Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H3A4

Protein Details
Accession C1H3A4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
531-551AKGSQRRTRGARRFKPKPDGWBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
536-547RRTRGARRFKPK
591-600GRSRGRGGST
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004843  Calcineurin-like_PHP_ApaH  
IPR029052  Metallo-depent_PP-like  
IPR003701  Mre11  
IPR038487  Mre11_capping_dom  
IPR007281  Mre11_DNA-bd  
IPR041796  Mre11_N  
Gene Ontology GO:0030870  C:Mre11 complex  
GO:0008296  F:3'-5'-DNA exonuclease activity  
GO:0004520  F:DNA endonuclease activity  
GO:0030145  F:manganese ion binding  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
GO:0051321  P:meiotic cell cycle  
KEGG pbl:PAAG_05247  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00149  Metallophos  
PF04152  Mre11_DNA_bind  
CDD cd00840  MPP_Mre11_N  
Amino Acid Sequences MPAFTAADTIRILVSTDNHVGYNERDPVRGDDSWKSFHEVMCLAKERDIDMVLLAGDLFHENKPSRKSMYQVMRSLRMNCYGDKPCELEMLSDASENFQGAFNHVNYEDMDINVAIPVFSIHGNHDDPSGEGHLAALDILQVSGLVNFYGRTPESDNIQVKPILLQKGRTKLALYGMSNVRDERLFRTFRDGKVKFFQPSLQKSDWFNLMCVHQNHHAHTETGYLPENFLPDFLDFVIWGHEHECLIEPRLNPETNFHVMQPGSSVATSLVPGEAVPKQVAILSITGREFKTEPIRLKTVRPFVTREIVLHEENEARRFARKENNRTELTRFLMGIVEELIEEAKKGWLEAQDDPDNEELEIPLPLVRLRVEVSSPDGGSFDCENPQRFSNRFVGKVANVNDVVQFYRKKKTVTALRRGETDAPDEAVISHLSSLDSVKVEKLVREFLMAQSLTILPQNSFGDAVSQFVDKDDKHAMEMFVNESLESQIKHLLALDQEQDEDDIDYGYGEGQSKIQVAMDKYRAQLEEMFAKGSQRRTRGARRFKPKPDGWDSEFDGPWEDQPGAFIHSENEAEDNQQQGAPPRRGASATGRSRGRGGSTAKFPPARATNPRKATTPTASTSISTRSRRRQTALSDDGDDDDDDDDEEQQEDPITLDDINEDDEGDSDSLFVRQTSVQQPKPASSVSKRMRRQTPSTSTATTKTTTIKAHPRISAATGSKKSQSTLFFARSQASQSQTLGDSGAATGTSFLVGKRPNRAAASRTTRSARVLSDDIEDDDDDAFDPVPPVRSSRSSKRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.17
3 0.2
4 0.2
5 0.21
6 0.21
7 0.23
8 0.24
9 0.28
10 0.31
11 0.29
12 0.29
13 0.31
14 0.35
15 0.39
16 0.38
17 0.36
18 0.37
19 0.4
20 0.43
21 0.42
22 0.44
23 0.4
24 0.38
25 0.38
26 0.32
27 0.31
28 0.34
29 0.38
30 0.33
31 0.34
32 0.34
33 0.3
34 0.3
35 0.28
36 0.21
37 0.15
38 0.14
39 0.11
40 0.1
41 0.09
42 0.06
43 0.06
44 0.07
45 0.09
46 0.09
47 0.15
48 0.18
49 0.24
50 0.29
51 0.34
52 0.38
53 0.4
54 0.44
55 0.47
56 0.56
57 0.58
58 0.61
59 0.62
60 0.62
61 0.62
62 0.62
63 0.56
64 0.53
65 0.47
66 0.42
67 0.44
68 0.44
69 0.44
70 0.43
71 0.42
72 0.35
73 0.36
74 0.34
75 0.27
76 0.22
77 0.22
78 0.19
79 0.17
80 0.16
81 0.14
82 0.14
83 0.13
84 0.12
85 0.11
86 0.11
87 0.12
88 0.17
89 0.15
90 0.18
91 0.18
92 0.19
93 0.16
94 0.2
95 0.19
96 0.14
97 0.15
98 0.12
99 0.12
100 0.11
101 0.11
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.07
108 0.09
109 0.13
110 0.15
111 0.15
112 0.16
113 0.15
114 0.15
115 0.17
116 0.17
117 0.13
118 0.12
119 0.11
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.06
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.05
132 0.04
133 0.04
134 0.05
135 0.06
136 0.09
137 0.1
138 0.12
139 0.16
140 0.18
141 0.22
142 0.3
143 0.32
144 0.3
145 0.33
146 0.3
147 0.26
148 0.29
149 0.3
150 0.29
151 0.29
152 0.34
153 0.37
154 0.45
155 0.46
156 0.44
157 0.4
158 0.35
159 0.39
160 0.39
161 0.33
162 0.31
163 0.33
164 0.34
165 0.34
166 0.32
167 0.27
168 0.22
169 0.22
170 0.2
171 0.24
172 0.24
173 0.24
174 0.34
175 0.37
176 0.41
177 0.5
178 0.47
179 0.45
180 0.5
181 0.55
182 0.47
183 0.44
184 0.45
185 0.43
186 0.48
187 0.49
188 0.44
189 0.42
190 0.42
191 0.44
192 0.44
193 0.35
194 0.3
195 0.25
196 0.25
197 0.28
198 0.27
199 0.27
200 0.28
201 0.31
202 0.32
203 0.34
204 0.33
205 0.27
206 0.26
207 0.26
208 0.2
209 0.19
210 0.2
211 0.16
212 0.15
213 0.15
214 0.16
215 0.12
216 0.12
217 0.11
218 0.08
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.06
223 0.07
224 0.09
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.11
232 0.1
233 0.13
234 0.16
235 0.16
236 0.19
237 0.24
238 0.24
239 0.22
240 0.24
241 0.27
242 0.27
243 0.27
244 0.23
245 0.22
246 0.21
247 0.21
248 0.19
249 0.14
250 0.11
251 0.1
252 0.11
253 0.07
254 0.08
255 0.08
256 0.07
257 0.06
258 0.05
259 0.05
260 0.07
261 0.07
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.1
272 0.1
273 0.12
274 0.12
275 0.13
276 0.13
277 0.15
278 0.22
279 0.26
280 0.3
281 0.32
282 0.38
283 0.38
284 0.43
285 0.46
286 0.47
287 0.47
288 0.45
289 0.44
290 0.42
291 0.45
292 0.4
293 0.34
294 0.3
295 0.28
296 0.25
297 0.22
298 0.2
299 0.19
300 0.19
301 0.2
302 0.16
303 0.14
304 0.17
305 0.18
306 0.21
307 0.28
308 0.36
309 0.44
310 0.52
311 0.58
312 0.57
313 0.58
314 0.57
315 0.52
316 0.45
317 0.36
318 0.27
319 0.21
320 0.19
321 0.16
322 0.13
323 0.09
324 0.06
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.07
335 0.09
336 0.12
337 0.14
338 0.2
339 0.22
340 0.22
341 0.23
342 0.22
343 0.2
344 0.17
345 0.15
346 0.09
347 0.07
348 0.06
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.07
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.11
361 0.12
362 0.11
363 0.11
364 0.1
365 0.09
366 0.11
367 0.11
368 0.09
369 0.11
370 0.13
371 0.15
372 0.16
373 0.18
374 0.2
375 0.2
376 0.23
377 0.28
378 0.28
379 0.28
380 0.27
381 0.27
382 0.25
383 0.29
384 0.27
385 0.22
386 0.19
387 0.18
388 0.17
389 0.16
390 0.16
391 0.13
392 0.15
393 0.15
394 0.21
395 0.23
396 0.23
397 0.25
398 0.33
399 0.4
400 0.45
401 0.53
402 0.54
403 0.53
404 0.54
405 0.54
406 0.48
407 0.39
408 0.32
409 0.22
410 0.16
411 0.14
412 0.12
413 0.11
414 0.09
415 0.08
416 0.06
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.09
427 0.1
428 0.11
429 0.12
430 0.13
431 0.13
432 0.14
433 0.14
434 0.12
435 0.16
436 0.15
437 0.13
438 0.12
439 0.12
440 0.1
441 0.11
442 0.11
443 0.06
444 0.09
445 0.1
446 0.09
447 0.09
448 0.09
449 0.1
450 0.09
451 0.1
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.08
456 0.11
457 0.08
458 0.12
459 0.14
460 0.13
461 0.14
462 0.16
463 0.16
464 0.14
465 0.15
466 0.13
467 0.11
468 0.1
469 0.09
470 0.08
471 0.09
472 0.09
473 0.08
474 0.08
475 0.1
476 0.1
477 0.1
478 0.1
479 0.1
480 0.1
481 0.11
482 0.12
483 0.09
484 0.1
485 0.1
486 0.1
487 0.09
488 0.08
489 0.07
490 0.05
491 0.05
492 0.04
493 0.04
494 0.04
495 0.05
496 0.05
497 0.06
498 0.06
499 0.07
500 0.07
501 0.07
502 0.08
503 0.1
504 0.11
505 0.16
506 0.2
507 0.21
508 0.22
509 0.24
510 0.24
511 0.22
512 0.22
513 0.19
514 0.2
515 0.18
516 0.19
517 0.16
518 0.18
519 0.2
520 0.26
521 0.29
522 0.28
523 0.32
524 0.39
525 0.5
526 0.57
527 0.65
528 0.67
529 0.73
530 0.79
531 0.82
532 0.85
533 0.78
534 0.77
535 0.74
536 0.71
537 0.64
538 0.6
539 0.55
540 0.5
541 0.46
542 0.37
543 0.31
544 0.24
545 0.21
546 0.17
547 0.14
548 0.09
549 0.1
550 0.11
551 0.11
552 0.11
553 0.11
554 0.1
555 0.11
556 0.12
557 0.11
558 0.12
559 0.1
560 0.11
561 0.12
562 0.12
563 0.11
564 0.12
565 0.12
566 0.18
567 0.26
568 0.26
569 0.27
570 0.27
571 0.28
572 0.29
573 0.31
574 0.32
575 0.34
576 0.37
577 0.42
578 0.42
579 0.42
580 0.43
581 0.41
582 0.35
583 0.31
584 0.3
585 0.29
586 0.33
587 0.36
588 0.4
589 0.41
590 0.39
591 0.39
592 0.4
593 0.41
594 0.45
595 0.5
596 0.54
597 0.6
598 0.62
599 0.58
600 0.58
601 0.57
602 0.53
603 0.49
604 0.42
605 0.39
606 0.37
607 0.35
608 0.32
609 0.33
610 0.34
611 0.37
612 0.42
613 0.48
614 0.56
615 0.61
616 0.64
617 0.64
618 0.63
619 0.66
620 0.64
621 0.57
622 0.51
623 0.46
624 0.43
625 0.37
626 0.29
627 0.2
628 0.14
629 0.11
630 0.09
631 0.08
632 0.08
633 0.07
634 0.08
635 0.08
636 0.07
637 0.07
638 0.07
639 0.07
640 0.07
641 0.08
642 0.07
643 0.07
644 0.07
645 0.07
646 0.09
647 0.08
648 0.08
649 0.07
650 0.08
651 0.1
652 0.09
653 0.09
654 0.07
655 0.08
656 0.08
657 0.08
658 0.08
659 0.08
660 0.09
661 0.14
662 0.23
663 0.32
664 0.35
665 0.41
666 0.43
667 0.44
668 0.46
669 0.43
670 0.41
671 0.37
672 0.44
673 0.48
674 0.55
675 0.6
676 0.66
677 0.73
678 0.74
679 0.76
680 0.76
681 0.75
682 0.71
683 0.69
684 0.64
685 0.58
686 0.54
687 0.49
688 0.4
689 0.34
690 0.32
691 0.31
692 0.31
693 0.36
694 0.43
695 0.48
696 0.53
697 0.53
698 0.52
699 0.49
700 0.49
701 0.49
702 0.44
703 0.45
704 0.42
705 0.43
706 0.45
707 0.44
708 0.43
709 0.4
710 0.38
711 0.36
712 0.39
713 0.41
714 0.38
715 0.39
716 0.4
717 0.36
718 0.36
719 0.34
720 0.31
721 0.29
722 0.27
723 0.28
724 0.26
725 0.26
726 0.22
727 0.17
728 0.13
729 0.11
730 0.1
731 0.07
732 0.06
733 0.07
734 0.06
735 0.07
736 0.07
737 0.07
738 0.13
739 0.19
740 0.23
741 0.31
742 0.35
743 0.4
744 0.45
745 0.5
746 0.47
747 0.52
748 0.58
749 0.54
750 0.56
751 0.54
752 0.52
753 0.52
754 0.51
755 0.43
756 0.4
757 0.38
758 0.34
759 0.33
760 0.32
761 0.29
762 0.28
763 0.26
764 0.19
765 0.17
766 0.15
767 0.12
768 0.11
769 0.1
770 0.08
771 0.1
772 0.11
773 0.15
774 0.15
775 0.18
776 0.23
777 0.3
778 0.38