FuNGI

C1H7Y2

Protein Details

Accession

C1H7Y2

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
7-70	DIDSVTPSPERKRKNKEKDGHSSKKRKHESTTIAQTAVDEISPKAKKTERKHKHNKDHEYLDES	Hydrophilic
74-99	LPDIPNARSKKTKKHKHHAEQAADND	Hydrophilic
459-479	EALGEVRGKEKKKKKSKKAAS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
16-34	ERKRKNKEKDGHSSKKRKH
50-59	KAKKTERKHK
82-89	SKKTKKHK
465-479	RGKEKKKKKSKKAAS

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
KEGG	pbl:PAAG_06873 -
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MSMDAMDIDSVTPSPERKRKNKEKDGHSSKKRKHESTTIAQTAVDEISPKAKKTERKHKHNKDHEYLDESAQTLPDIPNARSKKTKKHKHHAEQAADNDDYVDYDKEEGDQQSPQSPTATRKPLAKASTSQLESISVDPTASSPFYLITATLYVPLSPISISPTHALSSLQAEHLAPLLLTYYPPFRGIVLAYSNASISSIPPSFPYSKAGSTATHNPDEELNPQPLTLATSAGEYGVLFVYMTATFLVFRPERGQQLEGWINVQSDGFLGAVVYNLFSVGIERRRLPADWQWVAPGEGSSATPKSNNTSISAAVTDDDDDEDSDFDSDKENFRPLSTRSLAAVLDLSPHSQYNSTHNDPIQLSANPDEAATAGFFRTRSGRRVRGMIRFRVRDVDVIPGAEPDKAFLSIEGTMLSAKEEAQLVEEERKRAVFTPLSAAATMAGGLGEGSTVAGEADGEALGEVRGKEKKKKKSKKAAS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.32
3	0.42
4	0.52
5	0.63
6	0.73
7	0.82
8	0.89
9	0.89
10	0.91
11	0.92
12	0.93
13	0.93
14	0.92
15	0.92
16	0.89
17	0.9
18	0.9
19	0.85
20	0.82
21	0.81
22	0.79
23	0.79
24	0.81
25	0.73
26	0.64
27	0.57
28	0.49
29	0.41
30	0.32
31	0.22
32	0.13
33	0.1
34	0.18
35	0.21
36	0.21
37	0.26
38	0.32
39	0.41
40	0.5
41	0.61
42	0.63
43	0.72
44	0.83
45	0.88
46	0.93
47	0.94
48	0.94
49	0.92
50	0.89
51	0.82
52	0.76
53	0.67
54	0.58
55	0.48
56	0.39
57	0.3
58	0.23
59	0.18
60	0.14
61	0.12
62	0.15
63	0.17
64	0.17
65	0.26
66	0.29
67	0.34
68	0.42
69	0.48
70	0.54
71	0.62
72	0.72
73	0.73
74	0.81
75	0.88
76	0.89
77	0.93
78	0.92
79	0.89
80	0.85
81	0.79
82	0.72
83	0.61
84	0.5
85	0.39
86	0.29
87	0.22
88	0.17
89	0.13
90	0.08
91	0.09
92	0.09
93	0.1
94	0.13
95	0.14
96	0.14
97	0.15
98	0.16
99	0.21
100	0.22
101	0.22
102	0.21
103	0.22
104	0.26
105	0.32
106	0.37
107	0.34
108	0.39
109	0.42
110	0.48
111	0.48
112	0.46
113	0.41
114	0.4
115	0.45
116	0.41
117	0.37
118	0.3
119	0.28
120	0.26
121	0.23
122	0.19
123	0.11
124	0.1
125	0.09
126	0.09
127	0.09
128	0.08
129	0.08
130	0.07
131	0.07
132	0.08
133	0.08
134	0.07
135	0.06
136	0.07
137	0.07
138	0.09
139	0.09
140	0.08
141	0.08
142	0.08
143	0.07
144	0.07
145	0.07
146	0.08
147	0.09
148	0.1
149	0.11
150	0.12
151	0.12
152	0.13
153	0.12
154	0.1
155	0.12
156	0.12
157	0.11
158	0.11
159	0.1
160	0.1
161	0.1
162	0.09
163	0.06
164	0.05
165	0.05
166	0.05
167	0.05
168	0.06
169	0.07
170	0.08
171	0.09
172	0.09
173	0.09
174	0.09
175	0.1
176	0.11
177	0.11
178	0.11
179	0.11
180	0.11
181	0.1
182	0.09
