Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GWF8

Protein Details
Accession C1GWF8    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-21EASRGPPRVKNKAPAPQQISHydrophilic
52-71EYQGRKRKEFEDYVRRNRISHydrophilic
615-641IAKIERQMPSKVKKRRKLDDDRYEEYLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
626-630VKKRR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, mito_nucl 10.333, cyto 7.5, cyto_mito 5.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG pbl:PAAG_02853  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
PF13428  TPR_14  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MEASRGPPRVKNKAPAPQQISAEQLLREAVDRQEPALQAPTQRFADLEELHEYQGRKRKEFEDYVRRNRISMNNWMRYAQWELEQKEFRRARSVFERALDVDPTAVVLWIRYIEAEMKTRNINHARNLLDRAVTILPRVDKLWYKYVYMEEMLGNIPGTRQVFERWMSWEPDEGAWSAYIKLEKRYNEFDRVRAIFERFTVVHPEPKNWIKWARFEEEYGTNDMVREVYGLAIETLGEDFMDEKLFIAYARYEAKLKEFERARAIYKYALDRLPRAKSVALHKAYTTFEKQFGDREGVEDVILSKRRVQYEEQIKESPKNYDIWFDFVRLEESSGDVERVRDVYERAIAQMPPSQEKRHWRRYIYLWIFYALWEELEAKDMERARQIYQECLKLIPHKKFTFAKIWLMKAQFEIRQMDLQAARKTLGHAIGACPKDKLFKGYIDLERQLFEFVRCRKLFEKQIEWSPSNCQAWIKFAELERGLDDIDRARAIYELGISQPVLDMPELLWKSYIDFEEYEGEYDRTRALYERLLEKTNHVKVWINFARFEINVPEGEEEEEDEEEKPVSEEAKRRARMVFERAHKIFKEKEMKEERVALLNAWKSFEQTHGSPDDIAKIERQMPSKVKKRRKLDDDRYEEYLDYMFPADDESSAKLSQILQMAHKWKKEQASKASKET
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.81
3 0.79
4 0.74
5 0.7
6 0.63
7 0.58
8 0.51
9 0.44
10 0.34
11 0.28
12 0.22
13 0.19
14 0.18
15 0.17
16 0.17
17 0.2
18 0.2
19 0.21
20 0.25
21 0.25
22 0.26
23 0.28
24 0.28
25 0.27
26 0.3
27 0.34
28 0.31
29 0.31
30 0.28
31 0.26
32 0.3
33 0.26
34 0.26
35 0.26
36 0.25
37 0.26
38 0.3
39 0.28
40 0.29
41 0.36
42 0.39
43 0.37
44 0.41
45 0.45
46 0.5
47 0.59
48 0.62
49 0.65
50 0.69
51 0.76
52 0.81
53 0.77
54 0.68
55 0.65
56 0.63
57 0.57
58 0.57
59 0.57
60 0.55
61 0.56
62 0.56
63 0.5
64 0.45
65 0.45
66 0.36
67 0.32
68 0.33
69 0.34
70 0.42
71 0.48
72 0.46
73 0.52
74 0.53
75 0.48
76 0.5
77 0.48
78 0.47
79 0.49
80 0.55
81 0.49
82 0.47
83 0.49
84 0.42
85 0.44
86 0.37
87 0.28
88 0.21
89 0.16
90 0.15
91 0.11
92 0.09
93 0.07
94 0.06
95 0.06
96 0.07
97 0.07
98 0.06
99 0.07
100 0.1
101 0.13
102 0.18
103 0.19
104 0.21
105 0.25
106 0.26
107 0.34
108 0.38
109 0.4
110 0.41
111 0.46
112 0.47
113 0.47
114 0.5
115 0.43
116 0.35
117 0.31
118 0.28
119 0.24
120 0.21
121 0.18
122 0.17
123 0.17
124 0.18
125 0.18
126 0.19
127 0.22
128 0.26
129 0.33
130 0.31
131 0.32
132 0.33
133 0.34
134 0.33
135 0.28
136 0.25
137 0.17
138 0.16
139 0.15
140 0.13
141 0.11
142 0.08
143 0.08
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.11
148 0.13
149 0.17
150 0.19
151 0.2
152 0.21
153 0.24
154 0.26
155 0.26
156 0.26
157 0.24
158 0.23
159 0.22
160 0.18
161 0.15
162 0.12
163 0.12
164 0.1
165 0.1
166 0.13
167 0.13
168 0.19
169 0.23
170 0.26
171 0.31
172 0.38
173 0.41
174 0.48
175 0.48
176 0.45
177 0.48
178 0.46
179 0.44
180 0.38
181 0.36
182 0.27
183 0.26
184 0.27
185 0.2
186 0.2
187 0.24
188 0.22
189 0.28
190 0.28
191 0.29
192 0.31
193 0.35
194 0.35
195 0.34
196 0.4
197 0.35
198 0.41
199 0.44
200 0.43
201 0.4
202 0.39
203 0.38
204 0.35
205 0.34
206 0.3
207 0.26
208 0.2
209 0.19
210 0.18
211 0.14
212 0.1
213 0.08
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.03
225 0.03
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.06
236 0.07
237 0.1
238 0.1
239 0.12
240 0.12
241 0.15
242 0.21
243 0.21
244 0.27
245 0.27
246 0.29
247 0.33
248 0.35
249 0.35
250 0.3
251 0.31
252 0.26
253 0.26
254 0.26
255 0.24
256 0.25
257 0.23
258 0.25
259 0.29
260 0.3
261 0.28
262 0.27
263 0.25
264 0.25
265 0.31
266 0.36
267 0.33
268 0.31
269 0.3
270 0.31
271 0.31
272 0.31
273 0.28
274 0.2
275 0.21
276 0.21
277 0.22
278 0.21
279 0.21
280 0.21
281 0.17
282 0.16
283 0.14
284 0.13
285 0.13
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.12
290 0.12
291 0.14
292 0.18
293 0.19
294 0.22
295 0.23
296 0.28
297 0.37
298 0.41
299 0.41
300 0.41
301 0.41
302 0.42
303 0.4
304 0.34
305 0.25
306 0.23
307 0.2
308 0.21
309 0.21
310 0.22
311 0.21
312 0.2
313 0.19
314 0.17
315 0.18
316 0.13
317 0.13
318 0.08
319 0.09
320 0.08
321 0.08
322 0.09
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.08
330 0.08
331 0.1
332 0.1
333 0.11
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.14
338 0.14
339 0.16
340 0.19
341 0.19
342 0.22
343 0.32
344 0.39
345 0.47
346 0.52
347 0.5
348 0.53
349 0.56
350 0.63
351 0.56
352 0.51
353 0.41
354 0.37
355 0.34
356 0.29
357 0.25
358 0.14
359 0.1
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.08
364 0.08
365 0.06
366 0.1
367 0.11
368 0.11
369 0.14
370 0.15
371 0.14
372 0.2
373 0.2
374 0.23
375 0.26
376 0.28
377 0.25
378 0.24
379 0.25
380 0.28
381 0.34
382 0.34
383 0.39
384 0.37
385 0.42
386 0.44
387 0.47
388 0.46
389 0.42
390 0.44
391 0.4
392 0.41
393 0.4
394 0.38
395 0.35
396 0.3
397 0.3
398 0.24
399 0.23
400 0.22
401 0.19
402 0.2
403 0.19
404 0.2
405 0.2
406 0.22
407 0.21
408 0.2
409 0.19
410 0.18
411 0.19
412 0.19
413 0.17
414 0.13
415 0.12
416 0.14
417 0.2
418 0.21
419 0.2
420 0.18
421 0.18
422 0.21
423 0.21
424 0.22
425 0.18
426 0.19
427 0.22
428 0.29
429 0.33
430 0.33
431 0.34
432 0.31
433 0.29
434 0.27
435 0.25
436 0.19
437 0.16
438 0.19
439 0.2
440 0.29
441 0.28
442 0.32
443 0.33
444 0.4
445 0.47
446 0.46
447 0.5
448 0.45
449 0.53
450 0.55
451 0.54
452 0.48
453 0.44
454 0.43
455 0.37
456 0.34
457 0.28
458 0.22
459 0.25
460 0.26
461 0.23
462 0.2
463 0.2
464 0.24
465 0.23
466 0.23
467 0.2
468 0.19
469 0.16
470 0.14
471 0.14
472 0.09
473 0.1
474 0.09
475 0.09
476 0.08
477 0.08
478 0.09
479 0.08
480 0.08
481 0.07
482 0.07
483 0.08
484 0.08
485 0.07
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.06
490 0.06
491 0.05
492 0.13
493 0.14
494 0.14
495 0.14
496 0.13
497 0.15
498 0.18
499 0.18
500 0.13
501 0.13
502 0.14
503 0.17
504 0.18
505 0.18
506 0.17
507 0.17
508 0.15
509 0.15
510 0.14
511 0.11
512 0.11
513 0.12
514 0.12
515 0.16
516 0.19
517 0.25
518 0.27
519 0.3
520 0.3
521 0.33
522 0.4
523 0.4
524 0.37
525 0.33
526 0.36
527 0.34
528 0.44
529 0.45
530 0.39
531 0.35
532 0.35
533 0.36
534 0.3
535 0.31
536 0.23
537 0.19
538 0.18
539 0.18
540 0.18
541 0.15
542 0.16
543 0.14
544 0.12
545 0.12
546 0.11
547 0.11
548 0.11
549 0.11
550 0.1
551 0.1
552 0.1
553 0.09
554 0.11
555 0.15
556 0.21
557 0.29
558 0.39
559 0.41
560 0.43
561 0.45
562 0.5
563 0.52
564 0.53
565 0.54
566 0.52
567 0.59
568 0.59
569 0.62
570 0.56
571 0.55
572 0.52
573 0.52
574 0.55
575 0.47
576 0.55
577 0.58
578 0.62
579 0.6
580 0.61
581 0.53
582 0.48
583 0.47
584 0.38
585 0.36
586 0.36
587 0.33
588 0.3
589 0.28
590 0.24
591 0.24
592 0.27
593 0.25
594 0.22
595 0.26
596 0.26
597 0.27
598 0.26
599 0.26
600 0.28
601 0.24
602 0.24
603 0.21
604 0.22
605 0.27
606 0.3
607 0.32
608 0.35
609 0.42
610 0.51
611 0.59
612 0.65
613 0.71
614 0.76
615 0.83
616 0.86
617 0.88
618 0.9
619 0.91
620 0.91
621 0.89
622 0.85
623 0.79
624 0.71
625 0.6
626 0.49
627 0.39
628 0.28
629 0.21
630 0.16
631 0.11
632 0.09
633 0.11
634 0.1
635 0.1
636 0.12
637 0.13
638 0.16
639 0.16
640 0.16
641 0.16
642 0.16
643 0.19
644 0.22
645 0.22
646 0.23
647 0.3
648 0.39
649 0.44
650 0.48
651 0.48
652 0.49
653 0.57
654 0.62
655 0.64
656 0.66
657 0.7