FuNGI

C1GNS1

Protein Details

Accession

C1GNS1

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
49-69	LKSPPKTHSNRPSTNRLQSRA	Hydrophilic
514-533	AKSTPPRPSGTRKRKQDLID	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
562-569	RKKKRRIG

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009057 Homeobox-like_sf IPR039601 Rrn5 IPR001005 SANT/Myb
Gene Ontology	GO:0000500 C:RNA polymerase I upstream activating factor complex GO:0042790 P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I
KEGG	pbl:PAAG_00166 -
CDD	cd00167 SANT

Amino Acid Sequences

MGSSTSVYDPDEEDDSSDNDYFEHEISPTGFTASFPPLQKLNLASSPGLKSPPKTHSNRPSTNRLQSRANGLQPNRKLHTEKYAKLFNEVVNGTFDGSAEANKPVCAPSQIGVVTWSSQEKETLFNALEKKGKNGIREIASHFESKTVMEIQAYLETLHEALERQQLMERFSKNHILSDVPAAAEISEECCQALEENALALSRLDEKGENTVGRQKYGDMWLVDRHVAALVEDRLDEERDGSGNDDDDLANTLHPPPSILATAHLLNVGNWILLSERIFMNSGKSHIEDNWYNLRVDKETPSLTCEAFADFYALAISITRRLIQSAIFFSMSRIRALERGGYQRGKLVRRADVGAALDVLKMSHNSRQFWMGAARRHNLNVEDIRHRKGFKPTPLTYDEVEEELSLEAPRSRTSRSNSVAQSVAVSENNSISDAGGLSDDASSASAASTHHSSNISTSGDEEHLSDPEEVHAAALDKKYSRGEELRLLREISLSPPRSLFPEHEDYDIGMEKDAKSTPPRPSGTRKRKQDLIDWRDRVLYRSEWEEYGPDIAFVDDELSENRKKKRRIG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.18
3	0.2
4	0.2
5	0.17
6	0.14
7	0.16
8	0.16
9	0.14
10	0.14
11	0.11
12	0.12
13	0.14
14	0.15
15	0.14
16	0.14
17	0.14
18	0.13
19	0.16
20	0.19
21	0.23
22	0.23
23	0.26
24	0.26
25	0.27
26	0.29
27	0.29
28	0.3
29	0.28
30	0.29
31	0.27
32	0.3
33	0.32
34	0.31
35	0.34
36	0.31
37	0.32
38	0.36
39	0.43
40	0.49
41	0.52
42	0.61
43	0.66
44	0.73
45	0.78
46	0.78
47	0.8
48	0.79
49	0.83
50	0.8
51	0.74
52	0.7
53	0.63
54	0.66
55	0.63
56	0.61
57	0.59
58	0.56
59	0.61
60	0.61
61	0.66
62	0.61
63	0.6
64	0.56
65	0.52
66	0.57
67	0.57
68	0.56
69	0.55
70	0.59
71	0.54
72	0.54
73	0.53
74	0.43
75	0.41
76	0.35
77	0.29
78	0.24
79	0.24
80	0.21
81	0.18
82	0.16
83	0.11
84	0.11
85	0.11
86	0.1
87	0.13
88	0.13
89	0.13
90	0.14
91	0.13
92	0.14
93	0.15
94	0.15
95	0.13
96	0.18
97	0.18
98	0.17
99	0.17
100	0.17
101	0.15
102	0.15
103	0.16
104	0.12
105	0.13
106	0.14
107	0.14
108	0.16
109	0.16
110	0.18
111	0.17
112	0.2
113	0.22
114	0.25
115	0.29
116	0.27
117	0.3
118	0.34
119	0.37
120	0.35
121	0.37
122	0.39
123	0.37
124	0.4
125	0.4
126	0.37
127	0.36
128	0.35
129	0.3
130	0.25
131	0.22
132	0.19
133	0.17
134	0.14
135	0.12
136	0.11
137	0.11
138	0.11
139	0.12
140	0.12
141	0.1
142	0.08
143	0.08
144	0.08
145	0.08
146	0.07
147	0.06
148	0.08
149	0.13
150	0.13
151	0.13
152	0.17
153	0.18
154	0.21
155	0.26
156	0.26
157	0.24
158	0.27
159	0.34
160	0.31
161	0.31
162	0.29
163	0.25
164	0.24
165	0.25
166	0.22
167	0.14
168	0.14
169	0.12
170	0.1
171	0.09
172	0.08
173	0.08
174	0.08
175	0.08
176	0.07
177	0.08
178	0.08
179	0.08
180	0.08
181	0.06
182	0.05
183	0.05
184	0.06
185	0.06
186	0.05
187	0.05
188	0.05
189	0.07
190	0.07
191	0.08
192	0.09
193	0.09
194	0.12
195	0.15
196	0.14
197	0.14
198	0.21
199	0.21
200	0.21
201	0.21
202	0.18
203	0.19
204	0.21
205	0.23
206	0.16
207	0.17
208	0.18
209	0.19
210	0.19
211	0.16
212	0.13
213	0.1
214	0.09
215	0.08
216	0.09
217	0.08
218	0.08
219	0.08
220	0.08
221	0.09
222	0.09
223	0.09
224	0.07
225	0.07
226	0.07
227	0.08
228	0.09
229	0.08
230	0.07
231	0.08
232	0.08
233	0.07
234	0.07
235	0.08
236	0.07
237	0.07
238	0.07
239	0.08
240	0.08
241	0.08
242	0.08
243	0.07
244	0.08
245	0.09
246	0.09
247	0.09
248	0.1
249	0.1
250	0.1
251	0.1
252	0.09
253	0.08
254	0.09
255	0.08
256	0.06
257	0.05
258	0.05
259	0.04
260	0.05
261	0.06
262	0.06
263	0.06
264	0.06
265	0.08
266	0.08
267	0.1
268	0.1
269	0.11
270	0.11
271	0.12
272	0.12
273	0.11
274	0.16
275	0.14
276	0.17
277	0.21
278	0.21
279	0.21
280	0.21
281	0.21
282	0.18
283	0.19
284	0.18
285	0.15
286	0.16
287	0.16
288	0.17
289	0.18
290	0.16
291	0.15
292	0.13
293	0.11
294	0.1
295	0.09
296	0.08
297	0.06
298	0.06
299	0.06
300	0.05
301	0.05
302	0.04
303	0.05
304	0.06
305	0.06
306	0.07
307	0.07
308	0.08
309	0.09
310	0.1
311	0.11
312	0.11
313	0.13
314	0.12
315	0.12
316	0.13
317	0.18
318	0.18
319	0.16
320	0.14
321	0.14
322	0.15
323	0.16
324	0.18
325	0.16
326	0.2
327	0.25
328	0.26
329	0.25
330	0.28
331	0.32
332	0.31
333	0.34
334	0.32
335	0.32
336	0.33
337	0.34
338	0.3
339	0.27
340	0.25
341	0.19
342	0.16
343	0.12
344	0.1
345	0.08
346	0.07
347	0.05
348	0.06
349	0.08
350	0.12
351	0.16
352	0.18
353	0.19
354	0.22
355	0.21
356	0.22
357	0.27
358	0.27
359	0.29
360	0.32
361	0.34
362	0.32
363	0.33
364	0.34
365	0.28
366	0.29
367	0.28
368	0.27
369	0.33
370	0.35
371	0.38
372	0.39
373	0.4
374	0.38
375	0.44
376	0.48
377	0.47
378	0.54
379	0.52
380	0.55
381	0.56
382	0.55
383	0.46
384	0.41
385	0.33
386	0.24
387	0.22
388	0.16
389	0.13
390	0.1
391	0.1
392	0.07
393	0.07
394	0.08
395	0.09
396	0.12
397	0.13
398	0.16
399	0.22
400	0.28
401	0.36
402	0.38
403	0.45
404	0.44
405	0.45
406	0.43
407	0.37
408	0.31
409	0.24
410	0.21
411	0.14
412	0.14
413	0.11
414	0.11
415	0.11
416	0.11
417	0.1
418	0.08
419	0.07
420	0.07
421	0.06
422	0.06
423	0.06
424	0.05
425	0.05
426	0.05
427	0.05
428	0.05
429	0.05
430	0.05
431	0.05
432	0.05
433	0.05
434	0.08
435	0.1
436	0.1
437	0.13
438	0.14
439	0.14
440	0.15
441	0.19
442	0.17
443	0.15
444	0.15
445	0.16
446	0.16
447	0.16
448	0.16
449	0.14
450	0.13
451	0.15
452	0.14
453	0.12
454	0.12
455	0.12
456	0.1
457	0.09
458	0.09
459	0.09
460	0.12
461	0.13
462	0.15
463	0.15
464	0.18
465	0.21
466	0.22
467	0.26
468	0.27
469	0.3
470	0.36
471	0.43
472	0.44
473	0.44
474	0.43
475	0.37
476	0.35
477	0.32
478	0.28
479	0.31
480	0.29
481	0.28
482	0.28
483	0.29
484	0.31
485	0.33
486	0.31
487	0.28
488	0.34
489	0.34
490	0.34
491	0.34
492	0.31
493	0.31
494	0.3
495	0.23
496	0.17
497	0.17
498	0.15
499	0.18
500	0.19
501	0.2
502	0.24
503	0.3
504	0.37
505	0.44
506	0.48
507	0.52
508	0.62
509	0.69
510	0.74
511	0.78
512	0.8
513	0.79
514	0.82
515	0.8
516	0.79
517	0.79
518	0.77
519	0.78
520	0.7
521	0.64
522	0.63
523	0.59
524	0.51
525	0.45
526	0.39
527	0.32
528	0.35
529	0.36
530	0.31
531	0.32
532	0.31
533	0.27
534	0.26
535	0.23
536	0.17
537	0.14
538	0.13
539	0.12
540	0.1
541	0.1
542	0.07
543	0.08
544	0.11
545	0.15
546	0.22
547	0.28
548	0.38
549	0.45

C1GNS1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer