Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

X0CQP1

Protein Details
Accession X0CQP1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
51-71SSNPSRTSTPKPQPQPQPASVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
Amino Acid Sequences MDPNEQPSWAGGDAPDKEKMEQIRARRLAKLGTSTPVSAKSDENKAPDSESSNPSRTSTPKPQPQPQPASVESRLKINVTLAVPSASSSPNPFDKLGVKAEPSSSTGTSSVNRKRLASEIDDVAPADRPSPKPSTTQPESDESYADRTLSQIFRITVDPHNMVNSSGQRLTFLPNLNEELNESGEPLKLSVNTLDQALMEAASSYPHDKPLMNYFLPCWKRAVKASLQFKGTEGPKFEVHEEAKRLCMSGCLFALTMPDLYGRSPNPKHDTLMPYLLKGVQDENGLCFNFIQEAIKRFDDDEAFPALFNDAMVQISSKLGTISMDQDYKPYIQAMLTYTRFPSLIVNLAKHPTFTMAQSAAGIEKHTLLGPFFRISPLQNEVIKSYFPGARGLDKGRIANSQDALRMVLRTHQDDLFAITNAFIRAGQETRSRTLDWFAYIMNSNHKRRALQVDPREVASNGFMINVTTILDRFCEPFMDMDFSKVNKIDDNYFRKQPRINISDETKLNADQAYADSFYANKIPGETNFISEAFFLTLAAHHYGSEACNSQLKNLDRDIKYLEKRVKIMEADRIKFVNNPVQLQQYDKAVQRHVDALEKSIAVKLSIEGVLLDERMQSTSLRFMRIVAVWLLRLVTRSEYKPGQESKEIQLPLPAEKSDVFSCLPEYTLQNIVDNFKFIFRWLPKILPSAVGDEMIALCVTFLRSTEYIKNPYLKSSLVSLLFSATWPLMHLKRGVLGDQLVGSQFANDHLLKGLMKFYIECESTGADSAFYDKFNIRYEIFQVIKCVWVNDHYKRQLTRESRVNKQFFVQFVNMLLNDATYVLDEALTKFPKIRAIEKELEDPSIPQEDRQKKEEEMQQLANQATSFMQLANETLEMMKLFTEAMSEAFTMPEIVSRLASMLNYNLETLAGKKAAAELSVSNRDKYHFRPIQIISDIVDIYLNLGNSPVFIDAVAADGRSYKPEVLERVSRILISKHQKDPADVARWDKLRVKFVDAKTLLDQAELDLGDIPAEFEDPIMGDLMKDPVLLPSKHIVDRSTIVQHLLSDPKDPFTRQAMTIDDAIPQTELKERIEQWREERVQAAKDKLKSDVMDTTEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.31
3 0.29
4 0.29
5 0.34
6 0.37
7 0.39
8 0.42
9 0.46
10 0.52
11 0.58
12 0.6
13 0.6
14 0.59
15 0.55
16 0.54
17 0.53
18 0.46
19 0.43
20 0.43
21 0.4
22 0.39
23 0.39
24 0.37
25 0.32
26 0.33
27 0.33
28 0.39
29 0.42
30 0.43
31 0.42
32 0.4
33 0.41
34 0.39
35 0.39
36 0.36
37 0.38
38 0.4
39 0.4
40 0.41
41 0.4
42 0.42
43 0.42
44 0.45
45 0.5
46 0.54
47 0.6
48 0.67
49 0.75
50 0.8
51 0.85
52 0.85
53 0.8
54 0.77
55 0.7
56 0.68
57 0.65
58 0.62
59 0.52
60 0.49
61 0.45
62 0.38
63 0.37
64 0.3
65 0.3
66 0.23
67 0.24
68 0.2
69 0.19
70 0.18
71 0.17
72 0.18
73 0.14
74 0.14
75 0.15
76 0.19
77 0.23
78 0.26
79 0.26
80 0.27
81 0.29
82 0.32
83 0.34
84 0.33
85 0.31
86 0.3
87 0.31
88 0.3
89 0.29
90 0.29
91 0.24
92 0.23
93 0.22
94 0.23
95 0.25
96 0.32
97 0.38
98 0.41
99 0.43
100 0.42
101 0.43
102 0.46
103 0.47
104 0.43
105 0.39
106 0.35
107 0.34
108 0.34
109 0.31
110 0.27
111 0.24
112 0.19
113 0.17
114 0.19
115 0.21
116 0.25
117 0.31
118 0.32
119 0.34
120 0.42
121 0.49
122 0.48
123 0.52
124 0.5
125 0.5
126 0.52
127 0.48
128 0.42
129 0.34
130 0.33
131 0.27
132 0.24
133 0.18
134 0.15
135 0.19
136 0.19
137 0.19
138 0.19
139 0.19
140 0.21
141 0.23
142 0.26
143 0.25
144 0.29
145 0.3
146 0.26
147 0.28
148 0.26
149 0.25
150 0.26
151 0.24
152 0.24
153 0.24
154 0.23
155 0.22
156 0.23
157 0.27
158 0.27
159 0.28
160 0.25
161 0.26
162 0.29
163 0.28
164 0.27
165 0.24
166 0.2
167 0.18
