Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4JNB3

Protein Details
Accession W4JNB3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
197-228MARGCPSRPKQRFPPPSRGRFQPKRRMMRAMEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
204-222RPKQRFPPPSRGRFQPKRR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG hir:HETIRDRAFT_120455  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MLTNPRNPESKGPAIAKPTPFDGNRKRTEQFLHEIDLMILARKYDFPGEFAKIAYALSYMKGGSAELSGVDLETKKTHFLRGLKWELARGIYQDPAKQDTWEELVAKAKRHETMRIEEMRARDLRQGKYQVFTPSNYYSNIAPPRQERESQYVPMDVDAAEMEADAIRTRFKKLTPGERSQLAKEGKCFYCKKPGHMARGCPSRPKQRFPPPSRGRFQPKRRMMRAMEEEEGGDEEDQEEGKQRVAYIQQMMMGLSMDEIEEVRAFSESKNF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.57
3 0.53
4 0.47
5 0.44
6 0.44
7 0.42
8 0.48
9 0.51
10 0.54
11 0.57
12 0.61
13 0.58
14 0.57
15 0.6
16 0.56
17 0.53
18 0.47
19 0.44
20 0.39
21 0.38
22 0.32
23 0.29
24 0.23
25 0.17
26 0.14
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.12
31 0.15
32 0.15
33 0.16
34 0.2
35 0.23
36 0.23
37 0.23
38 0.21
39 0.17
40 0.16
41 0.14
42 0.11
43 0.07
44 0.07
45 0.08
46 0.07
47 0.07
48 0.08
49 0.07
50 0.07
51 0.07
52 0.06
53 0.05
54 0.06
55 0.06
56 0.05
57 0.06
58 0.06
59 0.07
60 0.09
61 0.1
62 0.13
63 0.14
64 0.17
65 0.22
66 0.25
67 0.3
68 0.38
69 0.43
70 0.42
71 0.42
72 0.4
73 0.35
74 0.33
75 0.27
76 0.21
77 0.16
78 0.17
79 0.17
80 0.18
81 0.19
82 0.21
83 0.21
84 0.19
85 0.18
86 0.16
87 0.18
88 0.17
89 0.16
90 0.13
91 0.19
92 0.21
93 0.22
94 0.22
95 0.22
96 0.25
97 0.26
98 0.31
99 0.28
100 0.31
101 0.36
102 0.37
103 0.36
104 0.35
105 0.34
106 0.33
107 0.3
108 0.26
109 0.25
110 0.28
111 0.28
112 0.31
113 0.36
114 0.32
115 0.32
116 0.34
117 0.34
118 0.29
119 0.28
120 0.27
121 0.24
122 0.25
123 0.24
124 0.22
125 0.17
126 0.21
127 0.25
128 0.21
129 0.21
130 0.21
131 0.26
132 0.27
133 0.29
134 0.27
135 0.3
136 0.33
137 0.33
138 0.32
139 0.28
140 0.25
141 0.22
142 0.2
143 0.12
144 0.09
145 0.07
146 0.06
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.03
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.06
155 0.07
156 0.11
157 0.12
158 0.13
159 0.22
160 0.28
161 0.38
162 0.44
163 0.49
164 0.5
165 0.53
166 0.55
167 0.48
168 0.49
169 0.43
170 0.36
171 0.34
172 0.37
173 0.34
174 0.38
175 0.41
176 0.36
177 0.43
178 0.44
179 0.46
180 0.5
181 0.55
182 0.58
183 0.6
184 0.64
185 0.62
186 0.69
187 0.65
188 0.63
189 0.63
190 0.64
191 0.65
192 0.66
193 0.67
194 0.69
195 0.78
196 0.76
197 0.81
198 0.79
199 0.82
200 0.8
201 0.79
202 0.79
203 0.78
204 0.81
205 0.81
206 0.81
207 0.83
208 0.82
209 0.82
210 0.75
211 0.74
212 0.72
213 0.67
214 0.58
215 0.48
216 0.43
217 0.36
218 0.33
219 0.24
220 0.15
221 0.1
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.11
227 0.1
228 0.13
229 0.13
230 0.13
231 0.16
232 0.19
233 0.23
234 0.23
235 0.23
236 0.23
237 0.23
238 0.23
239 0.19
240 0.16
241 0.12
242 0.08
243 0.07
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.09