FuNGI

W4JW06

Protein Details

Accession

W4JW06

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
322-344	SSSSTSYRRSRPPRKQYKCDFCG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 8, extr 8, cyto 6, nucl 3, cyto_pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding
KEGG	hir:HETIRDRAFT_216527 -
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF14223 Retrotran_gag_2

Amino Acid Sequences

MSYLPISFLIVLCSLNTRGPRAILSSDSYPLDHRLWALRSSDFALHRFIHTFWSPICCATPFWPHPIAATSSPLLSLPFPSSHIASNTFPCLCHSCHTMSDPSFALPSISPLNNRNYPSWSKEIKAWLRLKGLWILVSGDETAPVGTKEKPAEAREVAEWKRNAQKATSALLLSVKEQFRGILEGIEDDPIAIWTKLEEQFNKKSAGSRFNAMEDLFSIKKRNDESLQSLIHRVDESMRVLKNLRDSGFDLKKQDEELTCMALLWSLPSEFDTFCSSLSLMDVLSRSKLEDAFRREDLNRARRSDPTDSAQALVASFASSPSSSSTSYRRSRPPRKQYKCDFCGATGHTDDRCFKRINEELKKSKPQQAHSVQAPEASGPMQFAGNASFRSPAPSPSSTAPSLVTDLDWNADTGATSHMTPHRHWLRNYRPFVIPIRLADSSVIYSAGVGTVVFNPVVGGKRAQSVEFSNVLHVPDLGCNLLFVLYLTQHKHFSMLIEGSSMHFSWDGAVWFMAVIPDGSNNAYLQGTTSTVVLQSAGAASTLPLDLSLWHRRLCHHHHAGVQRMVKECLVTGLQLDSDVQPDPVCEPCLSGKMHAHPFPSTGSVTSKPLELVHSDLHGPLPVATHSGMRYWITFIDEFTKLKVVYVLRLKSDAFEAFKHYKAYVENLTRQCILAL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.18
3	0.2
4	0.22
5	0.23
6	0.24
7	0.26
8	0.26
9	0.28
10	0.26
11	0.29
12	0.28
13	0.29
14	0.29
15	0.28
16	0.26
17	0.28
18	0.26
19	0.22
20	0.22
21	0.25
22	0.26
23	0.29
24	0.3
25	0.27
26	0.27
27	0.3
28	0.33
29	0.3
30	0.29
31	0.3
32	0.29
33	0.3
34	0.3
35	0.27
36	0.28
37	0.26
38	0.27
39	0.24
40	0.28
41	0.27
42	0.26
43	0.28
44	0.23
45	0.24
46	0.25
47	0.34
48	0.31
49	0.36
50	0.37
51	0.35
52	0.35
53	0.36
54	0.36
55	0.28
56	0.29
57	0.24
58	0.21
59	0.21
60	0.2
61	0.18
62	0.14
63	0.14
64	0.14
65	0.14
66	0.16
67	0.18
68	0.19
69	0.21
70	0.22
71	0.24
72	0.24
73	0.26
74	0.28
75	0.27
76	0.25
77	0.26
78	0.27
79	0.25
80	0.26
81	0.27
82	0.26
83	0.28
84	0.31
85	0.35
86	0.32
87	0.33
88	0.31
89	0.27
90	0.25
91	0.22
92	0.2
93	0.13
94	0.15
95	0.17
96	0.18
97	0.2
98	0.24
99	0.31
100	0.35
101	0.38
102	0.37
103	0.39
104	0.41
105	0.44
106	0.48
107	0.44
108	0.4
109	0.42
110	0.5
111	0.49
112	0.54
113	0.53
114	0.51
115	0.52
116	0.51
117	0.48
118	0.43
119	0.38
120	0.29
121	0.25
122	0.21
123	0.17
124	0.17
125	0.15
126	0.1
127	0.09
128	0.08
129	0.08
130	0.07
131	0.07
132	0.08
133	0.09
134	0.13
135	0.15
136	0.19
137	0.24
138	0.26
139	0.31
140	0.3
141	0.32
142	0.31
143	0.37
144	0.35
145	0.37
146	0.36
147	0.34
148	0.41
149	0.42
150	0.41
151	0.34
152	0.38
153	0.34
154	0.36
155	0.34
156	0.25
157	0.22
158	0.23
159	0.22
160	0.18
161	0.21
162	0.18
163	0.17
164	0.17
165	0.16
166	0.15
167	0.17
168	0.16
169	0.1
170	0.1
171	0.11
172	0.11
173	0.11
174	0.1
175	0.07
176	0.07
177	0.07
178	0.08
179	0.07
180	0.06
181	0.06
182	0.11
183	0.15
184	0.19
185	0.22
186	0.27
187	0.33
188	0.36
189	0.38
190	0.34
191	0.37
192	0.38
193	0.41
194	0.37
195	0.36
196	0.34
197	0.33
198	0.34
199	0.28
200	0.23
201	0.16
202	0.18
203	0.16
204	0.15
205	0.17
206	0.15
207	0.2
208	0.21
209	0.26
210	0.25
211	0.28
212	0.32
213	0.35
214	0.37
215	0.34
216	0.34
217	0.29
218	0.26
219	0.22
220	0.17
221	0.13
222	0.13
223	0.15
224	0.18
225	0.18
226	0.18
227	0.2
228	0.21
229	0.25
230	0.26
231	0.24
232	0.22
233	0.24
234	0.31
235	0.35
236	0.36
237	0.33
238	0.3
239	0.3
240	0.29
241	0.29
242	0.21
243	0.2
244	0.18
245	0.17
246	0.16
247	0.14
248	0.13
249	0.1
250	0.09
251	0.06
252	0.06
253	0.04
254	0.04
255	0.05
256	0.07
257	0.07
258	0.08
259	0.11
260	0.11
261	0.11
262	0.11
263	0.11
264	0.09
265	0.1
266	0.08
267	0.05
268	0.06
269	0.06
270	0.06
271	0.07
272	0.07
273	0.07
274	0.08
275	0.1
276	0.12
277	0.18
278	0.23
279	0.26
280	0.27
281	0.3
282	0.29
283	0.34
284	0.4
285	0.42
286	0.42
287	0.41
288	0.42
289	0.42
290	0.47
291	0.46
292	0.41
293	0.35
294	0.34
295	0.31
296	0.29
297	0.26
298	0.21
299	0.16
300	0.13
301	0.09
302	0.05
303	0.05
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.05
308	0.06
309	0.08
310	0.09
311	0.11
312	0.15
313	0.23
314	0.27
315	0.32
316	0.4
317	0.48
318	0.58
319	0.67
320	0.74
321	0.77
322	0.82
323	0.86
324	0.87
325	0.87
326	0.8
327	0.74
328	0.63
329	0.53
330	0.48
331	0.39
332	0.32
333	0.23
334	0.21
335	0.17
336	0.18
337	0.2
338	0.19
339	0.21
340	0.2
341	0.19
342	0.24
343	0.3
344	0.38
345	0.44
346	0.49
347	0.53
348	0.58
349	0.65
350	0.62
351	0.62
352	0.57
353	0.52
354	0.53
355	0.51
356	0.51
357	0.46
358	0.46
359	0.39
360	0.35
361	0.31
362	0.22
363	0.17
364	0.11
365	0.08
366	0.05
367	0.06
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.07
372	0.07
373	0.08
374	0.08
375	0.09
376	0.09
377	0.13
378	0.13
379	0.14
380	0.18
381	0.19
382	0.21
383	0.22
384	0.26
385	0.23
386	0.23
387	0.21
388	0.16
389	0.16
390	0.14
391	0.12
392	0.09
393	0.08
394	0.08
395	0.08
396	0.07
397	0.06
398	0.06
399	0.05
400	0.05
