Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S7PSD5

Protein Details
Accession S7PSD5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MLRTVKPKNARSKRALEAREHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
249-267KRPKLKKQDVQKGLGKRRR
290-323GLRGKRMKALRGGPGESGEESEEERPRERKRSRS
Subcellular Location(s) mito 14, cyto 7, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
KEGG gtr:GLOTRDRAFT_66842  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MLRTVKPKNARSKRALEAREPKEVEGPRQAIFVKGTHTGEIVNNAMKELMALKRPDAISFSKKNPVHPFEDASSLEFWAQKNDASLFVVGQSTKKRPHGLTFVRMFDCKVLDMCEVGIEAFVSMHAFKTPKSTPGHRPLLHFAGELFDTHPRLAQLKSLLLAFFGGPALESIHVPGLEHVVSVSLAPAPPARAADDGTLLPRVHLRTYTVTRDRAGRAALAPMGPFLDLALRRHVPPEANAHLLALAMKRPKLKKQDVQKGLGKRRRNVEVDEMGDVRGRVHLGKQELGGLRGKRMKALRGGPGESGEESEEERPRERKRSRSGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.78
3 0.77
4 0.77
5 0.72
6 0.74
7 0.67
8 0.59
9 0.57
10 0.55
11 0.5
12 0.48
13 0.46
14 0.37
15 0.38
16 0.37
17 0.32
18 0.31
19 0.27
20 0.21
21 0.24
22 0.25
23 0.22
24 0.22
25 0.21
26 0.2
27 0.22
28 0.21
29 0.19
30 0.17
31 0.17
32 0.16
33 0.14
34 0.13
35 0.13
36 0.15
37 0.17
38 0.18
39 0.18
40 0.24
41 0.25
42 0.25
43 0.26
44 0.28
45 0.31
46 0.35
47 0.39
48 0.43
49 0.44
50 0.51
51 0.57
52 0.56
53 0.53
54 0.51
55 0.51
56 0.43
57 0.46
58 0.39
59 0.32
60 0.27
61 0.22
62 0.2
63 0.18
64 0.16
65 0.15
66 0.15
67 0.14
68 0.15
69 0.15
70 0.15
71 0.14
72 0.14
73 0.11
74 0.11
75 0.12
76 0.1
77 0.12
78 0.16
79 0.2
80 0.25
81 0.3
82 0.34
83 0.36
84 0.41
85 0.48
86 0.49
87 0.52
88 0.51
89 0.51
90 0.47
91 0.45
92 0.4
93 0.31
94 0.26
95 0.18
96 0.15
97 0.12
98 0.11
99 0.11
100 0.1
101 0.09
102 0.08
103 0.07
104 0.06
105 0.04
106 0.04
107 0.03
108 0.03
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.06
113 0.06
114 0.07
115 0.13
116 0.14
117 0.2
118 0.24
119 0.3
120 0.37
121 0.45
122 0.54
123 0.5
124 0.52
125 0.5
126 0.49
127 0.44
128 0.35
129 0.26
130 0.18
131 0.17
132 0.14
133 0.1
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.1
138 0.09
139 0.11
140 0.1
141 0.12
142 0.11
143 0.11
144 0.12
145 0.11
146 0.11
147 0.09
148 0.09
149 0.07
150 0.05
151 0.05
152 0.04
153 0.03
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.08
179 0.08
180 0.09
181 0.1
182 0.11
183 0.1
184 0.1
185 0.13
186 0.11
187 0.11
188 0.13
189 0.13
190 0.12
191 0.13
192 0.15
193 0.18
194 0.22
195 0.3
196 0.33
197 0.34
198 0.34
199 0.37
200 0.36
201 0.33
202 0.29
203 0.22
204 0.18
205 0.18
206 0.17
207 0.14
208 0.12
209 0.1
210 0.1
211 0.08
212 0.07
213 0.06
214 0.09
215 0.1
216 0.12
217 0.17
218 0.18
219 0.18
220 0.2
221 0.22
222 0.2
223 0.21
224 0.27
225 0.25
226 0.26
227 0.25
228 0.24
229 0.22
230 0.2
231 0.19
232 0.12
233 0.13
234 0.13
235 0.16
236 0.23
237 0.27
238 0.35
239 0.44
240 0.53
241 0.57
242 0.65
243 0.74
244 0.74
245 0.77
246 0.76
247 0.76
248 0.78
249 0.77
250 0.74
251 0.69
252 0.7
253 0.7
254 0.67
255 0.62
256 0.6
257 0.58
258 0.53
259 0.5
260 0.43
261 0.35
262 0.33
263 0.28
264 0.19
265 0.14
266 0.13
267 0.11
268 0.14
269 0.19
270 0.21
271 0.23
272 0.24
273 0.29
274 0.29
275 0.3
276 0.33
277 0.29
278 0.33
279 0.37
280 0.37
281 0.37
282 0.4
283 0.44
284 0.45
285 0.51
286 0.52
287 0.52
288 0.54
289 0.49
290 0.47
291 0.44
292 0.36
293 0.31
294 0.23
295 0.18
296 0.18
297 0.21
298 0.24
299 0.24
300 0.29
301 0.35
302 0.41
303 0.51
304 0.57
305 0.62