Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4JW71

Protein Details
Accession W4JW71    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
727-752PPSASPAPSSKKKPPPPPAPTPPTPTHydrophilic
754-777PPAPAQTRTRTRTRTRTRETAQARHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
715-758RRPRHRSSTPHTPPSASPAPSSKKKPPPPPAPTPPTPTPPPAPA
760-769TRTRTRTRTR
783-800GGGGGRDGRKGGLARARG
Subcellular Location(s) extr 10, mito 9, nucl 4, cyto 1, plas 1, pero 1, golg 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG hir:HETIRDRAFT_435801  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10367  Vps39_2  
Amino Acid Sequences MARRSTFPRSSVLILGINSLHSLLPATLISQAESLLESHRLDDVVELADQQRKKLQGKLTVDEDEADELRYVYQRLGFQLMSETRFEDAGYNFFEGNLDPSALVSYFPDLRGSLLSSVLEVDMFVGVADCMPPYDSVDDIIAANLVRNYSPHLAPNTRSAPPTAELRRILGIEAREMLETFLRKWRRIRGDSGTPEVHAIVDTVLAKLFAHGEKTEELYTLLDDSTHLVLSELESIFRSTGQYNALCKIYAKRGDDAKLLEAWSKLAEGEWTDADIPDPLSDMFALLTERRNRQLTQQWGIWLTRKDSERALKLLTSQGSTRRANRAEDDLAMLQQIRDANPEAGTQFLEHLVLQKRSTDRTLHTELAITCIDQLLSFLSEDATSKLWRAKSASYASTPTPNLTPFLAYFASTTPDSPAKRARLRTALFLQNSRLYDARAVRARLAPRERALAVEVAIVEGKVRARVSSRPKTPRPNLLTPFPSPQLGNHTAALTLLALTVRDHASAEAYCATGGSSAIPPRVARALADKHGLGPWAGVGGASAKAAQAVSGAGREGDADPAETRRLLKALLEVYMSGDAPGRDRAPPPSSPSSPSPPPPPPPPSSSSPSTGPSTSPSPITSSASISASTALLNAQAANFDVVDVLERVPPTWALPALSTFLARSLRRAVHARHEGLLVKAICAGQNLAVRPSRSPSRSFPPDPSLHPTRIVPDRRPRHRSSTPHTPPSASPAPSSKKKPPPPPAPTPPTPTPPPAPAQTRTRTRTRTRTRETAQARDGGGDGGGGGRDGRKGGLARARGGSSGGSSGAGRGAAVWASASALGLALALGLGTKM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.28
3 0.24
4 0.2
5 0.17
6 0.15
7 0.12
8 0.09
9 0.1
10 0.08
11 0.09
12 0.09
13 0.09
14 0.12
15 0.13
16 0.13
17 0.12
18 0.12
19 0.11
20 0.12
21 0.12
22 0.1
23 0.14
24 0.13
25 0.14
26 0.15
27 0.15
28 0.14
29 0.14
30 0.13
31 0.11
32 0.11
33 0.12
34 0.13
35 0.2
36 0.2
37 0.22
38 0.26
39 0.31
40 0.35
41 0.41
42 0.46
43 0.49
44 0.55
45 0.59
46 0.59
47 0.55
48 0.52
49 0.46
50 0.39
51 0.32
52 0.26
53 0.21
54 0.16
55 0.13
56 0.13
57 0.15
58 0.14
59 0.13
60 0.17
61 0.17
62 0.2
63 0.23
64 0.22
65 0.2
66 0.27
67 0.28
68 0.27
69 0.26
70 0.24
71 0.21
72 0.21
73 0.21
74 0.17
75 0.15
76 0.16
77 0.18
78 0.18
79 0.17
80 0.17
81 0.17
82 0.14
83 0.15
84 0.13
85 0.11
86 0.09
87 0.1
88 0.11
89 0.11
90 0.1
91 0.08
92 0.11
93 0.12
94 0.12
95 0.14
96 0.13
97 0.14
98 0.15
99 0.16
100 0.14
101 0.13
102 0.13
103 0.11
104 0.12
105 0.11
106 0.09
107 0.07
108 0.06
109 0.05
110 0.05
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.06
119 0.06
120 0.08
121 0.1
122 0.1
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.11
127 0.1
128 0.09
129 0.07
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.07
134 0.08
135 0.13
136 0.16
137 0.17
138 0.21
139 0.26
140 0.29
141 0.31
142 0.39
143 0.39
144 0.38
145 0.37
146 0.34
147 0.31
148 0.3
149 0.37
150 0.33
151 0.34
152 0.33
153 0.34
154 0.34
155 0.31
156 0.3
157 0.25
158 0.21
159 0.17
160 0.17
161 0.16
162 0.14
163 0.14
164 0.14
165 0.14
166 0.14
167 0.14
168 0.21
169 0.25
170 0.29
171 0.34
172 0.43
173 0.5
174 0.54
175 0.59
176 0.59
177 0.64
178 0.65
179 0.66
180 0.57
181 0.47
182 0.43
183 0.36
184 0.28
185 0.18
186 0.13
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.09
196 0.08
197 0.1
198 0.1
199 0.13
200 0.14
201 0.17
202 0.17
203 0.14
204 0.14
205 0.12
206 0.12
207 0.11
208 0.1
209 0.07
210 0.07
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.11
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.08
227 0.1
228 0.14
229 0.16
230 0.17
231 0.2
232 0.2
233 0.19
234 0.2
235 0.22
236 0.25
237 0.29
238 0.3
239 0.31
240 0.35
241 0.38
242 0.39
243 0.37
244 0.31
245 0.27
246 0.25
247 0.22
248 0.18
249 0.16
250 0.13
251 0.11
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.07
256 0.08
257 0.08
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.06
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.12
275 0.17
276 0.19
277 0.23
278 0.26
279 0.27
280 0.32
281 0.4
282 0.42
283 0.42
284 0.41
285 0.38
286 0.38
287 0.38
288 0.36
289 0.29
290 0.24
291 0.25
292 0.25
293 0.24
294 0.27
295 0.32
296 0.31
297 0.31
298 0.3
299 0.25
300 0.25
301 0.28
302 0.23
303 0.19
304 0.18
305 0.21
306 0.26
307 0.28
308 0.3
309 0.33
310 0.35
311 0.35
312 0.36
313 0.36
314 0.31
315 0.29
316 0.27
317 0.21
318 0.18
319 0.16
320 0.14
321 0.09
322 0.09
323 0.09
324 0.07
325 0.08
326 0.1
327 0.1
328 0.11
329 0.12
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.08
334 0.07
335 0.07
336 0.06
337 0.06
338 0.11
339 0.14
340 0.16
341 0.16
342 0.19
343 0.2
344 0.22
345 0.25
346 0.22
347 0.21
348 0.26
349 0.31
350 0.28
351 0.27
352 0.27
353 0.25
354 0.25
355 0.22
356 0.15
357 0.1
358 0.09
359 0.09
360 0.06
361 0.06
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.06
370 0.07
371 0.07
372 0.08
373 0.11
374 0.12
375 0.13
376 0.15
377 0.15
378 0.2
379 0.23
380 0.24
381 0.22
382 0.24
383 0.23
384 0.24
385 0.23
386 0.19
387 0.17
388 0.15
389 0.14
390 0.12
391 0.12
392 0.09
393 0.11
394 0.1
395 0.09
396 0.09
397 0.09
398 0.11
399 0.1
400 0.1
401 0.09
402 0.14
403 0.14
404 0.16
405 0.21
406 0.25
407 0.3
408 0.33
409 0.35
410 0.38
411 0.39
412 0.42
413 0.41
414 0.41
415 0.37
416 0.36
417 0.34
418 0.29
419 0.29
420 0.25
421 0.2
422 0.15
423 0.17
424 0.18
425 0.2
426 0.2
427 0.21
428 0.21
429 0.25
430 0.26
431 0.3
432 0.32
433 0.3
434 0.28
435 0.3
436 0.28
437 0.25
438 0.24
439 0.17
440 0.14
441 0.11
442 0.1
443 0.07
444 0.07
445 0.06
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.06
450 0.06
451 0.07
452 0.09
453 0.16
454 0.26
455 0.34
456 0.43
457 0.5
458 0.56
459 0.66
460 0.69
461 0.72
462 0.7
463 0.69
464 0.64
465 0.61
466 0.58
467 0.51
468 0.49
469 0.4
470 0.34
471 0.26
472 0.23
473 0.25
474 0.24
475 0.24
476 0.21
477 0.2
478 0.19
479 0.18
480 0.17
481 0.1
482 0.06
483 0.05
484 0.04
485 0.04
486 0.04
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.07
491 0.06
492 0.08
493 0.08
494 0.09
495 0.08
496 0.07
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.05
501 0.05
502 0.06
503 0.07
504 0.08
505 0.09
506 0.1
507 0.1
508 0.11
509 0.13
510 0.12
511 0.1
512 0.15
513 0.19
514 0.2
515 0.22
516 0.21
517 0.2
518 0.2
519 0.2
520 0.14
521 0.1
522 0.08
523 0.06
524 0.06
525 0.04
526 0.04
527 0.04
528 0.05
529 0.05
530 0.05
531 0.04
532 0.05
533 0.05
534 0.05
535 0.04
536 0.04
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.05
542 0.06
543 0.06
544 0.07
545 0.07
546 0.07
547 0.08
548 0.1
549 0.11
550 0.1
551 0.11
552 0.11
553 0.11
554 0.11
555 0.11
556 0.13
557 0.14
558 0.14
559 0.13
560 0.12
561 0.13
562 0.13
563 0.12
564 0.09
565 0.09
566 0.08
567 0.09
568 0.12
569 0.12
570 0.13
571 0.15
572 0.2
573 0.22
574 0.25
575 0.3
576 0.35
577 0.36
578 0.38
579 0.41
580 0.42
581 0.43
582 0.44
583 0.44
584 0.43
585 0.47
586 0.5
587 0.52
588 0.49
589 0.5
590 0.51
591 0.49
592 0.49
593 0.47
594 0.43
595 0.39
596 0.38
597 0.36
598 0.32
599 0.27
600 0.25
601 0.25
602 0.23
603 0.22
604 0.19
605 0.2
606 0.21
607 0.23
608 0.21
609 0.19
610 0.2
611 0.19
612 0.18
613 0.15
614 0.14
615 0.11
616 0.1
617 0.08
618 0.06
619 0.06
620 0.06
621 0.06
622 0.05
623 0.05
624 0.06
625 0.06
626 0.06
627 0.05
628 0.05
629 0.05
630 0.06
631 0.07
632 0.07
633 0.08
634 0.09
635 0.09
636 0.1
637 0.1
638 0.1
639 0.12
640 0.12
641 0.11
642 0.12
643 0.13
644 0.14
645 0.14
646 0.13
647 0.11
648 0.13
649 0.18
650 0.18
651 0.2
652 0.24
653 0.25
654 0.3
655 0.36
656 0.36
657 0.4
658 0.48
659 0.47
660 0.43
661 0.43
662 0.4
663 0.35
664 0.38
665 0.28
666 0.2
667 0.2
668 0.19
669 0.17
670 0.16
671 0.16
672 0.13
673 0.16
674 0.17
675 0.2
676 0.23
677 0.23
678 0.24
679 0.29
680 0.34
681 0.33
682 0.37
683 0.39
684 0.46
685 0.53
686 0.56
687 0.56
688 0.56
689 0.56
690 0.56
691 0.58
692 0.54
693 0.47
694 0.46
695 0.41
696 0.39
697 0.44
698 0.47
699 0.47
700 0.52
701 0.61
702 0.69
703 0.76
704 0.75
705 0.76
706 0.78
707 0.79
708 0.77
709 0.78
710 0.77
711 0.78
712 0.74
713 0.68
714 0.59
715 0.58
716 0.56
717 0.46
718 0.4
719 0.4
720 0.46
721 0.51
722 0.57
723 0.59
724 0.63
725 0.71
726 0.78
727 0.81
728 0.84
729 0.84
730 0.87
731 0.87
732 0.85
733 0.82
734 0.79
735 0.74
736 0.7
737 0.66
738 0.61
739 0.56
740 0.51
741 0.51
742 0.5
743 0.5
744 0.49
745 0.53
746 0.57
747 0.61
748 0.63
749 0.67
750 0.69
751 0.72
752 0.77
753 0.8
754 0.82
755 0.81
756 0.85
757 0.81
758 0.82
759 0.8
760 0.78
761 0.71
762 0.65
763 0.57
764 0.48
765 0.43
766 0.33
767 0.26
768 0.17
769 0.12
770 0.08
771 0.07
772 0.06
773 0.06
774 0.07
775 0.08
776 0.09
777 0.1
778 0.14
779 0.15
780 0.22
781 0.29
782 0.32
783 0.34
784 0.38
785 0.38
786 0.34
787 0.34
788 0.28
789 0.22
790 0.2
791 0.16
792 0.13
793 0.12
794 0.12
795 0.12
796 0.11
797 0.09
798 0.08
799 0.09
800 0.08
801 0.08
802 0.07
803 0.06
804 0.07
805 0.08
806 0.07
807 0.06
808 0.06
809 0.05
810 0.05
811 0.05
812 0.03
813 0.03
814 0.03