FuNGI

C1GP27

Protein Details

Accession

C1GP27

Localization Confidence

High

Confidence Score

24.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-23	MAVLKDVKKKPSKTAKASASPAS	Hydrophilic
264-284	SSSASDKKKSKKKSIPKSATA	Hydrophilic
357-384	SSSSSKSSVGKKKPKEAKKQTNSIAKSK	Hydrophilic
459-487	LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDIG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
270-279	KKKSKKKSIP
366-383	GKKKPKEAKKQTNSIAKS
464-480	GKGFTKEKNKKKRGSYR

Subcellular Location(s)

nucl 18, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
KEGG	pbl:PAAG_00272 -
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C

Amino Acid Sequences

MAVLKDVKKKPSKTAKASASPASNSTGIKSTTGMGKNEKDTSASERPALSPALLAMVTSFLTAYGFDKTSNVFGEELKESKMIRKAGNKSSGSATANTPLLVELFENWNRNLRKQGPKQKVVAKQSSEEDSDGSNYSDSDSSSSASSDSDVSMEDASSSSTSSSSSSNDDSSDEEEEEKGQEDNKATAPKSKTLKRKQDDASSSSSSGSDSDEGRPPAKRTKLPTNGKGKLKSSASDKSSSSDSSSESTSESSSGSSSDSDSDSSSASDKKKSKKKSIPKSATAADVAAIAAKIPLPESEESDSANSSSSSSSSFSSSGSSDGEDMSADRKPSADSSATLGGNSSSSDSSDFSSSSSSSSSKSSVGKKKPKEAKKQTNSIAKSKSKFSSPSALKNPPSSTSTSNAKSTPLSTPAGSTPQVKHSGAKPTPLALASMKPHDDHPSNAYVPYAYAERAHKDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDIGPGKSFKFED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.81
2	0.8
3	0.79
4	0.8
5	0.76
6	0.7
7	0.62
8	0.55
9	0.49
10	0.42
11	0.34
12	0.31
13	0.29
14	0.25
15	0.23
16	0.22
17	0.21
18	0.26
19	0.3
20	0.32
21	0.34
22	0.38
23	0.42
24	0.44
25	0.43
26	0.37
27	0.35
28	0.39
29	0.4
30	0.38
31	0.35
32	0.33
33	0.34
34	0.34
35	0.32
36	0.24
37	0.17
38	0.14
39	0.14
40	0.12
41	0.11
42	0.08
43	0.08
44	0.08
45	0.07
46	0.07
47	0.05
48	0.05
49	0.06
50	0.07
51	0.1
52	0.1
53	0.11
54	0.12
55	0.13
56	0.16
57	0.16
58	0.17
59	0.14
60	0.14
61	0.18
62	0.2
63	0.2
64	0.19
65	0.2
66	0.19
67	0.24
68	0.3
69	0.31
70	0.34
71	0.42
72	0.48
73	0.54
74	0.63
75	0.58
76	0.54
77	0.53
78	0.53
79	0.46
80	0.4
81	0.33
82	0.27
83	0.27
84	0.24
85	0.2
86	0.15
87	0.13
88	0.11
89	0.1
90	0.08
91	0.13
92	0.16
93	0.18
94	0.19
95	0.27
96	0.28
97	0.31
98	0.37
99	0.4
100	0.48
101	0.56
102	0.66
103	0.68
104	0.73
105	0.77
106	0.78
107	0.78
108	0.76
109	0.73
110	0.65
111	0.59
112	0.56
113	0.52
114	0.45
115	0.37
116	0.29
117	0.22
118	0.21
119	0.18
120	0.15
121	0.12
122	0.1
123	0.11
124	0.11
125	0.1
126	0.1
127	0.1
128	0.1
129	0.1
130	0.1
131	0.09
132	0.09
133	0.09
134	0.08
135	0.08
136	0.07
137	0.07
138	0.08
139	0.07
140	0.07
141	0.06
142	0.06
143	0.07
144	0.06
145	0.06
146	0.06
147	0.06
148	0.06
149	0.07
150	0.08
151	0.09
152	0.12
153	0.13
154	0.14
155	0.14
156	0.14
157	0.15
158	0.16
159	0.16
160	0.13
161	0.12
162	0.12
163	0.12
164	0.12
165	0.11
166	0.09
167	0.09
168	0.1
169	0.11
170	0.12
171	0.15
172	0.19
173	0.18
174	0.25
175	0.26
176	0.3
177	0.37
178	0.43
179	0.5
180	0.56
181	0.66
182	0.64
