Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4JS49

Protein Details
Accession W4JS49    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-61VTPQRIPRAHRHQHHLQNYFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, plas 6, mito 1, cyto 1, vacu 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR018957  Znf_C3HC4_RING-type  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG hir:HETIRDRAFT_390355  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00097  zf-C3HC4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
Amino Acid Sequences MMPITTTPNKHSFYTPNVPASAPATPAYTRSAKSNTDGPPPVTPQRIPRAHRHQHHLQNYFSNSPSTPASTLSTPYTPLSLRNVWSNDSSALTTPVSVASSKRTGLSVSPESSANGFGGDAGRGEIANDWRSRAGENGIRVASVNGSKDEGAYMRLILVSLNTRADPASEPPIPRLSQRLILLSIAQMVTLLPPPFFSTQRRPRSQTLAHQSQLPLSPQVQSQPHTPGRRTLAALNTPPPLASNVNRLKAKGSLTDPAYPRRRQPFGQTRTDLFDIDENDPYPTMFSPIQRLAIPLALNGPFDRNGFDDMTFPRIPAPALYPFERPNDPLKTDDSCSVCGQTSSSLAVLDPCSHVLCSACLTSALNIVGEKDMECAVCKIGVAAFHLRSSGAKGASPPNTAHGASQHSNFGTNDADGPFGHFNFFNVPETASPHGFGGVRHTPARPGELPVLRIDNVPWDITPPAIVAWLRHPVRRVHVLLDRKGKTFSHAFVEMVDEEAARQALRTAQNSVLGKGKRARGVTVTRSGQEELMKALFPSWQGRFDGVHPSLAGLSNEQIYAVLENGLISDSELKALLHLIQSPDSHFLKVPSLPFHSLISILSKFPANQDGRIYSGSSKEILFEITITALQILILRNTDESTACDPGLLAQLSQAAVACQAFSREQIANLASLANTSQHLLLPRSPASSISALSSHTPDHLSQRHPNISRASVQAQSNQALQRGPFDVLAREFGVDSHLSTKNASMSILQPSLDQGSPSKAFFSLSVWTLFKYRSPSLLALSCFMLSLLSSSLSIMLLFSCLLGFIGRFGGCFCVLLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.54
3 0.51
4 0.49
5 0.47
6 0.44
7 0.41
8 0.34
9 0.27
10 0.22
11 0.21
12 0.19
13 0.21
14 0.25
15 0.26
16 0.25
17 0.29
18 0.34
19 0.33
20 0.36
21 0.43
22 0.42
23 0.46
24 0.49
25 0.46
26 0.47
27 0.5
28 0.53
29 0.5
30 0.49
31 0.48
32 0.54
33 0.6
34 0.59
35 0.64
36 0.68
37 0.73
38 0.78
39 0.78
40 0.78
41 0.8
42 0.85
43 0.8
44 0.73
45 0.7
46 0.67
47 0.62
48 0.53
49 0.46
50 0.36
51 0.34
52 0.32
53 0.27
54 0.23
55 0.21
56 0.23
57 0.22
58 0.24
59 0.25
60 0.24
61 0.23
62 0.23
63 0.24
64 0.21
65 0.22
66 0.26
67 0.26
68 0.27
69 0.32
70 0.34
71 0.34
72 0.35
73 0.34
74 0.29
75 0.27
76 0.27
77 0.2
78 0.2
79 0.18
80 0.16
81 0.14
82 0.13
83 0.13
84 0.12
85 0.12
86 0.15
87 0.18
88 0.19
89 0.2
90 0.2
91 0.2
92 0.21
93 0.28
94 0.28
95 0.27
96 0.27
97 0.27
98 0.27
99 0.27
100 0.25
101 0.17
102 0.12
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.08
107 0.08
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.08
112 0.1
113 0.13
114 0.18
115 0.19
116 0.2
117 0.21
118 0.22
119 0.22
120 0.22
121 0.24
122 0.23
123 0.25
124 0.28
125 0.27
126 0.26
127 0.26
128 0.24
129 0.2
130 0.19
131 0.18
132 0.14
133 0.15
134 0.15
135 0.15
136 0.16
137 0.14
138 0.12
139 0.11
140 0.1
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.09
146 0.1
147 0.11
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.14
153 0.14
154 0.15
155 0.2
156 0.22
157 0.23
158 0.26
159 0.3
160 0.3
161 0.29
162 0.31
163 0.28
164 0.29
165 0.3
166 0.3
167 0.26
168 0.26
169 0.25
170 0.2
171 0.19
172 0.13
173 0.11
174 0.08
175 0.07
176 0.08
177 0.11
178 0.11
179 0.09
180 0.09
181 0.13
182 0.16
183 0.19
184 0.24
185 0.31
186 0.41
187 0.51
188 0.58
189 0.6
190 0.62
191 0.68
192 0.68
193 0.68
194 0.67
195 0.65
196 0.59
197 0.56
198 0.52
199 0.46
200 0.42
201 0.34
202 0.26
203 0.19
204 0.2
205 0.17
206 0.23
207 0.22
208 0.22
209 0.24
210 0.3
211 0.36
212 0.4
213 0.4
214 0.41
215 0.43
216 0.44
217 0.43
218 0.38
219 0.37
220 0.38
221 0.39
222 0.36
223 0.32
224 0.29
225 0.27
226 0.23
227 0.2
228 0.18
229 0.17
230 0.24
231 0.28
232 0.35
233 0.36
234 0.36
235 0.35
236 0.35
237 0.35
238 0.3
239 0.27
240 0.26
241 0.28
242 0.34
243 0.34
244 0.4
245 0.45
246 0.43
247 0.47
248 0.49
249 0.51
250 0.47
251 0.55
252 0.57
253 0.57
254 0.63
255 0.59
256 0.54
257 0.54
258 0.53
259 0.43
260 0.33
261 0.28
262 0.23
263 0.21
264 0.21
265 0.16
266 0.15
267 0.15
268 0.14
269 0.12
270 0.09
271 0.11
272 0.11
273 0.11
274 0.16
275 0.17
276 0.19
277 0.18
278 0.19
279 0.17
280 0.17
281 0.16
282 0.12
283 0.13
284 0.11
285 0.12
286 0.11
287 0.12
288 0.1
289 0.1
290 0.11
291 0.1
292 0.12
293 0.13
294 0.13
295 0.14
296 0.14
297 0.2
298 0.19
299 0.17
300 0.16
301 0.15
302 0.15
303 0.13
304 0.15
305 0.14
306 0.17
307 0.19
308 0.21
309 0.23
310 0.26
311 0.26
312 0.26
313 0.26
314 0.28
315 0.27
316 0.26
317 0.27
318 0.27
319 0.27
320 0.29
321 0.25
322 0.24
323 0.23
324 0.22
325 0.19
326 0.16
327 0.15
328 0.12
329 0.1
330 0.09
331 0.08
332 0.07
333 0.07
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.07
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.08
352 0.07
353 0.06
354 0.07
355 0.07
356 0.07
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.05
367 0.05
368 0.06
369 0.08
370 0.1
371 0.1
372 0.1
373 0.11
374 0.11
375 0.1
376 0.11
377 0.12
378 0.1
379 0.09
380 0.11
381 0.16
382 0.18
383 0.2
384 0.18
385 0.18
386 0.2
387 0.19
388 0.18
389 0.15
390 0.17
391 0.17
392 0.18
393 0.17
394 0.14
395 0.16
396 0.15
397 0.15
398 0.11
399 0.09
400 0.1
401 0.09
402 0.09
403 0.07
404 0.1
405 0.09
406 0.09
407 0.09
408 0.08
409 0.08
410 0.1
411 0.11
412 0.1
413 0.1
414 0.11
415 0.1
416 0.13
417 0.15
418 0.13
419 0.12
420 0.1
421 0.11
422 0.11
423 0.11
424 0.14
425 0.15
426 0.17
427 0.18
428 0.18
429 0.19
430 0.2
431 0.24
432 0.18
433 0.18
434 0.21
435 0.21
436 0.22
437 0.21
438 0.22
439 0.19
440 0.18
441 0.16
442 0.13
443 0.12
444 0.12
445 0.1
446 0.1
447 0.09
448 0.09
449 0.09
450 0.07
451 0.06
452 0.07
453 0.07
454 0.06
455 0.08
456 0.17
457 0.18
458 0.19
459 0.22
460 0.23
461 0.27
462 0.32
463 0.31
464 0.27
465 0.33
466 0.38
467 0.41
468 0.48
469 0.46
470 0.41
471 0.42
472 0.38
473 0.35
474 0.31
475 0.27
476 0.22
477 0.22
478 0.2
479 0.18
480 0.2
481 0.16
482 0.14
483 0.13
484 0.08
