Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S7RGN1

Protein Details
Accession S7RGN1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
62-89PDCAASRRATHTKKKPDNHIPRPPNAFIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
144-145RK
151-173FRPLHTKAKGPTEKRKVREVGPK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG gtr:GLOTRDRAFT_140738  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MPAERTKKSRRHEGDGVQLTWTTPVEPSGPQAIAFAPNLTPCTFNEPPPLEDPPESTLFPAPDCAASRRATHTKKKPDNHIPRPPNAFILFRSAFIKSQHVSSDVETNHSTLSKIIGLTWQNLPHEERQVWHAKAKAALDEHKRKWPEYAFRPLHTKAKGPTEKRKVREVGPKDIKRCEKIAELLVQGKKGEELDRAIREFDQHHVPQIITRFEAPLTARAYRRSSSAPAPDTDHSKQSDFLVPSSPDCKPRALRACSTQPTRNPSPTPGYYDSDAPSPLGSDAYSEADTYYDGYQHAPSTGFTFTSSTEPSFNFAPFTWTETVAAPDPSCDPLVEAPGFENLIPFSPQPSHVLPCPAQYDQGSLTIDTSFVNSWSSVPSPVSSVPGTPHCYSATQSSPCEPTSPVDTLSPLGAYDCTSYAIPYPVHAAMPSFDNLQMQQQQYYDVPSEFSNAPQANGAPYFPHGYTQLPKEHYIPQDQKSVLMRSNMDMLAYAVPAY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.76
3 0.69
4 0.59
5 0.51
6 0.43
7 0.35
8 0.28
9 0.18
10 0.12
11 0.13
12 0.13
13 0.14
14 0.17
15 0.2
16 0.2
17 0.19
18 0.19
19 0.19
20 0.2
21 0.19
22 0.17
23 0.14
24 0.15
25 0.17
26 0.17
27 0.18
28 0.16
29 0.24
30 0.25
31 0.26
32 0.34
33 0.35
34 0.37
35 0.4
36 0.43
37 0.38
38 0.37
39 0.37
40 0.32
41 0.32
42 0.29
43 0.27
44 0.26
45 0.23
46 0.22
47 0.22
48 0.18
49 0.18
50 0.21
51 0.22
52 0.23
53 0.24
54 0.27
55 0.32
56 0.41
57 0.47
58 0.54
59 0.62
60 0.69
61 0.77
62 0.82
63 0.85
64 0.86
65 0.89
66 0.89
67 0.89
68 0.85
69 0.83
70 0.82
71 0.73
72 0.67
73 0.59
74 0.5
75 0.4
76 0.41
77 0.34
78 0.29
79 0.29
80 0.25
81 0.25
82 0.25
83 0.3
84 0.22
85 0.24
86 0.24
87 0.24
88 0.24
89 0.22
90 0.27
91 0.22
92 0.25
93 0.23
94 0.22
95 0.21
96 0.2
97 0.19
98 0.12
99 0.14
100 0.11
101 0.11
102 0.1
103 0.15
104 0.16
105 0.18
106 0.22
107 0.23
108 0.22
109 0.24
110 0.27
111 0.25
112 0.29
113 0.27
114 0.24
115 0.27
116 0.34
117 0.34
118 0.35
119 0.35
120 0.31
121 0.34
122 0.34
123 0.32
124 0.27
125 0.33
126 0.39
127 0.45
128 0.46
129 0.51
130 0.52
131 0.49
132 0.51
133 0.51
134 0.51
135 0.48
136 0.56
137 0.52
138 0.52
139 0.58
140 0.55
141 0.55
142 0.47
143 0.45
144 0.38
145 0.45
146 0.5
147 0.51
148 0.59
149 0.62
150 0.68
151 0.68
152 0.72
153 0.65
154 0.64
155 0.67
156 0.62
157 0.62
158 0.65
159 0.67
160 0.63
161 0.67
162 0.65
163 0.58
164 0.54
165 0.46
166 0.38
167 0.36
168 0.35
169 0.3
170 0.27
171 0.3
172 0.29
173 0.27
174 0.24
175 0.21
176 0.18
177 0.16
178 0.16
179 0.11
180 0.13
181 0.17
182 0.19
183 0.2
184 0.2
185 0.19
186 0.19
187 0.19
188 0.19
189 0.21
190 0.19
191 0.2
192 0.2
193 0.2
194 0.21
195 0.23
196 0.21
197 0.14
198 0.15
199 0.13
200 0.12
201 0.14
202 0.13
203 0.14
204 0.16
205 0.18
206 0.19
207 0.22
208 0.26
209 0.24
210 0.26
211 0.24
212 0.24
213 0.25
214 0.3
215 0.28
216 0.26
217 0.29
218 0.28
219 0.31
220 0.3
221 0.29
222 0.24
223 0.23
224 0.23
225 0.21
226 0.25
227 0.19
228 0.19
229 0.19
230 0.18
231 0.18
232 0.21
233 0.2
234 0.19
235 0.2
236 0.23
237 0.2
238 0.28
239 0.36
240 0.36
241 0.37
242 0.39
243 0.46
244 0.48
245 0.51
246 0.48
247 0.43
248 0.47
249 0.48
250 0.46
251 0.4
252 0.38
253 0.39
254 0.36
255 0.38
256 0.35
257 0.33
258 0.3
259 0.3
260 0.27
261 0.22
262 0.21
263 0.15
264 0.11
265 0.09
266 0.08
267 0.07
268 0.06
269 0.05
270 0.06
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.08
278 0.07
279 0.06
280 0.07
281 0.08
282 0.08
283 0.09
284 0.09
285 0.08
286 0.08
287 0.1
288 0.1
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.12
294 0.13
295 0.12
296 0.13
297 0.13
298 0.15
299 0.15
300 0.14
301 0.13
302 0.12
303 0.14
304 0.13
305 0.17
306 0.16
307 0.15
308 0.16
309 0.15
310 0.17
311 0.15
312 0.16
313 0.12
314 0.11
315 0.12
316 0.12
317 0.12
318 0.1
319 0.1
320 0.09
321 0.13
322 0.12
323 0.11
324 0.11
325 0.11
326 0.12
327 0.1
328 0.1
329 0.07
330 0.08
331 0.09
332 0.08
333 0.1
334 0.11
335 0.12
336 0.16
337 0.18
338 0.19
339 0.2
340 0.25
341 0.24
342 0.25
343 0.28
344 0.25
345 0.25
346 0.23
347 0.23
348 0.19
349 0.22
350 0.19
351 0.15
352 0.15
353 0.13
354 0.13
355 0.11
356 0.11
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.11
363 0.12
364 0.12
365 0.12
366 0.12
367 0.14
368 0.14
369 0.17
370 0.15
371 0.15
372 0.17
373 0.21
374 0.26
375 0.24
376 0.25
377 0.24
378 0.24
379 0.25
380 0.27
381 0.29
382 0.27
383 0.28
384 0.3
385 0.32
386 0.31
387 0.31
388 0.27
389 0.23
390 0.24
391 0.24
392 0.22
393 0.2
394 0.2
395 0.19
396 0.19
397 0.16
398 0.11
399 0.1
400 0.09
401 0.09
402 0.09
403 0.09
404 0.1
405 0.1
406 0.11
407 0.12
408 0.15
409 0.14
410 0.13
411 0.17
412 0.16
413 0.16
414 0.16
415 0.15
416 0.13
417 0.16
418 0.16
419 0.14
420 0.13
421 0.15
422 0.15
423 0.2
424 0.25
425 0.24
426 0.25
427 0.23
428 0.26
429 0.25
430 0.28
431 0.24
432 0.19
433 0.19
434 0.17
435 0.21
436 0.19
437 0.19
438 0.24
439 0.22
440 0.22
441 0.22
442 0.22
443 0.21
444 0.22
445 0.21
446 0.15
447 0.17
448 0.2
449 0.18
450 0.2
451 0.18
452 0.22
453 0.27
454 0.31
455 0.36
456 0.36
457 0.38
458 0.4
459 0.46
460 0.46
461 0.5
462 0.52
463 0.48
464 0.53
465 0.51
466 0.52
467 0.5
468 0.51
469 0.44
470 0.42
471 0.4
472 0.34
473 0.39
474 0.34
475 0.28
476 0.24
477 0.21
478 0.17