Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4JY13

Protein Details
Accession W4JY13    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
450-473PTVSDHPPRRRLRRPTPRRPLLSMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
457-468PRRRLRRPTPRR
Subcellular Location(s) mito 12.5, nucl 9, cyto_mito 8.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
KEGG hir:HETIRDRAFT_420793  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01535  PPR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MTAFVPHALTRIPHGLHSFIWPTLPWLTAFPRSLSTSTVQRKEETPAVIALRSIPYPRTLPDPAIFESFSQEYQSIDVSGVRQQPRYVPLYDHSAPLARLVVAGKYEDAEVVRAELVQSGTFIRHSPVYFRAAQHVLEHEDLPNRSQAFSNWWSLIPYASSVRQGSFRNVTRLIFSSNRVDLPTAIRYAIISAEKGYARKIGPLAIGHITRFADPAFTARFIDEFDRADREFYEKTREISGVYTPSVVRNKDSRKRWWSLAIRTHCNAKRPLAAFELLEAAREHGVRLTRYTYSYVLGELEAKKCTDAATALKAMFKKQILVPAKDLMTQGPPATSPEALPTIDASRTLENNLAISLRMLKRSLLSDYPPSARELAAFFDIYKTHRRGGRAINLLQTRAFRLSRTAFAVVKHAELLHHHHKKEYNHVLYVFTNYFHMVGVPREDVLHLLPTVSDHPPRRRLRRPTPRRPLLSMFKFTTFNTSDKIWPSGYHTSLVWTALVHHCSKRVQLEQLYEKLIDFASRRSYKPISSASSPPSASTSAAPQSSAATEGHWSETTSPDIAPVEAFDAAHFNAFVDGFCRFQRFDRAYRVIEDMRSFGIQPDFHTMCMLAGRLAKLGDTDEALNMLDQIRQRSVTEQQEGAVNESEKVEGVAVQEGESVEESRKPMSRQQFIEALRKRRRSGPLLAAYTSVLRGFVDRRLLDHARAIEVALGEHLGYVSGSEPQTEEAINWLRRIEGLERERLEAEGFSAEAEITDEEQTAGEPQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.28
3 0.28
4 0.32
5 0.31
6 0.25
7 0.25
8 0.21
9 0.22
10 0.22
11 0.22
12 0.17
13 0.18
14 0.22
15 0.27
16 0.29
17 0.27
18 0.29
19 0.32
20 0.32
21 0.32
22 0.31
23 0.34
24 0.42
25 0.47
26 0.46
27 0.45
28 0.46
29 0.49
30 0.51
31 0.43
32 0.36
33 0.33
34 0.33
35 0.31
36 0.29
37 0.25
38 0.21
39 0.21
40 0.21
41 0.18
42 0.2
43 0.21
44 0.23
45 0.27
46 0.28
47 0.3
48 0.32
49 0.35
50 0.34
51 0.35
52 0.34
53 0.28
54 0.3
55 0.26
56 0.23
57 0.21
58 0.18
59 0.15
60 0.16
61 0.16
62 0.12
63 0.11
64 0.12
65 0.11
66 0.17
67 0.24
68 0.26
69 0.27
70 0.28
71 0.32
72 0.36
73 0.39
74 0.35
75 0.31
76 0.31
77 0.37
78 0.37
79 0.34
80 0.3
81 0.28
82 0.26
83 0.25
84 0.23
85 0.14
86 0.14
87 0.14
88 0.14
89 0.12
90 0.13
91 0.12
92 0.11
93 0.11
94 0.11
95 0.11
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.1
100 0.09
101 0.09
102 0.1
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.1
108 0.11
109 0.12
110 0.12
111 0.14
112 0.15
113 0.18
114 0.21
115 0.25
116 0.28
117 0.28
118 0.33
119 0.31
120 0.31
121 0.3
122 0.29
123 0.28
124 0.26
125 0.25
126 0.21
127 0.24
128 0.24
129 0.23
130 0.24
131 0.22
132 0.21
133 0.21
134 0.2
135 0.22
136 0.25
137 0.28
138 0.25
139 0.25
140 0.25
141 0.24
142 0.24
143 0.17
144 0.16
145 0.14
146 0.14
147 0.18
148 0.17
149 0.18
150 0.23
151 0.24
152 0.27
153 0.32
154 0.34
155 0.36
156 0.37
157 0.37
158 0.35
159 0.35
160 0.34
161 0.29
162 0.28
163 0.28
164 0.28
165 0.28
166 0.26
167 0.25
168 0.22
169 0.23
170 0.23
171 0.19
172 0.17
173 0.15
174 0.15
175 0.14
176 0.16
177 0.13
178 0.1
179 0.1
180 0.13
181 0.15
182 0.15
183 0.16
184 0.17
185 0.17
186 0.19
187 0.19
188 0.18
189 0.19
190 0.19
191 0.21
192 0.21
193 0.21
194 0.18
195 0.2
196 0.18
197 0.16
198 0.16
199 0.13
200 0.1
201 0.1
202 0.13
203 0.12
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.13
208 0.13
209 0.15
210 0.14
211 0.14
212 0.14
213 0.17
214 0.17
215 0.18
216 0.17
217 0.19
218 0.19
219 0.19
220 0.25
221 0.24
222 0.25
223 0.27
224 0.26
225 0.23
226 0.23
227 0.24
228 0.18
229 0.16
230 0.16
231 0.14
232 0.19
233 0.23
234 0.22
235 0.22
236 0.28
237 0.37
238 0.44
239 0.51
240 0.56
241 0.59
242 0.63
243 0.63
244 0.65
245 0.63
246 0.64
247 0.66
248 0.63
249 0.61
250 0.58
251 0.63
252 0.56
253 0.54
254 0.48
255 0.42
256 0.42
257 0.38
258 0.4
259 0.33
260 0.32
261 0.26
262 0.23
263 0.23
264 0.16
265 0.15
266 0.12
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.1
271 0.09
272 0.12
273 0.12
274 0.13
275 0.15
276 0.15
277 0.17
278 0.19
279 0.18
280 0.17
281 0.16
282 0.15
283 0.13
284 0.11
285 0.13
286 0.13
287 0.14
288 0.13
289 0.13
290 0.12
291 0.12
292 0.12
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.12
297 0.14
298 0.14
299 0.17
300 0.17
301 0.17
302 0.19
303 0.17
304 0.16
305 0.15
306 0.24
307 0.26
308 0.28
309 0.29
310 0.29
311 0.29
312 0.28
313 0.28
314 0.2
315 0.16
316 0.15
317 0.13
318 0.1
319 0.1
320 0.1
321 0.11
322 0.1
323 0.08
324 0.09
325 0.1
326 0.1
327 0.1
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.09
334 0.1
335 0.11
336 0.11
337 0.1
338 0.1
339 0.1
340 0.09
341 0.07
342 0.07
343 0.11
344 0.11
345 0.12
346 0.12
347 0.12
348 0.13
349 0.15
350 0.17
351 0.14
352 0.15
353 0.17
354 0.19
355 0.2
356 0.2
357 0.19
358 0.18
359 0.16
360 0.14
361 0.12
362 0.11
363 0.1
364 0.09
365 0.08
366 0.08
367 0.09
368 0.11
369 0.15
370 0.16
371 0.18
372 0.21
373 0.22
374 0.26
375 0.31
376 0.37
377 0.37
378 0.37
379 0.39
380 0.38
381 0.36
382 0.33
383 0.28
384 0.21
385 0.19
386 0.18
387 0.12
388 0.16
389 0.17
390 0.18
391 0.2
392 0.21
393 0.19
394 0.19
395 0.23
396 0.19
397 0.17
398 0.16
399 0.13
400 0.11
401 0.11
402 0.17
403 0.24
404 0.29
405 0.29
406 0.32
407 0.37
408 0.39
409 0.47
410 0.49
411 0.42
412 0.38
413 0.39
414 0.38
415 0.33
416 0.35
417 0.25
418 0.16
419 0.14
420 0.12
421 0.11
422 0.09
423 0.09
424 0.07
425 0.07
426 0.09
427 0.09
428 0.08
429 0.08
430 0.09
431 0.09
432 0.08
433 0.09
434 0.07
435 0.06
436 0.06
437 0.07
438 0.1
439 0.11
440 0.16
441 0.2
442 0.26
443 0.36
444 0.44
445 0.52
446 0.59
447 0.67
