Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S7QHR4

Protein Details
Accession S7QHR4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
194-225EDRSRSPSRSRSRSRSRSRSRSKSTSRTPSRSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
197-237SRSPSRSRSRSRSRSRSRSKSTSRTPSRSPSSRSRSRSRTP
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 15, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG gtr:GLOTRDRAFT_15980  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MANTTVRGAQAIHGQNPQYLVETVIRNRIYESPYWKEQCFALTAETLIDKAIDLKCIGGVYGNQKPTAFLCLLLKLLQIQPEKEILIEYLQADEFKYLRALAAMYIRMTFRSVEVYEILEPLLKDYRKLRYRTNTGYTLTYMDEFVDNLLREERVCDIILPRLAKRSVLEETGEIGPRKSRLLDAMEGKSDVGEDRSRSPSRSRSRSRSRSRSRSKSTSRTPSRSPSSRSRSRSRTPSDAGERYISRSPSRSPSAAGSREASPQRPIRSRSRSESPYRSRSRSVSPDRMNTEISNRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.31
3 0.33
4 0.31
5 0.25
6 0.21
7 0.2
8 0.2
9 0.23
10 0.24
11 0.31
12 0.31
13 0.28
14 0.3
15 0.32
16 0.31
17 0.32
18 0.37
19 0.36
20 0.45
21 0.49
22 0.46
23 0.43
24 0.4
25 0.37
26 0.32
27 0.26
28 0.19
29 0.16
30 0.15
31 0.15
32 0.14
33 0.12
34 0.1
35 0.09
36 0.06
37 0.1
38 0.1
39 0.11
40 0.11
41 0.11
42 0.12
43 0.12
44 0.12
45 0.09
46 0.11
47 0.15
48 0.22
49 0.23
50 0.23
51 0.23
52 0.24
53 0.24
54 0.25
55 0.19
56 0.15
57 0.15
58 0.15
59 0.16
60 0.16
61 0.15
62 0.13
63 0.14
64 0.19
65 0.19
66 0.18
67 0.19
68 0.2
69 0.2
70 0.18
71 0.17
72 0.11
73 0.1
74 0.1
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.08
80 0.09
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.09
90 0.1
91 0.09
92 0.1
93 0.1
94 0.11
95 0.11
96 0.1
97 0.08
98 0.11
99 0.11
100 0.11
101 0.12
102 0.13
103 0.12
104 0.12
105 0.11
106 0.09
107 0.08
108 0.09
109 0.13
110 0.12
111 0.13
112 0.17
113 0.26
114 0.32
115 0.35
116 0.41
117 0.45
118 0.52
119 0.57
120 0.59
121 0.53
122 0.48
123 0.46
124 0.39
125 0.32
126 0.25
127 0.19
128 0.14
129 0.1
130 0.08
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.11
146 0.14
147 0.14
148 0.14
149 0.16
150 0.16
151 0.16
152 0.16
153 0.17
154 0.16
155 0.16
156 0.17
157 0.13
158 0.16
159 0.17
160 0.18
161 0.15
162 0.13
163 0.14
164 0.14
165 0.14
166 0.12
167 0.12
168 0.12
169 0.16
170 0.2
171 0.23
172 0.24
173 0.24
174 0.24
175 0.23
176 0.19
177 0.16
178 0.12
179 0.1
180 0.1
181 0.11
182 0.14
183 0.21
184 0.23
185 0.25
186 0.3
187 0.37
188 0.44
189 0.53
190 0.58
191 0.61
192 0.71
193 0.8
194 0.85
195 0.87
196 0.88
197 0.89
198 0.91
199 0.91
200 0.89
201 0.89
202 0.87
203 0.86
204 0.85
205 0.85
206 0.83
207 0.79
208 0.76
209 0.74
210 0.74
211 0.71
212 0.67
213 0.67
214 0.67
215 0.7
216 0.72
217 0.72
218 0.72
219 0.74
220 0.78
221 0.75
222 0.73
223 0.68
224 0.7
225 0.69
226 0.64
227 0.58
228 0.52
229 0.46
230 0.43
231 0.43
232 0.38
233 0.32
234 0.32
235 0.34
236 0.37
237 0.41
238 0.38
239 0.36
240 0.39
241 0.45
242 0.44
243 0.43
244 0.38
245 0.34
246 0.4
247 0.42
248 0.38
249 0.37
250 0.4
251 0.46
252 0.51
253 0.55
254 0.58
255 0.64
256 0.68
257 0.69
258 0.72
259 0.71
260 0.73
261 0.78
262 0.77
263 0.78
264 0.79
265 0.77
266 0.73
267 0.7
268 0.7
269 0.7
270 0.7
271 0.7
272 0.7
273 0.73
274 0.72
275 0.7
276 0.64
277 0.56