Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CIR0

Protein Details
Accession Q6CIR0    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
59-87FSSDEEEKEKKPKKQNKKAKVKAGPIVDSHydrophilic
390-417DSEDEKKKKAKKAKKSKRRLPNANEMPSBasic
751-772LEEQENIKKKQKKTFRDPTFYLHydrophilic
810-837QVHKQTATVKWDKKRKKYVNTQGLDNKKHydrophilic
891-916RTVGGKFKHKTQKAPKLPDKHRDDYABasic
947-973VDEIRKLREIKEKKRSKNARPTKRRKHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
66-81KEKKPKKQNKKAKVKA
395-409KKKKAKKAKKSKRRL
688-702KRRRRQIAPIQRKAK
903-906KAPK
950-973IRKLREIKEKKRSKNARPTKRRKH
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012541  DBP10_C  
IPR033517  DDX54/DBP10_DEAD-box_helicase  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG kla:KLLA0_F24684g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08147  DBP10CT  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17959  DEADc_DDX54  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MVDSSKRALPAEDYSSEDEDAFDIAGDIALNADSEDSDISDDDNDNIGFQAEVQDVIEFSSDEEEKEKKPKKQNKKAKVKAGPIVDSKFPSLELSDDEKKATNESDDDLNDYFNTTADAAAKHKKGSFASFGLSKLVLINISKKGFRQPTPIQRKTIPLILQKRDIVGMARTGSGKTAAFVLPMIEKLKTHSAKIGVRAVILSPSRELAIQTHRVFKEFSKGSDLRSILLTGGDSLEDQFGMMMGNPDVVIATPGRFLHLKVEMNLDLKSVEYVVFDEADRLFEMGFQEQLNELLVAFPTNRQTLLFSATLPSSLVDFAKAGLSNPVLVRLDAETKISENLEMLFISIKKDEREANLLYLLQEAIKMPVATESQIKKLKQQNDADSDSDDSEDEKKKKAKKAKKSKRRLPNANEMPSEKATIVFVPTRHHVEYVTQLLKNCGYLVSYIYGALNQHARKQQLYNFRAGLTSILVVTDVAARGVDIPLLANVINYSLPGSSKIFIHRVGRTARAGNRGWAFSIVSENELPYLLDLELFLGKKILLTPMYESSCQILRKKAESEGNNNFTDPKVSYTTRMVLGACPRSEIDGMGDLYSNMIKSDFELNTVKGVALKAEKLYFRTRTPASAESMKRSKEILRSGWDEQNIYFGKNAEKEKLDFLAKLQHRNNKETVFEFARNPDDEMSVLMKRRRRQIAPIQRKAKERQELLEKERMIGLRHSIEDEILKGEDNEVGYSVPDEVLKEFEDADVLLEEQENIKKKQKKTFRDPTFYLSHFAPTSDIQDKQLQISSGFTNDASNAAFDLANDDKVQVHKQTATVKWDKKRKKYVNTQGLDNKKYIIGESGQKIPASFRSGKFQDWSKARKIAPLKVGARESTIPSNLLADPTSPSERTVGGKFKHKTQKAPKLPDKHRDDYAFQKKKVEAALERGVRVKGYNGPGMKQEIKSVDEIRKLREIKEKKRSKNARPTKRRKH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.35
3 0.34
4 0.3
5 0.24
6 0.19
7 0.17
8 0.13
9 0.09
10 0.07
11 0.06
12 0.06
13 0.06
14 0.05
15 0.05
16 0.05
17 0.05
18 0.05
19 0.05
20 0.05
21 0.06
22 0.06
23 0.06
24 0.07
25 0.07
26 0.08
27 0.1
28 0.11
29 0.11
30 0.14
31 0.13
32 0.12
33 0.12
34 0.12
35 0.1
36 0.09
37 0.11
38 0.09
39 0.1
40 0.1
41 0.1
42 0.09
43 0.1
44 0.11
45 0.07
46 0.07
47 0.11
48 0.11
49 0.12
50 0.16
51 0.18
52 0.22
53 0.32
54 0.4
55 0.45
56 0.56
57 0.66
58 0.74
59 0.82
60 0.89
61 0.9
62 0.93
63 0.94
64 0.94
65 0.93
66 0.9
67 0.86
68 0.81
69 0.76
70 0.71
71 0.65
72 0.58
73 0.51
74 0.44
75 0.37
76 0.31