448 0.73
449 0.79
450 0.84
451 0.86
452 0.89
453 0.89
454 0.84
455 0.79
456 0.75
457 0.73
458 0.68
459 0.62
460 0.53
461 0.46
462 0.43
463 0.38
464 0.37
465 0.3
466 0.25
467 0.22
468 0.22
469 0.22
470 0.23
471 0.25
472 0.19
473 0.17
474 0.22
475 0.25
476 0.24
477 0.23
478 0.21
479 0.2
480 0.21
481 0.2
482 0.15
483 0.09
484 0.11
485 0.13
486 0.16
487 0.16
488 0.16
489 0.18
490 0.19
491 0.22
492 0.25
493 0.25
494 0.28
495 0.3
496 0.36
497 0.38
498 0.39
499 0.38
500 0.33
501 0.29
502 0.24
503 0.21
504 0.16
505 0.12
506 0.12
507 0.2
508 0.23
509 0.24
510 0.29
511 0.31
512 0.3
513 0.35
514 0.38
515 0.33
516 0.34
517 0.38
518 0.36
519 0.38
520 0.37
521 0.32
522 0.29
523 0.25
524 0.22
525 0.18
526 0.18
527 0.17
528 0.17
529 0.17
530 0.15
531 0.15
532 0.14
533 0.15
534 0.11
535 0.08
536 0.1
537 0.1
538 0.12
539 0.12
540 0.12
541 0.12
542 0.13
543 0.15
544 0.14
545 0.13
546 0.12
547 0.12
548 0.12
549 0.11
550 0.09
551 0.09
552 0.08
553 0.08
554 0.07
555 0.08
556 0.08
557 0.08
558 0.08
559 0.07
560 0.07
561 0.07
562 0.07
563 0.07
564 0.07
565 0.09
566 0.1
567 0.12
568 0.13
569 0.15
570 0.25
571 0.28
572 0.33
573 0.41
574 0.45
575 0.45
576 0.46
577 0.49
578 0.41
579 0.39
580 0.35
581 0.27
582 0.23
583 0.22
584 0.2
585 0.17
586 0.19
587 0.17
588 0.17
589 0.24
590 0.23
591 0.22
592 0.23
593 0.2
594 0.17
595 0.17
596 0.16
597 0.1
598 0.11
599 0.12
600 0.12
601 0.12
602 0.11
603 0.11
604 0.12
605 0.11
606 0.1
607 0.1
608 0.09
609 0.1
610 0.1
611 0.09
612 0.09
613 0.08
614 0.1
615 0.11
616 0.14
617 0.16
618 0.17
619 0.18
620 0.21
621 0.28
622 0.32
623 0.34
624 0.31
625 0.3
626 0.33
627 0.33
628 0.32
629 0.28
630 0.22
631 0.19
632 0.19
633 0.18
634 0.14
635 0.13
636 0.1
637 0.08
638 0.08
639 0.11
640 0.1
641 0.1
642 0.11
643 0.11
644 0.12
645 0.12
646 0.12
647 0.1
648 0.13
649 0.14
650 0.16
651 0.2
652 0.22
653 0.3
654 0.38
655 0.45
656 0.46
657 0.5
658 0.54
659 0.54
660 0.61
661 0.61
662 0.62
663 0.64
664 0.67
665 0.66
666 0.67
667 0.71
668 0.67
669 0.68
670 0.68
671 0.67
672 0.64
673 0.62
674 0.54
675 0.47
676 0.41
677 0.33
678 0.23
679 0.14
680 0.1
681 0.12
682 0.13
683 0.16
684 0.23
685 0.23
686 0.25
687 0.32
688 0.35
689 0.34
690 0.38
691 0.35
692 0.29
693 0.29
694 0.27
695 0.21
696 0.19
697 0.17
698 0.12
699 0.1
700 0.08
701 0.08
702 0.07
703 0.05
704 0.05
705 0.05
706 0.05
707 0.1
708 0.1
709 0.11
710 0.11
711 0.13
712 0.14
713 0.14
714 0.14
715 0.16
716 0.24
717 0.25
718 0.26
719 0.25
720 0.24
721 0.25
722 0.28
723 0.26
724 0.28
725 0.31
726 0.38
727 0.4
728 0.42
729 0.42
730 0.39
731 0.36
732 0.26
733 0.23
734 0.15
735 0.13
736 0.11
737 0.1
738 0.09
739 0.08
740 0.09
741 0.09
742 0.09
743 0.1
744 0.1
745 0.1
746 0.1