Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HDN0

Protein Details
Accession C1HDN0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
64-103IEFGYLRPRARRREKQDIAKLRKRLQKRVLKRKTESAQAIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
70-96RPRARRREKQDIAKLRKRLQKRVLKRK
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 6, cyto 5, plas 3, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024586  DnaJ-like_C11_C  
IPR007219  Transcription_factor_dom_fun  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG pbl:PAAG_08887  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11875  DnaJ-like_C11_C  
PF04082  Fungal_trans  
PF00172  Zn_clus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51257  PROKAR_LIPOPROTEIN  
PS00463  ZN2_CY6_FUNGAL_1  
PS50048  ZN2_CY6_FUNGAL_2  
CDD cd12148  fungal_TF_MHR  
cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences MVGGFTRMGLTISTIGNMGLGCSISWSRLGQTLKVPIAMCPVDQLTGDLCILAVIVPFTVYSAIEFGYLRPRARRREKQDIAKLRKRLQKRVLKRKTESAQAISMMRDQVLRRQDREAERDGLVIVHAEYGCPPSPSAREKKQIGPMAVIDDYDECMIDVTIPVAALVDQGQLVISPRVIKVWMLSDVLFLLINKNTNVLTHAAPQNNSNRYQPQEQLPPVRQLLTPISYSDVPNSHYYIPGRRNSPLYSSGTHGSSPTGEAYDARTLTTRHPSHGRVSSPMRPPVPDSVEPSYGGGQYPAYSREHLPPLSHVGLSLTSLPSHHFPDYTRNSNDAPLTRYHRSQLSFERDLPNSEASPVSNPSSLAIETALRSPSPTSQSQPRLAHVVDERYIGSEGLCYIYSDGTHCPKLIDGELVNANWGITKAGKPRKRLAQACITCRDKKIKCIPNVPKCDQCQKSGRECKFENAPRGNQAAKALQQLPIVSEQTVGHHGSSTVSTISQSQRTGYPASGYSTSSLSIGSPRDLISTSSHSNDSGPTVPKTVGPCLDFNRTLKRRRRSSTNAIDRAGDNPKPYKDMTTAPDSYPVVDILSDMAAMDLHDPTLSEWETDPYQNHPESTMHYVDRYFKYVNGATYCIFPREPFIRWLRFCVNKSLDDKMLLYAMLAMGAIFGNGKEHRADAMRFARIAKHAVEKSQNSPTLHLAQTRIILGMWHFTIGASATASDFTGSAMRTICGLKLNVEHGASTSGSEWDEFFQAETILECQRRTFWAAFLMDRHTSLEAHSPTVLKPQDIFLRLPLREDWYESQKWANMPYFENGIILSDVSLLEERNALDPMAFLVEVSAIWGDVLEHIYRSTYVSSPNYAVRFGEFYDSTVKRTDKWLASLPQYFSYNVQNLELSVQAGKADVFVSVHILYHATMMRLNRYARCQDLPYHIVERNVRRSHQHSIDVLRIALDLSQFLNTSNKSRSSSSTTKTTFSTPLTGNAILSATDVLSAGGSIREAPYYLQLISAGMDLTAEVARFWHSAREQLRIMELRVGKVTDAIRAHGSQGEKRGFAVQGLPLDLILVDKLMPNNEAAGAHAAPTKPSKMQGSTNPSITAKRGDLVYCLTRDEYFRALGLNDISVQRDEVLWISCEDEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.12
4 0.11
5 0.09
6 0.07
7 0.07
8 0.06
9 0.1
10 0.11
11 0.11
12 0.13
13 0.14
14 0.15
15 0.21
16 0.24
17 0.23
18 0.29
19 0.36
20 0.35
21 0.38
22 0.37
23 0.31
24 0.36
25 0.33
26 0.27
27 0.23
28 0.22
29 0.19
30 0.19
31 0.19
32 0.13
33 0.14
34 0.14
35 0.11
36 0.09
37 0.08
38 0.08
39 0.07
40 0.06
41 0.05
