Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S7PVL6

Protein Details
Accession S7PVL6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
53-107DSGVKKTATKAKPKAKPKTKTTTQAKAKAKAPPKAKAKPKVKKVKTDKPRLTQEDHydrophilic
187-211VRRINKEKAKDGKRRLRSPVSRRVPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
40-102KAKATRAPRAKAADSGVKKTATKAKPKAKPKTKTTTQAKAKAKAPPKAKAKPKVKKVKTDKPR
188-207RRINKEKAKDGKRRLRSPVS
Subcellular Location(s) mito 21.5, cyto_mito 12, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG gtr:GLOTRDRAFT_140950  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09011  HMG_box_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MFSILPRLSRTLAFSAPVFRAPTRRTLLTTAVRFEPATAKAKATRAPRAKAADSGVKKTATKAKPKAKPKTKTTTQAKAKAKAPPKAKAKPKVKKVKTDKPRLTQEDLPPKKPPPPYVIFYSRYLNGLPQPIRGPSAVLQAARTASGIWKEMSEHEKQAFSDEYRSLLPEYEKAREAYWTKVDPAVVRRINKEKAKDGKRRLRSPVSRRVPNPYALFVKENAAEIRAGLDSNSLTPRQMVGATGKEAAQRWKALSEEEKKRYVDEAKAKREAADAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.27
3 0.26
4 0.28
5 0.27
6 0.25
7 0.31
8 0.31
9 0.38
10 0.39
11 0.41
12 0.4
13 0.41
14 0.47
15 0.48
16 0.49
17 0.45
18 0.41
19 0.4
20 0.36
21 0.34
22 0.3
23 0.26
24 0.28
25 0.25
26 0.26
27 0.29
28 0.33
29 0.37
30 0.39
31 0.45
32 0.47
33 0.5
34 0.54
35 0.56
36 0.55
37 0.52
38 0.51
39 0.5
40 0.45
41 0.46
42 0.42
43 0.38
44 0.37
45 0.38
46 0.43
47 0.41
48 0.47
49 0.52
50 0.59
51 0.66
52 0.76
53 0.82
54 0.83
55 0.85
56 0.84
57 0.84
58 0.82
59 0.84
60 0.82
61 0.82
62 0.8
63 0.81
64 0.79
65 0.75
66 0.71
67 0.68
68 0.67
69 0.64
70 0.61
71 0.61
72 0.63
73 0.66
74 0.71
75 0.73
76 0.76
77 0.78
78 0.83
79 0.85
80 0.82
81 0.83
82 0.84
83 0.84
84 0.84
85 0.86
86 0.83
87 0.8
88 0.84
89 0.78
90 0.74
91 0.7
92 0.68
93 0.68
94 0.63
95 0.58
96 0.52
97 0.49
98 0.49
99 0.46
100 0.41
101 0.37
102 0.38
103 0.38
104 0.41
105 0.44
106 0.42
107 0.4
108 0.39
109 0.33
110 0.29
111 0.25
112 0.2
113 0.17
114 0.19
115 0.17
116 0.17
117 0.17
118 0.17
119 0.18
120 0.17
121 0.16
122 0.11
123 0.15
124 0.14
125 0.13
126 0.13
127 0.12
128 0.13
129 0.11
130 0.1
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.08
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.11
139 0.14
140 0.15
141 0.16
142 0.16
143 0.17
144 0.17
145 0.19
146 0.18
147 0.15
148 0.17
149 0.15
150 0.15
151 0.14
152 0.15
153 0.13
154 0.13
155 0.13
156 0.14
157 0.17
158 0.18
159 0.19
160 0.19
161 0.19
162 0.22
163 0.24
164 0.23
165 0.25
166 0.23
167 0.23
168 0.24
169 0.24
170 0.22
171 0.24
172 0.29
173 0.29
174 0.3
175 0.34
176 0.39
177 0.47
178 0.5
179 0.51
180 0.51
181 0.57
182 0.64
183 0.69
184 0.73
185 0.75
186 0.79
187 0.81
188 0.8
189 0.81
190 0.81
191 0.8
192 0.8
193 0.79
194 0.78
195 0.73
196 0.74
197 0.67
198 0.64
199 0.57
200 0.51
201 0.46
202 0.4
203 0.4
204 0.32
205 0.31
206 0.25
207 0.25
208 0.2
209 0.17
210 0.15
211 0.13
212 0.13
213 0.11
214 0.1
215 0.08
216 0.09
217 0.08
218 0.11
219 0.14
220 0.13
221 0.13
222 0.13
223 0.14
224 0.14
225 0.14
226 0.13
227 0.14
228 0.17
229 0.19
230 0.19
231 0.2
232 0.21
233 0.23
234 0.27
235 0.27
236 0.27
237 0.27
238 0.29
239 0.29
240 0.31
241 0.38
242 0.42
243 0.48
244 0.51
245 0.55
246 0.53
247 0.53
248 0.54
249 0.5
250 0.5
251 0.5
252 0.54
253 0.57
254 0.63
255 0.62
256 0.57