401	0.07
402	0.07
403	0.06
404	0.09
405	0.13
406	0.15
407	0.16
408	0.25
409	0.33
410	0.38
411	0.4
412	0.48
413	0.55
414	0.63
415	0.66
416	0.6
417	0.53
418	0.51
419	0.52
420	0.46
421	0.37
422	0.28
423	0.29
424	0.25
425	0.24
426	0.21
427	0.18
428	0.14
429	0.12
430	0.11
431	0.06
432	0.06
433	0.06
434	0.05
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.07
444	0.08
445	0.09
446	0.09
447	0.09
448	0.14
449	0.15
450	0.15
451	0.16
452	0.17
453	0.2
454	0.21
455	0.2
456	0.18
457	0.18
458	0.18
459	0.16
460	0.14
461	0.11
462	0.09
463	0.1
464	0.09
465	0.07
466	0.07
467	0.07
468	0.07
469	0.06
470	0.05
471	0.05
472	0.07
473	0.1
474	0.13
475	0.15
476	0.16
477	0.17
478	0.18
479	0.17
480	0.16
481	0.17
482	0.16
483	0.14
484	0.13
485	0.13
486	0.13
487	0.15
488	0.13
489	0.1
490	0.09
491	0.08
492	0.09
493	0.1
494	0.09
495	0.08
496	0.08
497	0.07
498	0.07
499	0.07
500	0.06
501	0.05
502	0.05
503	0.04
504	0.05
505	0.06
506	0.07
507	0.07
508	0.07
509	0.08
510	0.08
511	0.08
512	0.08
513	0.09
514	0.09
515	0.09
516	0.09
517	0.08
518	0.08
519	0.08
520	0.08
521	0.06
522	0.06
523	0.05
524	0.05
525	0.05
526	0.05
527	0.05
528	0.05
529	0.05
530	0.05
531	0.05
532	0.05
533	0.06
534	0.13
535	0.2
536	0.22
537	0.25
538	0.26
539	0.3
540	0.38
541	0.45
542	0.49
543	0.5
544	0.51
545	0.56
546	0.61
547	0.65
548	0.64
549	0.61
550	0.54
551	0.49
552	0.46
553	0.39
554	0.33
555	0.25
556	0.21
557	0.17
558	0.14
559	0.12
560	0.11
561	0.11
562	0.1
563	0.12
564	0.09
565	0.1
566	0.1
567	0.1
568	0.09
569	0.1
570	0.11
571	0.13
572	0.14
573	0.13
574	0.15
575	0.16
576	0.21
577	0.22
578	0.24
579	0.27
580	0.33
581	0.4
582	0.41
583	0.42
584	0.38
585	0.38
586	0.37
587	0.34
588	0.28
589	0.22
590	0.24
591	0.24
592	0.26
593	0.25
594	0.24
595	0.22
596	0.22
597	0.22
598	0.19
599	0.2
600	0.19
601	0.2
602	0.2
603	0.19
604	0.19
605	0.17
606	0.16
607	0.13
608	0.13
609	0.11
610	0.13
611	0.13
612	0.15
613	0.15
614	0.15
615	0.18
616	0.17
617	0.18
618	0.17
619	0.18
620	0.2
621	0.19
622	0.2
623	0.22
624	0.24
625	0.23
626	0.24
627	0.27
628	0.23
629	0.23
630	0.27
631	0.23
632	0.28
633	0.36
634	0.38
635	0.35
636	0.38
637	0.38
638	0.34
639	0.37
640	0.33
641	0.27
642	0.25
643	0.3
644	0.32
645	0.34
646	0.35
647	0.32
648	0.3
649	0.3
650	0.35
651	0.36
652	0.4
653	0.47
654	0.48
655	0.52
656	0.49

W4JW06

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer