Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4KA39

Protein Details
Accession W4KA39    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
250-272AVSKKLQQSERKREEKRLRQISNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
259-283ERKREEKRLRQISNARARHAEKRKR
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_mito 9, nucl 7, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR014816  tRNA_MeTrfase_Gcd14  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0016429  F:tRNA (adenine-N1-)-methyltransferase activity  
KEGG hir:HETIRDRAFT_384346  -  
hir:HETIRDRAFT_475459  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08704  GCD14  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51620  SAM_TRM61  
Amino Acid Sequences MWSSDARIAPGHLVIVWLTRDMVQSFIVTPGKEFNSKYGNYRHSDLLGLPYGSKVASRTGKGFIHVLRPTPELWTLALPHRTQILYIADIAFITSWLNIRPGSVVIEAGTGSGSFSHSVARTVGSTGKLWSYEFHEARANKARDEFTRHGMSDVVTLTHRNVCKDGFTVEDTADSVFLDLPAPWEAVEHAKRALRRDCITRICCFSPCIEQVLRTVSALNDAGFTDITMYETLLRPHEVSEVPTLLPIGAVSKKLQQSERKREEKRLRQISNARARHAEKRKREQDGGPEDNDATGSKRVKTEDETRGDAQGSSGPSAQDPASPVDPKALTSEVPTPPPATTQIVSKVIQEVRGHTSYLTFACLLPAVATQSPTCPVEKHESAPSPRTPASQTSDVTAGPSIDET
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.13
4 0.12
5 0.12
6 0.13
7 0.15
8 0.15
9 0.16
10 0.14
11 0.14
12 0.15
13 0.19
14 0.21
15 0.18
16 0.19
17 0.22
18 0.25
19 0.29
20 0.29
21 0.29
22 0.33
23 0.35
24 0.4
25 0.44
26 0.47
27 0.47
28 0.5
29 0.47
30 0.41
31 0.41
32 0.36
33 0.32
34 0.28
35 0.25
36 0.21
37 0.19
38 0.18
39 0.16
40 0.16
41 0.12
42 0.16
43 0.21
44 0.23
45 0.26
46 0.31
47 0.32
48 0.33
49 0.36
50 0.31
51 0.35
52 0.34
53 0.35
54 0.32
55 0.33
56 0.31
57 0.3
58 0.29
59 0.22
60 0.21
61 0.19
62 0.19
63 0.24
64 0.28
65 0.25
66 0.25
67 0.27
68 0.25
69 0.23
70 0.24
71 0.21
72 0.17
73 0.18
74 0.17
75 0.13
76 0.13
77 0.13
78 0.09
79 0.07
80 0.06
81 0.05
82 0.06
83 0.07
84 0.08
85 0.08
86 0.09
87 0.1
88 0.1
89 0.12
90 0.11
91 0.11
92 0.09
93 0.1
94 0.09
95 0.08
96 0.08
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.06
103 0.08
104 0.09
105 0.1
106 0.11
107 0.11
108 0.11
109 0.12
110 0.14
111 0.13
112 0.13
113 0.13
114 0.14
115 0.14
116 0.14
117 0.14
118 0.17
119 0.24
120 0.23
121 0.24
122 0.29
123 0.29
124 0.34
125 0.42
126 0.38
127 0.31
128 0.34
129 0.35
130 0.32
131 0.4
132 0.38
133 0.33
134 0.36
135 0.35
136 0.32
137 0.29
138 0.27
139 0.2
140 0.18
141 0.13
142 0.09
143 0.1
144 0.1
145 0.15
146 0.15
147 0.15
148 0.16
149 0.15
150 0.16
151 0.17
152 0.16
153 0.14
154 0.14
155 0.14
156 0.12
157 0.12
158 0.11
159 0.1
160 0.09
161 0.07
162 0.06
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.04
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.12
174 0.13
175 0.12
176 0.14
177 0.16
178 0.18
179 0.23
180 0.27
181 0.27
182 0.28
183 0.32
184 0.36
185 0.42
186 0.43
187 0.4
188 0.4
189 0.36
190 0.34
191 0.3
192 0.25
193 0.22
194 0.2
195 0.21
196 0.18
197 0.17
198 0.17
199 0.19
200 0.18
201 0.14
202 0.13
203 0.1
204 0.11
205 0.11
206 0.1
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.07
219 0.08
220 0.09
221 0.1
222 0.09
223 0.1
224 0.12
225 0.11
226 0.12
227 0.13
228 0.13
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.09
233 0.08
234 0.06
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.09
239 0.14
240 0.17
241 0.21
242 0.27
243 0.34
244 0.44
245 0.54
246 0.63
247 0.67
248 0.68
249 0.76
250 0.81
251 0.81
252 0.82
253 0.81
254 0.74
255 0.73
256 0.77
257 0.76
258 0.76
259 0.69
260 0.6
261 0.56
262 0.57
263 0.58
264 0.61
265 0.6
266 0.6
267 0.67
268 0.73
269 0.74
270 0.76
271 0.7
272 0.7
273 0.7
274 0.64
275 0.55
276 0.48
277 0.41
278 0.36
279 0.32
280 0.22
281 0.15
282 0.16
283 0.17
284 0.17
285 0.2
286 0.22
287 0.24
288 0.3
289 0.36
290 0.39
291 0.42
292 0.46
293 0.44
294 0.44
295 0.42
296 0.36
297 0.28
298 0.22
299 0.19
300 0.15
301 0.15
302 0.14
303 0.13
304 0.15
305 0.15
306 0.13
307 0.13
308 0.15
309 0.18
310 0.19
311 0.19
312 0.23
313 0.23
314 0.22
315 0.23
316 0.21
317 0.17
318 0.19
319 0.26
320 0.23
321 0.25
322 0.26
323 0.25
324 0.24
325 0.25
326 0.25
327 0.23
328 0.21
329 0.22
330 0.27
331 0.3
332 0.3
333 0.29
334 0.32
335 0.29
336 0.34
337 0.31
338 0.29
339 0.31
340 0.32
341 0.32
342 0.25
343 0.25
344 0.23
345 0.22
346 0.2
347 0.15
348 0.13
349 0.14
350 0.14
351 0.13
352 0.11
353 0.11
354 0.12
355 0.13
356 0.15
357 0.14
358 0.16
359 0.19
360 0.2
361 0.21
362 0.18
363 0.22
364 0.29
365 0.32
366 0.34
367 0.39
368 0.46
369 0.5
370 0.56
371 0.55
372 0.52
373 0.51
374 0.5
375 0.46
376 0.44
377 0.45
378 0.45
379 0.42
380 0.39
381 0.39
382 0.35
383 0.33
384 0.28
385 0.21