Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S7RTD2

Protein Details
Accession S7RTD2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-34AKLQELRKARAERQKERNAASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-28IEAKRAKLQELRKARAERQK
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 10.5, cyto_nucl 6.833, cyto_mito 6.333, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
KEGG gtr:GLOTRDRAFT_39841  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MSDKRRAEIEAKRAKLQELRKARAERQKERNAASEASPSTGPPRDVDDLINSLLGGSRPGRGVHSAGDVTPSSSVPGTPTLGGGSTLAGPSGYSGRRSRQSDFGSEPVSIGTTLAHSATDDVMDRTMTSRLIPDLIDVEQELFELPQKVGVPHERVIYNKEVQTMSVETEPSPDIEEQIRERILREKERELEVERAREKELEEESVKLDKEIEQEIRELTEEEKISVFTSPEFLDFVEQSSKIVERALNDNYDYIRDYTVGAESGGDDSEGKRVKRVCAFWDERYCKNRSITDVDWSPKYPELSCASYNKNPAALNEPDGIVAVWNLHLLERPEFVFHSQSDVLSVTFSPFHSNLVFGGTYSGQILLWDTRSKHLPVLKTPLSAAGHTHPVYAMQMVGTQNAHNLITSSTDGLVCSWLVDMLAQPQETLELVHAGHSKTGEVAITTLDFPDNETTTFWVGTEEGNVYQANRYDRAGAKAGLNQYDIYRGHSGPIMGIHFHPLVGPVDFSDLFLTCSVDWTVKLWRAKSLAKPSTTAHSVPPVYSFDEADDYVYDVKWHPSHPALFGTADGSGKFLLWNLNQDTEVPVVSTTVGSGRAINKIQWDGKDGRRAALGGSDGKLYVYDIGDMAIPRESEWTDMQRTVSGIVGGGNANGVIDGDSRVLAGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.6
3 0.59
4 0.59
5 0.59
6 0.62
7 0.64
8 0.69
9 0.74
10 0.76
11 0.78
12 0.78
13 0.78
14 0.82
15 0.81
16 0.78
17 0.76
18 0.71
19 0.63
20 0.55
21 0.52
22 0.42
23 0.38
24 0.34
25 0.27
26 0.28
27 0.3
28 0.28
29 0.22
30 0.27
31 0.29
32 0.3
33 0.31
34 0.29
35 0.28
36 0.27
37 0.26
38 0.19
39 0.15
40 0.15
41 0.13
42 0.12
43 0.11
44 0.12
45 0.14
46 0.15
47 0.18
48 0.19
49 0.21
50 0.2
51 0.24
52 0.23
53 0.21
54 0.24
55 0.21
56 0.19
57 0.19
58 0.17
59 0.13
60 0.13
61 0.13
62 0.11
63 0.14
64 0.14
65 0.13
66 0.14
67 0.13
68 0.13
69 0.13
70 0.11
71 0.1
72 0.09
73 0.08
74 0.08
75 0.07
76 0.06
77 0.07
78 0.12
79 0.13
80 0.17
81 0.21
82 0.28
83 0.36
84 0.41
85 0.44
86 0.48
87 0.51
88 0.52
89 0.53
90 0.5
91 0.44
92 0.39
93 0.36
94 0.27
95 0.23
96 0.17
97 0.12
98 0.08
99 0.07
100 0.08
101 0.08
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.1
113 0.11
114 0.1
115 0.1
116 0.11
117 0.11
118 0.12
119 0.12
120 0.12
121 0.12
122 0.12
123 0.12
124 0.11
125 0.1
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.06
130 0.08
131 0.09
132 0.09
133 0.11
134 0.12
135 0.13
136 0.17
137 0.22
138 0.25
139 0.25
140 0.29
141 0.28
142 0.29
143 0.32
144 0.33
145 0.32
146 0.29
147 0.31
148 0.27
149 0.26
150 0.27
151 0.24
152 0.21
153 0.18
154 0.17
155 0.13
156 0.15
157 0.15
158 0.13
159 0.14
160 0.12
161 0.12
162 0.13
163 0.16
164 0.16
165 0.19
166 0.2
167 0.18
168 0.2
169 0.25
170 0.3
171 0.36
172 0.39
173 0.41
174 0.44
175 0.47
176 0.49
177 0.44
178 0.46
179 0.41
180 0.44
181 0.4
182 0.37
183 0.35
184 0.33
185 0.3
186 0.27
187 0.25
188 0.23
189 0.22
190 0.21
191 0.22
192 0.24
193 0.23
194 0.18
195 0.17
196 0.14
197 0.16
198 0.19
199 0.19
200 0.17
201 0.18
202 0.18
203 0.17
204 0.16
205 0.14
206 0.11
207 0.13
208 0.13
209 0.12
210 0.13
211 0.12
212 0.12
213 0.12
214 0.12
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.11
228 0.11
229 0.1
230 0.11
231 0.11
232 0.1
233 0.15
234 0.17
235 0.17
236 0.17
237 0.18
238 0.16
239 0.16
240 0.16
241 0.12
242 0.11
243 0.1
244 0.1
245 0.09
246 0.1
247 0.09
248 0.07
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.1
257 0.14
258 0.13
259 0.17
260 0.19
261 0.23
262 0.28
263 0.3
264 0.29
265 0.35
266 0.39
267 0.41
268 0.5
269 0.5
270 0.5
271 0.53