77 0.26
78 0.2
79 0.18
80 0.18
81 0.23
82 0.27
83 0.28
84 0.29
85 0.3
86 0.3
87 0.31
88 0.28
89 0.24
90 0.2
91 0.22
92 0.25
93 0.23
94 0.26
95 0.23
96 0.22
97 0.19
98 0.19
99 0.16
100 0.12
101 0.12
102 0.09
103 0.1
104 0.11
105 0.13
106 0.16
107 0.23
108 0.26
109 0.28
110 0.29
111 0.33
112 0.34
113 0.38
114 0.38
115 0.32
116 0.35
117 0.33
118 0.32
119 0.29
120 0.26
121 0.21
122 0.17
123 0.15
124 0.13
125 0.13
126 0.16
127 0.2
128 0.23
129 0.25
130 0.25
131 0.34
132 0.39
133 0.41
134 0.46
135 0.5
136 0.58
137 0.68
138 0.72
139 0.68
140 0.64
141 0.67
142 0.61
143 0.58
144 0.53
145 0.52
146 0.55
147 0.55
148 0.57
149 0.52
150 0.49
151 0.43
152 0.37
153 0.3
154 0.23
155 0.21
156 0.17
157 0.17
158 0.17
159 0.16
160 0.16
161 0.16
162 0.15
163 0.11
164 0.13
165 0.12
166 0.11
167 0.11
168 0.12
169 0.1
170 0.13
171 0.14
172 0.12
173 0.12
174 0.15
175 0.25
176 0.25
177 0.26
178 0.28
179 0.33
180 0.36
181 0.41
182 0.43
183 0.34
184 0.33
185 0.32
186 0.28
187 0.26
188 0.24
189 0.2
190 0.15
191 0.15
192 0.15
193 0.15
194 0.15
195 0.14
196 0.19
197 0.26
198 0.28
199 0.36
200 0.35
201 0.37
202 0.37
203 0.34
204 0.38
205 0.32
206 0.31
207 0.32
208 0.32
209 0.34
210 0.39
211 0.39
212 0.3
213 0.28
214 0.27
215 0.18
216 0.18
217 0.15
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.05
239 0.06
240 0.08
241 0.08
242 0.1
243 0.11
244 0.11
245 0.15
246 0.2
247 0.21
248 0.21
249 0.25
250 0.25
251 0.26
252 0.26
253 0.21
254 0.16
255 0.14
256 0.13
257 0.09
258 0.07
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.08
263 0.07
264 0.09
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.08
269 0.07
270 0.08
271 0.09
272 0.08
273 0.1
274 0.08
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.09
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.12
291 0.13
292 0.16
293 0.15
294 0.13
295 0.14
296 0.13
297 0.13
298 0.12
299 0.11
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.09
310 0.09
311 0.1
312 0.1
313 0.13
314 0.12
315 0.12
316 0.12
317 0.12
318 0.14
319 0.13
320 0.14
321 0.11
322 0.12
323 0.13
324 0.12
325 0.11
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.08
334 0.1
335 0.11
336 0.11
337 0.13
338 0.15
339 0.16
340 0.21
341 0.21
342 0.2
343 0.2
344 0.19
345 0.17
346 0.16
347 0.13
348 0.08
349 0.07
350 0.06
351 0.06
352 0.07
353 0.07
354 0.06
355 0.08
356 0.09
357 0.09
358 0.15
359 0.15
360 0.21
361 0.27
362 0.27
363 0.33
364 0.4
365 0.46
366 0.48
367 0.53
368 0.53
369 0.53
370 0.56
371 0.49
372 0.43
373 0.37
374 0.29
375 0.23
376 0.17
377 0.12
378 0.13
379 0.19
380 0.19
381 0.23
382 0.29
