Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HDA4

Protein Details
Accession C1HDA4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
327-355LTTLTGHMRFKQRRRSRRDSGRKIAKSISHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
336-352FKQRRRSRRDSGRKIAK
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 7.5, cyto_nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
KEGG pbl:PAAG_08745  -  
CDD cd00024  CD_CSD  
Amino Acid Sequences MAAVTMDKIQFYQPPNPMSAAKPRSPNLPAISTPPKPPARRPNPTADSFTSLLCPSQQLRHPLPPRLFPSVTPPISSRPAGRRSQPPATPVNDFDRILEGISSDDGSQPLGGDGRNADEHATIPSGSNLSGFASDRLGMPVEEADTAAESATEAGLRACRLGGSRDGLIVDGWTEIGHSGEPTSESAAGQTSRPLLPAREAPTDHGDDLDGMADGGRASLTPREVSETPPPLTMDEVSASAGAPHDAVSPHPGSRRQISAGHARATQEEWRVKKILDSRIRVRKGKPILEYHVAWRSTWQPRSDLIPGCEELVKEFHAEWKDERPSLTTLTGHMRFKQRRRSRRDSGRKIAKSIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.38
3 0.4
4 0.4
5 0.39
6 0.44
7 0.43
8 0.43
9 0.47
10 0.47
11 0.51
12 0.52
13 0.55
14 0.49
15 0.47
16 0.43
17 0.43
18 0.49
19 0.45
20 0.46
21 0.49
22 0.52
23 0.52
24 0.6
25 0.64
26 0.66
27 0.73
28 0.75
29 0.76
30 0.75
31 0.75
32 0.71
33 0.64
34 0.59
35 0.5
36 0.44
37 0.36
38 0.3
39 0.25
40 0.2
41 0.19
42 0.16
43 0.22
44 0.26
45 0.31
46 0.36
47 0.46
48 0.51
49 0.57
50 0.59
51 0.59
52 0.59
53 0.59
54 0.55
55 0.45
56 0.48
57 0.48
58 0.45
59 0.4
60 0.37
61 0.34
62 0.37
63 0.38
64 0.35
65 0.34
66 0.4
67 0.42
68 0.47
69 0.51
70 0.54
71 0.61
72 0.58
73 0.54
74 0.53
75 0.52
76 0.48
77 0.43
78 0.41
79 0.37
80 0.34
81 0.3
82 0.27
83 0.24
84 0.21
85 0.18
86 0.12
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.1
107 0.1
108 0.11
109 0.08
110 0.08
111 0.09
112 0.09
113 0.08
114 0.08
115 0.07
116 0.06
117 0.07
118 0.08
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.09
124 0.09
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.06
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.04
135 0.04
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.04
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.06
148 0.08
149 0.09
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.1
156 0.08
157 0.06
158 0.04
159 0.04
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.06
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.09
179 0.08
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.11
184 0.16
185 0.19
186 0.21
187 0.21
188 0.22
189 0.25
190 0.26
191 0.24
192 0.19
193 0.15
194 0.12
195 0.12
196 0.09
197 0.06
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.04
206 0.06
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.13
211 0.14
212 0.18
213 0.24
214 0.27
215 0.27
216 0.27
217 0.28
218 0.23
219 0.24
220 0.2
221 0.14
222 0.11
223 0.1
224 0.09
225 0.09
226 0.08
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.11
236 0.12
237 0.14
238 0.18
239 0.21
240 0.24
241 0.27
242 0.3
243 0.29
244 0.3
245 0.33
246 0.39
247 0.39
248 0.38
249 0.36
250 0.34
251 0.32
252 0.32
253 0.32
254 0.29
255 0.32
256 0.32
257 0.34
258 0.35
259 0.34
260 0.36
261 0.4
262 0.43
263 0.45
264 0.5
265 0.55
266 0.64
267 0.71
268 0.71
269 0.66
270 0.66
271 0.66
272 0.65
273 0.62
274 0.59
275 0.58
276 0.58
277 0.57
278 0.53
279 0.52
280 0.45
281 0.39
282 0.35
283 0.36
284 0.4
285 0.44
286 0.41
287 0.36
288 0.37
289 0.43
290 0.47
291 0.45
292 0.38
293 0.37
294 0.35
295 0.34
296 0.34
297 0.28
298 0.23
299 0.19
300 0.18
301 0.15
302 0.15
303 0.19
304 0.21
305 0.23
306 0.24
307 0.31
308 0.36
309 0.36
310 0.37
311 0.35
312 0.34
313 0.35
314 0.35
315 0.27
316 0.25
317 0.32
318 0.36
319 0.36
320 0.4
321 0.47
322 0.53
323 0.61
324 0.69
325 0.71
326 0.76
327 0.83
328 0.87
329 0.87
330 0.89
331 0.92
332 0.91
333 0.92
334 0.92
335 0.88