Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HEC1

Protein Details
Accession C1HEC1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-66AEQEKLRKEREQRAELKRKLDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
52-106RKEREQRAELKRKLDEAEEHKTREREEKRRRLAEESRRKREAEAEAKERARRRRL
Subcellular Location(s) nucl 19.5, mito_nucl 10.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004098  Prp18  
IPR014906  PRP4-like  
IPR036285  PRP4-like_sf  
IPR039979  PRPF18  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG pbl:PAAG_09112  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02840  Prp18  
PF08799  PRP4  
Amino Acid Sequences MDFATLMAKEISKAKSPQTSTPSSGSGKQYVKRSELEAARLAAYNAEQEKLRKEREQRAELKRKLDEAEEHKTREREEKRRRLAEESRRKREAEAEAKERARRRRLGLPEIPEGSPTDSKNITPLEDHERDPNENEVIDKLRAAGEPARLFGEGHKARVKRYRRLVQRSLTPQPQASEGPIPTTLVLVPEAEMKVPSKLPKDDEGRKFVFRQLASYFTMILKEWEIALAKRDAAVKQSYQGKQAYNAMVQSRENMRPLFRKFEKGDLEESILEPVVEIVRNAQDRRYVDANDGYLRLSIGKAAWPIGVTMVGIHERSAREKLHESDKGQAHIMSDEITRKFLQSIKRCLTFRPGPLAAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.41
3 0.45
4 0.52
5 0.53
6 0.56
7 0.54
8 0.54
9 0.52
10 0.47
11 0.49
12 0.45
13 0.46
14 0.46
15 0.48
16 0.53
17 0.53
18 0.54
19 0.5
20 0.49
21 0.49
22 0.47
23 0.46
24 0.41
25 0.37
26 0.34
27 0.32
28 0.29
29 0.21
30 0.18
31 0.18
32 0.16
33 0.16
34 0.16
35 0.18
36 0.26
37 0.32
38 0.37
39 0.39
40 0.46
41 0.55
42 0.63
43 0.7
44 0.72
45 0.77
46 0.82
47 0.8
48 0.79
49 0.72
50 0.65
51 0.57
52 0.51
53 0.48
54 0.44
55 0.49
56 0.46
57 0.47
58 0.49
59 0.48
60 0.47
61 0.49
62 0.52
63 0.54
64 0.6
65 0.67
66 0.72
67 0.78
68 0.79
69 0.77
70 0.78
71 0.78
72 0.78
73 0.78
74 0.77
75 0.73
76 0.7
77 0.63
78 0.6
79 0.58
80 0.57
81 0.53
82 0.5
83 0.53
84 0.56
85 0.59
86 0.59
87 0.58
88 0.56
89 0.54
90 0.55
91 0.57
92 0.61
93 0.65
94 0.64
95 0.61
96 0.59
97 0.56
98 0.5
99 0.42
100 0.35
101 0.3
102 0.26
103 0.21
104 0.19
105 0.17
106 0.17
107 0.2
108 0.2
109 0.17
110 0.15
111 0.18
112 0.23
113 0.24
114 0.26
115 0.27
116 0.28
117 0.29
118 0.3
119 0.29
120 0.21
121 0.18
122 0.18
123 0.15
124 0.15
125 0.14
126 0.12
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.12
131 0.12
132 0.15
133 0.15
134 0.16
135 0.16
136 0.15
137 0.16
138 0.14
139 0.22
140 0.18
141 0.21
142 0.26
143 0.25
144 0.29
145 0.37
146 0.43
147 0.41
148 0.5
149 0.56
150 0.61
151 0.69
152 0.72
153 0.68
154 0.7
155 0.68
156 0.64
157 0.59
158 0.5
159 0.43
160 0.36
161 0.34
162 0.26
163 0.21
164 0.18
165 0.14
166 0.14
167 0.13
168 0.12
169 0.1
170 0.1
171 0.08
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.07
181 0.08
182 0.1
183 0.12
184 0.14
185 0.16
186 0.19
187 0.25
188 0.31
189 0.39
190 0.42
191 0.46
192 0.45
193 0.46
194 0.44
195 0.41
196 0.39
197 0.3
198 0.29
199 0.24
200 0.25
201 0.24
202 0.23
203 0.21
204 0.15
205 0.16
206 0.13
207 0.12
208 0.09
209 0.08
210 0.07
211 0.08
212 0.09
213 0.08
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.11
218 0.13
219 0.13
220 0.15
221 0.17
222 0.15
223 0.2
224 0.28
225 0.28
226 0.31
227 0.33
228 0.31
229 0.31
230 0.35
231 0.32
232 0.25
233 0.26
234 0.23
235 0.22
236 0.21
237 0.22
238 0.22
239 0.23
240 0.24
241 0.23
242 0.26
243 0.31
244 0.34
245 0.4
246 0.38
247 0.44
248 0.43
249 0.5
250 0.52
251 0.47
252 0.47
253 0.4
254 0.4
255 0.32
256 0.3
257 0.23
258 0.17
259 0.14
260 0.1
261 0.09
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.07
266 0.12
267 0.17
268 0.17
269 0.19
270 0.24
271 0.25
272 0.31
273 0.33
274 0.29
275 0.29
276 0.32
277 0.32
278 0.28
279 0.27
280 0.22
281 0.18
282 0.17
283 0.15
284 0.11
285 0.1
286 0.09
287 0.11
288 0.11
289 0.12
290 0.12
291 0.12
292 0.12
293 0.11
294 0.11
295 0.08
296 0.07
297 0.09
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.13
302 0.15
303 0.19
304 0.23
305 0.23
306 0.26
307 0.32
308 0.37
309 0.43
310 0.48
311 0.46
312 0.5
313 0.53
314 0.5
315 0.46
316 0.42
317 0.34
318 0.28
319 0.26
320 0.19
321 0.17
322 0.21
323 0.2
324 0.22
325 0.21
326 0.22
327 0.24
328 0.27
329 0.34
330 0.37
331 0.47
332 0.52
333 0.59
334 0.59
335 0.59
336 0.64
337 0.62
338 0.58
339 0.57