Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4KHV0

Protein Details
Accession W4KHV0    Localization Confidence Low Confidence Score 5.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1061-1081EELYREGRKHQWKPPPAPGATHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 13.5, cyto_mito 9.833, cyto 5, cyto_nucl 4.833, nucl 3.5, plas 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR030843  PAN2  
IPR028881  PAN2_UCH_dom  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR028889  USP_dom  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0031251  C:PAN complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004535  F:poly(A)-specific ribonuclease activity  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
KEGG hir:HETIRDRAFT_432176  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00929  RNase_T  
PF13423  UCH_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50235  USP_3  
CDD cd06143  PAN2_exo  
Amino Acid Sequences MSTAAYRPTVPITHQSQTFPQPITALCFDPVSDTLWSGTNTGHVVAYYTPRGMRGVNFPVGGNLAVKKVIADENYVRASGVASEGIGSWNKGGVNKWYHRPPAATVTTFSNTSGSSNLLAVATSALELLLLNPLTGSVVRQSIFSSPVTQLHYSHSFLLSGDANGFVRCHDPRTGLRRDGGAEATAKAHESEIQGLQSSGNCVYTIGWGLRQSRPIPDPLVKVYDMRVMRPLPPVPFPAGPAFINSLPRRSSSIVVTSNQGLVNIVDTSNPTNATEFYQLDTQVPISSVAVSPTGAYMAFGDADGVIHLMTAADDEGVHPFNGFEGQPVEWADTPEPLPDIQWTDSTPLNSIGLPYYGSLLLSSWTPQFEAPPQYSSAPEKIPQQVLNTMKMNDNIAYAPLPRELKGRRNMVATAPRKDQARFRSGKLSRPEAELTSSANEARYGLDDVPPRYAKVEIAYSKFGVEDFDFAFYNRTEFSGLETHILNSYTNPILQVMHYSYPIRCLAKSHITTNCTREHCLLCELGFVTRMLEDARGTNCQSSNFCKTVGVLAHIENKIELVDYGRDSIYMDYAHMIQAFHRFLIDKIGSEGNMFSSNPSIVPSALPAVAPISQLLGLNSKNIIMCTSCKAVREKEHNTHIVDLVYPRKAVSTDSNSAMDFASILYTSLVRRNGYKATCQKCKQFVNFESVHSIPTRNLPPILALNANVHSEESLEYWLDSRKTTFLKPRVQLRGQTEGIDDFQSAIYELRAMVVKVVAKDKRSHLVAVVKVPEAEGLEDRQSPWYVFNDFVVHNISEEEALSFPGKWKVPTILYMERVDMRDRLDFSGLPDQIDASILSHDTSISSKRDENLIKHDPLRPDELPRPGTLVAIDAEFVSMQQEETEYRSDGTKKILRPARLSLARVSVLRGDGPRQGVPFIDDHIHTSEVIVDYLTEWSGIKFGDLDPNISPYTLTPLKVVYKKLRLLVDRGCVFIGHGLSKDFRIINIFVPPEQVIDTVDLYFLNSRQRRLSLRFLSWFVLGEQIQQDTHDSIEDARSALMLYKAYHEFEERGVFDEKLEELYREGRKHQWKPPPAPGATVDAPSLALTPAATPNSIQFSPFQSNLLPTPGGFQRAVQPPNFFTMTPPTRYNGPAPWT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.41
3 0.43
4 0.48
5 0.5
6 0.43
7 0.38
8 0.34
9 0.32
10 0.35
11 0.32
12 0.27
13 0.23
14 0.22
15 0.21
16 0.22
17 0.22
18 0.18
19 0.16
20 0.15
21 0.15
22 0.18
23 0.18
24 0.16
25 0.15
26 0.15
27 0.15
28 0.15
29 0.14
30 0.11
31 0.12
32 0.14
33 0.19
34 0.18
35 0.2
36 0.2
37 0.21
38 0.22
