Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HDM1

Protein Details
Accession C1HDM1    Localization Confidence Low Confidence Score 7.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
399-440ASALLQAQKQKQKQKQRQKQQQKQKQKQKQKQEQEQEQLYRLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 13, cyto_nucl 8.5, nucl 7.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045865  ACT-like_dom_sf  
IPR027795  CASTOR_ACT_dom  
Gene Ontology GO:0006520  P:amino acid metabolic process  
KEGG pbl:PAAG_08878  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13840  ACT_7  
Amino Acid Sequences MSMSRSLSLFSAKVRLLNDRLALIHIPIDFYTFFLKPILQLIFHDLPPIEDRNPNELDVLDLNISEPEKPTFFNFSITPVECSIVCSRELAELYFRPLTEKFNKNEPSRANHVSISKDDFIAMQVDGQGLEAGQRVLELTSPLAMAGISIFFISTYFSDYILVPQRSKGHVTQALENRGFSFEVSTDAFVNSSNNPQYQSSQSSLNTKPSTTTTPSPSSLSELQTRTFASLRKHNIHARVDKSLRIVQCAAQYSSPHPSSTSTLRPSLVTTLILDNPRFLSLTLTATDPSPSILLEKRLLPRFSLDPICSISHDQHGDYSLEDGNNLLLGSKVDVLIPIMLDLRDLPLEATGIVCGVASRLATATQSRLHTHSSESENEGASGGIDIPTIGSAGSKLKASALLQAQKQKQKQKQRQKQQQKQKQKQKQKQEQEQEQLYRLPRDPDASYPDVVDISFLSTARAGTVIVGERELEKAIASLDAESGESS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.32
3 0.33
4 0.36
5 0.35
6 0.31
7 0.31
8 0.3
9 0.29
10 0.22
11 0.22
12 0.17
13 0.17
14 0.15
15 0.16
16 0.13
17 0.14
18 0.18
19 0.15
20 0.16
21 0.15
22 0.16
23 0.14
24 0.19
25 0.2
26 0.16
27 0.17
28 0.25
29 0.27
30 0.26
31 0.28
32 0.23
33 0.23
34 0.26
35 0.29
36 0.23
37 0.25
38 0.28
39 0.31
40 0.33
41 0.32
42 0.29
43 0.25
44 0.25
45 0.21
46 0.19
47 0.14
48 0.12
49 0.11
50 0.12
51 0.13
52 0.11
53 0.12
54 0.13
55 0.13
56 0.15
57 0.17
58 0.22
59 0.22
60 0.25
61 0.23
62 0.25
63 0.3
64 0.3
65 0.3
66 0.24
67 0.25
68 0.21
69 0.25
70 0.24
71 0.19
72 0.18
73 0.16
74 0.16
75 0.18
76 0.19
77 0.16
78 0.18
79 0.17
80 0.22
81 0.23
82 0.22
83 0.21
84 0.22
85 0.28
86 0.32
87 0.38
88 0.37
89 0.45
90 0.53
91 0.53
92 0.59
93 0.57
94 0.55
95 0.56
96 0.57
97 0.5
98 0.46
99 0.46
100 0.42
101 0.4
102 0.39
103 0.32
104 0.28
105 0.25
106 0.21
107 0.19
108 0.17
109 0.14
110 0.09
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.07
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.06
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.05
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.05
141 0.05
142 0.08
143 0.08
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.15
148 0.22
149 0.23
150 0.2
151 0.23
152 0.26
153 0.27
154 0.3
155 0.27
156 0.27
157 0.3
158 0.32
159 0.36
160 0.39
161 0.44
162 0.41
163 0.4
164 0.32
165 0.29
166 0.27
167 0.19
168 0.14
169 0.08
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.1
178 0.08
179 0.12
180 0.13
181 0.13
182 0.15
183 0.16
184 0.18
185 0.19
186 0.22
187 0.2
188 0.21
189 0.22
190 0.26
191 0.27
192 0.32
193 0.29
194 0.26
195 0.26
196 0.25
197 0.28
198 0.26
199 0.28
200 0.26
201 0.28
202 0.3
203 0.3
204 0.28
205 0.28
206 0.26
207 0.25
208 0.25
209 0.22
210 0.21
211 0.21
212 0.21
213 0.19
214 0.18
215 0.19
216 0.17
217 0.23
218 0.29
219 0.31
220 0.36
221 0.38
222 0.44
223 0.46
224 0.49
225 0.44
226 0.45
227 0.42
228 0.39
229 0.38
230 0.36
231 0.3
232 0.26
233 0.24
234 0.19
235 0.21
236 0.22
237 0.2
238 0.16
239 0.17
240 0.17
241 0.21
242 0.2
243 0.17
244 0.16
245 0.16
246 0.18
247 0.21
248 0.25
249 0.22
250 0.23
251 0.23
252 0.23
253 0.22
254 0.21
255 0.18
256 0.13
257 0.11
258 0.11
259 0.13
260 0.15
261 0.14
262 0.13
263 0.13
264 0.13
265 0.12
266 0.1
267 0.1
268 0.09
269 0.11
270 0.11
271 0.11
272 0.11
273 0.11
274 0.11
275 0.09
276 0.08
277 0.07
278 0.06
279 0.08
280 0.09
281 0.11
282 0.13
283 0.17
284 0.22
285 0.28
286 0.28
287 0.27
288 0.28
289 0.27
290 0.3
291 0.3
292 0.24
293 0.21
294 0.23
295 0.23
296 0.21
297 0.21
298 0.18
299 0.19
300 0.19
301 0.18
302 0.16
303 0.17
304 0.16
305 0.14
306 0.15
307 0.12
308 0.11
309 0.1
310 0.1
311 0.08
312 0.08
313 0.07
314 0.05
315 0.04
316 0.04
317 0.05
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.05
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.05
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.03
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.05
348 0.05
349 0.07
350 0.08
351 0.11
352 0.15
353 0.17
354 0.2
355 0.21
356 0.24
357 0.24
358 0.25
359 0.29
360 0.28
361 0.28
362 0.29
363 0.29
364 0.26
365 0.25
366 0.23
367 0.17
368 0.13
369 0.1
370 0.07
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.04
375 0.05
376 0.05
377 0.04
378 0.04
379 0.05
380 0.07
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.1
385 0.13
386 0.14
387 0.19
388 0.24
389 0.29
390 0.33
391 0.41
392 0.48
393 0.54
394 0.61
395 0.65
396 0.67
397 0.73
398 0.79
399 0.82
400 0.86
401 0.89
402 0.93
403 0.94
404 0.95
405 0.95
406 0.96
407 0.96
408 0.96
409 0.96
410 0.95
411 0.95
412 0.94
413 0.94
414 0.94
415 0.94
416 0.94
417 0.93
418 0.92
419 0.89
420 0.88
421 0.8
422 0.72
423 0.66
424 0.59
425 0.54
426 0.47
427 0.41
428 0.35
429 0.36
430 0.35
431 0.35
432 0.39
433 0.37
434 0.35
435 0.31
436 0.3
437 0.26
438 0.23
439 0.19
440 0.11
441 0.11
442 0.11
443 0.1
444 0.11
445 0.11
446 0.11
447 0.11
448 0.11
449 0.08
450 0.08
451 0.11
452 0.13
453 0.14
454 0.14
455 0.14
456 0.15
457 0.16
458 0.17
459 0.13
460 0.1
461 0.1
462 0.1
463 0.1
464 0.1
465 0.09
466 0.09
467 0.1