Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S7PWC0

Protein Details
Accession S7PWC0    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
226-251VEKLNRDIDKKRKFHRKRANEDEGDIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
135-143KKKARKARR
235-243KKRKFHRKR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG gtr:GLOTRDRAFT_107931  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MEVAHKVAESVSNVAGAAEEFARQMTEGQEAAAEQSKEDVEMKDESEKKLSLEERRAKLEQLRNKMRSSAIANRQSLVEESQKQKLGAKEAARLDRQRKLAETLRLKADAEERGEDIERQKNWEYTIEENDEWEKKKARKARRADFEFHDDAHAARRKYKKDLDYIKPDLAAYNRQKEVALGLAPGTLLIPSSQQQQLAAESLYRDANTLLYADNKPSEEAIDRVVEKLNRDIDKKRKFHRKRANEDEGDITYINERNRVFNKKIARFYDKYTAEIRASFERGTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.1
4 0.09
5 0.07
6 0.07
7 0.07
8 0.07
9 0.08
10 0.08
11 0.09
12 0.09
13 0.11
14 0.11
15 0.11
16 0.11
17 0.1
18 0.12
19 0.16
20 0.15
21 0.12
22 0.14
23 0.14
24 0.15
25 0.17
26 0.15
27 0.13
28 0.15
29 0.16
30 0.23
31 0.26
32 0.27
33 0.29
34 0.29
35 0.26
36 0.31
37 0.35
38 0.34
39 0.42
40 0.49
41 0.49
42 0.55
43 0.55
44 0.52
45 0.55
46 0.57
47 0.55
48 0.56
49 0.62
50 0.6
51 0.6
52 0.59
53 0.52
54 0.48
55 0.46
56 0.45
57 0.44
58 0.48
59 0.47
60 0.45
61 0.44
62 0.41
63 0.35
64 0.29
65 0.25
66 0.23
67 0.26
68 0.3
69 0.32
70 0.31
71 0.34
72 0.34
73 0.33
74 0.34
75 0.32
76 0.34
77 0.37
78 0.41
79 0.42
80 0.45
81 0.44
82 0.45
83 0.46
84 0.42
85 0.38
86 0.39
87 0.41
88 0.44
89 0.45
90 0.42
91 0.41
92 0.4
93 0.38
94 0.34
95 0.31
96 0.25
97 0.21
98 0.19
99 0.16
100 0.17
101 0.17
102 0.17
103 0.17
104 0.2
105 0.18
106 0.21
107 0.23
108 0.22
109 0.23
110 0.25
111 0.24
112 0.21
113 0.25
114 0.24
115 0.22
116 0.22
117 0.23
118 0.22
119 0.21
120 0.21
121 0.23
122 0.22
123 0.29
124 0.37
125 0.45
126 0.51
127 0.59
128 0.66
129 0.71
130 0.73
131 0.71
132 0.66
133 0.62
134 0.54
135 0.45
136 0.36
137 0.26
138 0.21
139 0.23
140 0.24
141 0.18
142 0.23
143 0.29
144 0.31
145 0.38
146 0.45
147 0.43
148 0.48
149 0.56
150 0.57
151 0.6
152 0.61
153 0.55
154 0.48
155 0.44
156 0.36
157 0.29
158 0.3
159 0.26
160 0.28
161 0.28
162 0.27
163 0.27
164 0.26
165 0.25
166 0.19
167 0.14
168 0.08
169 0.08
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.04
175 0.04
176 0.03
177 0.05
178 0.06
179 0.1
180 0.11
181 0.11
182 0.12
183 0.13
184 0.13
185 0.13
186 0.13
187 0.09
188 0.09
189 0.1
190 0.11
191 0.1
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.07
198 0.11
199 0.12
200 0.13
201 0.14
202 0.15
203 0.15
204 0.15
205 0.16
206 0.14
207 0.14
208 0.14
209 0.16
210 0.16
211 0.16
212 0.2
213 0.2
214 0.2
215 0.24
216 0.29
217 0.3
218 0.33
219 0.41
220 0.48
221 0.56
222 0.62
223 0.67
224 0.71
225 0.77
226 0.84
227 0.87
228 0.87
229 0.88
230 0.9
231 0.91
232 0.83
233 0.77
234 0.7
235 0.6
236 0.51
237 0.41
238 0.31
239 0.23
240 0.24
241 0.21
242 0.22
243 0.21
244 0.26
245 0.33
246 0.4
247 0.41
248 0.45
249 0.54
250 0.58
251 0.66
252 0.67
253 0.68
254 0.64
255 0.67
256 0.7
257 0.61
258 0.56
259 0.5
260 0.47
261 0.4
262 0.39
263 0.37
264 0.32
265 0.33
266 0.3