Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S7QF26

Protein Details
Accession S7QF26    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
220-265HDDRRPRSPPPPKREHDDRRPAGDDYERRRDDRPRREERDDRYDDRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-96GPAPRSKRP
202-243VPHRRERSRSPAGRRAYDHDDRRPRSPPPPKREHDDRRPAGD
246-254ERRRDDRPR
Subcellular Location(s) mito 13, cyto_nucl 7.5, cyto 7, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG gtr:GLOTRDRAFT_109943  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12339  RRM2_SRSF1_4_like  
Amino Acid Sequences MARRLYLGKLPADARTDDVSKMFEGYGRIVDCRVMTGFGFVEFENPRDAEDAVHHFNGKQFMGASIVVEFAKETRRTRGDVYEGDRRGPAPRSKRPPGIRLIVAGISRDTSWQDLKDFGREAGSVSYADIDRDYPGNGILEYLSRDDADRAVKDLDGKELRGRAVRVTYDDSRATVDNYRRDDRRDDRRGGYERSSYRDDRVPHRRERSRSPAGRRAYDHDDRRPRSPPPPKREHDDRRPAGDDYERRRDDRPRREERDDRYDDRSSRAAPVNGDAGWSRQPAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.3
3 0.29
4 0.26
5 0.26
6 0.24
7 0.21
8 0.21
9 0.18
10 0.15
11 0.15
12 0.16
13 0.19
14 0.18
15 0.19
16 0.18
17 0.19
18 0.17
19 0.18
20 0.16
21 0.13
22 0.12
23 0.13
24 0.13
25 0.12
26 0.13
27 0.11
28 0.15
29 0.14
30 0.15
31 0.16
32 0.16
33 0.16
34 0.16
35 0.17
36 0.13
37 0.15
38 0.2
39 0.21
40 0.22
41 0.22
42 0.21
43 0.24
44 0.26
45 0.23
46 0.18
47 0.14
48 0.14
49 0.15
50 0.15
51 0.13
52 0.09
53 0.1
54 0.09
55 0.08
56 0.08
57 0.07
58 0.13
59 0.17
60 0.19
61 0.25
62 0.28
63 0.31
64 0.34
65 0.38
66 0.37
67 0.38
68 0.41
69 0.43
70 0.41
71 0.39
72 0.37
73 0.33
74 0.31
75 0.32
76 0.34
77 0.34
78 0.43
79 0.51
80 0.57
81 0.65
82 0.67
83 0.67
84 0.65
85 0.62
86 0.53
87 0.45
88 0.4
89 0.33
90 0.28
91 0.23
92 0.17
93 0.12
94 0.11
95 0.1
96 0.09
97 0.09
98 0.11
99 0.11
100 0.12
101 0.15
102 0.15
103 0.17
104 0.17
105 0.15
106 0.15
107 0.14
108 0.14
109 0.11
110 0.11
111 0.08
112 0.07
113 0.08
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.06
118 0.06
119 0.07
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.08
135 0.09
136 0.09
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.12
141 0.12
142 0.16
143 0.15
144 0.16
145 0.17
146 0.18
147 0.18
148 0.19
149 0.19
150 0.15
151 0.16
152 0.16
153 0.17
154 0.21
155 0.21
156 0.22
157 0.22
158 0.21
159 0.2
160 0.2
161 0.19
162 0.19
163 0.23
164 0.25
165 0.3
166 0.35
167 0.35
168 0.38
169 0.44
170 0.46
171 0.52
172 0.54
173 0.54
174 0.53
175 0.59
176 0.61
177 0.58
178 0.54
179 0.51
180 0.45
181 0.45
182 0.47
183 0.4
184 0.38
185 0.39
186 0.39
187 0.41
188 0.49
189 0.51
190 0.55
191 0.63
192 0.68
193 0.69
194 0.74
195 0.74
196 0.75
197 0.76
198 0.76
199 0.74
200 0.72
201 0.72
202 0.66
203 0.62
204 0.6
205 0.61
206 0.59
207 0.6
208 0.65
209 0.63
210 0.64
211 0.62
212 0.59
213 0.61
214 0.65
215 0.65
216 0.65
217 0.71
218 0.72
219 0.76
220 0.82
221 0.82
222 0.82
223 0.82
224 0.78
225 0.74
226 0.73
227 0.66
228 0.59
229 0.57
230 0.55
231 0.52
232 0.57
233 0.53
234 0.52
235 0.55
236 0.62
237 0.64
238 0.66
239 0.69
240 0.69
241 0.74
242 0.81
243 0.85
244 0.83
245 0.83
246 0.8
247 0.75
248 0.71
249 0.7
250 0.62
251 0.58
252 0.54
253 0.45
254 0.44
255 0.45
256 0.42
257 0.36
258 0.37
259 0.35
260 0.3
261 0.3
262 0.25
263 0.21
264 0.22