Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HDC5

Protein Details
Accession C1HDC5    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
180-203WMLNQRRGKNGRRRQGIKRKSALNHydrophilic
741-761GGVSKHIRRKHLQHIKPSDTIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
185-199RRGKNGRRRQGIKRK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021842  DUF3435  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
KEGG pbl:PAAG_08766  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11917  DUF3435  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MARRRGSVVPSPIVSDDSDDSDESMMDTDSDVDSDASGETDITTPIHHGDGKKEKEKEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEKEEEEEEEEEKEDEQQDIDDLAELLTENNHSPEHYLNMMQTIDLSRTECVNYAIGTLALQDRIRQEWLSYCKFLKSDAKAMYQQLDYRVLFTFFEWMLNQRRGKNGRRRQGIKRKSALNTYWKNFRTVYELEMHEKIDKDTSRRIVKNGIPFLVKKYRLSNKPRPKTTVYLDDLIRVVETTVTTTKKKFGHGRLRISLILYFQLAGFSANRPQALLSLCYRHIKVTLIKDPEGGPNNILIEFTTEFTKQFLGEKEETEFVIPEIIFDPSLILSPQVILLGLLFADGAFARLDGERILTSASQLLDLDIPEDTYQLEFNLDPGLSDIPILRRSERTLDGIRISDVEALTYNILLPWIKCIGKISTIREIVRPYSLRYGAGKALDNSGHISDAVRSLIFQHSDPKTFLKYYLHRKVDKDVRAVVQGLDPQKQIIRAACRMIRTVNPHRPQELTTEESSSVNRQPHIKELVERRDHLSKRLGRPIARHKGTVKYELYTRVSRELAGARQRARDKLLLEKQEKFDFEEPLREIKRQLLGIKISRKVKKSLDANTAVPPVHRRLISALLSLPRETLQDEMLRRTEAIDAVVDYCRFEEGETCRLPRDKRAGPKVFQEVKIEIHVPPPPPPPPSVRDIALKAVMEDHRPLYCFICLDKFSKHGGVSKHIRRKHLQHIKPSDTISCRRCDITLDHKMHLQSHAFSVHQTVT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.27
3 0.22
4 0.21
5 0.22
6 0.19
7 0.19
8 0.18
9 0.17
10 0.14
11 0.13
12 0.09
13 0.08
14 0.08
15 0.08
16 0.08
17 0.08
18 0.09
19 0.08
20 0.08
21 0.08
22 0.08
23 0.07
24 0.07
25 0.07
26 0.07
27 0.08
28 0.09
29 0.08
30 0.09
31 0.09
32 0.11
33 0.14
34 0.16
35 0.17
36 0.26
37 0.36
38 0.44
39 0.51
40 0.55
41 0.55
42 0.6
43 0.63
44 0.6
45 0.58
46 0.54
47 0.49
48 0.47
49 0.45
50 0.37
51 0.33
52 0.27
53 0.19
54 0.14
55 0.11
56 0.09
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.1
77 0.1
78 0.11
79 0.11
80 0.12
81 0.11
82 0.13
83 0.13
84 0.12
85 0.12
86 0.11
87 0.11
88 0.11
89 0.1
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.07
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.07
98 0.08
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.12
103 0.13
104 0.16
105 0.16
106 0.17
107 0.16
108 0.18
109 0.18
110 0.16
111 0.15
112 0.13
113 0.13
114 0.13
115 0.13
116 0.12
117 0.13
118 0.14
119 0.14
120 0.14
121 0.14
122 0.13
123 0.12
124 0.12
125 0.1
126 0.09
127 0.1
128 0.09
129 0.11
130 0.11
131 0.13
132 0.14
133 0.17
134 0.19
135 0.18
136 0.18
137 0.23
138 0.31
139 0.33
140 0.35
141 0.33
142 0.34
143 0.34
144 0.37
145 0.38
146 0.35
147 0.39
148 0.4
149 0.43
150 0.44
151 0.46
152 0.45
153 0.39
154 0.36
155 0.31
156 0.32
157 0.27
158 0.25
159 0.24
160 0.21
161 0.2
162 0.18
163 0.18
164 0.13
165 0.14
166 0.13
167 0.17
168 0.22
169 0.29
170 0.33
171 0.32
172 0.4
173 0.46
174 0.56
175 0.62
176 0.65
177 0.69
178 0.75
179 0.8
180 0.82
181 0.86
182 0.86
183 0.84
184 0.81
185 0.79
186 0.73
187 0.74
188 0.69
189 0.68
190 0.67
191 0.61
192 0.63
193 0.56
194 0.55
195 0.48
196 0.43
197 0.39
198 0.32
199 0.3
200 0.27
201 0.28
202 0.29
203 0.29
204 0.29
205 0.24
206 0.24
207 0.22
208 0.22
209 0.23
210 0.23
211 0.28
212 0.35
213 0.42
214 0.43
215 0.44
216 0.45
217 0.48
218 0.53
219 0.5
220 0.45
221 0.39
222 0.37
223 0.42
224 0.43
225 0.4
226 0.34
227 0.39
228 0.45
229 0.52
230 0.61
231 0.66
232 0.68
233 0.76
234 0.79
235 0.77
236 0.73
237 0.7
238 0.66
239 0.64
240 0.57
241 0.51
242 0.45
243 0.41
244 0.36
245 0.29
246 0.24
247 0.14
248 0.1
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.11
253 0.14
254 0.16
255 0.17
256 0.23
257 0.24
258 0.31
259 0.37
260 0.43
261 0.51
262 0.58
263 0.65
264 0.62
265 0.63
266 0.57
267 0.5
268 0.41
269 0.31
270 0.23
271 0.16
272 0.12
273 0.09
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.11
280 0.12
281 0.12
282 0.12
283 0.12
284 0.14
285 0.14
286 0.16
287 0.13
288 0.15
289 0.18
290 0.2
291 0.2
292 0.18
293 0.18
294 0.19
295 0.22
296 0.26
297 0.31
298 0.32
299 0.32
300 0.32
301 0.33
302 0.35
303 0.33
304 0.26
305 0.2
306 0.17
307 0.18
308 0.16
309 0.15
310 0.1
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.1
315 0.1
316 0.1
317 0.1
318 0.11
319 0.09
320 0.11
321 0.12
322 0.16
323 0.17
324 0.17
325 0.19
326 0.19
327 0.19
328 0.16
329 0.15
330 0.09
331 0.1
332 0.08
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.03
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.02
354 0.02
355 0.02
356 0.02
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.04
361 0.04
362 0.05
363 0.05
364 0.06
365 0.05
366 0.05
367 0.06
368 0.05
369 0.05
370 0.07
371 0.07
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.04
379 0.05
380 0.04
381 0.05
382 0.05
383 0.04
384 0.05
385 0.04
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.05
391 0.05
392 0.06
393 0.06
394 0.05
395 0.06
396 0.06
397 0.07
398 0.1
399 0.11
400 0.11
401 0.12
402 0.14
403 0.18
404 0.19
405 0.21
406 0.21
407 0.22
408 0.22
409 0.21
410 0.2
411 0.17
412 0.15
413 0.13
414 0.1
415 0.08
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.06
420 0.06
421 0.04
422 0.05
423 0.05
424 0.04
425 0.06
426 0.09
427 0.09
428 0.09
429 0.12
430 0.12
431 0.18
432 0.22
433 0.23
434 0.27
435 0.3
436 0.31
437 0.31
438 0.32
439 0.27
440 0.28
441 0.25
442 0.21
443 0.23
444 0.23
445 0.22
446 0.22
447 0.23
448 0.2
449 0.21
450 0.2
451 0.16
452 0.17
453 0.16
454 0.15
455 0.14
456 0.12
457 0.11
458 0.09
459 0.09
460 0.07
461 0.08
462 0.08
463 0.06
464 0.06
465 0.08
466 0.1
467 0.11
468 0.11
469 0.17
470 0.19
471 0.21
472 0.23
473 0.23
474 0.23
475 0.23
476 0.25
477 0.24
478 0.29
479 0.37
480 0.46
481 0.51
482 0.52
483 0.53
484 0.59
485 0.61
486 0.59
487 0.52
488 0.46
489 0.41
490 0.39
491 0.38
492 0.3
493 0.22
494 0.22
495 0.2
496 0.19
497 0.17
498 0.16
499 0.17
500 0.17
501 0.17
502 0.17
503 0.2
504 0.2
505 0.25
506 0.27
507 0.27
508 0.27
509 0.28
510 0.28
511 0.31
512 0.39
513 0.44
514 0.48
515 0.49
516 0.5
517 0.49
518 0.46
519 0.43
520 0.38
521 0.32
522 0.26
523 0.26
524 0.25
525 0.24
526 0.24
527 0.22
528 0.22
529 0.2
530 0.21
531 0.23
532 0.24
533 0.29
534 0.33
535 0.31
536 0.33
537 0.39
538 0.47
539 0.48
540 0.48
541 0.46
542 0.5
543 0.5
544 0.48
545 0.48
546 0.46
547 0.49
548 0.56
549 0.57
550 0.51
551 0.58
552 0.65
553 0.66
554 0.61
555 0.58
556 0.52
557 0.56
558 0.57
559 0.56
560 0.47
561 0.39
562 0.39
563 0.41
564 0.43
565 0.37
566 0.35
567 0.32
568 0.3
569 0.28
570 0.28
571 0.26
572 0.27
573 0.31
574 0.35
575 0.34
576 0.4
577 0.43
578 0.43
579 0.44
580 0.41
581 0.36
582 0.41
583 0.46
584 0.49
585 0.5
586 0.53
587 0.53
588 0.53
589 0.52
590 0.47
591 0.42
592 0.38
593 0.34
594 0.35
595 0.33
596 0.37
597 0.38
598 0.33
599 0.32
600 0.31
601 0.34
602 0.31
603 0.32
604 0.29
605 0.33
606 0.4
607 0.45
608 0.48
609 0.52
610 0.55
611 0.56
612 0.57
613 0.56
614 0.58
615 0.58
616 0.6
617 0.6
618 0.58
619 0.57
620 0.54
621 0.52
622 0.43
623 0.37
624 0.32
625 0.28
626 0.29
627 0.27
628 0.24
629 0.24
630 0.3
631 0.3
632 0.28
633 0.28
634 0.27
635 0.28
636 0.27
637 0.25
638 0.19
639 0.18
640 0.17
641 0.15
642 0.14
643 0.18
644 0.2
645 0.23
646 0.24
647 0.24
648 0.23
649 0.23
650 0.22
651 0.17
652 0.16
653 0.13
654 0.12
655 0.13
656 0.15
657 0.14
658 0.12
659 0.12
660 0.12
661 0.11
662 0.1
663 0.14
664 0.16
665 0.24
666 0.27
667 0.28
668 0.32
669 0.37
670 0.39
671 0.42
672 0.47
673 0.48
674 0.55
675 0.65
676 0.68
677 0.67
678 0.72
679 0.74
680 0.72
681 0.67
682 0.61
683 0.53
684 0.47
685 0.47
686 0.41
687 0.31
688 0.28
689 0.29
690 0.26
691 0.29
692 0.32
693 0.33
694 0.34
695 0.37
696 0.38
697 0.38
698 0.42
699 0.41
700 0.38
701 0.4
702 0.4
703 0.41
704 0.39
705 0.34
706 0.29
707 0.31
708 0.3
709 0.27
710 0.27
711 0.25
712 0.23
713 0.24
714 0.26
715 0.23
716 0.23
717 0.21
718 0.21
719 0.25
720 0.25
721 0.27
722 0.29
723 0.3
724 0.32
725 0.35
726 0.35
727 0.34
728 0.36
729 0.42
730 0.49
731 0.56
732 0.62
733 0.63
734 0.68
735 0.71
736 0.75
737 0.77
738 0.78
739 0.76
740 0.77
741 0.81
742 0.8
743 0.77
744 0.71
745 0.68
746 0.63
747 0.64
748 0.58
749 0.53
750 0.49
751 0.47
752 0.44
753 0.41
754 0.41
755 0.42
756 0.48
757 0.48
758 0.47
759 0.49
760 0.5
761 0.49
762 0.47
763 0.4
764 0.32
765 0.31
766 0.33
767 0.29
768 0.27