39 0.23
40 0.24
41 0.27
42 0.31
43 0.32
44 0.32
45 0.31
46 0.31
47 0.3
48 0.28
49 0.22
50 0.17
51 0.14
52 0.14
53 0.13
54 0.12
55 0.14
56 0.17
57 0.16
58 0.2
59 0.22
60 0.27
61 0.29
62 0.29
63 0.26
64 0.22
65 0.21
66 0.16
67 0.15
68 0.09
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.11
73 0.11
74 0.11
75 0.1
76 0.12
77 0.13
78 0.15
79 0.17
80 0.23
81 0.31
82 0.37
83 0.45
84 0.51
85 0.55
86 0.57
87 0.58
88 0.54
89 0.54
90 0.54
91 0.47
92 0.41
93 0.41
94 0.4
95 0.37
96 0.34
97 0.26
98 0.2
99 0.19
100 0.19
101 0.14
102 0.13
103 0.12
104 0.12
105 0.11
106 0.1
107 0.09
108 0.08
109 0.07
110 0.06
111 0.05
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.05
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.08
122 0.09
123 0.09
124 0.08
125 0.12
126 0.12
127 0.13
128 0.14
129 0.16
130 0.18
131 0.18
132 0.19
133 0.18
134 0.22
135 0.26
136 0.26
137 0.25
138 0.29
139 0.32
140 0.3
141 0.3
142 0.26
143 0.22
144 0.21
145 0.22
146 0.17
147 0.14
148 0.13
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.1
154 0.14
155 0.15
156 0.18
157 0.19
158 0.23
159 0.31
160 0.39
161 0.46
162 0.45
163 0.46
164 0.45
165 0.44
166 0.42
167 0.36
168 0.3
169 0.24
170 0.21
171 0.2
172 0.17
173 0.16
174 0.13
175 0.12
176 0.13
177 0.13
178 0.16
179 0.16
180 0.16
181 0.16
182 0.16
183 0.16
184 0.14
185 0.15
186 0.12
187 0.11
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.11
192 0.13
193 0.11
194 0.13
195 0.16
196 0.2
197 0.23
198 0.28
199 0.28
200 0.32
201 0.33
202 0.34
203 0.36
204 0.37
205 0.37
206 0.35
207 0.38
208 0.33
209 0.31
210 0.29
211 0.31
212 0.27
213 0.24
214 0.26
215 0.24
216 0.26
217 0.31
218 0.33
219 0.29
220 0.31
221 0.32
222 0.31
223 0.3
224 0.3
225 0.27
226 0.26
227 0.23
228 0.22
229 0.23
230 0.2
231 0.27
232 0.26
233 0.27
234 0.26
235 0.27
236 0.29
237 0.29
238 0.29
239 0.24
240 0.3
241 0.3
242 0.3
243 0.31
244 0.28
245 0.28
246 0.25
247 0.22
248 0.16
249 0.12
250 0.12
251 0.1
252 0.09
253 0.07
254 0.09
255 0.1
256 0.11
257 0.12
258 0.11
259 0.11
260 0.12
261 0.15
262 0.17
263 0.16
264 0.16
265 0.18
266 0.18
267 0.18
268 0.17
269 0.15
270 0.12
271 0.12
272 0.11
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.08
279 0.08
280 0.07
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.04
293 0.04
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.03
301 0.03
302 0.04
303 0.06
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.09
310 0.08
311 0.08
312 0.09
313 0.09
314 0.1
