 0.39
731 0.41
732 0.42
733 0.41
734 0.47
735 0.51
736 0.51
737 0.56
738 0.56
739 0.59
740 0.63
741 0.62
742 0.54
743 0.52
744 0.53
745 0.5
746 0.52
747 0.55
748 0.59
749 0.67
750 0.75
751 0.7
752 0.72
753 0.73
754 0.71
755 0.73
756 0.72
757 0.73
758 0.74
759 0.82
760 0.83
761 0.8
762 0.75
763 0.71
764 0.63
765 0.55
766 0.48
767 0.45
768 0.43
769 0.4
770 0.39
771 0.35
772 0.33
773 0.32
774 0.31
775 0.25
776 0.22
777 0.22
778 0.21
779 0.24
780 0.31
781 0.32
782 0.35
783 0.39
784 0.42
785 0.48
786 0.52
787 0.51
788 0.49
789 0.5
790 0.48
791 0.5
792 0.54
793 0.54
794 0.57
795 0.63
796 0.69
797 0.75
798 0.83
799 0.86
800 0.86
801 0.87
802 0.84
803 0.82
804 0.81
805 0.73
806 0.72
807 0.68
808 0.6
809 0.54
810 0.51
811 0.43
812 0.37
813 0.4
814 0.4
815 0.43
816 0.46
817 0.48
818 0.5
819 0.56
820 0.62
821 0.6
822 0.59
823 0.54
824 0.56
825 0.54
826 0.54
827 0.49
828 0.48
829 0.54
830 0.5
831 0.51
832 0.51
833 0.47
834 0.47
835 0.54
836 0.58
837 0.6
838 0.68
839 0.73
840 0.77
841 0.87
842 0.92
843 0.93
844 0.94
845 0.94
846 0.95