Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HAF5

Protein Details
Accession C1HAF5    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
71-93GLCREHSPWKRRFSRLSRHSSHTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 12.5, nucl 10, cyto_mito 8, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
KEGG pbl:PAAG_07609  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MSFFKSLEKSRGFLLSRAGLFYVPSPYPRPIDLDLLLLPSSYFPRTMRLQSYLTSRTPISNLFISSLVLAGLCREHSPWKRRFSRLSRHSSHTTAIQPSQNIPEQHKVAHESNLVGQAAEPHHTKPLMPKEPGKGASIRTDHKFHTCTLTPDFAIDHASFKRAAASKLANTKHLFRLYLEILGKEEGLKSLQVVLSNPAREISLPQKKPPERYRPDAVQIHGVQRIVDLLNDENSSNQQIFRAYKDLPSPGVSYLSARTRRLLLHRFASPPRRLRIHAERYLKLLDDMAEASFYISPSLWTAAIHLTGKSYPSVKKCDLKSSLGMWRRMEYEGLVPSSSIAFNILYDIAIKARQWKVADKVIEEMKARGLELSRFGRVAHIFSFGLRGDAEGIRNTYREFIRLGEVVDTVVLNCVMVSLLRCGQQHVAEKMYERMKDMYITLKEQNPELLGSSVYPSPSDNYAAYRKATKRLGRVLGMTTFLHDKLPEHHRALQRAMPLTPDAKTFYIFLWHHANVTGDLARVIALLEDMKGTFSIPPQGMIYIFLFHGFAAHGWKADTAWTFKRLKGVWKHFLRALYHSKAELSAKRSVKSRREKFVWENPLTDKPYSSSSEPERAEQAGDERAESESHSKERASESQAHSSNPSDGNGSPKTFEETDDDWRYENSVYLGRKLIVSCLRAHAACGGPEAVLDVWVRIERLWKLELQKKEDILAVRAVLEQLVPINLRARK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.38
3 0.36
4 0.36
5 0.34
6 0.26
7 0.24
8 0.24
9 0.23
10 0.18
11 0.21
12 0.24
13 0.27
14 0.29
15 0.3
16 0.33
17 0.31
18 0.35
19 0.32
20 0.31
21 0.28
22 0.27
23 0.26
24 0.2
25 0.17
26 0.14
27 0.15
28 0.13
29 0.15
30 0.14
31 0.19
32 0.25
33 0.31
34 0.35
35 0.37
36 0.38
37 0.39
38 0.46
39 0.46
40 0.43
41 0.39
42 0.35
43 0.33
44 0.33
45 0.32
46 0.28
47 0.25
48 0.25
49 0.23
50 0.23
51 0.2
52 0.18
53 0.16
54 0.11
55 0.09
56 0.07
57 0.06
58 0.07
59 0.08
60 0.09
61 0.11
62 0.2
63 0.3
64 0.39
65 0.46
66 0.56
67 0.63
68 0.7
69 0.79
70 0.79
71 0.81
72 0.82
73 0.84
74 0.8
75 0.79
76 0.77
77 0.69
78 0.62
79 0.56
80 0.52
81 0.47
82 0.45
83 0.42
84 0.38
85 0.37
86 0.4
87 0.4
88 0.37
89 0.37
90 0.39
91 0.37
92 0.37
93 0.38
94 0.38
95 0.35
96 0.37
97 0.34
98 0.28
99 0.29
100 0.32
101 0.28
102 0.22
103 0.2
104 0.19
105 0.19
106 0.21
107 0.2
108 0.16
109 0.2
110 0.2
111 0.21
112 0.26
113 0.35
114 0.4
115 0.43
116 0.48
117 0.5
118 0.57
119 0.58
120 0.52
121 0.45
122 0.4
123 0.43
124 0.42
125 0.42
126 0.38
127 0.4
128 0.4
129 0.43
130 0.42
131 0.35
132 0.38
133 0.35
134 0.35
135 0.36
136 0.36
137 0.3
138 0.29
139 0.28
140 0.2
141 0.22
142 0.18
143 0.17
144 0.14
145 0.16
146 0.16
147 0.15
148 0.21
149 0.2
150 0.21
151 0.23
152 0.26
153 0.3
154 0.38
155 0.4
156 0.4
157 0.39
158 0.43
159 0.44
160 0.43
161 0.38
162 0.31
163 0.35
164 0.3
165 0.34
166 0.3
167 0.24
168 0.22
169 0.21
170 0.2
171 0.15
172 0.14
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.08
177 0.1
178 0.11
179 0.11
180 0.12
181 0.15
182 0.18
183 0.19
184 0.19
185 0.16
186 0.16
187 0.15
188 0.18
189 0.24
190 0.3
191 0.32
192 0.37
193 0.47
194 0.5
195 0.6
196 0.66
197 0.67
198 0.63
199 0.68
200 0.7
201 0.65
202 0.7
203 0.65
204 0.56
205 0.52
206 0.47
207 0.43
208 0.38
209 0.33
210 0.25
211 0.2
212 0.2
213 0.13
214 0.11
215 0.1
216 0.08
217 0.1
218 0.11
219 0.11
220 0.1
221 0.11
222 0.12
223 0.12
224 0.11
225 0.1
226 0.13
227 0.14
228 0.16
229 0.19
230 0.18
231 0.2
232 0.23
233 0.24
234 0.22
235 0.23
236 0.21
237 0.18
238 0.19
239 0.16
240 0.15
241 0.17
242 0.22
243 0.24
244 0.24
245 0.24
246 0.25
247 0.28
248 0.34
249 0.37
250 0.34
251 0.34
252 0.37
253 0.4
254 0.44
255 0.49
256 0.49
257 0.49
258 0.49
259 0.49
260 0.48
261 0.51
262 0.56
263 0.56
264 0.58
265 0.58
266 0.54
267 0.53
268 0.51
269 0.44
270 0.33
271 0.25
272 0.17
273 0.11
274 0.11
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.1
296 0.1
297 0.12
298 0.15
299 0.18
300 0.24
301 0.28
302 0.34
303 0.35
304 0.42
305 0.43
306 0.41
307 0.4
308 0.38
309 0.42
310 0.41
311 0.43
312 0.35
313 0.33
314 0.32
315 0.3
316 0.26
317 0.19
318 0.16
319 0.14
320 0.14
321 0.13
322 0.1
323 0.1
324 0.1
325 0.09
326 0.07
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.04
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.06
338 0.11
339 0.13
340 0.16
341 0.17
342 0.2
343 0.24
344 0.28
345 0.29
346 0.24
347 0.26
348 0.24
349 0.25
350 0.22
351 0.19
352 0.15
353 0.14
354 0.13
355 0.11
356 0.1
357 0.08
358 0.12
359 0.14
360 0.13
361 0.13
362 0.13
363 0.15
364 0.15
365 0.16
366 0.12
367 0.12
368 0.12
369 0.12
370 0.14
371 0.11
372 0.11
373 0.09
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.09
378 0.08
379 0.1
380 0.1
381 0.1
382 0.1
383 0.12
384 0.11
385 0.12
386 0.12
387 0.11
388 0.13
389 0.13
390 0.14
391 0.11
392 0.11
393 0.09
394 0.09
395 0.08
396 0.05
397 0.05
398 0.04
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.04
405 0.05
406 0.07
407 0.1
408 0.1
409 0.12
410 0.13
411 0.17
412 0.22
413 0.22
414 0.22
415 0.2
416 0.21
417 0.24
418 0.27
419 0.23
420 0.2
421 0.2
422 0.18
423 0.19
424 0.19
425 0.2
426 0.18
427 0.21
428 0.22
429 0.24
430 0.24
431 0.23
432 0.23
433 0.17
434 0.16
435 0.14
436 0.11
437 0.08
438 0.08
439 0.09
440 0.09
441 0.09
442 0.09
443 0.08
444 0.09
445 0.1
446 0.12
447 0.11
448 0.14
449 0.17
450 0.19
451 0.2
452 0.25
453 0.26
454 0.31
455 0.38
456 0.39
457 0.42
458 0.48
459 0.51
460 0.46
461 0.46
462 0.41
463 0.35
464 0.33
465 0.26
466 0.2
467 0.17
468 0.15
469 0.14
470 0.12
471 0.12
472 0.15
473 0.22
474 0.26
475 0.28
476 0.35
477 0.38
478 0.42
479 0.44
480 0.41
481 0.39
482 0.35
483 0.32
484 0.26
485 0.24
486 0.22
487 0.19
488 0.18
489 0.17
490 0.15
491 0.15
492 0.15
493 0.13
494 0.2
495 0.19
496 0.21
497 0.24
498 0.24
499 0.23
500 0.24
501 0.24
502 0.17
503 0.19
504 0.16
505 0.1
506 0.1
507 0.09
508 0.08
509 0.07
510 0.06
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.04
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.06
520 0.06
521 0.07
522 0.13
523 0.12
524 0.14
525 0.14
526 0.14
527 0.14
528 0.15
529 0.15
530 0.1
531 0.1
532 0.09
533 0.09
534 0.08
535 0.08
536 0.07
537 0.06
538 0.09
539 0.1
540 0.1
541 0.1
542 0.11
543 0.1
544 0.13
545 0.15
546 0.16
547 0.19
548 0.25
549 0.27
550 0.28
551 0.35
552 0.34
553 0.41
554 0.46
555 0.52
556 0.56
557 0.59
558 0.62
559 0.58
560 0.61
561 0.55
562 0.51
563 0.5
564 0.45
565 0.41
566 0.38
567 0.35
568 0.33
569 0.35
570 0.34
571 0.3
572 0.34
573 0.35
574 0.38
575 0.44
576 0.5
577 0.55
578 0.61
579 0.66
580 0.67
581 0.68
582 0.74
583 0.75
584 0.76
585 0.76
586 0.68
587 0.63
588 0.58
589 0.6
590 0.56
591 0.48
592 0.39
593 0.3
594 0.32
595 0.32
596 0.3
597 0.29
598 0.31
599 0.38
600 0.39
601 0.39
602 0.37
603 0.34
604 0.32
605 0.27
606 0.25
607 0.22
608 0.21
609 0.19
610 0.17
611 0.17
612 0.17
613 0.17
614 0.19
615 0.19
616 0.21
617 0.23
618 0.22
619 0.24
620 0.29
621 0.33
622 0.34
623 0.38
624 0.41
625 0.48
626 0.5
627 0.49
628 0.46
629 0.42
630 0.41
631 0.34
632 0.29
633 0.23
634 0.22
635 0.27
636 0.28
637 0.28
638 0.25
639 0.24
640 0.29
641 0.27
642 0.27
643 0.27
644 0.27
645 0.34
646 0.38
647 0.37
648 0.33
649 0.33
650 0.33
651 0.27
652 0.25
653 0.19
654 0.2
655 0.21
656 0.23
657 0.25
658 0.24
659 0.26
660 0.25
661 0.29
662 0.29
663 0.29
664 0.29
665 0.31
666 0.34
667 0.32
668 0.33
669 0.31
670 0.27
671 0.26
672 0.25
673 0.21
674 0.17
675 0.17
676 0.18
677 0.12
678 0.12
679 0.11
680 0.09
681 0.1
682 0.11
683 0.12
684 0.11
685 0.17
686 0.17
687 0.21
688 0.23
689 0.26
690 0.34
691 0.42
692 0.49
693 0.5
694 0.54
695 0.52
696 0.51
697 0.51
698 0.45
699 0.4
700 0.35
701 0.29
702 0.23
703 0.23
704 0.21
705 0.17
706 0.14
707 0.12
708 0.1
709 0.12
710 0.11
711 0.12