383 0.35
384 0.43
385 0.53
386 0.58
387 0.63
388 0.73
389 0.8
390 0.85
391 0.89
392 0.91
393 0.91
394 0.92
395 0.91
396 0.86
397 0.86
398 0.84
399 0.79
400 0.71
401 0.62
402 0.54
403 0.45
404 0.39
405 0.27
406 0.19
407 0.14
408 0.12
409 0.12
410 0.11
411 0.11
412 0.12
413 0.14
414 0.18
415 0.18
416 0.18
417 0.16
418 0.16
419 0.18
420 0.22
421 0.22
422 0.2
423 0.2
424 0.2
425 0.2
426 0.19
427 0.15
428 0.1
429 0.07
430 0.06
431 0.07
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.11
440 0.11
441 0.15
442 0.18
443 0.2
444 0.21
445 0.23
446 0.28
447 0.34
448 0.35
449 0.34
450 0.32
451 0.31
452 0.29
453 0.27
454 0.22
455 0.11
456 0.1
457 0.06
458 0.05
459 0.05
460 0.04
461 0.04
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.03
466 0.03
467 0.04
468 0.04
469 0.04
470 0.03
471 0.03
472 0.03
473 0.04
474 0.04
475 0.03
476 0.03
477 0.04
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.04
483 0.06
484 0.07
485 0.07
486 0.09
487 0.11
488 0.12
489 0.15
490 0.19
491 0.18
492 0.22
493 0.23
494 0.25
495 0.24
496 0.27
497 0.27
498 0.29
499 0.29
500 0.28
501 0.28
502 0.26
503 0.24
504 0.2
505 0.17
506 0.12
507 0.13
508 0.09
509 0.09
510 0.09
511 0.09
512 0.08
513 0.08
514 0.08
515 0.05
516 0.06
517 0.05
518 0.04
519 0.04
520 0.05
521 0.07
522 0.07
523 0.07
524 0.06
525 0.06
526 0.06
527 0.07
528 0.08
529 0.07
530 0.08
531 0.1
532 0.14
533 0.16
534 0.16
535 0.16
536 0.16
537 0.19
538 0.21
539 0.21
540 0.22
541 0.22
542 0.25
543 0.27
544 0.3
545 0.34
546 0.34
547 0.4
548 0.43
549 0.45
550 0.42
551 0.4
552 0.36
553 0.29
554 0.27
555 0.2
556 0.15
557 0.15
558 0.15
559 0.17
560 0.19
561 0.21
562 0.2
563 0.2
564 0.18
565 0.16
566 0.2
567 0.22
568 0.19
569 0.18
570 0.18
571 0.18
572 0.18
573 0.16
574 0.12
575 0.11
576 0.11
577 0.1
578 0.1
579 0.09
580 0.09
581 0.09
582 0.08
583 0.05
584 0.05
585 0.04
586 0.06
587 0.11
588 0.11
589 0.14
590 0.16
591 0.16
592 0.16
593 0.17
594 0.15
595 0.11
596 0.11
597 0.1
598 0.1
599 0.1
600 0.11
601 0.13
602 0.14
603 0.17
604 0.22
605 0.24
606 0.24
607 0.29
608 0.28
609 0.28
610 0.32
611 0.31
612 0.29
613 0.34
614 0.35
615 0.36
616 0.4
617 0.38
618 0.34
619 0.33
620 0.33
621 0.32
622 0.35
623 0.33
624 0.33
625 0.37
626 0.4
627 0.42
628 0.4
629 0.34
630 0.29
631 0.31
632 0.26
633 0.22
634 0.19
635 0.16
636 0.18
637 0.22
638 0.24
639 0.21
640 0.23
641 0.23
642 0.24
643 0.27
644 0.25
645 0.2
646 0.19
647 0.25
648 0.26
649 0.33
650 0.37
651 0.41
652 0.44
653 0.48
654 0.51
655 0.44
656 0.44
657 0.37
658 0.37
659 0.35
660 0.33
661 0.3
662 0.28
663 0.29
664 0.27
665 0.27
666 0.22