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.06
46 0.06
47 0.06
48 0.06
49 0.07
50 0.07
51 0.09
52 0.09
53 0.1
54 0.18
55 0.23
56 0.25
57 0.34
58 0.42
59 0.51
60 0.62
61 0.71
62 0.72
63 0.79
64 0.85
65 0.87
66 0.9
67 0.91
68 0.9
69 0.88
70 0.87
71 0.85
72 0.84
73 0.82
74 0.82
75 0.81
76 0.81
77 0.84
78 0.87
79 0.89
80 0.9
81 0.87
82 0.87
83 0.83
84 0.81
85 0.77
86 0.7
87 0.62
88 0.55
89 0.51
90 0.42
91 0.38
92 0.3
93 0.24
94 0.23
95 0.2
96 0.24
97 0.32
98 0.37
99 0.36
100 0.41
101 0.49
102 0.52
103 0.57
104 0.56
105 0.5
106 0.45
107 0.43
108 0.38
109 0.3
110 0.22
111 0.17
112 0.12
113 0.11
114 0.1
115 0.09
116 0.1
117 0.14
118 0.15
119 0.15
120 0.15
121 0.16
122 0.22
123 0.3
124 0.39
125 0.43
126 0.51
127 0.55
128 0.62
129 0.67
130 0.68
131 0.62
132 0.56
133 0.49
134 0.44
135 0.39
136 0.32
137 0.23
138 0.17
139 0.16
140 0.13
141 0.11
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.1
164 0.1
165 0.11
166 0.12
167 0.12
168 0.12
169 0.15
170 0.17
171 0.16
172 0.16
173 0.15
174 0.15
175 0.15
176 0.13
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.12
181 0.12
182 0.13
183 0.13
184 0.13
185 0.15
186 0.15
187 0.14
188 0.19
189 0.25
190 0.27
191 0.28
192 0.33
193 0.39
194 0.4
195 0.41
196 0.39
197 0.38
198 0.4
199 0.44
200 0.44
201 0.43
202 0.47
203 0.51
204 0.54
205 0.52
206 0.53
207 0.49
208 0.47
209 0.4
210 0.35
211 0.33
212 0.28
213 0.25
214 0.2
215 0.23
216 0.22
217 0.22
218 0.22
219 0.19
220 0.2
221 0.21
222 0.23
223 0.2
224 0.23
225 0.24
226 0.29
227 0.34
228 0.37
229 0.38
230 0.39
231 0.42
232 0.4
233 0.42
234 0.4
235 0.37
236 0.33
237 0.33
238 0.33
239 0.3
240 0.28
241 0.24
242 0.2
243 0.16
244 0.16
245 0.13
246 0.11
247 0.1
248 0.1
249 0.13
250 0.16
251 0.16
252 0.15
253 0.16
254 0.17
255 0.21
256 0.3
257 0.28
258 0.28
259 0.34
260 0.36
261 0.41
262 0.46
263 0.44
264 0.41
265 0.46
266 0.49
267 0.5
268 0.54
269 0.48
270 0.43
271 0.44
272 0.44
273 0.45
274 0.4
275 0.39
276 0.37
277 0.36
278 0.35
279 0.34
280 0.28
281 0.22
282 0.2
283 0.15
284 0.1
285 0.1
286 0.11
287 0.12
288 0.12
289 0.14
290 0.16
291 0.21
292 0.25
293 0.25
294 0.25
295 0.25
296 0.29
297 0.29
298 0.26
299 0.21
300 0.17
301 0.17
302 0.16
303 0.16
304 0.1
305 0.08
306 0.09
307 0.11
308 0.12
309 0.15
310 0.15
311 0.14
312 0.15
313 0.25
314 0.32
315 0.37
316 0.37
317 0.36
318 0.36
319 0.38
320 0.4
321 0.33
322 0.28
323 0.27
324 0.31
325 0.32
326 0.32
327 0.32
328 0.34
329 0.34
330 0.36
331 0.39
332 0.41
333 0.41
334 0.43
335 0.45
336 0.41
337 0.41
338 0.39
339 0.32
340 0.24
341 0.22
342 0.19
343 0.15
344 0.16
345 0.16
346 0.16
347 0.14
348 0.14
349 0.13
350 0.14
351 0.14
352 0.12
353 0.1
354 0.09
355 0.09
356 0.11
357 0.11
358 0.09
359 0.1
360 0.11
361 0.14
362 0.17
363 0.19
364 0.21
365 0.29
366 0.34
367 0.42
368 0.42
369 0.4
370 0.4
371 0.37
372 0.37
373 0.31
374 0.29
375 0.22
376 0.22
377 0.2
378 0.17
379 0.18
380 0.14
381 0.11
382 0.08
383 0.07
384 0.08
385 0.08
386 0.06
387 0.06
388 0.07
389 0.07
390 0.08
391 0.11
392 0.13
393 0.14
394 0.14
395 0.14
396 0.14
397 0.16
398 0.15
399 0.14
400 0.11
401 0.13
402 0.14
403 0.13
404 0.13
405 0.11
406 0.1
407 0.08
408 0.08
409 0.06
410 0.06
411 0.09
412 0.18
413 0.27
414 0.32
415 0.37
416 0.44
417 0.52
418 0.61
419 0.62
420 0.59
421 0.6
422 0.61
423 0.61
424 0.62
425 0.58
426 0.51
427 0.5
428 0.54
429 0.45
430 0.48
431 0.53
432 0.54
433 0.55
434 0.63
435 0.7
436 0.7
437 0.77
438 0.72
439 0.68
440 0.63
441 0.67
442 0.59
443 0.54
444 0.52
445 0.49
446 0.56
447 0.59
448 0.58
449 0.55
450 0.54
451 0.53
452 0.54
453 0.54
454 0.52
455 0.48
456 0.47
457 0.43
458 0.45
459 0.42
460 0.33
461 0.3
462 0.24
463 0.2
464 0.22
465 0.2
466 0.19
467 0.19
468 0.18
469 0.17
470 0.17
471 0.15
472 0.11
473 0.12
474 0.1
475 0.1
476 0.13
477 0.12
478 0.1
479 0.1
480 0.1
481 0.09
482 0.09
483 0.09
484 0.06
485 0.06
486 0.06
487 0.09
488 0.11
489 0.13
490 0.13
491 0.13
492 0.15
493 0.17
494 0.17
495 0.15
496 0.14
497 0.13
498 0.14
499 0.14
500 0.13
501 0.12
502 0.12
503 0.12
504 0.1
505 0.09
506 0.07
507 0.08
508 0.09
509 0.08
510 0.09
511 0.08
512 0.09
513 0.09
514 0.11
515 0.11
516 0.14
517 0.15
518 0.16
519 0.16
520 0.16
521 0.15
522 0.15
523 0.14
524 0.14
525 0.14
526 0.13
527 0.14
528 0.14
529 0.16
530 0.17
531 0.17
532 0.16
533 0.16
534 0.18
535 0.19
536 0.23
537 0.23
538 0.23
539 0.31
540 0.34
541 0.41
542 0.48
543 0.54
544 0.58
545 0.61
546 0.69
547 0.67
548 0.72
549 0.73
550 0.75
551 0.7
552 0.62
553 0.59
554 0.5
555 0.45
556 0.38
557 0.29
558 0.21
559 0.19
560 0.19
561 0.2
562 0.2
563 0.19
564 0.18
565 0.2
566 0.21
567 0.24
568 0.25
569 0.23
570 0.26
571 0.24
572 0.22
573 0.19
574 0.16
575 0.1
576 0.08
577 0.08
578 0.05
579 0.05
580 0.04
581 0.03
582 0.03
583 0.03
584 0.03
585 0.04
586 0.03
587 0.03
588 0.03
589 0.04
590 0.04
591 0.06
592 0.06
593 0.06
594 0.07
595 0.09
596 0.1
597 0.11
598 0.11
599 0.12
