FuNGI

W4JPA1

Protein Details

Accession

W4JPA1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
17-62	TDTIITNIKRPHKERRTNKQDLGQEYPPGTRRINNQLRHNNRPIRR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18, mito 3, cyto 2, extr 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR032567 LDOC1-rel IPR005162 Retrotrans_gag_dom
KEGG	hir:HETIRDRAFT_456270 -
Pfam	View protein in Pfam PF03732 Retrotrans_gag

Amino Acid Sequences

MISVMITFCRALTAVYTDTIITNIKRPHKERRTNKQDLGQEYPPGTRRINNQLRHNNRPIRREGDFWVYEDNNRYAPPNYDNCSYRNGRYYFTLEDGTEEEDIWNETEAQWELAPQYREPAPVIPEDSEQEETTSESDSDSPDQTPINTRNEPLANMSGQASTSTDPPSATVQPGRGKVKLPDNYTGNRIESQKFMLQCLLFFAAESDRYKTDQDKISLVLSCMRYGTAGAWAENFLLKSVEADPPTDLGTWRDFLTKFKLQFRETGKTDKARSALMAFSQGRMTVDEYSNQFILIAADADISDKEQVPYFQRGLDPRVMDKIYDKEVQPKDTIQDWINTACEIDGRLRARSAQKAILANSTSFRSDYLNRFHTQPAVRYNSTTAPRRMNNQVVDMDIDATRKCNAEKAFAQFEETRRDAWVRQGEETAQLIWKEKTTHPLWETKREYIEEWRQRMFIATTSGYHNLVLRWNVLTLPHPDDPKRTMGNALCYLTDDGETEASVILLESEQCSEN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.15
3	0.16
4	0.15
5	0.15
6	0.16
7	0.18
8	0.15
9	0.21
10	0.27
11	0.36
12	0.45
13	0.5
14	0.6
15	0.68
16	0.77
17	0.81
18	0.85
19	0.87
20	0.87
21	0.89
22	0.86
23	0.82
24	0.78
25	0.74
26	0.66
27	0.6
28	0.52
29	0.51
30	0.45
31	0.42
32	0.38
33	0.35
34	0.38
35	0.45
36	0.52
37	0.55
38	0.62
39	0.69
40	0.75
41	0.8
42	0.83
43	0.82
44	0.8
45	0.79
46	0.75
47	0.71
48	0.65
49	0.6
50	0.55
51	0.54
52	0.48
53	0.42
54	0.42
55	0.37
56	0.37
57	0.38
58	0.35
59	0.27
60	0.26
61	0.28
62	0.23
63	0.26
64	0.29
65	0.31
66	0.34
67	0.38
68	0.4
69	0.39
70	0.44
71	0.44
72	0.42
73	0.43
74	0.4
75	0.37
76	0.39
77	0.41
78	0.36
79	0.35
80	0.34
81	0.25
82	0.25
83	0.24
84	0.22
85	0.18
86	0.15
87	0.12
88	0.11
89	0.11
90	0.1
91	0.1
92	0.08
93	0.08
94	0.1
95	0.11
96	0.11
97	0.1
98	0.1
99	0.11
100	0.16
101	0.18
102	0.15
103	0.18
104	0.19
105	0.2
106	0.21
107	0.22
108	0.19
109	0.2
110	0.22
111	0.2
112	0.19
113	0.2
114	0.21
115	0.21
116	0.19
117	0.17
118	0.15
119	0.14
120	0.13
121	0.13
122	0.1
123	0.09
124	0.09
125	0.11
126	0.13
127	0.13
128	0.13
129	0.13
130	0.13
131	0.14
132	0.19
133	0.22
134	0.27
135	0.27
136	0.27
137	0.3
138	0.31
139	0.31
140	0.28
141	0.26
142	0.19
143	0.19
144	0.19
145	0.14
146	0.13
147	0.12
148	0.1
149	0.09
150	0.1
151	0.11
152	0.11
153	0.1
154	0.12
155	0.15
156	0.15
157	0.17
158	0.17
159	0.2
160	0.24
161	0.3
162	0.32
163	0.3
164	0.31
165	0.33
166	0.41
167	0.42
168	0.41
169	0.41
170	0.42
171	0.42
172	0.43
173	0.41
174	0.33
175	0.3
176	0.3
177	0.25
178	0.22
179	0.24
180	0.24
181	0.22
182	0.22
183	0.22
184	0.19
185	0.17
186	0.18
187	0.16
188	0.12
189	0.11
190	0.11
191	0.09
192	0.11
193	0.12
194	0.12
195	0.12
196	0.13
197	0.15
198	0.16
199	0.21
200	0.23
201	0.24
202	0.23
203	0.23
204	0.24
205	0.23
206	0.21
207	0.21
208	0.16
209	0.15
210	0.14
211	0.12
212	0.11
213	0.1
214	0.1
215	0.1
216	0.1
217	0.09
218	0.09
219	0.1
220	0.1
221	0.1
222	0.1
223	0.06
224	0.06
225	0.05
226	0.06
227	0.08
228	0.1
229	0.1
230	0.11
231	0.11
232	0.11
233	0.12
234	0.11
235	0.1
236	0.08
237	0.09
238	0.1
239	0.1
240	0.12
241	0.12
242	0.13
243	0.19
244	0.22
245	0.24
246	0.3
247	0.34
248	0.32
249	0.38
250	0.42
251	0.43
252	0.4
253	0.43
254	0.41
255	0.4
256	0.41
257	0.38
258	0.33
259	0.26
260	0.25
261	0.2
262	0.18
263	0.13
264	0.18
265	0.15
266	0.15
267	0.14
268	0.14
269	0.13
270	0.13
271	0.14
272	0.1
273	0.11
274	0.13
275	0.14
276	0.15
277	0.15
278	0.14
279	0.12
280	0.1
281	0.09
282	0.07
283	0.06
284	0.04
285	0.04
286	0.04
287	0.05
288	0.04
289	0.05
290	0.06
291	0.06
292	0.06
293	0.07
294	0.09
295	0.12
296	0.16
297	0.16
298	0.16
299	0.19
300	0.2
301	0.23
302	0.25
303	0.23
304	0.2
305	0.24
306	0.23
307	0.21
308	0.21
309	0.21
310	0.21
311	0.23
312	0.23
313	0.28
314	0.3
315	0.32
316	0.31
317	0.29
318	0.27
319	0.27
320	0.29
321	0.21
322	0.2
323	0.19
324	0.19
325	0.18
326	0.16
327	0.13
328	0.1
329	0.1
330	0.08
331	0.08
332	0.13
333	0.14
334	0.15
335	0.16
336	0.2
337	0.25
338	0.29
339	0.31
340	0.29
341	0.31
342	0.34
343	0.34
344	0.34
345	0.31
346	0.26
347	0.24
348	0.23
349	0.19
350	0.16
351	0.16
352	0.15
353	0.19
354	0.23
355	0.28
356	0.31
357	0.32
358	0.34
359	0.35
360	0.38
361	0.36
362	0.35
363	0.36
364	0.39
365	0.38
366	0.37
367	0.39
368	0.39
369	0.42
370	0.44
371	0.41
372	0.42
373	0.43
374	0.47
375	0.52
376	0.52
377	0.48
378	0.46
379	0.42
380	0.35
381	0.34
382	0.29
383	0.23
384	0.17
385	0.16
386	0.12
387	0.12
388	0.12
389	0.13
390	0.13
391	0.17
392	0.18
393	0.24
394	0.28
395	0.33
396	0.38
397	0.36
398	0.41
399	0.38
400	0.4
401	0.41
402	0.38
403	0.32
404	0.28
405	0.31
406	0.27
407	0.32
408	0.36
409	0.31
410	0.32
411	0.33
412	0.32
413	0.33
414	0.32
415	0.25
416	0.2
417	0.19
418	0.2
419	0.19
420	0.2
421	0.22
422	0.22
423	0.29
424	0.29
425	0.36
426	0.36
427	0.45
428	0.48
429	0.54
430	0.57
431	0.55
432	0.57
433	0.51
434	0.5
435	0.51
436	0.56
437	0.55
438	0.55
439	0.52
440	0.48
441	0.46
442	0.46
443	0.38
444	0.3
445	0.26
446	0.22
447	0.22
448	0.26
449	0.28
450	0.25
451	0.24
452	0.23
453	0.19
454	0.22
455	0.22
456	0.2
457	0.19
458	0.19
459	0.19
460	0.19
461	0.21
462	0.21
463	0.26
464	0.28
465	0.33
466	0.35
467	0.39
468	0.41
469	0.45
470	0.44
471	0.39
472	0.42
473	0.41
474	0.46
475	0.46
476	0.44
477	0.38
478	0.36
479	0.36
480	0.29
481	0.26
482	0.18
483	0.14
484	0.13
485	0.13
486	0.11
487	0.09
488	0.08
489	0.08
490	0.07
491	0.06
492	0.06
493	0.07
494	0.07

W4JPA1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer