FuNGI

S7RWI6

Protein Details

Accession

S7RWI6

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
185-204	SILFHPKKPKPGQAPPPKAP	Hydrophilic
322-346	VAAPGDKKNGRKKFQKKTRQVYLIP	Hydrophilic
755-780	ADGTTGTEQRKRKKRKPALPVEELTA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
190-217	PKKPKPGQAPPPKAPGTPRKAPPKPPPK
328-338	KKNGRKKFQKK
764-771	RKRKKRKP

Subcellular Location(s)

nucl 10, cyto 10, cyto_nucl 10

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	gtr:GLOTRDRAFT_119452 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MPSLLEPQTFPAIDGISASILVLAGYQYYELASWDTALYPARFVQGRVPTGIAAYHFWWTLPVSLFGRRNPSGTIVEAAGVFLVGVYSRRGGSSGPLKPAEQGLYVTPITSGKLSSSYVAGMEQANGRPVRPSRRHFRGESGMHVVPGRKVGQVVVDHICVATRYEWQTLDSDNMAPGKGAPSASILFHPKKPKPGQAPPPKAPGTPRKAPPKPPPKDDDLNPPRPEGEYIEYQLESSALNGWKYDLMKFDSRRPVDVGTWVPPVKLNRKEPRRELAPQARAPQAVGPMLGPDGKPVIGADGNPVMVDAEGRPIHNLSGAGVAAPGDKKNGRKKFQKKTRQVYLIPEEVRQLRKEERYPWVMEDASGQEVWVGKMEEVSRSETHAFFMPTANEVFKFVPANRWYKFQKKPNYRIPNLEEAESMMAKIQKNKDPGRWLPHNRTSGSAASGSGGGGGGTASVSMPYIQAGPSLVYDAGTSLGPGGRRLRAVDSGMERGLFGDDDEEDSKRRRQREYGGEGDQDEMDYEEIFEDDEEKPNVDEAEDEEAKELEERMKKEYSKAKVLNDGEESEDEEDETKLTKAGRQLKKLMRSLEKNQAYESDDDENPYASEEEESEEEPPEVPVGPAVQDQSQSQSQSRSGSQQPLPSTPLPAPTPIKKEPPAASLSRPTSPTQSGHSIVAKRATSPPKISKVKTSPNVSRASSPLAQGPASPLGRPGSPVNGAPPPSAAPTPSKQNNKRKAEDAPTSPTSPTTAADGTTGTEQRKRKKRKPALPVEELTASKLVEWIQAHPGCTTKDCINAFRGYLEHSKDGRKIFSDLIKEVATIKSNLLILRPQYRGDDAPDGTTPGSAPATPGQGS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.15
3	0.1
4	0.1
5	0.09
6	0.07
7	0.06
8	0.06
9	0.05
10	0.04
11	0.04
12	0.05
13	0.05
14	0.05
15	0.05
16	0.06
17	0.06
18	0.08
19	0.08
20	0.09
21	0.09
22	0.1
23	0.11
24	0.15
25	0.15
26	0.15
27	0.16
28	0.2
29	0.2
30	0.21
31	0.27
32	0.31
33	0.33
34	0.33
35	0.33
36	0.29
37	0.29
38	0.29
39	0.22
40	0.17
41	0.16
42	0.16
43	0.15
44	0.15
45	0.15
46	0.15
47	0.18
48	0.17
49	0.2
50	0.2
51	0.28
52	0.32
53	0.34
54	0.41
55	0.39
56	0.39
57	0.36
58	0.38
59	0.33
60	0.31
61	0.3
62	0.22
63	0.21
64	0.19
65	0.17
66	0.12
67	0.09
68	0.07
69	0.04
70	0.04
71	0.04
72	0.05
73	0.06
74	0.08
75	0.08
76	0.09
77	0.1
78	0.1
79	0.17
80	0.25
81	0.3
82	0.35
83	0.36
84	0.37
85	0.37
86	0.4
87	0.35
88	0.27
89	0.23
90	0.18
91	0.2
92	0.2
93	0.19
94	0.16
95	0.15
96	0.15
97	0.14
98	0.13
99	0.09
100	0.12
101	0.13
102	0.13
103	0.13
104	0.13
105	0.12
106	0.12
107	0.12
108	0.11
109	0.11
110	0.13
111	0.13
112	0.18
113	0.18
114	0.18
115	0.23
116	0.28
117	0.37
118	0.43
119	0.5
120	0.55
121	0.64
122	0.71
123	0.68
124	0.71
125	0.7
126	0.64
127	0.61
128	0.58
129	0.49
130	0.43
131	0.42
132	0.35
133	0.27
134	0.27
135	0.23
136	0.17
137	0.17
138	0.16
139	0.2
140	0.2
141	0.22
142	0.21
143	0.2
144	0.19
145	0.18
146	0.18
147	0.13
148	0.14
149	0.11
150	0.13
151	0.16
152	0.18
153	0.19
154	0.2
155	0.21
156	0.21
157	0.22
158	0.19
159	0.16
160	0.16
161	0.16
162	0.14
163	0.13
164	0.12
165	0.11
166	0.11
167	0.1
168	0.09
169	0.11
170	0.12
171	0.13
172	0.16
173	0.22
174	0.24
175	0.29
176	0.38
177	0.39
178	0.48
179	0.53
180	0.59
181	0.61
182	0.68
183	0.73
184	0.76
185	0.81
186	0.76
187	0.78
188	0.71
189	0.63
190	0.61
191	0.6
192	0.56
193	0.55
194	0.59
195	0.62
196	0.66
197	0.74
198	0.77
199	0.78
200	0.78
201	0.77
202	0.74
203	0.71
204	0.71
205	0.65
206	0.66
207	0.64
208	0.65
209	0.59
210	0.55
211	0.48
212	0.42
213	0.4
214	0.32
215	0.27
216	0.22
217	0.22
218	0.24
219	0.23
220	0.21
221	0.2
222	0.16
223	0.12
224	0.09
225	0.11
226	0.11
227	0.11
228	0.11
229	0.12
230	0.14
231	0.15
232	0.16
233	0.15
234	0.18
235	0.25
236	0.27
237	0.35
238	0.41
239	0.42
240	0.42
241	0.41
242	0.39
243	0.33
244	0.35
245	0.3
246	0.24
247	0.28
248	0.25
249	0.23
250	0.24
251	0.28
252	0.32
253	0.37
254	0.44
255	0.49
256	0.59
257	0.67
258	0.69
259	0.72
260	0.7
261	0.67
262	0.67
263	0.67
264	0.66
265	0.62
266	0.6
267	0.55
268	0.49
269	0.44
270	0.36
271	0.28
272	0.2
273	0.16
274	0.11
275	0.09
276	0.1
277	0.1
278	0.08
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.07
284	0.08
285	0.07
286	0.08
287	0.09
288	0.09
289	0.09
290	0.09
291	0.09
292	0.07
293	0.06
294	0.06
295	0.04
296	0.08
297	0.09
298	0.09
299	0.1
300	0.11
301	0.11
302	0.12
303	0.11
304	0.07
305	0.08
306	0.08
307	0.07
308	0.07
309	0.07
310	0.06
311	0.07
312	0.07
313	0.08
314	0.11
315	0.18
316	0.28
317	0.37
318	0.44
319	0.54
320	0.64
321	0.72
322	0.8
323	0.85
324	0.85
325	0.86
326	0.88
327	0.85
328	0.77
329	0.73
330	0.67
331	0.63
332	0.53
333	0.44
334	0.38
335	0.34
336	0.33
337	0.27
338	0.25
339	0.24
340	0.28
341	0.31
342	0.34
343	0.36
344	0.38
345	0.38
346	0.36
347	0.34
348	0.29
349	0.25
350	0.21
351	0.17
352	0.14
353	0.12
354	0.1
355	0.08
356	0.09
357	0.08
358	0.08
359	0.07
360	0.06
361	0.08
362	0.09
363	0.1
364	0.11
365	0.15
366	0.14
367	0.16
368	0.17
369	0.16
370	0.16
371	0.16
372	0.15
373	0.12
374	0.13
375	0.11
376	0.1
377	0.11
378	0.1
379	0.09
380	0.1
381	0.1
382	0.1
383	0.11
384	0.1
385	0.17
386	0.2
387	0.25
388	0.24
389	0.3
390	0.33
391	0.4
392	0.48
393	0.5
394	0.57
395	0.61
396	0.69
397	0.74
398	0.8
399	0.74
400	0.72
401	0.68
402	0.66
403	0.57
404	0.49
405	0.38
406	0.28
407	0.27
408	0.2
409	0.16
410	0.08
411	0.1
412	0.1
413	0.14
414	0.18
415	0.21
416	0.28
417	0.31
418	0.34
419	0.38
420	0.42
421	0.45
422	0.5
423	0.52
424	0.54
425	0.58
426	0.58
427	0.52
428	0.49
429	0.44
430	0.36
431	0.31
432	0.23
433	0.16
434	0.12
435	0.12
436	0.09
437	0.06
438	0.05
439	0.04
440	0.03
441	0.03
442	0.02
443	0.02
444	0.02
445	0.02
446	0.02
447	0.03
448	0.03
449	0.03
450	0.03
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.05
455	0.05
456	0.05
457	0.06
458	0.05
459	0.05
460	0.05
461	0.05
462	0.06
463	0.05
464	0.05
465	0.04
466	0.06
467	0.06
468	0.08
469	0.1
470	0.1
471	0.11
472	0.13
473	0.15
474	0.16
475	0.17
476	0.18
477	0.18
478	0.19
479	0.18
480	0.17
481	0.15
482	0.13
483	0.12
484	0.09
485	0.06
486	0.05
487	0.05
488	0.07
489	0.08
490	0.09
491	0.1
492	0.13
493	0.19
494	0.23
495	0.27
496	0.28
497	0.33
498	0.41
499	0.49
500	0.54
501	0.54
502	0.52
503	0.49
504	0.46
505	0.41
506	0.32
507	0.22
508	0.15
509	0.1
510	0.07
511	0.05
512	0.05
513	0.04
514	0.04
515	0.04
516	0.04
517	0.06
518	0.06
519	0.09
520	0.1
521	0.1
522	0.1
523	0.11
524	0.11
525	0.09
526	0.08
527	0.07
528	0.14
529	0.13
530	0.13
531	0.13
532	0.13
533	0.13
534	0.13
535	0.12
536	0.11
537	0.15
538	0.16
539	0.2
540	0.24
541	0.25
542	0.31
543	0.39
544	0.39
545	0.44
546	0.47
547	0.45
548	0.49
549	0.5
550	0.47
551	0.41
552	0.36
553	0.28
554	0.24
555	0.23
556	0.16
557	0.14
558	0.11
559	0.1
560	0.09
561	0.08
562	0.08
563	0.07
564	0.08
565	0.08
566	0.11
567	0.17
568	0.28
569	0.34
570	0.39
571	0.48
572	0.53
573	0.61
574	0.63
575	0.63
576	0.61
577	0.61
578	0.61
579	0.63
580	0.61
581	0.54
582	0.5
583	0.46
584	0.4
585	0.34
586	0.31
587	0.25
588	0.2
589	0.21
590	0.2
591	0.18
592	0.15
593	0.15
594	0.13
595	0.08
596	0.09
597	0.07
598	0.09
599	0.1
600	0.1
601	0.1
602	0.11
603	0.11
604	0.11
605	0.1
606	0.09
607	0.08
608	0.07
609	0.07
610	0.06
611	0.07
612	0.08
613	0.09
614	0.1
615	0.11
616	0.11
617	0.15
618	0.17
619	0.18
620	0.19
621	0.2
622	0.21
623	0.23
624	0.24
625	0.26
626	0.27
627	0.32
628	0.34
629	0.37
630	0.37
631	0.37
632	0.4
633	0.35
634	0.34
635	0.28
636	0.3
637	0.25
638	0.28
639	0.3
640	0.31
641	0.38
642	0.39
643	0.44
644	0.43
645	0.48
646	0.46
647	0.45
648	0.44
649	0.4
650	0.4
651	0.41
652	0.41
653	0.38
654	0.38
655	0.36
656	0.35
657	0.36
658	0.33
659	0.3
660	0.32
661	0.31
662	0.32
663	0.35
664	0.33
665	0.32
666	0.36
667	0.31
668	0.29
669	0.35
670	0.38
671	0.38
672	0.44
673	0.49
674	0.53
675	0.6
676	0.6
677	0.62
678	0.64
679	0.69
680	0.7
681	0.7
682	0.68
683	0.67
684	0.71
685	0.62
686	0.57
687	0.49
688	0.47
689	0.4
690	0.34
691	0.31
692	0.27
693	0.26
694	0.23
695	0.24
696	0.24
697	0.23
698	0.22
699	0.21
700	0.21
701	0.21
702	0.23
703	0.22
704	0.19
705	0.21
706	0.22
707	0.23
708	0.26
709	0.27
710	0.25
711	0.24
712	0.21
713	0.23
714	0.23
715	0.2
716	0.21
717	0.23
718	0.32
719	0.39
720	0.49
721	0.56
722	0.66
723	0.74
724	0.78
725	0.8
726	0.75
727	0.75
728	0.73
729	0.71
730	0.66
731	0.63
732	0.59
733	0.55
734	0.51
735	0.43
736	0.36
737	0.29
738	0.24
739	0.2
740	0.17
741	0.15
742	0.15
743	0.15
744	0.14
745	0.17
746	0.2
747	0.19
748	0.26
749	0.32
750	0.42
751	0.52
752	0.62
753	0.66
754	0.74
755	0.82
756	0.86
757	0.9
758	0.91
759	0.9
760	0.88
761	0.81
762	0.74
763	0.68
764	0.58
765	0.49
766	0.39
767	0.29
768	0.2
769	0.19
770	0.16
771	0.16
772	0.17
773	0.17
774	0.25
775	0.27
776	0.28
777	0.28
778	0.3
779	0.28
780	0.29
781	0.31
782	0.24
783	0.3
784	0.32
785	0.34
786	0.36
787	0.36
788	0.34
789	0.32
790	0.3
791	0.28
792	0.31
793	0.32
794	0.35
795	0.36
796	0.41
797	0.45
798	0.47
799	0.46
800	0.42
801	0.41
802	0.4
803	0.43
804	0.43
805	0.39
806	0.39
807	0.35
808	0.33
809	0.31
810	0.29
811	0.25
812	0.21
813	0.2
814	0.19
815	0.21
816	0.21
817	0.21
818	0.23
819	0.25
820	0.32
821	0.33
822	0.32
823	0.34
824	0.37
825	0.37
826	0.38
827	0.4
828	0.34
829	0.35
830	0.34
831	0.32
832	0.28
833	0.26
834	0.21
835	0.16
836	0.17
837	0.13
838	0.15
839	0.16

S7RWI6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer