Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H5Q1

Protein Details
Accession C1H5Q1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
344-364DTINKLLKKQAPKRRGKISAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
326-339MARRRKNLSEKRNE
347-360NKLLKKQAPKRRGK
Subcellular Location(s) nucl 14, mito_nucl 12.833, mito 10.5, cyto_nucl 8.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029523  INO80B/Ies2  
IPR006880  INO80B_C  
Gene Ontology GO:0031011  C:Ino80 complex  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
KEGG pbl:PAAG_06246  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04795  PAPA-1  
Amino Acid Sequences MSTQRSLRSHTGLTHVSSPLSNSISRYRRTTDEAVSPPSVTVSRLPLSPPKDAHRSIRLKVKMPSSKLREVTSGAEKHHHNIFTEPVIVTGPRNSRSKKTLVEVDTDEDEEVEESMGEEDGEQSQTSDADGSDGEEIGNDSEDADADADADGDDDVDMDDVLPIPPNVKQAVSRPTVSVTAAGESRLNHADSTMNLDDDDDEELSELDSEADADGEPDETVMPEDPEEPEEIVEDEDMEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEGEVELESDSGTPITGSRSSTPDVSKLTKRQRGRMELGGDFLQLPMEPQVKKHLTAEEHAMRRAEMARRRKNLSEKRNEEEKMDTINKLLKKQAPKRRGKISAAETAAGGETTPRAQEPQEPEKPEPTMIRYVSNREGCRVGVPEELFGTPAGRIFENGSTTRSIGSGQGHRRLVEEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.36
3 0.32
4 0.29
5 0.28
6 0.26
7 0.25
8 0.23
9 0.22
10 0.31
11 0.36
12 0.4
13 0.43
14 0.43
15 0.45
16 0.51
17 0.53
18 0.49
19 0.51
20 0.51
21 0.52
22 0.49
23 0.44
24 0.37
25 0.34
26 0.29
27 0.22
28 0.2
29 0.19
30 0.2
31 0.2
32 0.24
33 0.29
34 0.33
35 0.37
36 0.39
37 0.41
38 0.47
39 0.5
40 0.53
41 0.57
42 0.59
43 0.58
44 0.64
45 0.62
46 0.6
47 0.62
48 0.65
49 0.63
50 0.63
51 0.67
52 0.65
53 0.68
54 0.66
55 0.62
56 0.55
57 0.49
58 0.48
59 0.46
60 0.42
61 0.36
62 0.38
63 0.36
64 0.37
65 0.41
66 0.37
67 0.3
68 0.28
69 0.29
70 0.26
71 0.27
72 0.23
73 0.18
74 0.17
75 0.16
76 0.15
77 0.18
78 0.21
79 0.23
80 0.3
81 0.33
82 0.38
83 0.43
84 0.48
85 0.47
86 0.48
87 0.52
88 0.47
89 0.48
90 0.44
91 0.42
92 0.38
93 0.34
94 0.28
95 0.19
96 0.17
97 0.12
98 0.1
99 0.07
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.04
106 0.05
107 0.06
108 0.07
109 0.07
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.04
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.04
148 0.04
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.07
153 0.09
154 0.1
155 0.1
156 0.12
157 0.16
158 0.23
159 0.25
160 0.25
161 0.23
162 0.24
163 0.24
164 0.23
165 0.19
166 0.13
167 0.11
168 0.11
169 0.1
170 0.1
171 0.09
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.1
179 0.17
180 0.14
181 0.13
182 0.12
183 0.12
184 0.12
185 0.12
186 0.12
187 0.06
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.04
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.03
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.03
254 0.04
255 0.03
256 0.04
257 0.03
258 0.04
259 0.03
260 0.04
261 0.06
262 0.08
263 0.09
264 0.11
265 0.14
266 0.15
267 0.18
268 0.19
269 0.2
270 0.23
271 0.26
272 0.3
273 0.36
274 0.44
275 0.5
276 0.53
277 0.58
278 0.63
279 0.65
280 0.65
281 0.62
282 0.57
283 0.5
284 0.48
285 0.4
286 0.32
287 0.24
288 0.19
289 0.13
290 0.08
291 0.08
292 0.09
293 0.13
294 0.12
295 0.13
296 0.23
297 0.24
298 0.26
299 0.28
300 0.3
301 0.28
302 0.3
303 0.37
304 0.36
305 0.37
306 0.37
307 0.35
308 0.29
309 0.29
310 0.32
311 0.31
312 0.32
313 0.4
314 0.47
315 0.53
316 0.58
317 0.63
318 0.7
319 0.73
320 0.75
321 0.75
322 0.73
323 0.74
324 0.77
325 0.71
326 0.63
327 0.57
328 0.48
329 0.45
330 0.41
331 0.34
332 0.28
333 0.33
334 0.33
335 0.32
336 0.36
337 0.35
338 0.43
339 0.53
340 0.61
341 0.66
342 0.73
343 0.79
344 0.82
345 0.84
346 0.79
347 0.78
348 0.73
349 0.71
350 0.63
351 0.55
352 0.44
353 0.37
354 0.32
355 0.22
356 0.16
357 0.08
358 0.07
359 0.07
360 0.09
361 0.08
362 0.1
363 0.11
364 0.19
365 0.26
366 0.35
367 0.42
368 0.47
369 0.49
370 0.52
371 0.53
372 0.5
373 0.45
374 0.4
375 0.4
376 0.36
377 0.4
378 0.39
379 0.43
380 0.48
381 0.52
382 0.49
383 0.45
384 0.45
385 0.39
386 0.4
387 0.36
388 0.3
389 0.28
390 0.27
391 0.26
392 0.26
393 0.25
394 0.22
395 0.19
396 0.17
397 0.11
398 0.13
399 0.14
400 0.12
401 0.13
402 0.15
403 0.18
404 0.22
405 0.24
406 0.23
407 0.24
408 0.24
409 0.23
410 0.21
411 0.19
412 0.18
413 0.23
414 0.3
415 0.35
416 0.43
417 0.45
418 0.45