183	0.09
184	0.07
185	0.06
186	0.08
187	0.08
188	0.08
189	0.1
190	0.13
191	0.15
192	0.16
193	0.19
194	0.18
195	0.18
196	0.2
197	0.2
198	0.18
199	0.2
200	0.27
201	0.27
202	0.26
203	0.26
204	0.24
205	0.24
206	0.24
207	0.23
208	0.18
209	0.16
210	0.14
211	0.13
212	0.13
213	0.12
214	0.12
215	0.09
216	0.07
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.06
221	0.06
222	0.04
223	0.04
224	0.04
225	0.04
226	0.03
227	0.03
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.04
233	0.04
234	0.05
235	0.09
236	0.08
237	0.09
238	0.11
239	0.14
240	0.16
241	0.18
242	0.19
243	0.15
244	0.2
245	0.22
246	0.19
247	0.18
248	0.16
249	0.14
250	0.14
251	0.13
252	0.08
253	0.05
254	0.06
255	0.05
256	0.04
257	0.04
258	0.03
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.03
263	0.03
264	0.03
265	0.03
266	0.04
267	0.07
268	0.11
269	0.13
270	0.14
271	0.16
272	0.18
273	0.19
274	0.21
275	0.25
276	0.3
277	0.3
278	0.29
279	0.28
280	0.27
281	0.27
282	0.23
283	0.17
284	0.09
285	0.07
286	0.07
287	0.08
288	0.09
289	0.09
290	0.1
291	0.1
292	0.14
293	0.17
294	0.17
295	0.18
296	0.19
297	0.19
298	0.19
299	0.18
300	0.15
301	0.12
302	0.11
303	0.09
304	0.07
305	0.07
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.08
315	0.09
316	0.11
317	0.13
318	0.16
319	0.16
320	0.16
321	0.2
322	0.2
323	0.27
324	0.26
325	0.26
326	0.24
327	0.25
328	0.24
329	0.21
330	0.19
331	0.11
332	0.12
333	0.11
334	0.11
335	0.1
336	0.1
337	0.11
338	0.12
339	0.13
340	0.17
341	0.25
342	0.28
343	0.31
344	0.31
345	0.34
346	0.33
347	0.34
348	0.31
349	0.24
350	0.22
351	0.2
352	0.21
353	0.17
354	0.16
355	0.14
356	0.11
357	0.1
358	0.08
359	0.07
360	0.06
361	0.08
362	0.08
363	0.09
364	0.16
365	0.19
366	0.26
367	0.35
368	0.42
369	0.44
370	0.53
371	0.58
372	0.61
373	0.65
374	0.68
375	0.69
376	0.65
377	0.63
378	0.6
379	0.55
380	0.48
381	0.41
382	0.38
383	0.29
384	0.27
385	0.25
386	0.21
387	0.2
388	0.18
389	0.17
390	0.12
391	0.12
392	0.12
393	0.12
394	0.1
395	0.12
396	0.12
397	0.12
398	0.11
399	0.1
400	0.09
401	0.09
402	0.1
403	0.08
404	0.07
405	0.09
406	0.09
407	0.09
408	0.11
409	0.13
410	0.14
411	0.23
412	0.26
413	0.26
414	0.27
415	0.27
416	0.27
417	0.27
418	0.31
419	0.26
420	0.25
421	0.3
422	0.32
423	0.33
424	0.31
425	0.29
426	0.23
427	0.19
428	0.17
429	0.1
430	0.06
431	0.04
432	0.04
433	0.04
434	0.03
435	0.03
436	0.03
437	0.03
438	0.03
439	0.03
440	0.03
441	0.03
442	0.04
443	0.04
444	0.04
445	0.04
446	0.04
447	0.05
448	0.05
449	0.08
450	0.08
451	0.12
452	0.2
453	0.26
454	0.36
455	0.46
456	0.57
457	0.66
458	0.77
459	0.83

C1H7Y2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer