Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4KMK0

Protein Details
Accession W4KMK0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
59-79EASRAIRKKLKHGNAHQQYRAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
174-219KRRREEKIAKEEAKKKAKLDKEAEKERLKNEEAARRQRAKDKTTRK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004827  bZIP  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR004152  GAT_dom  
IPR044103  GAT_LSB5  
IPR038425  GAT_sf  
IPR045007  LSB5  
IPR002014  VHS_dom  
Gene Ontology GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0035091  F:phosphatidylinositol binding  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:0007015  P:actin filament organization  
GO:0006897  P:endocytosis  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0007034  P:vacuolar transport  
KEGG hir:HETIRDRAFT_238204  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03127  GAT  
PF00790  VHS  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00036  BZIP_BASIC  
PS50909  GAT  
PS50179  VHS  
CDD cd14232  GAT_LSB5  
cd16980  VHS_Lsb5  
Amino Acid Sequences MSAIALGKQVAAAFGREKPRSSITEWIDILTAPSYADEVYDGIPELIDSINLQPTGPAEASRAIRKKLKHGNAHQQYRALVILKALVENCGHKFQTTFADGQLTDAIRHLASDSSTDEKVKRKLNAVLASWRNQFKDDHSMTLVANMFKPRRPSEPARRSVDHEVEARESEYEKRRREEKIAKEEAKKKAKLDKEAEKERLKNEEAARRQRAKDKTTRKPFNFEQEKPQVLNSIASASSAANNLVNAITLVNTEHDSLQANERVQECLGKAKQARKQIVRYIQLVEDEEFIGTLIETNDRIIAAIETYDKLSNPHVTEQDIADVQEGLAAANIHDSELQKLQIKQRAALQRAVNRDRSAVLEEQNERSRQPQSPLHPDLQDLSFGTLGVDQQNLPPPIRPNGPYSSDDDRRGGSLSDFSDYQSSDEDAHHQRAGPSSRRTYVTVSDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.28
3 0.3
4 0.32
5 0.35
6 0.4
7 0.42
8 0.43
9 0.46
10 0.42
11 0.48
12 0.46
13 0.42
14 0.37
15 0.33
16 0.3
17 0.21
18 0.17
19 0.09
20 0.08
21 0.08
22 0.08
23 0.08
24 0.07
25 0.07
26 0.08
27 0.09
28 0.09
29 0.08
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.07
34 0.06
35 0.07
36 0.08
37 0.12
38 0.12
39 0.12
40 0.12
41 0.12
42 0.16
43 0.16
44 0.14
45 0.12
46 0.18
47 0.22
48 0.3
49 0.34
50 0.36
51 0.41
52 0.44
53 0.52
54 0.58
55 0.64
56 0.65
57 0.7
58 0.76
59 0.81
60 0.86
61 0.79
62 0.71
63 0.62
64 0.53
65 0.46
66 0.36
67 0.26
68 0.18
69 0.18
70 0.15
71 0.16
72 0.14
73 0.14
74 0.13
75 0.16
76 0.18
77 0.2
78 0.2
79 0.19
80 0.19
81 0.2
82 0.24
83 0.24
84 0.23
85 0.18
86 0.22
87 0.21
88 0.22
89 0.23
90 0.17
91 0.15
92 0.14
93 0.15
94 0.11
95 0.11
96 0.1
97 0.08
98 0.08
99 0.09
100 0.11
101 0.14
102 0.15
103 0.17
104 0.2
105 0.25
106 0.31
107 0.36
108 0.37
109 0.38
110 0.43
111 0.49
112 0.51
113 0.48
114 0.51
115 0.48
116 0.49
117 0.49
118 0.46
119 0.39
120 0.35
121 0.33
122 0.28