600 0.16
601 0.16
602 0.16
603 0.16
604 0.15
605 0.17
606 0.2
607 0.19
608 0.16
609 0.16
610 0.17
611 0.21
612 0.21
613 0.22
614 0.18
615 0.17
616 0.2
617 0.21
618 0.23
619 0.19
620 0.19
621 0.16
622 0.19
623 0.19
624 0.16
625 0.14
626 0.12
627 0.15
628 0.16
629 0.17
630 0.2
631 0.25
632 0.3
633 0.3
634 0.35
635 0.37
636 0.4
637 0.4
638 0.43
639 0.4
640 0.38
641 0.4
642 0.39
643 0.34
644 0.29
645 0.28
646 0.2
647 0.18
648 0.13
649 0.1
650 0.07
651 0.06
652 0.04
653 0.04
654 0.03
655 0.03
656 0.03
657 0.03
658 0.03
659 0.03
660 0.05
661 0.05
662 0.07
663 0.07
664 0.07
665 0.09
666 0.11
667 0.12
668 0.16
669 0.2
670 0.21
671 0.21
672 0.21
673 0.22
674 0.21
675 0.23
676 0.18
677 0.21
678 0.21
679 0.24
680 0.29
681 0.3
682 0.32
683 0.36
684 0.4
685 0.33
686 0.34
687 0.33
688 0.32
689 0.31
690 0.28
691 0.24
692 0.2
693 0.2
694 0.19
695 0.16
696 0.11
697 0.1
698 0.09
699 0.09
700 0.08
701 0.07
702 0.06
703 0.06
704 0.06
705 0.06
706 0.06
707 0.05
708 0.05
709 0.05
710 0.05
711 0.05
712 0.05
713 0.05
714 0.05
715 0.07
716 0.06
717 0.08
718 0.08
719 0.08
720 0.09
721 0.09
722 0.1
723 0.11
724 0.11
725 0.11
726 0.13
727 0.14
728 0.15
729 0.15
730 0.14
731 0.12
732 0.13
733 0.12
734 0.11
735 0.09
736 0.08
737 0.08
738 0.09
739 0.08
740 0.08
741 0.09
742 0.08
743 0.08
744 0.07
745 0.07
746 0.07
747 0.07
748 0.08
749 0.11
750 0.12
751 0.12
752 0.12
753 0.13
754 0.15
755 0.19
756 0.18
757 0.15
758 0.2
759 0.21
760 0.22
761 0.22
762 0.24
763 0.21
764 0.2
765 0.2
766 0.16
767 0.14
768 0.14
769 0.2
770 0.17
771 0.17
772 0.18
773 0.17
774 0.17
775 0.24
776 0.24
777 0.17
778 0.17
779 0.19
780 0.23
781 0.25
782 0.25
783 0.23
784 0.29
785 0.29
786 0.3
787 0.28
788 0.28
789 0.26
790 0.29
791 0.28
792 0.28
793 0.29
794 0.28
795 0.29
796 0.27
797 0.27
798 0.27
799 0.27
800 0.23
801 0.23
802 0.24
803 0.24
804 0.22
805 0.21
806 0.16
807 0.14
808 0.11
809 0.09
810 0.07
811 0.06
812 0.05
813 0.06
814 0.06
815 0.06
816 0.06
817 0.07
818 0.08
819 0.09
820 0.09
821 0.08
822 0.08
823 0.08
824 0.08
825 0.08
826 0.07
827 0.05
828 0.05
829 0.05
830 0.05
831 0.06
832 0.05
833 0.03
834 0.03
835 0.04
836 0.04
837 0.04
838 0.06
839 0.06
840 0.06
841 0.07
842 0.08
843 0.08
844 0.09
845 0.11
846 0.1
847 0.15
848 0.17
849 0.19
850 0.21
851 0.25
852 0.25
853 0.23
854 0.22
855 0.19
856 0.18
857 0.17
858 0.19
859 0.15
860 0.15
861 0.22
862 0.23
863 0.23
864 0.27
865 0.27
866 0.24
867 0.28
868 0.34
869 0.29
870 0.32
871 0.38
872 0.37
873 0.42
874 0.46
875 0.44
876 0.4
877 0.39
878 0.35
879 0.3
880 0.31
881 0.28
882 0.24
883 0.23
884 0.2
885 0.18
886 0.18
887 0.17
888 0.12
889 0.09
890 0.09
891 0.08
892 0.08
893 0.07
894 0.07
895 0.06
896 0.06
897 0.06
898 0.06
899 0.09
900 0.09
901 0.09
902 0.09
903 0.09
904 0.09
905 0.11
906 0.12
907 0.09
908 0.12
909 0.13
910 0.17
911 0.21
912 0.24
913 0.25
914 0.3
915 0.34
916 0.36
917 0.38
918 0.37
919 0.37
920 0.42
921 0.4
922 0.39
923 0.39
924 0.36
925 0.38
926 0.42
927 0.45
928 0.47
929 0.49
930 0.48
931 0.49
932 0.53
933 0.57
934 0.56
935 0.55
936 0.49
937 0.49
938 0.52
939 0.47
940 0.41
941 0.32
942 0.26
943 0.2
944 0.17
945 0.12
946 0.08
947 0.08
948 0.09
949 0.08
950 0.1
951 0.14
952 0.15
953 0.19
954 0.23
955 0.26
956 0.29
957 0.31
958 0.35
959 0.39
960 0.45
961 0.45
962 0.5
963 0.48
964 0.47
965 0.47
966 0.46
967 0.41
968 0.36
969 0.36
970 0.28
971 0.3
972 0.32
973 0.3
974 0.27
975 0.23
976 0.21
977 0.16
978 0.15
979 0.11
980 0.07
981 0.06
982 0.06
983 0.06
984 0.05
985 0.05
986 0.05
987 0.05
988 0.05
989 0.06
990 0.06
991 0.07
992 0.08
993 0.08
994 0.12
995 0.14
996 0.13
997 0.13
998 0.12
999 0.12
1000 0.13
1001 0.12
1002 0.08
1003 0.06
1004 0.06
1005 0.05
1006 0.06
1007 0.07
1008 0.06
1009 0.06
1010 0.06
1011 0.09
1012 0.1
1013 0.11
1014 0.16
1015 0.17
1016 0.25
1017 0.28
1018 0.33
1019 0.33
1020 0.33
1021 0.39
1022 0.35
1023 0.35
1024 0.35
1025 0.34
1026 0.3
1027 0.31
1028 0.3
1029 0.24
1030 0.26
1031 0.25
1032 0.24
1033 0.23
1034 0.23
1035 0.24
1036 0.24
1037 0.26
1038 0.25
1039 0.28
1040 0.26
1041 0.33
1042 0.35
1043 0.32
1044 0.32
1045 0.34
1046 0.31
1047 0.28
1048 0.27
1049 0.23
1050 0.21
1051 0.22
1052 0.21
1053 0.17
1054 0.16
1055 0.15
1056 0.12
1057 0.09
1058 0.07
1059 0.06
1060 0.08
1061 0.1
1062 0.11
1063 0.12
1064 0.12
1065 0.13
1066 0.14
1067 0.13
1068 0.13
1069 0.15
1070 0.14
1071 0.14
1072 0.17
1073 0.17
1074 0.18
1075 0.22
1076 0.24
1077 0.23
1078 0.28
1079 0.33
1080 0.34
1081 0.41
1082 0.48
1083 0.54
1084 0.55
1085 0.55
1086 0.54
1087 0.5
1088 0.48
1089 0.44
1090 0.39
1091 0.31
1092 0.29
1093 0.29
1094 0.26
1095 0.26
1096 0.3
1097 0.32
1098 0.28
1099 0.29
1100 0.28
1101 0.27
1102 0.29
1103 0.3
1104 0.27
1105 0.23
1106 0.22
1107 0.21
1108 0.2
1109 0.21
1110 0.19
1111 0.17
1112 0.17
1113 0.17
1114 0.19
1115 0.18
1116 0.18
1117 0.16
1118 0.15
1119 0.15
1120 0.14
1121 0.15
1122 0.14
1123 0.14