Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S7S5T1

Protein Details
Accession S7S5T1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
199-218EKMYPDYVYRPQRSKRKGKGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
210-218QRSKRKGKG
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG gtr:GLOTRDRAFT_98119  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09011  HMG_box_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MPAHRTRDTPARSALEVTTDAPQPPTVAIISPTPRVFSFPINNDSPSPSPSSSPFDPDVNPFATVFESASSPATSIARTLSPAESVSSDSSTPPARSYHKRQKSTQSTSSDTTSERRPKKGDEGYIKRPENAFILFRRKCCEERKELLQQLEESSEGANTKRQRQADLSKLISQQWKALPAEDRLHWEELAKEKKKEHEKMYPDYVYRPQRSKRKGKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.33
3 0.3
4 0.26
5 0.23
6 0.2
7 0.2
8 0.19
9 0.19
10 0.16
11 0.15
12 0.15
13 0.12
14 0.11
15 0.12
16 0.16
17 0.18
18 0.22
19 0.23
20 0.23
21 0.23
22 0.25
23 0.25
24 0.26
25 0.31
26 0.31
27 0.36
28 0.36
29 0.38
30 0.36
31 0.38
32 0.34
33 0.29
34 0.28
35 0.23
36 0.23
37 0.24
38 0.3
39 0.26
40 0.29
41 0.29
42 0.27
43 0.27
44 0.28
45 0.28
46 0.23
47 0.23
48 0.18
49 0.17
50 0.15
51 0.14
52 0.11
53 0.09
54 0.08
55 0.08
56 0.09
57 0.08
58 0.08
59 0.09
60 0.09
61 0.08
62 0.08
63 0.09
64 0.08
65 0.09
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.1
72 0.11
73 0.11
74 0.11
75 0.11
76 0.1
77 0.11
78 0.12
79 0.12
80 0.12
81 0.14
82 0.18
83 0.25
84 0.35
85 0.44
86 0.52
87 0.57
88 0.6
89 0.68
90 0.72
91 0.73
92 0.7
93 0.64
94 0.58
95 0.55
96 0.52
97 0.42
98 0.33
99 0.28
100 0.28
101 0.32
102 0.32
103 0.34
104 0.34
105 0.36
106 0.44
107 0.47
108 0.47
109 0.49
110 0.53
111 0.58
112 0.64
113 0.62
114 0.55
115 0.5
116 0.43
117 0.35
118 0.3
119 0.24
120 0.19
121 0.29
122 0.29
123 0.3
124 0.33
125 0.35
126 0.38
127 0.43
128 0.45
129 0.44
130 0.47
131 0.53
132 0.59
133 0.59
134 0.57
135 0.51
136 0.45
137 0.37
138 0.32
139 0.25
140 0.17
141 0.12
142 0.1
143 0.09
144 0.09
145 0.14
146 0.16
147 0.23
148 0.29
149 0.3
150 0.33
151 0.39
152 0.47
153 0.49
154 0.53
155 0.5
156 0.49
157 0.49
158 0.5
159 0.48
160 0.4
161 0.37
162 0.32
163 0.34
164 0.29
165 0.31
166 0.31
167 0.31
168 0.35
169 0.31
170 0.35
171 0.33
172 0.35
173 0.31
174 0.29
175 0.27
176 0.32
177 0.41
178 0.4
179 0.41
180 0.43
181 0.53
182 0.62
183 0.66
184 0.65
185 0.65
186 0.66
187 0.7
188 0.74
189 0.7
190 0.62
191 0.59
192 0.6
193 0.6
194 0.6
195 0.61
196 0.62
197 0.67
198 0.75