Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S7PXT2

Protein Details
Accession S7PXT2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
166-185RGRGRGRGRGGRRNERPVKSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-27PRGIRRGSSRRGGPG
162-182RGGGRGRGRGRGRGGRRNERP
Subcellular Location(s) mito 20, cyto_nucl 4, nucl 3.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG gtr:GLOTRDRAFT_112251  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13865  FoP_duplication  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MDKSLDDIIASRPRGIRRGSSRRGGPGGRAQILGNGPVSPSARARYAGAVPVAGAPPADKIIVSNLPLDVNEAQIKELFHQTVGPCREVTLHYDAAGRSKGVAAVHFTRKGDATKAYQQYNNRLIDGKRPMRIEIVVDPAKPVPATLASRVAPAGVVDSVPRGGGRGRGRGRGRGGRRNERPVKSAADLDAEMEDYTSTAAAETAAAAPAAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.4
3 0.44
4 0.47
5 0.57
6 0.61
7 0.64
8 0.66
9 0.67
10 0.7
11 0.62
12 0.57
13 0.55
14 0.55
15 0.48
16 0.44
17 0.37
18 0.35
19 0.34
20 0.3
21 0.22
22 0.15
23 0.13
24 0.15
25 0.16
26 0.13
27 0.15
28 0.16
29 0.17
30 0.18
31 0.19
32 0.2
33 0.2
34 0.21
35 0.19
36 0.16
37 0.15
38 0.15
39 0.14
40 0.1
41 0.09
42 0.06
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.06
47 0.06
48 0.09
49 0.11
50 0.12
51 0.12
52 0.12
53 0.12
54 0.12
55 0.14
56 0.11
57 0.11
58 0.12
59 0.11
60 0.11
61 0.12
62 0.13
63 0.12
64 0.14
65 0.12
66 0.1
67 0.13
68 0.13
69 0.19
70 0.21
71 0.2
72 0.18
73 0.18
74 0.19
75 0.17
76 0.2
77 0.17
78 0.16
79 0.15
80 0.17
81 0.16
82 0.17
83 0.17
84 0.13
85 0.09
86 0.08
87 0.09
88 0.08
89 0.08
90 0.1
91 0.13
92 0.16
93 0.18
94 0.18
95 0.17
96 0.18
97 0.18
98 0.17
99 0.16
100 0.17
101 0.23
102 0.27
103 0.29
104 0.31
105 0.33
106 0.38
107 0.42
108 0.39
109 0.32
110 0.31
111 0.29
112 0.33
113 0.39
114 0.36
115 0.34
116 0.34
117 0.34
118 0.33
119 0.33
120 0.28
121 0.21
122 0.24
123 0.22
124 0.2
125 0.21
126 0.19
127 0.19
128 0.17
129 0.14
130 0.08
131 0.11
132 0.13
133 0.14
134 0.18
135 0.17
136 0.18
137 0.18
138 0.17
139 0.13
140 0.11
141 0.1
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.07
151 0.14
152 0.18
153 0.27
154 0.31
155 0.4
156 0.43
157 0.49
158 0.56
159 0.58
160 0.63
161 0.62
162 0.69
163 0.71
164 0.76
165 0.8
166 0.82
167 0.77
168 0.72
169 0.66
170 0.62
171 0.54
172 0.49
173 0.39
174 0.34
175 0.29
176 0.26
177 0.23
178 0.18
179 0.15
180 0.12
181 0.11
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.05
186 0.04
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.07