Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HDX6

Protein Details
Accession C1HDX6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
198-226RGEGRRERLERIRRNERRMRANERRAGKGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
123-130RKKGIGKY
194-228GKGIRGEGRRERLERIRRNERRMRANERRAGKGQG
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 9.5, cyto_nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007023  Ribosom_reg  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
KEGG pbl:PAAG_08969  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04939  RRS1  
Amino Acid Sequences MANSVPKAKATPKPERLPITVEKPTPYIFDLGHLLALDPNPISLPSISSTFNDTNNASINAALTSTARDGVQCLLNQLLTTCPITATPCDGILLTLPPCNTHLPRFKALPTPKLPTKWELFARKKGIGKYSKKLGSGGGSAETEWRKKSVYDEQSGEWVPKWGYKGKNKQADNQWLVEVDEKMWKKEEGLSAEGKGIRGEGRRERLERIRRNERRMRANERRAGKGQG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.71
3 0.67
4 0.66
5 0.64
6 0.61
7 0.58
8 0.53
9 0.46
10 0.43
11 0.41
12 0.37
13 0.32
14 0.26
15 0.19
16 0.19
17 0.2
18 0.18
19 0.17
20 0.15
21 0.13
22 0.12
23 0.12
24 0.11
25 0.08
26 0.08
27 0.08
28 0.08
29 0.09
30 0.08
31 0.09
32 0.1
33 0.12
34 0.13
35 0.14
36 0.19
37 0.19
38 0.2
39 0.21
40 0.2
41 0.19
42 0.21
43 0.21
44 0.15
45 0.14
46 0.13
47 0.1
48 0.1
49 0.09
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.08
54 0.07
55 0.07
56 0.08
57 0.1
58 0.12
59 0.11
60 0.12
61 0.11
62 0.11
63 0.11
64 0.11
65 0.09
66 0.08
67 0.09
68 0.08
69 0.07
70 0.08
71 0.09
72 0.09
73 0.11
74 0.1
75 0.1
76 0.1
77 0.1
78 0.09
79 0.08
80 0.09
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.1
86 0.13
87 0.14
88 0.19
89 0.25
90 0.28
91 0.31
92 0.32
93 0.32
94 0.37
95 0.39
96 0.4
97 0.37
98 0.39
99 0.39
100 0.41
101 0.41
102 0.36
103 0.35
104 0.32
105 0.35
106 0.39
107 0.4
108 0.44
109 0.47
110 0.47
111 0.49
112 0.46
113 0.48
114 0.47
115 0.49
116 0.47
117 0.51
118 0.5
119 0.47
120 0.46
121 0.39
122 0.32
123 0.27
124 0.23
125 0.16
126 0.13
127 0.12
128 0.15
129 0.16
130 0.15
131 0.15
132 0.15
133 0.14
134 0.14
135 0.2
136 0.26
137 0.31
138 0.34
139 0.36
140 0.35
141 0.38
142 0.38
143 0.34
144 0.25
145 0.2
146 0.15
147 0.15
148 0.17
149 0.2
150 0.27
151 0.37
152 0.47
153 0.54
154 0.63
155 0.63
156 0.68
157 0.71
158 0.74
159 0.67
160 0.58
161 0.49
162 0.41
163 0.4
164 0.34
165 0.25
166 0.16
167 0.2
168 0.2
169 0.2
170 0.22
171 0.21
172 0.2
173 0.25
174 0.3
175 0.27
176 0.29
177 0.3
178 0.28
179 0.32
180 0.32
181 0.27
182 0.21
183 0.18
184 0.18
185 0.2
186 0.26
187 0.31
188 0.38
189 0.44
190 0.47
191 0.53
192 0.6
193 0.66
194 0.69
195 0.71
196 0.74
197 0.76
198 0.84
199 0.86
200 0.85
201 0.85
202 0.84
203 0.85
204 0.85
205 0.86
206 0.84
207 0.81
208 0.8