Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H7M6

Protein Details
Accession C1H7M6    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
128-151LGQSRPEKKAAKTKRTKKEDGLINHydrophilic
302-322ESATSKPRRVKAKNRPKSKLTHydrophilic
720-742DSVPPSRPRQPSKSCTPRDRENTHydrophilic
841-863ESKGVCCIWRKQRGARAHCPLVRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
133-145PEKKAAKTKRTKK
307-319KPRRVKAKNRPKS
357-374SAAKRTSGARCAKPGRKK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, mito 10, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
KEGG pbl:PAAG_06767  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
CDD cd22999  SAP_SLX4  
Amino Acid Sequences MTTQSSSDGRMFTSSIIPVIPDSSPTAAEVIELSSQLSLPSPTSLLDFLSTSTSRGPTRSDTVGDKTQGKEVLDTRPILENSFRRENRVVTGTGGKAATGKRLKRRTESPGNACQSKIHIVSGEQIILGQSRPEKKAAKTKRTKKEDGLINYKLHGRVSKANQTVSRQPETKISAPKECNDTTQPAGNDHINDLDDGLQLEQATQRRFDWTPTKDTTIPVIDLVGDSPSSCEKSLSGMRSTRTMLSNYEFSGVVGTLGGSRSEGTPDAPTTKRPIELLKVNNFKEISGLSDDRQSSITEDSESATSKPRRVKAKNRPKSKLTTITSYATAKYTVVEKSVNLDPVETLLSDEPGKEKSAAKRTSGARCAKPGRKKSTTTEKKNEPPIFKVVHPLEAFKAFGGQELLFGTSSQLANGHSEDQHEQNEGTSHISNSSAFLPLSRSESSSKALSQASLGSGFLKLSSSKNLWSAGARDLTGAVLEIDEIDLSEHRMKPSIFAFQPKAPLGCKADTQIPPQLGEIDSDNSCQKPLAAIDPPEFVTRSETPSEKGVLHKYIVKPTHTNSCSQSGSSISVGSPEKPVQDKPIFNGFTTSELAKKVAAYGFKPIKSRDKMISLLEKCWENRNKAPNSVPKLTPGDGLSKVDEPTKGQSLGPHLQPNSISQKATTQVPKVKPAKRATKSQGVPVSSRRSTSTSKVSRKRTVSPSAILVDDDQTSDSTGDSVPPSRPRQPSKSCTPRDRENTPESFNLPTTPLTIRSGKVPSTVTSSESLPSLYTQITAAIKAQPRLRAFNGVKQPTWYEKILMYDPIQLEDLAVWLNTDGFERIGEDREVWPGLLREWCESKGVCCIWRKQRGARAHCPLVRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.17
3 0.16
4 0.15
5 0.14
6 0.16
7 0.14
8 0.12
9 0.14
10 0.15
11 0.15
12 0.15
13 0.15
14 0.13
15 0.13
16 0.12
17 0.1
18 0.1
19 0.09
20 0.09
21 0.09
22 0.09
23 0.09
24 0.1
25 0.09
26 0.09
27 0.11
28 0.11
29 0.11
30 0.13
31 0.14
32 0.13
33 0.14
34 0.13
35 0.12
36 0.17
37 0.17
38 0.16
39 0.19
40 0.22
41 0.22
42 0.23
43 0.26
44 0.26
45 0.31
46 0.33
47 0.34
48 0.35
49 0.4
50 0.45
51 0.45
52 0.44
53 0.41
54 0.42
55 0.42
56 0.38
57 0.37
58 0.33
59 0.36
60 0.36
61 0.35
62 0.33
63 0.36
64 0.36
65 0.33
66 0.38
67 0.35
68 0.38
69 0.48
70 0.46
71 0.46
72 0.49
73 0.49
74 0.48
75 0.47
76 0.4
77 0.33
78 0.38
79 0.32
80 0.32
81 0.3
82 0.24
83 0.23
84 0.23
85 0.29
86 0.31
87 0.38
88 0.45
89 0.54
90 0.61
91 0.65
92 0.72
93 0.72
94 0.75
95 0.78
96 0.75
97 0.76
98 0.77
99 0.71
100 0.63
101 0.55
102 0.47
103 0.43
104 0.37
105 0.28
106 0.23
107 0.21
108 0.25
109 0.26
110 0.22
111 0.16
112 0.15
113 0.14
114 0.13
115 0.13
116 0.11
117 0.15
118 0.2
119 0.23
120 0.29
121 0.33
122 0.39
123 0.5
124 0.57
125 0.63
126 0.68
127 0.77
128 0.82
129 0.86
130 0.87
131 0.83
132 0.81
133 0.79
134 0.77
135 0.75
136 0.69
137 0.61
138 0.56
139 0.53
140 0.45
141 0.39
142 0.32
143 0.28
144 0.32
145 0.38
146 0.45
147 0.45
148 0.49
149 0.51
150 0.54
151 0.58
152 0.56
153 0.55
154 0.47
155 0.45
156 0.46
157 0.48
158 0.48
159 0.49
160 0.47
161 0.49
162 0.5
163 0.53
164 0.53
165 0.48
166 0.46
167 0.41
168 0.41
169 0.35
170 0.37
171 0.34
172 0.29
173 0.31
174 0.29