168 0.16
169 0.15
170 0.12
171 0.13
172 0.13
173 0.12
174 0.12
175 0.1
176 0.12
177 0.13
178 0.14
179 0.14
180 0.14
181 0.14
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.09
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.08
191 0.1
192 0.1
193 0.13
194 0.15
195 0.15
196 0.18
197 0.26
198 0.31
199 0.29
200 0.29
201 0.29
202 0.37
203 0.38
204 0.36
205 0.32
206 0.29
207 0.32
208 0.36
209 0.41
210 0.39
211 0.46
212 0.54
213 0.55
214 0.54
215 0.5
216 0.46
217 0.46
218 0.41
219 0.36
220 0.31
221 0.29
222 0.29
223 0.31
224 0.31
225 0.31
226 0.31
227 0.33
228 0.34
229 0.32
230 0.33
231 0.31
232 0.3
233 0.23
234 0.24
235 0.2
236 0.18
237 0.18
238 0.16
239 0.15
240 0.15
241 0.16
242 0.13
243 0.11
244 0.08
245 0.09
246 0.08
247 0.09
248 0.12
249 0.13
250 0.21
251 0.24
252 0.31
253 0.37
254 0.38
255 0.4
256 0.44
257 0.46
258 0.42
259 0.48
260 0.4
261 0.34
262 0.33
263 0.32
264 0.26
265 0.22
266 0.19
267 0.12
268 0.14
269 0.14
270 0.15
271 0.16
272 0.16
273 0.15
274 0.14
275 0.12
276 0.11
277 0.11
278 0.12
279 0.12
280 0.15
281 0.19
282 0.2
283 0.2
284 0.2
285 0.22
286 0.21
287 0.2
288 0.18
289 0.18
290 0.17
291 0.16
292 0.16
293 0.14
294 0.11
295 0.1
296 0.08
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.07
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.07
309 0.09
310 0.12
311 0.14
312 0.14
313 0.15
314 0.16
315 0.16
316 0.16
317 0.13
318 0.11
319 0.09
320 0.11
321 0.12
322 0.17
323 0.17
324 0.18
325 0.18
326 0.18
327 0.18
328 0.17
329 0.16
330 0.11
331 0.17
332 0.18
333 0.19
334 0.2
335 0.23
336 0.23
337 0.21
338 0.2
339 0.15
340 0.15
341 0.14
342 0.15
343 0.13
344 0.13
345 0.13
346 0.13
347 0.12
348 0.11
349 0.11
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.08
354 0.08
355 0.07
356 0.09
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.11
361 0.11
362 0.12
363 0.15
364 0.18
365 0.2
366 0.21
367 0.21
368 0.22
369 0.22
370 0.21
371 0.18
372 0.17
373 0.14
374 0.13
375 0.16
376 0.15
377 0.17
378 0.2
379 0.22
380 0.23
381 0.24
382 0.24
383 0.22
384 0.24
385 0.24
386 0.24
387 0.23
388 0.2
389 0.19
390 0.18
391 0.18
392 0.15
393 0.14
394 0.11
395 0.14
396 0.15
397 0.16
398 0.18
399 0.17
400 0.17
401 0.17
402 0.19
403 0.16
404 0.14
405 0.12
406 0.1
407 0.1
408 0.1
409 0.1
410 0.07
411 0.06
412 0.07
413 0.08
414 0.11
415 0.15
416 0.17
417 0.2
418 0.22
419 0.22
420 0.21
421 0.23
422 0.21
423 0.17
424 0.15
425 0.13
426 0.12
427 0.13
428 0.13
429 0.2
430 0.26
431 0.28
432 0.31
433 0.33
434 0.32
435 0.34
436 0.41
437 0.4
438 0.42
439 0.47
440 0.5
441 0.5
442 0.5
443 0.47
444 0.39
445 0.32
446 0.23
447 0.17
448 0.09
449 0.08
450 0.07
451 0.06
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.05
458 0.06
459 0.06
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.08
464 0.08
465 0.1
466 0.12
467 0.12
468 0.13
469 0.14
470 0.14
471 0.15
472 0.15
473 0.14
474 0.12
475 0.14
476 0.17
477 0.24
478 0.31
479 0.33
480 0.4
481 0.41
482 0.42
483 0.43
484 0.44
485 0.44
486 0.41
487 0.4
488 0.37
489 0.39
490 0.42
491 0.39
492 0.35
493 0.27
494 0.23
495 0.21
496 0.16
497 0.13
498 0.07
499 0.08
500 0.08
501 0.07
502 0.07
503 0.07
504 0.07
505 0.07
506 0.08
507 0.08
508 0.06
509 0.07
510 0.08
511 0.08
512 0.15
513 0.14
514 0.15
515 0.15
516 0.15
517 0.14
518 0.14
519 0.14
520 0.07
521 0.07
522 0.05
523 0.04
524 0.05
525 0.06
526 0.07
527 0.06
528 0.06
529 0.07
530 0.07
531 0.07
532 0.08
533 0.07
534 0.07
535 0.1
536 0.1
537 0.11
538 0.17
539 0.18
540 0.19
541 0.22
542 0.29
543 0.26
544 0.28
545 0.3
546 0.3
547 0.31
548 0.35
549 0.37
550 0.31
551 0.32
552 0.32
553 0.31
554 0.26
555 0.26
556 0.28
557 0.29
558 0.28
559 0.29
560 0.28
561 0.26
562 0.25
563 0.26
564 0.23
565 0.18
566 0.18
567 0.19
568 0.21
569 0.21
570 0.22
571 0.21
572 0.18
573 0.2
574 0.21
575 0.22
576 0.2
577 0.21
578 0.19
579 0.21
580 0.19
581 0.2
582 0.17
583 0.17
584 0.17
585 0.16
586 0.15
587 0.14
588 0.13
589 0.08
590 0.08
591 0.07
592 0.07
593 0.07
594 0.07
595 0.05
596 0.06
597 0.06
598 0.06
599 0.06
600 0.05
601 0.05
602 0.05
603 0.06
604 0.06
605 0.06
606 0.13
607 0.14
608 0.16
609 0.15
610 0.16
611 0.17
612 0.17
613 0.18
614 0.12
615 0.11
616 0.1
617 0.1
618 0.09
619 0.08
620 0.08
621 0.08
622 0.09
623 0.12
624 0.13
625 0.17
626 0.18
627 0.19
628 0.24
629 0.27
630 0.28
631 0.29
632 0.31
633 0.3
634 0.34
635 0.34
636 0.28
637 0.27
638 0.25
639 0.23
640 0.21
641 0.18
642 0.13
643 0.13
644 0.16
645 0.13
646 0.14
647 0.13
648 0.12
649 0.13
650 0.12
651 0.12
652 0.1
653 0.11
654 0.12
655 0.15
656 0.15
657 0.15
658 0.16
659 0.18
660 0.17
661 0.17
662 0.15
663 0.11
664 0.11
665 0.1
666 0.17
667 0.15
668 0.21
669 0.22
670 0.24
671 0.25
672 0.28
673 0.28
674 0.24
675 0.23
676 0.2
677 0.18
678 0.16
679 0.14
680 0.11
681 0.11
682 0.08
683 0.07
684 0.04
685 0.03
686 0.03
687 0.04
688 0.04
689 0.04
690 0.07
691 0.08
692 0.12
693 0.18
694 0.22
695 0.26
696 0.29
697 0.34
698 0.31
699 0.33
700 0.32
701 0.26
702 0.23
703 0.21
704 0.22
705 0.17
706 0.17
707 0.15
708 0.14
709 0.14
710 0.12
711 0.11
712 0.07
713 0.06
714 0.07
715 0.1
716 0.1
717 0.12
718 0.14
719 0.13
720 0.17
721 0.18
722 0.17
723 0.15
724 0.14
725 0.13
726 0.12
727 0.12
728 0.08
729 0.08
730 0.07
731 0.06
732 0.06
733 0.06
734 0.09
735 0.09
736 0.09
737 0.09
738 0.11
739 0.11
740 0.11
741 0.12
742 0.09
743 0.09
744 0.09
745 0.1
746 0.14
747 0.14
748 0.14
749 0.13
750 0.14
751 0.14
752 0.15
753 0.13
754 0.08
755 0.08
756 0.1
757 0.1
758 0.09
759 0.11
760 0.11
761 0.13
762 0.16
763 0.19
764 0.17
765 0.18
766 0.2
767 0.25
768 0.26
769 0.24
770 0.23
771 0.21
772 0.23
773 0.22
774 0.2
775 0.14
776 0.18
777 0.24
778 0.29
779 0.38
780 0.39
781 0.44
782 0.46
783 0.49
784 0.52
785 0.51
786 0.52
787 0.52
788 0.53
789 0.58
790 0.65
791 0.64
792 0.56
793 0.54
794 0.5
795 0.42
796 0.42
797 0.33
798 0.24
799 0.22
800 0.23
801 0.19
802 0.16
803 0.15
804 0.1
805 0.08
806 0.08
807 0.07
808 0.05
809 0.05
810 0.04
811 0.05
812 0.06
813 0.07
814 0.12
815 0.13
816 0.14
817 0.15
818 0.16
819 0.23
820 0.25
821 0.3
822 0.32
823 0.39
824 0.45
825 0.45
826 0.5
827 0.45
828 0.44
829 0.37
830 0.31
831 0.26
832 0.26
833 0.23
834 0.2
835 0.29
836 0.36
837 0.4
838 0.43
839 0.44
840 0.4
841 0.47
842 0.51
843 0.48
844 0.44
845 0.44
846 0.42
847 0.42
848 0.4
849 0.34
850 0.27
851 0.21
852 0.16
853 0.13
854 0.11
855 0.08
856 0.08
857 0.07
858 0.08
859 0.09
860 0.08
861 0.08
862 0.07
863 0.08
864 0.07
865 0.07
866 0.07
867 0.06
868 0.06
869 0.05
870 0.06
871 0.06
872 0.06
873 0.07
874 0.08
875 0.08
876 0.08
877 0.08
878 0.08
879 0.07
880 0.09
881 0.09
882 0.09
883 0.09
884 0.09
885 0.1
886 0.09
887 0.1
888 0.09
889 0.1
890 0.11
891 0.12
892 0.12
893 0.11
894 0.11
895 0.11
896 0.11
897 0.13
898 0.11
899 0.1
900 0.1
901 0.13
902 0.13
903 0.13
904 0.13
905 0.12
906 0.19
907 0.28
908 0.3
909 0.29
910 0.29
911 0.31
912 0.34
913 0.36
914 0.41
915 0.36
916 0.37
917 0.44
918 0.45
919 0.5
920 0.48
921 0.44
922 0.34
923 0.3
924 0.28
925 0.2
926 0.17
927 0.1
928 0.1
929 0.11
930 0.1
931 0.08
932 0.08
933 0.08
934 0.08
935 0.09
936 0.08
937 0.06
938 0.06
939 0.06
940 0.06
941 0.08
942 0.08
943 0.07
944 0.07
945 0.08
946 0.09
947 0.12
948 0.14
949 0.13
950 0.16
951 0.2
952 0.25
953 0.29
954 0.35
955 0.35
956 0.37
957 0.37
958 0.35
959 0.32
960 0.31
961 0.34
962 0.37
963 0.42
964 0.44
965 0.5
966 0.51
967 0.52
968 0.56
969 0.55
970 0.53
971 0.48
972 0.47
973 0.47
974 0.47
975 0.49
976 0.5
977 0.46
978 0.47
979 0.47
980 0.5
981 0.51
982 0.52
983 0.58
984 0.51
985 0.5
986 0.44
987 0.46
988 0.38
989 0.3
990 0.28
991 0.18
992 0.2
993 0.16
994 0.14
995 0.1
996 0.1
997 0.1
998 0.09
999 0.09
1000 0.06
1001 0.07
1002 0.06
1003 0.05
1004 0.06
1005 0.06
1006 0.07
1007 0.07
1008 0.07
1009 0.06
1010 0.08
1011 0.1
1012 0.1
1013 0.09
1014 0.09
1015 0.14
1016 0.2
1017 0.2
1018 0.22
1019 0.27
1020 0.32
1021 0.35
1022 0.37
1023 0.33
1024 0.31
1025 0.34
1026 0.36
1027 0.34
1028 0.3
1029 0.29
1030 0.27
1031 0.27
1032 0.27
1033 0.3
1034 0.26
1035 0.26
1036 0.26
1037 0.3
1038 0.33
1039 0.33
1040 0.33
1041 0.33
1042 0.37
1043 0.34
1044 0.36
1045 0.34
1046 0.34
1047 0.35
1048 0.31
1049 0.27
1050 0.23
1051 0.22
1052 0.19
1053 0.16
1054 0.14
1055 0.18
1056 0.2
1057 0.2
1058 0.26
1059 0.29
1060 0.38
1061 0.45
1062 0.49
1063 0.49
1064 0.57
1065 0.57
1066 0.53
1067 0.55
1068 0.5
1069 0.51
1070 0.52
1071 0.56
1072 0.52
1073 0.54
1074 0.54
1075 0.52
1076 0.53
1077 0.47
1078 0.44
1079 0.42