Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H8W8

Protein Details
Accession C1H8W8    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MPREKQKRGRRAEAKRKRDDVITBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-18REKQKRGRRAEAKRKR
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR040000  NOP9  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG pbl:PAAG_07209  -  
Amino Acid Sequences MPREKQKRGRRAEAKRKRDDVITDPTVLKRQKSSDVSNYPNRSYEQLEIRGDYIPLDEELVDSTGTAFYGLLDIEEQEYFSHASGLLELNQFETEEEKSIFIERVYEEANGKELKIACSQSCSRLMEKLISASTVSQIKRLFSKFIGHFLDLVQHRFASHCCECLFIHAAQYVTSEMKKKSSKEKENLEEDSTSELQLEDLFLKAISELEGNWGYLLTERFASHTIRVLLLVLAGKPLRNPSTTTVIASRKKEYLASKVGTQLDPSISEKQAVPTSFNKALEKMMKDLVTGLDNTYLRALATHPVGNPVLQVLLSVELSHMGKSKAKDADSVLRRLVPDENLQEDGESATFLKGLFYDPVGSRLLETIVQDAPGKFFKLFYKIIVRERIGSFSRNEIAGHVVVRILERLSKEDLKSAMDLILPEVPPLVERSRLTVIKALIERGIVRGVDLGPLAATLLSAYGDDAVSRINNMLKLQRSNKENDGTTSSSNTSSPEQLHGSLLAQAMLKSTGPLCELVQSSLLAVTPETLISIAQDPVVSHVLQDALTLPTSTPQFRRQITSRLSGKIAELALHSSGSHVVDALWPATRDLIFVKQRFAEELVVHERALRDSFVGRAVWRNWSMDLYKRKRGSWIAIAKGLEDSAEVNLNTLTNKPKSNIDLARARFAAKANGSKEPANTPSKKIPTTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.92
2 0.92
3 0.88
4 0.8
5 0.76
6 0.7
7 0.66
8 0.64
9 0.57
10 0.51
11 0.48
12 0.47
13 0.49
14 0.46
15 0.43
16 0.39
17 0.4
18 0.46
19 0.5
20 0.55
21 0.57
22 0.63
23 0.67
24 0.71
25 0.72
26 0.65
27 0.62
28 0.56
29 0.49
30 0.44
31 0.43
32 0.4
33 0.41
34 0.42
35 0.4
36 0.39
37 0.37
38 0.33
39 0.27
40 0.2
41 0.15
42 0.12
43 0.12
44 0.1
45 0.09
46 0.1
47 0.11
48 0.09
49 0.08
50 0.08
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.06
55 0.05
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.07
65 0.09
66 0.1
67 0.09
68 0.1
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.11
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.14
77 0.14
78 0.14
79 0.13
80 0.13
81 0.12
82 0.13
83 0.14
84 0.13
85 0.13
86 0.15
87 0.16
88 0.13
89 0.15
90 0.13
91 0.14
92 0.16
93 0.17
94 0.16
95 0.16
96 0.2
97 0.17
98 0.17
99 0.19
100 0.19
101 0.2
102 0.23
103 0.26
104 0.23
105 0.29
106 0.31
107 0.31
108 0.35
109 0.36
110 0.33
111 0.33
112 0.34
113 0.32
114 0.31
115 0.29
116 0.23
117 0.21
118 0.2
119 0.16
120 0.18
121 0.21
122 0.2
123 0.22
124 0.23
125 0.24
126 0.29
127 0.31
128 0.31
129 0.27
130 0.35
131 0.32
132 0.38
133 0.4
134 0.34
135 0.33
136 0.29
137 0.35
138 0.28
139 0.29
140 0.22
141 0.18
142 0.18
143 0.19
144 0.19
145 0.2
146 0.19
147 0.21
148 0.2
149 0.22
150 0.22
151 0.25
152 0.28
153 0.2
154 0.21
155 0.19
156 0.19
157 0.17
158 0.17
159 0.15
160 0.13
161 0.15
162 0.17
163 0.17
164 0.24
165 0.29
166 0.32
167 0.41
168 0.5
169 0.58
170 0.62
171 0.71
172 0.71
173 0.73
174 0.72
175 0.64
176 0.54
177 0.45
178 0.41
179 0.32
180 0.24
181 0.18
182 0.14
183 0.11
184 0.11
185 0.11
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.06
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.08
202 0.1
203 0.11
204 0.08
205 0.09
206 0.09
207 0.1
208 0.12
209 0.14
210 0.13
211 0.16
212 0.16
213 0.15
214 0.15
215 0.14
216 0.12
217 0.11
218 0.11
219 0.07
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.13
225 0.14
226 0.15
227 0.17
228 0.19
229 0.25
230 0.25
231 0.26
232 0.28
233 0.33
234 0.38
235 0.38
236 0.37
237 0.32
238 0.32
239 0.35
240 0.33
241 0.32
242 0.33
243 0.31
244 0.3
245 0.34
246 0.35
247 0.3
248 0.28
249 0.23
250 0.17
251 0.17
252 0.19
253 0.17
254 0.15
255 0.16
256 0.16
257 0.17
258 0.2
259 0.19
260 0.2
261 0.18
262 0.24
263 0.26
264 0.28
265 0.26
266 0.23
267 0.26
268 0.28
269 0.27
270 0.23
271 0.22
272 0.2
273 0.2
274 0.19
275 0.17
276 0.13
277 0.12
278 0.1
279 0.11
280 0.11
281 0.11
282 0.11
283 0.1
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.07
288 0.09
289 0.1
290 0.1
291 0.13
292 0.13
293 0.12
294 0.12
295 0.09
296 0.08
297 0.06
298 0.06
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.05
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.08
309 0.11
310 0.12
311 0.17
312 0.19
313 0.2
314 0.21
315 0.22
316 0.3
317 0.3
318 0.32
319 0.27
320 0.25
321 0.25
322 0.24
323 0.23
324 0.16
325 0.16
326 0.15
327 0.16
328 0.16
329 0.16
330 0.15
331 0.13
332 0.12
333 0.08
334 0.07
335 0.05
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.08
345 0.08
346 0.1
347 0.11
348 0.1
349 0.09
350 0.09
351 0.1
352 0.09
353 0.09
354 0.08
355 0.08
356 0.09
357 0.09
358 0.09
359 0.1
360 0.1
361 0.11
362 0.09
363 0.11
364 0.12
365 0.16
366 0.16
367 0.17
368 0.25
369 0.27
370 0.32
371 0.36
372 0.35
373 0.33
374 0.33
375 0.35
376 0.28
377 0.27
378 0.23
379 0.21
380 0.21
381 0.18
382 0.17
383 0.13
384 0.14
385 0.12
386 0.12
387 0.09
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.06
393 0.08
394 0.08
395 0.1
396 0.14
397 0.17
398 0.17
399 0.2
400 0.21
401 0.2
402 0.2
403 0.18
404 0.14
405 0.12
406 0.11
407 0.09
408 0.11
409 0.1
410 0.09
411 0.09
412 0.08
413 0.08
414 0.1
415 0.1
416 0.11
417 0.11
418 0.16
419 0.2
420 0.21
421 0.22
422 0.23
423 0.23
424 0.24
425 0.24
426 0.21
427 0.17
428 0.17
429 0.16
430 0.13
431 0.14
432 0.09
433 0.09
434 0.09
435 0.09
436 0.09
437 0.08
438 0.07
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.04
443 0.03
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.06
457 0.07
458 0.09
459 0.11
460 0.16
461 0.19
462 0.26
463 0.31
464 0.36
465 0.38
466 0.42
467 0.46
468 0.46
469 0.43
470 0.39
471 0.39
472 0.35
473 0.33
474 0.3
475 0.26
476 0.22
477 0.21
478 0.21
479 0.18
480 0.18
481 0.18
482 0.18
483 0.19
484 0.18
485 0.19
486 0.17
487 0.16
488 0.15
489 0.14
490 0.12
491 0.11
492 0.1
493 0.1
494 0.1
495 0.09
496 0.08
497 0.08
498 0.08
499 0.09
500 0.1
501 0.09
502 0.12
503 0.13
504 0.13
505 0.14
506 0.13
507 0.12
508 0.11
509 0.11
510 0.07
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.05
517 0.05
518 0.06
519 0.08
520 0.07
521 0.07
522 0.08
523 0.08
524 0.11
525 0.13
526 0.11
527 0.1
528 0.1
529 0.11
530 0.1
531 0.1
532 0.09
533 0.08
534 0.09
535 0.09
536 0.08
537 0.11
538 0.14
539 0.17
540 0.19
541 0.25
542 0.32
543 0.34
544 0.41
545 0.42
546 0.49
547 0.51
548 0.56
549 0.54
550 0.5
551 0.49
552 0.43
553 0.4
554 0.34
555 0.3
556 0.22
557 0.17
558 0.16
559 0.15
560 0.14
561 0.13
562 0.1
563 0.12
564 0.11
565 0.1
566 0.08
567 0.08
568 0.09
569 0.11
570 0.11
571 0.11
572 0.11
573 0.11
574 0.13
575 0.13
576 0.12
577 0.14
578 0.21
579 0.27
580 0.28
581 0.32
582 0.32
583 0.33
584 0.35
585 0.34
586 0.3
587 0.22
588 0.26
589 0.28
590 0.27
591 0.26
592 0.25
593 0.24
594 0.22
595 0.23
596 0.18
597 0.14
598 0.15
599 0.16
600 0.17
601 0.17
602 0.17
603 0.22
604 0.23
605 0.28
606 0.29
607 0.3
608 0.29
609 0.32
610 0.33
611 0.36
612 0.45
613 0.45
614 0.53
615 0.55
616 0.55
617 0.58
618 0.61
619 0.6
620 0.59
621 0.6
622 0.56
623 0.57
624 0.56
625 0.49
626 0.44
627 0.36
628 0.26
629 0.17
630 0.13
631 0.09
632 0.13
633 0.12
634 0.12
635 0.12
636 0.13
637 0.13
638 0.16
639 0.22
640 0.22
641 0.26
642 0.28
643 0.34
644 0.37
645 0.46
646 0.48
647 0.48
648 0.53
649 0.53
650 0.57
651 0.52
652 0.49
653 0.43
654 0.39
655 0.4
656 0.37
657 0.42
658 0.39
659 0.45
660 0.47
661 0.47
662 0.47
663 0.46
664 0.47
665 0.48
666 0.48
667 0.48
668 0.54
669 0.59