Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4JW98

Protein Details
Accession W4JW98    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
90-111APPAPAPTKTHRRRRSTASDLNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
101-104RRRR
211-227QRVKGKKAAALKGKGKK
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 6, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG hir:HETIRDRAFT_460226  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MPAYRTRDTHSRSLEVTVDHVHTPMFNIISPTPRAFTFPNIMTSPLSSPSNSPFEAELKPSTLTPPPTTPTPSSHISSDVSLQIAERTQAPPAPAPTKTHRRRRSTASDLNERRPKKGDEDYVKRPENAFILFRRKCCEDRNSALGAGEAGEGGDKASAPTKKQRQADLSKAISREWKALTAEERQYWEELAKEKKKEHEQLHPNYVYRPQRVKGKKAAALKGKGKKPDDEEMDDGEISFIMPLSVRPGPRAASAPTPPYQQHITVPPVFMSSTPSSPSMVPTGARRPSFPFPAQNGGFNFDFAPSDGLQQPYPEPQGWDPNVNGSAGFVGTFDPTPFFVDNNNKNDVSLDSFGGCPDQRMFAPSQQLLVSSYAAGSSGPPSPDDRPFTPTSSLEVIGIPGEIWQQHEAFCIPDVPTSQCPPEMLEFEYRPFAWPSATIKGGWTNGSQPLFNEDFDLSSLSPIELEGVKYSDDPKAATVESMGSGFPHEQYCSPTHMDVDRLGHDPFTAMFGYNDLQMSGEHFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.39
3 0.36
4 0.31
5 0.28
6 0.24
7 0.23
8 0.19
9 0.17
10 0.18
11 0.19
12 0.16
13 0.14
14 0.17
15 0.19
16 0.24
17 0.28
18 0.27
19 0.26
20 0.25
21 0.28
22 0.26
23 0.29
24 0.31
25 0.3
26 0.34
27 0.33
28 0.34
29 0.31
30 0.32
31 0.28
32 0.25
33 0.25
34 0.2
35 0.21
36 0.25
37 0.29
38 0.27
39 0.27
40 0.25
41 0.27
42 0.28
43 0.3
44 0.26
45 0.23
46 0.24
47 0.23
48 0.24
49 0.26
50 0.28
51 0.29
52 0.31
53 0.33
54 0.36
55 0.41
56 0.4
57 0.39
58 0.39
59 0.39
60 0.38
61 0.35
62 0.34
63 0.3
64 0.28
65 0.26
66 0.23
67 0.19
68 0.16
69 0.15
70 0.14
71 0.13
72 0.13
73 0.12
74 0.12
75 0.13
76 0.15
77 0.17
78 0.19
79 0.24
80 0.27
81 0.27
82 0.32
83 0.39
84 0.48
85 0.56
86 0.63
87 0.68
88 0.72
89 0.77
90 0.8
91 0.81
92 0.8
93 0.79
94 0.76
95 0.77
96 0.74
97 0.77
98 0.77
99 0.69
100 0.63
101 0.59
102 0.54
103 0.5
104 0.53
105 0.53
106 0.55
107 0.61
108 0.66
109 0.7
110 0.7
111 0.64
112 0.57
113 0.49
114 0.41
115 0.36
116 0.31
117 0.28
118 0.35
119 0.37
120 0.38
121 0.4
122 0.42
123 0.43
124 0.46
125 0.48
126 0.45
127 0.48
128 0.51
129 0.49
130 0.45
131 0.41
132 0.34
133 0.26
134 0.19
135 0.13
136 0.07
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.03
143 0.04
144 0.1
145 0.12
146 0.15
147 0.25
148 0.34
149 0.41
150 0.45
151 0.51
152 0.55
153 0.6
154 0.65
155 0.64
156 0.6
157 0.56
158 0.52
159 0.47
160 0.44
161 0.38
162 0.33
163 0.26
164 0.25
165 0.22
166 0.24
167 0.25
168 0.26
169 0.28
170 0.26
171 0.28
172 0.25
173 0.25
174 0.23
175 0.2
176 0.17
177 0.18
178 0.25
179 0.29
180 0.31
181 0.34
182 0.4
183 0.48
184 0.54
185 0.54
186 0.55
187 0.59
188 0.62
189 0.68
190 0.63
191 0.56
192 0.49
193 0.52
194 0.47
195 0.43
196 0.41
197 0.36
198 0.43
199 0.48
200 0.53
201 0.54
202 0.56
203 0.56
204 0.58
205 0.62
206 0.59
207 0.61
208 0.62
209 0.62
210 0.59
211 0.61
212 0.56
213 0.53
214 0.5
215 0.5
216 0.47
217 0.42
218 0.4
219 0.34
220 0.33
221 0.29
222 0.24
223 0.17
224 0.12
225 0.08
226 0.06
227 0.04
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.06
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.12
236 0.13
237 0.14
238 0.16
239 0.14
240 0.16
241 0.18
242 0.2
243 0.2
244 0.22
245 0.2
246 0.21
247 0.21
248 0.18
249 0.18
250 0.19
251 0.22
252 0.2
253 0.2
254 0.18
255 0.17
256 0.16
257 0.14
258 0.15
259 0.12
260 0.12
261 0.13
262 0.14
263 0.14
264 0.14
265 0.15
266 0.12
267 0.11
268 0.11
269 0.13
270 0.18
271 0.22
272 0.22
273 0.23
274 0.26
275 0.29
276 0.34
277 0.33
278 0.32
279 0.3
280 0.37
281 0.36
282 0.34
283 0.31
284 0.3
285 0.27
286 0.22
287 0.2
288 0.13
289 0.13
290 0.1
291 0.11
292 0.08
293 0.1
294 0.11
295 0.13
296 0.12
297 0.13
298 0.13
299 0.14
300 0.16
301 0.14
302 0.14
303 0.14
304 0.22
305 0.22
306 0.24
307 0.21
308 0.22
309 0.22
310 0.2
311 0.18
312 0.11
313 0.09
314 0.07
315 0.07
316 0.04
317 0.04
318 0.05
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.07
323 0.09
324 0.1
325 0.1
326 0.13
327 0.22
328 0.29
329 0.32
330 0.35
331 0.33
332 0.32
333 0.33
334 0.29
335 0.25
336 0.19
337 0.16
338 0.13
339 0.13
340 0.13
341 0.15
342 0.13
343 0.11
344 0.1
345 0.11
346 0.1
347 0.13
348 0.16
349 0.17
350 0.23
351 0.21
352 0.22
353 0.2
354 0.21
355 0.19
356 0.18
357 0.15
358 0.1
359 0.09
360 0.08
361 0.08
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.09
366 0.09
367 0.11
368 0.14
369 0.17
370 0.23
371 0.28
372 0.28
373 0.31
374 0.33
375 0.35
376 0.36
377 0.33
378 0.31
379 0.28
380 0.27
381 0.21
382 0.19
383 0.16
384 0.13
385 0.12
386 0.08
387 0.06
388 0.07
389 0.07
390 0.09
391 0.1
392 0.1
393 0.11
394 0.12
395 0.12
396 0.12
397 0.12
398 0.12
399 0.11
400 0.12
401 0.14
402 0.17
403 0.2
404 0.22
405 0.23
406 0.22
407 0.22
408 0.23
409 0.24
410 0.22
411 0.21
412 0.24
413 0.24
414 0.25
415 0.27
416 0.25
417 0.24
418 0.24
419 0.22
420 0.17
421 0.19
422 0.22
423 0.23
424 0.24
425 0.22
426 0.22
427 0.26
428 0.27
429 0.25
430 0.22
431 0.2
432 0.25
433 0.26
434 0.25
435 0.21
436 0.26
437 0.26
438 0.25
439 0.24
440 0.18
441 0.17
442 0.18
443 0.19
444 0.13
445 0.12
446 0.12
447 0.1
448 0.09
449 0.08
450 0.1
451 0.09
452 0.1
453 0.1
454 0.11
455 0.12
456 0.13
457 0.15
458 0.16
459 0.17
460 0.16
461 0.16
462 0.19
463 0.18
464 0.17
465 0.16
466 0.14
467 0.14
468 0.14
469 0.12
470 0.09
471 0.11
472 0.12
473 0.13
474 0.14
475 0.15
476 0.16
477 0.2
478 0.23
479 0.25
480 0.27
481 0.26
482 0.27
483 0.28
484 0.29
485 0.28
486 0.3
487 0.28
488 0.28
489 0.27
490 0.24
491 0.22
492 0.2
493 0.17
494 0.15
495 0.13
496 0.12
497 0.11
498 0.13
499 0.14
500 0.15
501 0.15
502 0.12
503 0.12
504 0.11