123 0.35
124 0.31
125 0.29
126 0.27
127 0.28
128 0.26
129 0.29
130 0.27
131 0.18
132 0.18
133 0.21
134 0.21
135 0.22
136 0.28
137 0.27
138 0.3
139 0.37
140 0.44
141 0.51
142 0.59
143 0.65
144 0.66
145 0.66
146 0.65
147 0.65
148 0.59
149 0.5
150 0.43
151 0.36
152 0.31
153 0.29
154 0.24
155 0.18
156 0.16
157 0.18
158 0.25
159 0.31
160 0.33
161 0.37
162 0.41
163 0.44
164 0.52
165 0.56
166 0.57
167 0.59
168 0.65
169 0.66
170 0.7
171 0.74
172 0.74
173 0.73
174 0.66
175 0.6
176 0.58
177 0.58
178 0.58
179 0.58
180 0.58
181 0.58
182 0.63
183 0.66
184 0.63
185 0.6
186 0.54
187 0.52
188 0.44
189 0.41
190 0.38
191 0.4
192 0.42
193 0.48
194 0.53
195 0.53
196 0.54
197 0.56
198 0.58
199 0.56
200 0.58
201 0.6
202 0.63
203 0.69
204 0.76
205 0.7
206 0.71
207 0.67
208 0.68
209 0.66
210 0.58
211 0.55
212 0.51
213 0.51
214 0.45
215 0.42
216 0.33
217 0.25
218 0.24
219 0.15
220 0.11
221 0.09
222 0.08
223 0.09
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.08
244 0.09
245 0.12
246 0.14
247 0.13
248 0.16
249 0.17
250 0.17
251 0.16
252 0.17
253 0.14
254 0.18
255 0.19
256 0.21
257 0.24
258 0.3
259 0.36
260 0.43
261 0.5
262 0.49
263 0.54
264 0.57
265 0.61
266 0.57
267 0.54
268 0.48
269 0.41
270 0.36
271 0.32
272 0.25
273 0.18
274 0.14
275 0.12
276 0.09
277 0.08
278 0.07
279 0.05
280 0.05
281 0.04
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.08
295 0.09
296 0.09
297 0.1
298 0.12
299 0.16
300 0.17
301 0.21
302 0.21
303 0.21
304 0.23
305 0.22
306 0.21
307 0.17
308 0.15
309 0.12
310 0.11
311 0.09
312 0.09
313 0.08
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.05
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.08
322 0.08
323 0.1
324 0.12
325 0.15
326 0.18
327 0.22
328 0.28
329 0.33
330 0.34
331 0.33
332 0.39
333 0.46
334 0.45
335 0.48
336 0.47
337 0.46
338 0.55
339 0.58
340 0.55
341 0.47
342 0.45
343 0.4
344 0.36
345 0.34
346 0.28
347 0.26
348 0.28
349 0.3
350 0.34
351 0.39
352 0.37
353 0.34
354 0.34
355 0.36
356 0.34
357 0.38
358 0.39
359 0.42
360 0.51
361 0.55
362 0.56
363 0.52
364 0.48
365 0.45
366 0.38
367 0.32
368 0.23
369 0.2
370 0.16
371 0.15
372 0.14
373 0.11
374 0.11
375 0.11
376 0.11
377 0.1
378 0.12
379 0.2
380 0.22
381 0.22
382 0.25
383 0.28
384 0.33
385 0.38
386 0.37
387 0.35
388 0.39
389 0.43
390 0.42
391 0.44
392 0.47
393 0.48
394 0.49
395 0.45
396 0.4
397 0.37
398 0.36
399 0.31
400 0.23
401 0.22
402 0.2
403 0.21
404 0.2
405 0.2
406 0.22
407 0.21
408 0.2
409 0.18
410 0.18
411 0.16
412 0.17
413 0.23
414 0.25
415 0.29
416 0.29
417 0.29
418 0.3
419 0.36
420 0.43
421 0.44
422 0.47
423 0.5
424 0.54
425 0.55
426 0.56
427 0.53
428 0.52