Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S7QCD2

Protein Details
Accession S7QCD2    Localization Confidence High Confidence Score 16.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-56AEEPRAKKSRKEGKDKKQKKNDKGRTRDSDGQFRVBasic
325-351ASKMEKENERTEKRKRKEENAGTSESKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-46KKRKKSLAAGLDAEEPRAKKSRKEGKDKKQKKNDKGR
334-359RTEKRKRKEENAGTSESKHAKKKKKA
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
KEGG gtr:GLOTRDRAFT_137433  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MSLLADTQAKKRKKSLAAGLDAEEPRAKKSRKEGKDKKQKKNDKGRTRDSDGQFRVVRASMVVSIPPVFASDPRAGVEEMLDSMVMRYVPALQGVVLVHSNLQFLDRKASIKADCPYAVCPIDFDATVWSPSVGMKLLGRVNLCSPDHVSLLVHRTFNVSIPRHHIPTDHWEFEYGPAENDPEFGPHAVREDGDDAMNEGDNAKGEDTHEIEGGGRWVHKVTGDRLGGPDRQLEFTVIGLTVANNMLSLIGSIQPDPFSPEHIPANASSAQAATEDADVAAEDVDLEDEAGTDDGEDSDEDDDPFAKLGKMGDAAAQRQAEEAQASKMEKENERTEKRKRKEENAGTSESKHAKKKKKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.71
3 0.71
4 0.72
5 0.7
6 0.64
7 0.62
8 0.54
9 0.47
10 0.4
11 0.31
12 0.29
13 0.35
14 0.35
15 0.34
16 0.45
17 0.54
18 0.6
19 0.71
20 0.77
21 0.79
22 0.89
23 0.93
24 0.93
25 0.94
26 0.94
27 0.94
28 0.94
29 0.94
30 0.94
31 0.93
32 0.92
33 0.9
34 0.88
35 0.86
36 0.81
37 0.8
38 0.72
39 0.69
40 0.61
41 0.52
42 0.46
43 0.37
44 0.31
45 0.21
46 0.2
47 0.14
48 0.13
49 0.13
50 0.12
51 0.12
52 0.12
53 0.11
54 0.1
55 0.09
56 0.09
57 0.14
58 0.14
59 0.15
60 0.15
61 0.17
62 0.16
63 0.16
64 0.15
65 0.11
66 0.1
67 0.09
68 0.08
69 0.06
70 0.06
71 0.07
72 0.06
73 0.05
74 0.05
75 0.06
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.06
80 0.08
81 0.08
82 0.09
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.09
88 0.07
89 0.09
90 0.1
91 0.1
92 0.16
93 0.16
94 0.17
95 0.18
96 0.23
97 0.22
98 0.25
99 0.27
100 0.25
101 0.25
102 0.25
103 0.25
104 0.25
105 0.24
106 0.18
107 0.17
108 0.15
109 0.15
110 0.13
111 0.12
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.09
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.1
124 0.11
125 0.13
126 0.13
127 0.14
128 0.15
129 0.19
130 0.19
131 0.16
132 0.17
133 0.16
134 0.16
135 0.15
136 0.14
137 0.11
138 0.16
139 0.17
140 0.15
141 0.14
142 0.15
143 0.15
144 0.18
145 0.23
146 0.2
147 0.2
148 0.26
149 0.28
150 0.27
151 0.27
152 0.25
153 0.21
154 0.28
155 0.32
156 0.28
157 0.26
158 0.25
159 0.25
160 0.26
161 0.26
162 0.17
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.09
167 0.1
168 0.08
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.06
186 0.05
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.07
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.08
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.09
207 0.11
208 0.13
209 0.2
210 0.2
211 0.2
212 0.22
213 0.25
214 0.24
215 0.22
216 0.24
217 0.18
218 0.19
219 0.19
220 0.18
221 0.15
222 0.14
223 0.14
224 0.09
225 0.08
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.05
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.06
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.13
244 0.12
245 0.15
246 0.16
247 0.19
248 0.2
249 0.2
250 0.21
251 0.17
252 0.21
253 0.18
254 0.17
255 0.14
256 0.12
257 0.12
258 0.11
259 0.11
260 0.08
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.04
269 0.03
270 0.03
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.04
279 0.04
280 0.05
281 0.05
282 0.06
283 0.05
284 0.06
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.08
294 0.08
295 0.09
296 0.11
297 0.12
298 0.12
299 0.16
300 0.19
301 0.2
302 0.24
303 0.24
304 0.22
305 0.21
306 0.21
307 0.18
308 0.16
309 0.16
310 0.13
311 0.17
312 0.18
313 0.19
314 0.23
315 0.28
316 0.31
317 0.37
318 0.44
319 0.5
320 0.58
321 0.65
322 0.71
323 0.76
324 0.8
325 0.83
326 0.83
327 0.83
328 0.85
329 0.87
330 0.87
331 0.83
332 0.81
333 0.73
334 0.67
335 0.65
336 0.61
337 0.57
338 0.56
339 0.59