272 0.52
273 0.46
274 0.45
275 0.41
276 0.35
277 0.37
278 0.32
279 0.33
280 0.35
281 0.33
282 0.31
283 0.3
284 0.28
285 0.23
286 0.23
287 0.18
288 0.17
289 0.19
290 0.21
291 0.22
292 0.24
293 0.27
294 0.29
295 0.31
296 0.28
297 0.27
298 0.24
299 0.22
300 0.24
301 0.2
302 0.2
303 0.18
304 0.18
305 0.15
306 0.14
307 0.13
308 0.08
309 0.07
310 0.04
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.05
316 0.06
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.09
321 0.09
322 0.1
323 0.11
324 0.1
325 0.13
326 0.12
327 0.12
328 0.12
329 0.12
330 0.11
331 0.09
332 0.09
333 0.06
334 0.07
335 0.07
336 0.09
337 0.08
338 0.1
339 0.09
340 0.1
341 0.09
342 0.1
343 0.1
344 0.07
345 0.08
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.05
351 0.05
352 0.06
353 0.05
354 0.07
355 0.09
356 0.1
357 0.12
358 0.14
359 0.15
360 0.18
361 0.21
362 0.22
363 0.24
364 0.31
365 0.3
366 0.28
367 0.28
368 0.29
369 0.26
370 0.23
371 0.21
372 0.15
373 0.19
374 0.18
375 0.18
376 0.14
377 0.13
378 0.13
379 0.11
380 0.09
381 0.05
382 0.07
383 0.07
384 0.08
385 0.09
386 0.08
387 0.09
388 0.1
389 0.1
390 0.07
391 0.07
392 0.06
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.08
399 0.07
400 0.08
401 0.06
402 0.06
403 0.05
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.06
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.08
413 0.08
414 0.08
415 0.08
416 0.06
417 0.05
418 0.05
419 0.08
420 0.1
421 0.1
422 0.11
423 0.11
424 0.11
425 0.1
426 0.1
427 0.08
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.07
437 0.1
438 0.1
439 0.1
440 0.1
441 0.11
442 0.12
443 0.12
444 0.11
445 0.09
446 0.09
447 0.08
448 0.09
449 0.09
450 0.08
451 0.09
452 0.09
453 0.09
454 0.1
455 0.14
456 0.15
457 0.15
458 0.16
459 0.19
460 0.21
461 0.24
462 0.25
463 0.23
464 0.23
465 0.25
466 0.28
467 0.25
468 0.24
469 0.2
470 0.18
471 0.22
472 0.2
473 0.2
474 0.2
475 0.19
476 0.19
477 0.2
478 0.19
479 0.15
480 0.17
481 0.14
482 0.12
483 0.12
484 0.14
485 0.13
486 0.13
487 0.12
488 0.12
489 0.12
490 0.11
491 0.11
492 0.08
493 0.11
494 0.12
495 0.12
496 0.11
497 0.1
498 0.11
499 0.11
500 0.12
501 0.09
502 0.11
503 0.11
504 0.1
505 0.11
506 0.11
507 0.16
508 0.21
509 0.25
510 0.24
511 0.28
512 0.32
513 0.37
514 0.44
515 0.49
516 0.5
517 0.48
518 0.5
519 0.47
520 0.49
521 0.47
522 0.4
523 0.32
524 0.32
525 0.31
526 0.29
527 0.29
528 0.25
529 0.24
530 0.23
531 0.21
532 0.16
533 0.17
534 0.17
535 0.15
536 0.13
537 0.12
538 0.12
539 0.12
540 0.12
541 0.1
542 0.15
543 0.16
544 0.17
545 0.2
546 0.24
547 0.26
548 0.27
549 0.29
550 0.26
551 0.24
552 0.24
553 0.21
554 0.17
555 0.16
556 0.13
557 0.12
558 0.1
559 0.09
560 0.09
561 0.09
562 0.13
563 0.13
564 0.2
565 0.21
566 0.23
567 0.23
568 0.24
569 0.25
570 0.21
571 0.2
572 0.14
573 0.11
574 0.09
575 0.1
576 0.09
577 0.07
578 0.08
579 0.09
580 0.09
581 0.12
582 0.14
583 0.19
584 0.2
585 0.22
586 0.25
587 0.3
588 0.34
589 0.33
590 0.36
591 0.38
592 0.43
593 0.5
594 0.47
595 0.42
596 0.39
597 0.38
598 0.33
599 0.3
600 0.27
601 0.21
602 0.21
603 0.2
604 0.18
605 0.18
606 0.17
607 0.14
608 0.13
609 0.11
610 0.1
611 0.09
612 0.1
613 0.12
614 0.12
615 0.12
616 0.12
617 0.11
618 0.11
619 0.14
620 0.14
621 0.16
622 0.2
623 0.25
624 0.27
625 0.29
626 0.29
627 0.28
628 0.28
629 0.26
630 0.23
631 0.17
632 0.13
633 0.12
634 0.12
635 0.11
636 0.1
637 0.09
638 0.07
639 0.07
640 0.07
641 0.06
642 0.05
643 0.06
644 0.07
645 0.08
646 0.08