175 0.26
176 0.22
177 0.21
178 0.16
179 0.15
180 0.14
181 0.11
182 0.1
183 0.09
184 0.09
185 0.08
186 0.07
187 0.08
188 0.11
189 0.15
190 0.16
191 0.17
192 0.17
193 0.21
194 0.22
195 0.28
196 0.33
197 0.33
198 0.39
199 0.41
200 0.45
201 0.42
202 0.42
203 0.41
204 0.34
205 0.3
206 0.23
207 0.19
208 0.14
209 0.13
210 0.12
211 0.09
212 0.06
213 0.05
214 0.07
215 0.08
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.15
221 0.21
222 0.23
223 0.26
224 0.27
225 0.28
226 0.31
227 0.33
228 0.31
229 0.28
230 0.26
231 0.24
232 0.24
233 0.24
234 0.22
235 0.22
236 0.18
237 0.16
238 0.15
239 0.12
240 0.09
241 0.07
242 0.06
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.1
253 0.12
254 0.17
255 0.17
256 0.19
257 0.23
258 0.24
259 0.24
260 0.24
261 0.25
262 0.26
263 0.33
264 0.38
265 0.41
266 0.47
267 0.46
268 0.49
269 0.46
270 0.4
271 0.34
272 0.27
273 0.21
274 0.18
275 0.19
276 0.15
277 0.2
278 0.2
279 0.2
280 0.2
281 0.18
282 0.15
283 0.15
284 0.15
285 0.11
286 0.12
287 0.12
288 0.12
289 0.13
290 0.12
291 0.18
292 0.2
293 0.24
294 0.3
295 0.35
296 0.44
297 0.52
298 0.62
299 0.65
300 0.75
301 0.79
302 0.83
303 0.84
304 0.79
305 0.78
306 0.75
307 0.74
308 0.66
309 0.62
310 0.55
311 0.5
312 0.47
313 0.41
314 0.33
315 0.24
316 0.21
317 0.15
318 0.12
319 0.13
320 0.11
321 0.11
322 0.11
323 0.11
324 0.14
325 0.16
326 0.18
327 0.16
328 0.15
329 0.13
330 0.14
331 0.14
332 0.1
333 0.09
334 0.06
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.08
339 0.08
340 0.1
341 0.1
342 0.14
343 0.2
344 0.29
345 0.32
346 0.32
347 0.38
348 0.42
349 0.47
350 0.52
351 0.51
352 0.44
353 0.48
354 0.55
355 0.56
356 0.6
357 0.62
358 0.63
359 0.63
360 0.65
361 0.65
362 0.68
363 0.71
364 0.71
365 0.71
366 0.69
367 0.7
368 0.76
369 0.74
370 0.65
371 0.57
372 0.53
373 0.47
374 0.4
375 0.41
376 0.32
377 0.32
378 0.29
379 0.27
380 0.23
381 0.22
382 0.21
383 0.14
384 0.15
385 0.09
386 0.09
387 0.1
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.09
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.07
396 0.07
397 0.06
398 0.07
399 0.07
400 0.08
401 0.08
402 0.09
403 0.08
404 0.1
405 0.11
406 0.12
407 0.13
408 0.12
409 0.12
410 0.11
411 0.11
412 0.1
413 0.1
414 0.09
415 0.08
416 0.08
417 0.09
418 0.08
419 0.09
420 0.09
421 0.08
422 0.07
423 0.08
424 0.09
425 0.09
426 0.13
427 0.12
428 0.13
429 0.14
430 0.16
431 0.18
432 0.17
433 0.17
434 0.16
435 0.15
436 0.14
437 0.12
438 0.11
439 0.1
440 0.09
441 0.09
442 0.06
443 0.06
444 0.06
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.07
449 0.1
450 0.11
451 0.12
452 0.14
453 0.15
454 0.15
455 0.14
456 0.15
457 0.15
458 0.15
459 0.13
460 0.12
461 0.11
462 0.1
463 0.09
464 0.07
465 0.04
466 0.03
467 0.03
468 0.03
469 0.03
470 0.03
471 0.03
472 0.03
473 0.03
474 0.05
475 0.09
476 0.1
477 0.1
478 0.13
479 0.13
480 0.15
481 0.17
482 0.21
483 0.19
484 0.23
485 0.25
486 0.25
487 0.29
488 0.27
489 0.27
490 0.21
491 0.24
492 0.23
493 0.21
494 0.2
495 0.18
496 0.24
497 0.25
498 0.28
499 0.28
500 0.25
501 0.24
502 0.23
503 0.23
504 0.16
505 0.15
506 0.13
507 0.12
508 0.11
509 0.12
510 0.13
511 0.12
512 0.12
513 0.11
514 0.09
515 0.08
516 0.09
517 0.11
518 0.13
519 0.15
520 0.16
521 0.18
522 0.19
523 0.19
524 0.18
525 0.15
526 0.17
527 0.16
528 0.18
529 0.19
530 0.19
531 0.2
532 0.21
533 0.23
534 0.18
535 0.21
536 0.21
537 0.2
538 0.21
539 0.25
540 0.25
541 0.31
542 0.33
543 0.33
544 0.32
545 0.33
546 0.42
547 0.37
548 0.38
549 0.33
550 0.36
551 0.33
552 0.31
553 0.29
554 0.2
555 0.21
556 0.19
557 0.16
558 0.1
559 0.13
560 0.14
561 0.14
562 0.15
563 0.14
564 0.17
565 0.19
566 0.2
567 0.24
568 0.29
569 0.29
570 0.31
571 0.39
572 0.37
573 0.34
574 0.36
575 0.28
576 0.25
577 0.26
578 0.23
579 0.15
580 0.15
581 0.15
582 0.13
583 0.13
584 0.12
585 0.13
586 0.15
587 0.14
588 0.22
589 0.27
590 0.29
591 0.32
592 0.34
593 0.41
594 0.43
595 0.47
596 0.43
597 0.42
598 0.42
599 0.43
600 0.49
601 0.41
602 0.39
603 0.38
604 0.36
605 0.33
606 0.39
607 0.4
608 0.37
609 0.42
610 0.49
611 0.5
612 0.53
613 0.59
614 0.59
615 0.6
616 0.6
617 0.53
618 0.49
619 0.5
620 0.45
621 0.4
622 0.33
623 0.3
624 0.26
625 0.27
626 0.24
627 0.21
628 0.21
629 0.21
630 0.2
631 0.18
632 0.2
633 0.22
634 0.21
635 0.2
636 0.22
637 0.27
638 0.31
639 0.33
640 0.34
641 0.31
642 0.32
643 0.32
644 0.34
645 0.35
646 0.32
647 0.28
648 0.23
649 0.26
650 0.27
651 0.32
652 0.32
653 0.31
654 0.37
655 0.4
656 0.5
657 0.55
658 0.58
659 0.61
660 0.66
661 0.7
662 0.66
663 0.73
664 0.7
665 0.72
666 0.68
667 0.68
668 0.65
669 0.57
670 0.55
671 0.52
672 0.53
673 0.45
674 0.44
675 0.38
676 0.37
677 0.38
678 0.41
679 0.44
680 0.46
681 0.55
682 0.62
683 0.68
684 0.72
685 0.73
686 0.76
687 0.74
688 0.72
689 0.67
690 0.61
691 0.57
692 0.5
693 0.45
694 0.37
695 0.3
696 0.23
697 0.18
698 0.15
699 0.12
700 0.1
701 0.1
702 0.1
703 0.09
704 0.08
705 0.08
706 0.1
707 0.11
708 0.13
709 0.17
710 0.24
711 0.3
712 0.38
713 0.46
714 0.53
715 0.6
716 0.68
717 0.71
718 0.74
719 0.79
720 0.8
721 0.81
722 0.81
723 0.81
724 0.79
725 0.77
726 0.74
727 0.71
728 0.67
729 0.62
730 0.58
731 0.5
732 0.45
733 0.39
734 0.33
735 0.27
736 0.22
737 0.21
738 0.2
739 0.21
740 0.22
741 0.24
742 0.24
743 0.27
744 0.3
745 0.28
746 0.3
747 0.3
748 0.27
749 0.31
750 0.31
751 0.28
752 0.26
753 0.26
754 0.23
755 0.22
756 0.2
757 0.14
758 0.14
759 0.13
760 0.12
761 0.11
762 0.1
763 0.14
764 0.14
765 0.14
766 0.15
767 0.2
768 0.24
769 0.28
770 0.32
771 0.36
772 0.39
773 0.44
774 0.45
775 0.49
776 0.48
777 0.52
778 0.58
779 0.56
780 0.54
781 0.51
782 0.53
783 0.49
784 0.51
785 0.43
786 0.35
787 0.32
788 0.35
789 0.34
790 0.34
791 0.29
792 0.3
793 0.29
794 0.29
795 0.27
796 0.22
797 0.2
798 0.16
799 0.15
800 0.1
801 0.09
802 0.07
803 0.06
804 0.07
805 0.07
806 0.08
807 0.08
808 0.08
809 0.09
810 0.11
811 0.12
812 0.16
813 0.16
814 0.17
815 0.18
816 0.21
817 0.22
818 0.2
819 0.2
820 0.18
821 0.2
822 0.23
823 0.24
824 0.25
825 0.28
826 0.29
827 0.31
828 0.3
829 0.29
830 0.32
831 0.34
832 0.35
833 0.38
834 0.46
835 0.53
836 0.62
837 0.68
838 0.68
839 0.74
840 0.78
841 0.81
842 0.82
843 0.81
844 0.81