485 0.07
486 0.07
487 0.07
488 0.05
489 0.05
490 0.04
491 0.09
492 0.12
493 0.14
494 0.16
495 0.17
496 0.22
497 0.23
498 0.24
499 0.26
500 0.23
501 0.26
502 0.28
503 0.31
504 0.3
505 0.31
506 0.31
507 0.3
508 0.36
509 0.37
510 0.4
511 0.38
512 0.34
513 0.35
514 0.34
515 0.3
516 0.25
517 0.21
518 0.15
519 0.14
520 0.13
521 0.11
522 0.1
523 0.1
524 0.1
525 0.14
526 0.14
527 0.16
528 0.16
529 0.18
530 0.19
531 0.19
532 0.26
533 0.22
534 0.21
535 0.19
536 0.18
537 0.18
538 0.18
539 0.16
540 0.09
541 0.09
542 0.08
543 0.08
544 0.08
545 0.07
546 0.06
547 0.06
548 0.06
549 0.05
550 0.05
551 0.05
552 0.05
553 0.05
554 0.05
555 0.04
556 0.06
557 0.06
558 0.06
559 0.07
560 0.07
561 0.06
562 0.07
563 0.08
564 0.07
565 0.09
566 0.1
567 0.12
568 0.12
569 0.14
570 0.19
571 0.18
572 0.19
573 0.17
574 0.17
575 0.19
576 0.21
577 0.22
578 0.2
579 0.24
580 0.25
581 0.25
582 0.25
583 0.22
584 0.2
585 0.18
586 0.19
587 0.16
588 0.14
589 0.14
590 0.14
591 0.13
592 0.15
593 0.23
594 0.2
595 0.21
596 0.24
597 0.25
598 0.26
599 0.27
600 0.27
601 0.2
602 0.2
603 0.19
604 0.17
605 0.16
606 0.14
607 0.13
608 0.13
609 0.11
610 0.09
611 0.08
612 0.08
613 0.08
614 0.07
615 0.06
616 0.05
617 0.05
618 0.07
619 0.07
620 0.08
621 0.08
622 0.09
623 0.1
624 0.1
625 0.11
626 0.1
627 0.13
628 0.15
629 0.17
630 0.16
631 0.15
632 0.15
633 0.15
634 0.19
635 0.15
636 0.11
637 0.1
638 0.12
639 0.12
640 0.12
641 0.11
642 0.06
643 0.07
644 0.07
645 0.07
646 0.06
647 0.08
648 0.08
649 0.09
650 0.13
651 0.13
652 0.14
653 0.16
654 0.16
655 0.15
656 0.15
657 0.14
658 0.1
659 0.09
660 0.09
661 0.08
662 0.08
663 0.08
664 0.09
665 0.1
666 0.13
667 0.15
668 0.18
669 0.21
670 0.22
671 0.23
672 0.23
673 0.22
674 0.23
675 0.22
676 0.2
677 0.18
678 0.17
679 0.16
680 0.18
681 0.18
682 0.15
683 0.15
684 0.17
685 0.16
686 0.23
687 0.28
688 0.32
689 0.38
690 0.46
691 0.53
692 0.54
693 0.57
694 0.55
695 0.53
696 0.51
697 0.47
698 0.43
699 0.39
700 0.38
701 0.39
702 0.37
703 0.35
704 0.36
705 0.33
706 0.32
707 0.28
708 0.27
709 0.25
710 0.24
711 0.23
712 0.2
713 0.2
714 0.22
715 0.21
716 0.24
717 0.2
718 0.19
719 0.17
720 0.15
721 0.17
722 0.14
723 0.14
724 0.16
725 0.19
726 0.19
727 0.2
728 0.22
729 0.21
730 0.22
731 0.21
732 0.17
733 0.17
734 0.23
735 0.23
736 0.21
737 0.19
738 0.2
739 0.23
740 0.22
741 0.2
742 0.16
743 0.21
744 0.23
745 0.23
746 0.23
747 0.19
748 0.2
749 0.19
750 0.2
751 0.18
752 0.18
753 0.21
754 0.2
755 0.21
756 0.23
757 0.23
758 0.24
759 0.27
760 0.27
761 0.27
762 0.31
763 0.32
764 0.35
765 0.39
766 0.37
767 0.32
768 0.31
769 0.27
770 0.22
771 0.2
772 0.15
773 0.09
774 0.09
775 0.09
776 0.08
777 0.08
778 0.08
779 0.09
780 0.09
781 0.09
782 0.08
783 0.07
784 0.07
785 0.06
786 0.06
787 0.05
788 0.05
789 0.06
790 0.06
791 0.06
792 0.06
793 0.1
794 0.1
795 0.11
796 0.11
797 0.14
798 0.14