315 0.11
316 0.13
317 0.12
318 0.13
319 0.13
320 0.13
321 0.13
322 0.12
323 0.12
324 0.1
325 0.1
326 0.1
327 0.12
328 0.12
329 0.13
330 0.13
331 0.14
332 0.16
333 0.16
334 0.16
335 0.14
336 0.13
337 0.12
338 0.12
339 0.11
340 0.09
341 0.09
342 0.08
343 0.08
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.08
354 0.08
355 0.1
356 0.13
357 0.18
358 0.18
359 0.19
360 0.21
361 0.21
362 0.23
363 0.24
364 0.23
365 0.2
366 0.21
367 0.23
368 0.26
369 0.28
370 0.28
371 0.27
372 0.31
373 0.31
374 0.34
375 0.31
376 0.29
377 0.27
378 0.26
379 0.25
380 0.19
381 0.17
382 0.13
383 0.12
384 0.11
385 0.1
386 0.1
387 0.12
388 0.13
389 0.13
390 0.19
391 0.22
392 0.29
393 0.36
394 0.4
395 0.39
396 0.4
397 0.41
398 0.41
399 0.46
400 0.43
401 0.41
402 0.38
403 0.39
404 0.39
405 0.39
406 0.4
407 0.37
408 0.41
409 0.4
410 0.39
411 0.47
412 0.47
413 0.53
414 0.52
415 0.52
416 0.44
417 0.45
418 0.44
419 0.34
420 0.34
421 0.27
422 0.23
423 0.18
424 0.17
425 0.13
426 0.12
427 0.11
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.09
432 0.09
433 0.13
434 0.15
435 0.16
436 0.21
437 0.21
438 0.2
439 0.19
440 0.19
441 0.16
442 0.14
443 0.19
444 0.18
445 0.2
446 0.22
447 0.21
448 0.2
449 0.2
450 0.18
451 0.13
452 0.1
453 0.09
454 0.08
455 0.09
456 0.09
457 0.09
458 0.11
459 0.1
460 0.1
461 0.09
462 0.09
463 0.08
464 0.08
465 0.11
466 0.12
467 0.12
468 0.13
469 0.13
470 0.13
471 0.13
472 0.13
473 0.1
474 0.08
475 0.1
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.08
480 0.08
481 0.08
482 0.1
483 0.09
484 0.1
485 0.11
486 0.12
487 0.11
488 0.14
489 0.17
490 0.16
491 0.14
492 0.16
493 0.19
494 0.26
495 0.28
496 0.3
497 0.31
498 0.33
499 0.36
500 0.37
501 0.39
502 0.32
503 0.32
504 0.3
505 0.27
506 0.26
507 0.25
508 0.22
509 0.15
510 0.14
511 0.13
512 0.1
513 0.1
514 0.08
515 0.07
516 0.06
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.06
521 0.07
522 0.09
523 0.1
524 0.11
525 0.12
526 0.13
527 0.14
528 0.15
529 0.18
530 0.22
531 0.21
532 0.21
533 0.19
534 0.18
535 0.2
536 0.18
537 0.16
538 0.12
539 0.12
540 0.17
541 0.17
542 0.17
543 0.14
544 0.13
545 0.11
546 0.1
547 0.09
548 0.05
549 0.06
550 0.06
551 0.07
552 0.07
553 0.07
554 0.08
555 0.08
556 0.07
557 0.06
558 0.06
559 0.06
560 0.06
561 0.06
562 0.06
563 0.06
564 0.06
565 0.1
566 0.1
567 0.09
568 0.1
569 0.1
570 0.09
571 0.14
572 0.14
573 0.1
574 0.12
575 0.12
576 0.12
577 0.12
578 0.12
579 0.08
580 0.08
581 0.08
582 0.07
583 0.07
584 0.07
585 0.07
