Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4JWD4

Protein Details
Accession W4JWD4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
311-335GVRLNLRETERKRRKKVDDPAALAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
321-345RKRRKKVDDPAALAAAANKGKGKRR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021740  Velvet  
IPR037525  Velvet_dom  
IPR038491  Velvet_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
KEGG hir:HETIRDRAFT_65493  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11754  Velvet  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51821  VELVET  
Amino Acid Sequences MYGHPYGSQPQQGYSSQEYPPQPQPASASSASRSREDRPPRHHSSSRSIGDPLNFTSGQFSGQLIRAELVELQKADLGRKYARKDRRPLDPPPVVQLRLYKVQSDQREVEVENYDNMGLICHVDLFPVPPQESSLREGSTYPYTFPAPQPPYQGAGMPPHGAPSVGMPMQLPPMHIPPTSQYTHDPATASHHPSHPPQEFDVVHIHQNHPITESSKCTEALAGTTFVQASNLDYKGNKVLMFVFSDLAVKMEGNFILRYRCFDLFSKVSTDEGETPVWAQCYGGQFRVYSTKEFPGLRASTDLTKHLSYFGVRLNLRETERKRRKKVDDPAALAAAANKGKGKRRDEGDGGEGGYRQYDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.38
3 0.33
4 0.39
5 0.4
6 0.42
7 0.47
8 0.48
9 0.42
10 0.4
11 0.42
12 0.38
13 0.41
14 0.37
15 0.33
16 0.29
17 0.34
18 0.35
19 0.35
20 0.36
21 0.35
22 0.43
23 0.5
24 0.57
25 0.6
26 0.66
27 0.71
28 0.77
29 0.78
30 0.75
31 0.73
32 0.74
33 0.68
34 0.61
35 0.55
36 0.49
37 0.45
38 0.42
39 0.34
40 0.3
41 0.26
42 0.23
43 0.23
44 0.21
45 0.19
46 0.17
47 0.15
48 0.13
49 0.16
50 0.17
51 0.15
52 0.15
53 0.14
54 0.14
55 0.16
56 0.14
57 0.13
58 0.12
59 0.12
60 0.14
61 0.14
62 0.16
63 0.16
64 0.18
65 0.22
66 0.28
67 0.35
68 0.43
69 0.52
70 0.59
71 0.67
72 0.68
73 0.73
74 0.73
75 0.72
76 0.73
77 0.7
78 0.62
79 0.6
80 0.58
81 0.48
82 0.44
83 0.41
84 0.36
85 0.36
86 0.35
87 0.29
88 0.29
89 0.36
90 0.38
91 0.4
92 0.37
93 0.32
94 0.33
95 0.32
96 0.3
97 0.25
98 0.22
99 0.17
100 0.16
101 0.14
102 0.12
103 0.11
104 0.09
105 0.06
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.07
113 0.09
114 0.11
115 0.12
116 0.11
117 0.13
118 0.15
119 0.17
120 0.19
121 0.19
122 0.16
123 0.16
124 0.17
125 0.18
126 0.21
127 0.19
128 0.17
129 0.16
130 0.17
131 0.18
132 0.19
133 0.25
134 0.24
135 0.25
136 0.28
137 0.28
138 0.29
139 0.28
140 0.27
141 0.2
142 0.19
143 0.18
144 0.16
145 0.14
146 0.13
147 0.12
148 0.11
149 0.1
150 0.08
151 0.09
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.1
157 0.11
158 0.1
159 0.09
160 0.11
161 0.13
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.17
166 0.17
167 0.17
168 0.17
169 0.18
170 0.19
171 0.2
172 0.18
173 0.14
174 0.19
175 0.21
176 0.23
177 0.22
178 0.22
179 0.23
180 0.25
181 0.32
182 0.28
183 0.26
184 0.24
185 0.27
186 0.25
187 0.25
188 0.28
189 0.22
190 0.23
191 0.23
192 0.23
193 0.21
194 0.22
195 0.2
196 0.17
197 0.17
198 0.15
199 0.15
200 0.18
201 0.16
202 0.17
203 0.17
204 0.15
205 0.14
206 0.13
207 0.13
208 0.11
209 0.11
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.09
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.1
218 0.1
219 0.11
220 0.11
221 0.13
222 0.15
223 0.17
224 0.15
225 0.12
226 0.13
227 0.14
228 0.15
229 0.14
230 0.12
231 0.1
232 0.11
233 0.1
234 0.09
235 0.08
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.13
244 0.14
245 0.17
246 0.2
247 0.21
248 0.22
249 0.23
250 0.29
251 0.27
252 0.29
253 0.29
254 0.25
255 0.24
256 0.22
257 0.23
258 0.19
259 0.19
260 0.17
261 0.14
262 0.14
263 0.15
264 0.15
265 0.12
266 0.1
267 0.11
268 0.16
269 0.18
270 0.2
271 0.2
272 0.19
273 0.21
274 0.29
275 0.28
276 0.26
277 0.27
278 0.28
279 0.32
280 0.32
281 0.32
282 0.32
283 0.31
284 0.29
285 0.28
286 0.27
287 0.26
288 0.28
289 0.29
290 0.25
291 0.25
292 0.24
293 0.23
294 0.23
295 0.19
296 0.2
297 0.22
298 0.26
299 0.25
300 0.26
301 0.29
302 0.32
303 0.35
304 0.42
305 0.44
306 0.48
307 0.59
308 0.68
309 0.74
310 0.79
311 0.84
312 0.85
313 0.89
314 0.89
315 0.88
316 0.83
317 0.78
318 0.69
319 0.59
320 0.49
321 0.39
322 0.33
323 0.24
324 0.19
325 0.19
326 0.23
327 0.32
328 0.41
329 0.45
330 0.49
331 0.53
332 0.6
333 0.62
334 0.62
335 0.57
336 0.51
337 0.47
338 0.4
339 0.35
340 0.26