667 0.18
668 0.16
669 0.16
670 0.16
671 0.15
672 0.18
673 0.22
674 0.26
675 0.3
676 0.39
677 0.45
678 0.45
679 0.52
680 0.59
681 0.66
682 0.72
683 0.77
684 0.77
685 0.75
686 0.78
687 0.76
688 0.74
689 0.7
690 0.62
691 0.58
692 0.59
693 0.61
694 0.6
695 0.6
696 0.51
697 0.44
698 0.44
699 0.39
700 0.31
701 0.26
702 0.24
703 0.2
704 0.2
705 0.21
706 0.18
707 0.18
708 0.16
709 0.15
710 0.13
711 0.11
712 0.1
713 0.09
714 0.09
715 0.1
716 0.1
717 0.09
718 0.08
719 0.08
720 0.07
721 0.08
722 0.08
723 0.07
724 0.06
725 0.07
726 0.07
727 0.09
728 0.1
729 0.1
730 0.09
731 0.09
732 0.09
733 0.08
734 0.08
735 0.07
736 0.06
737 0.06
738 0.06
739 0.06
740 0.08
741 0.12
742 0.16
743 0.19
744 0.28
745 0.36
746 0.42
747 0.52
748 0.6
749 0.66
750 0.72
751 0.8
752 0.81
753 0.82
754 0.79
755 0.75
756 0.71
757 0.62
758 0.54
759 0.44
760 0.37
761 0.29
762 0.26
763 0.22
764 0.17
765 0.21
766 0.22
767 0.22
768 0.22
769 0.27
770 0.27
771 0.27
772 0.29
773 0.24
774 0.21
775 0.22
776 0.2
777 0.17
778 0.17
779 0.15
780 0.13
781 0.12
782 0.13
783 0.1
784 0.09
785 0.08
786 0.09
787 0.08
788 0.07
789 0.12
790 0.12
791 0.13
792 0.13
793 0.13
794 0.14
795 0.16
796 0.2
797 0.18
798 0.2
799 0.21
800 0.25
801 0.32
802 0.34
803 0.4
804 0.46
805 0.52
806 0.58
807 0.67
808 0.73
809 0.76
810 0.82
811 0.84
812 0.85
813 0.88
814 0.9
815 0.9
816 0.84
817 0.82
818 0.8
819 0.79
820 0.71
821 0.6
822 0.51
823 0.42
824 0.38
825 0.3
826 0.24
827 0.19
828 0.23
829 0.26
830 0.3
831 0.31
832 0.31
833 0.3
834 0.29
835 0.3
836 0.3
837 0.33
838 0.29
839 0.37
840 0.39
841 0.42
842 0.44
843 0.46
844 0.47
845 0.5
846 0.54
847 0.52
848 0.57
849 0.55
850 0.59
851 0.59
852 0.58
853 0.57
854 0.6
855 0.57
856 0.56
857 0.59
858 0.51
859 0.49
860 0.44
861 0.4
862 0.36
863 0.34
864 0.28
865 0.25
866 0.27
867 0.23
868 0.22
869 0.18
870 0.14
871 0.15
872 0.19
873 0.23
874 0.2
875 0.21
876 0.21
877 0.22
878 0.26
879 0.29
880 0.33
881 0.33
882 0.42
883 0.44
884 0.53
885 0.61
886 0.63
887 0.68
888 0.7
889 0.77
890 0.78
891 0.86
892 0.86
893 0.86
894 0.9
895 0.89
896 0.87
897 0.82
898 0.79
899 0.73
900 0.69
901 0.69
902 0.71
903 0.7
904 0.63
905 0.64
906 0.58
907 0.57
908 0.57
909 0.53
910 0.47
911 0.45
912 0.52
913 0.49
914 0.49
915 0.48
916 0.44
917 0.37
918 0.33
919 0.29
920 0.27
921 0.29
922 0.35
923 0.33
924 0.35
925 0.38
926 0.44
927 0.46
928 0.39
929 0.4
930 0.36
931 0.37
932 0.4
933 0.42
934 0.41
935 0.45
936 0.46
937 0.45
938 0.51
939 0.51
940 0.51
941 0.56
942 0.6
943 0.62
944 0.7
945 0.76
946 0.76
947 0.86
948 0.9
949 0.91
950 0.92
951 0.92
952 0.93
953 0.94