586 0.08
587 0.07
588 0.06
589 0.07
590 0.07
591 0.07
592 0.07
593 0.07
594 0.06
595 0.06
596 0.06
597 0.06
598 0.06
599 0.05
600 0.06
601 0.06
602 0.06
603 0.08
604 0.07
605 0.08
606 0.08
607 0.08
608 0.08
609 0.08
610 0.08
611 0.07
612 0.08
613 0.1
614 0.13
615 0.14
616 0.16
617 0.19
618 0.22
619 0.28
620 0.35
621 0.39
622 0.43
623 0.48
624 0.49
625 0.47
626 0.44
627 0.38
628 0.3
629 0.24
630 0.2
631 0.17
632 0.14
633 0.13
634 0.12
635 0.11
636 0.11
637 0.13
638 0.16
639 0.19
640 0.22
641 0.24
642 0.24
643 0.24
644 0.24
645 0.22
646 0.16
647 0.1
648 0.07
649 0.05
650 0.04
651 0.05
652 0.04
653 0.05
654 0.06
655 0.1
656 0.12
657 0.12
658 0.13
659 0.16
660 0.21
661 0.22
662 0.3
663 0.35
664 0.4
665 0.48
666 0.51
667 0.55
668 0.57
669 0.62
670 0.58
671 0.58
672 0.53
673 0.51
674 0.48
675 0.43
676 0.39
677 0.33
678 0.29
679 0.21
680 0.21
681 0.14
682 0.18
683 0.19
684 0.16
685 0.16
686 0.15
687 0.16
688 0.17
689 0.18
690 0.14
691 0.12
692 0.12
693 0.13
694 0.14
695 0.12
696 0.11
697 0.09
698 0.09
699 0.08
700 0.07
701 0.07
702 0.06
703 0.06
704 0.07
705 0.1
706 0.1
707 0.1
708 0.11
709 0.13
710 0.16
711 0.21
712 0.29
713 0.34
714 0.42
715 0.46
716 0.54
717 0.59
718 0.59
719 0.61
720 0.57
721 0.56
722 0.49
723 0.44
724 0.36
725 0.29
726 0.27
727 0.21
728 0.16
729 0.1
730 0.09
731 0.08
732 0.08
733 0.07
734 0.06
735 0.05
736 0.05
737 0.06
738 0.06
739 0.06
740 0.06
741 0.07
742 0.09
743 0.1
744 0.17
745 0.19
746 0.2
747 0.24
748 0.27
749 0.31
750 0.31
751 0.3
752 0.28
753 0.32
754 0.32
755 0.32
756 0.31
757 0.26
758 0.24
759 0.23
760 0.2
761 0.14
762 0.13
763 0.1
764 0.09
765 0.11
766 0.11
767 0.12
768 0.14
769 0.14
770 0.13
771 0.14
772 0.15
773 0.15
774 0.15
775 0.15
776 0.16
777 0.15
778 0.16
779 0.17
780 0.14
781 0.13
782 0.13
783 0.12
784 0.09
785 0.09
786 0.09
787 0.06
788 0.07
789 0.07
790 0.07
791 0.09
792 0.14
793 0.15
794 0.15
795 0.17
796 0.2
797 0.2
798 0.24
799 0.29
800 0.29
801 0.31
802 0.32
803 0.31
804 0.3
805 0.3
806 0.28
807 0.23
808 0.2
809 0.2
810 0.21
811 0.21
812 0.2
813 0.19
814 0.21
815 0.27
816 0.25
817 0.22
818 0.21
819 0.19
820 0.17
821 0.18
822 0.14
823 0.06
824 0.07
825 0.07
826 0.07
827 0.07
828 0.07
829 0.07
830 0.08
831 0.11
832 0.13
833 0.15
834 0.17
835 0.18
836 0.26
837 0.29
838 0.31
839 0.36
840 0.4
841 0.41
842 0.43
843 0.47
844 0.43
845 0.42
846 0.45
847 0.38
848 0.38
849 0.4
850 0.44
851 0.41
852 0.37
853 0.38
854 0.31
855 0.3
856 0.24
857 0.19
858 0.13
859 0.11
860 0.11
861 0.07
862 0.07
863 0.06
864 0.06
865 0.06
866 0.05
867 0.05
868 0.05
869 0.06
870 0.07
871 0.09
872 0.12
873 0.11
874 0.12
875 0.15
876 0.17
877 0.18
878 0.25
879 0.29
880 0.29
881 0.38
882 0.44
883 0.45
884 0.48
885 0.52
886 0.54
887 0.53
888 0.52
889 0.46
890 0.43
891 0.41
892 0.36
893 0.33
894 0.25
895 0.21
896 0.21
897 0.2
898 0.18
899 0.2
900 0.23
901 0.24
902 0.22
903 0.22
904 0.2
905 0.2
906 0.18
907 0.17
908 0.16
909 0.15
910 0.16
911 0.18
912 0.18
913 0.16
914 0.16
915 0.16
916 0.14
917 0.13
918 0.11
919 0.08
920 0.08
921 0.09
922 0.09
923 0.07
924 0.06
925 0.06
926 0.07
927 0.07
928 0.07
929 0.07
930 0.08
931 0.16
932 0.16
933 0.19
934 0.18
935 0.22
936 0.22
937 0.21
938 0.2
939 0.12
940 0.19
941 0.2
942 0.2
943 0.17
944 0.21
945 0.28
946 0.32
947 0.39
948 0.4
949 0.45
950 0.48
951 0.53
952 0.56
953 0.52
954 0.54
955 0.53
956 0.53
957 0.46
958 0.44
959 0.38
960 0.31
961 0.29
962 0.26
963 0.22
964 0.14
965 0.14
966 0.15
967 0.16
968 0.17
969 0.2
970 0.17
971 0.16
972 0.18
973 0.19
974 0.19
975 0.24
976 0.24
977 0.21
978 0.23
979 0.23
980 0.2
981 0.19
982 0.17
983 0.13
984 0.13
985 0.14
986 0.11
987 0.11
988 0.1
989 0.1
990 0.12
991 0.12
992 0.21
993 0.23
994 0.26
995 0.29
996 0.35
997 0.41
998 0.45
999 0.54
1000 0.51
1001 0.55
1002 0.56
1003 0.55
1004 0.52
1005 0.45
1006 0.4
1007 0.31
1008 0.28
1009 0.22
1010 0.2
1011 0.19
1012 0.18
1013 0.18
1014 0.17
1015 0.19
1016 0.15
1017 0.15
1018 0.13
1019 0.12
1020 0.12
1021 0.14
1022 0.14
1023 0.12
1024 0.11
1025 0.11
1026 0.1
1027 0.11
1028 0.12
1029 0.12
1030 0.12
1031 0.16
1032 0.19
1033 0.2
1034 0.22
1035 0.23
1036 0.22
1037 0.23
1038 0.28
1039 0.24
1040 0.25
1041 0.26
1042 0.25
1043 0.22
1044 0.23
1045 0.2
1046 0.19
1047 0.2
1048 0.17
1049 0.16
1050 0.24
1051 0.3
1052 0.31
1053 0.34
1054 0.4
1055 0.49
1056 0.56
1057 0.64
1058 0.67
1059 0.71
1060 0.76
1061 0.82
1062 0.82
1063 0.73
1064 0.69
1065 0.62
1066 0.58
1067 0.5
1068 0.43
1069 0.33
1070 0.24
1071 0.23
1072 0.19
1073 0.17
1074 0.1
1075 0.08
1076 0.07
1077 0.09
1078 0.13
1079 0.14
1080 0.14
1081 0.14
1082 0.17
1083 0.23
1084 0.23
1085 0.22
1086 0.2
1087 0.25
1088 0.31
1089 0.31
1090 0.3
1091 0.25
1092 0.28
1093 0.29
1094 0.31
1095 0.25
1096 0.19
1097 0.23
1098 0.25
1099 0.27
1100 0.24
1101 0.23
1102 0.28
1103 0.36
1104 0.41
1105 0.39
1106 0.4
1107 0.38
1108 0.44
1109 0.44
1110 0.35
1111 0.3
1112 0.36
1113 0.38
1114 0.39
1115 0.4
1116 0.37
1117 0.39
1118 0.43
1119 0.44