183	0.7
184	0.69
185	0.71
186	0.68
187	0.61
188	0.56
189	0.48
190	0.45
191	0.36
192	0.31
193	0.22
194	0.18
195	0.15
196	0.11
197	0.1
198	0.11
199	0.15
200	0.16
201	0.18
202	0.19
203	0.21
204	0.27
205	0.31
206	0.33
207	0.35
208	0.44
209	0.53
210	0.59
211	0.64
212	0.67
213	0.69
214	0.7
215	0.68
216	0.59
217	0.54
218	0.48
219	0.42
220	0.37
221	0.36
222	0.33
223	0.32
224	0.31
225	0.27
226	0.28
227	0.26
228	0.22
229	0.16
230	0.15
231	0.13
232	0.13
233	0.12
234	0.11
235	0.11
236	0.09
237	0.09
238	0.08
239	0.07
240	0.06
241	0.06
242	0.07
243	0.06
244	0.06
245	0.07
246	0.07
247	0.08
248	0.08
249	0.08
250	0.08
251	0.08
252	0.09
253	0.12
254	0.13
255	0.2
256	0.25
257	0.34
258	0.42
259	0.5
260	0.59
261	0.65
262	0.74
263	0.78
264	0.84
265	0.83
266	0.8
267	0.77
268	0.67
269	0.59
270	0.49
271	0.38
272	0.26
273	0.18
274	0.13
275	0.08
276	0.06
277	0.04
278	0.04
279	0.04
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.07
284	0.08
285	0.11
286	0.13
287	0.13
288	0.14
289	0.14
290	0.14
291	0.12
292	0.12
293	0.09
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.08
298	0.09
299	0.09
300	0.1
301	0.11
302	0.1
303	0.12
304	0.12
305	0.11
306	0.11
307	0.1
308	0.09
309	0.09
310	0.08
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.09
315	0.09
316	0.08
317	0.09
318	0.1
319	0.11
320	0.14
321	0.14
322	0.13
323	0.16
324	0.21
325	0.2
326	0.19
327	0.18
328	0.15
329	0.13
330	0.13
331	0.11
332	0.06
333	0.07
334	0.08
335	0.09
336	0.1
337	0.11
338	0.11
339	0.1
340	0.11
341	0.11
342	0.11
343	0.12
344	0.11
345	0.12
346	0.13
347	0.14
348	0.16
349	0.22
350	0.3
351	0.38
352	0.47
353	0.56
354	0.61
355	0.7
356	0.76
357	0.81
358	0.83
359	0.85
360	0.86
361	0.85
362	0.88
363	0.86
364	0.85
365	0.8
366	0.76
367	0.74
368	0.7
369	0.64
370	0.61
371	0.55
372	0.51
373	0.5
374	0.47
375	0.48
376	0.46
377	0.52
378	0.54
379	0.59
380	0.56
381	0.58
382	0.56
383	0.49
384	0.47
385	0.42
386	0.37
387	0.35
388	0.39
389	0.37
390	0.38
391	0.35
392	0.34
393	0.32
394	0.31
395	0.3
396	0.26
397	0.25
398	0.22
399	0.24
400	0.24
401	0.27
402	0.26
403	0.27
404	0.25
405	0.29
406	0.35
407	0.33
408	0.34
409	0.35
410	0.44
411	0.41
412	0.44
413	0.39
414	0.36
415	0.37
416	0.34
417	0.31
418	0.23
419	0.25
420	0.24
421	0.27
422	0.27
423	0.25
424	0.27
425	0.32
426	0.33
427	0.32
428	0.32
429	0.33
430	0.33
431	0.32
432	0.31
433	0.24
434	0.22
435	0.21
436	0.18
437	0.12
438	0.16
439	0.19
440	0.22
441	0.25
442	0.25
443	0.24
444	0.26
445	0.3
446	0.33
447	0.39
448	0.37
449	0.37
450	0.42
451	0.42
452	0.47
453	0.5
454	0.52
455	0.54
456	0.63
457	0.71
458	0.77
459	0.85
460	0.87
461	0.9
462	0.91
463	0.9
464	0.9
465	0.89
466	0.89
467	0.88
468	0.82
469	0.72
470	0.62
471	0.61
472	0.54
473	0.47
474	0.37
475	0.3
476	0.28

C1GP27

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer