Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H8R2

Protein Details
Accession C1H8R2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
415-437ISESKAKRGRPKGAKNFRPPPPTHydrophilic
539-564ELVNGRRVANRPRKRRKGRMGDVGYLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
419-432KAKRGRPKGAKNFR
544-557RRVANRPRKRRKGR
Subcellular Location(s) mito 16, nucl 7, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011665  BRF1_TBP-bd_dom  
IPR013763  Cyclin-like_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
Gene Ontology GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
KEGG pbl:PAAG_07153  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07741  BRF1  
PF00382  TFIIB  
CDD cd20554  CYCLIN_TFIIIB90_rpt2  
Amino Acid Sequences MASIRPPTRFPRAPGVGIRTPVQRLASLRNPNPTPIPRPQKTATTYPKPPTCPNPGCPAPNIVEDDGMKVCSGCGTVVSESNIVSEITFGESASGAAIVQGTFVGADQSHGRSGGPGFQRGGGMESREITEQNGNRYIAQLSRALNVPESATKAAGQVFKLAVGLNFIQGRRTKTVAAVCLYIACRRQDGNTVMLIDFADVLMINVFKLGRAYKALLDELRLGGNVFIMNPIDPESLIYRFAKQLEFGTSMMQVASEAVRIVQRMNRDWMITGRRPAGICGAALILAARMNNFRRTVREVVYVVKVTELTIHQRLNEFKATESGELTVDQFRSVQLETAHDPPSFTQGKLKEATKRKAAATVAEMESDEDGNDENTPEPTPSPPKPRQVDADGFSIPDIPIDPTLSANKDNANDISESKAKRGRPKGAKNFRPPPPTESELASESALESEMQELLGSNLLAPTTNTTTNNATAANPPKTVSSSPDIHESEFDSDPEVKYCLLSPAEVEIKERIWVHENKDYLRTQQAKALKRALAEEEELVNGRRVANRPRKRRKGRMGDVGYLGEGNGEGGEGEGGGTRASTPAEATRRMLEKRGFSKKINYRLLEEMYEDDETGKVKRRDSDGSSRIGIGIGIGIGKDGDRERGRSRSGSVFSERSFAGGVSVSGVRGPVRERVVKGGKMGGIFTGTPHQATTVKPTSASSTSVSARTKPQQSQAQEPAHPTPPPTNPNEEILGYIPGYIPGTELDQTNGEDVEEDLEDEDMDDEEEEEDDHVDEAFAGNYYGGVSDDDYYDDGYDYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.63
3 0.58
4 0.55
5 0.54
6 0.48
7 0.44
8 0.43
9 0.38
10 0.33
11 0.32
12 0.37
13 0.43
14 0.48
15 0.51
16 0.56
17 0.55
18 0.56
19 0.6
20 0.59
21 0.56
22 0.57
23 0.63
24 0.58
25 0.64
26 0.64
27 0.64
28 0.63
29 0.67
30 0.66
31 0.65
32 0.7
33 0.72
34 0.75
35 0.72
36 0.73
37 0.71
38 0.71
39 0.69
40 0.65
41 0.65
42 0.64
43 0.62
44 0.57
45 0.54
46 0.46
47 0.43
48 0.43
49 0.34
50 0.31
51 0.28
52 0.29
53 0.25
54 0.22
55 0.18
56 0.13
57 0.13
58 0.1
59 0.11
60 0.08
61 0.08
62 0.11
63 0.12
64 0.15
65 0.17
66 0.17
67 0.16
68 0.16
69 0.16
70 0.13
71 0.11
72 0.09
73 0.08
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.08
78 0.08
79 0.09
80 0.08
81 0.08
82 0.05
83 0.05
84 0.06
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.05
92 0.05
93 0.07
94 0.09
95 0.11
96 0.12
97 0.13
98 0.13
99 0.14
100 0.15
101 0.21
102 0.22
103 0.23
104 0.24
105 0.25
106 0.25
107 0.24
108 0.26
109 0.2
110 0.19
111 0.17
112 0.17
113 0.17
114 0.17
115 0.17
116 0.17
117 0.23
118 0.23
119 0.27
120 0.31
121 0.3
122 0.29
123 0.3
124 0.3
125 0.24
126 0.24
127 0.22
128 0.19
129 0.2
130 0.22
131 0.21
132 0.21
133 0.2
134 0.19
135 0.17
136 0.19
137 0.17
138 0.16
139 0.15
140 0.16
141 0.19
142 0.2
143 0.18
144 0.18
145 0.17
146 0.16
147 0.16
148 0.15
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.15
154 0.15
155 0.19
156 0.22
157 0.27
158 0.27
159 0.29
160 0.27
161 0.29
162 0.34
163 0.34
164 0.32
165 0.28
166 0.24
167 0.25
168 0.25
169 0.24
170 0.23
171 0.19
172 0.2
173 0.2
174 0.21
175 0.25
176 0.27
177 0.26
178 0.25
179 0.25
180 0.23
181 0.23
182 0.21
183 0.14
184 0.11
185 0.08
186 0.06
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.07
196 0.08
197 0.09
198 0.12
199 0.14
200 0.15
201 0.17
202 0.2
203 0.18
204 0.19
205 0.19
206 0.17
207 0.16
208 0.14
209 0.12
210 0.09
211 0.09
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.11
223 0.11
224 0.14
225 0.15
226 0.14
227 0.16
228 0.17
229 0.17
230 0.16
231 0.17
232 0.18
233 0.19
234 0.18
235 0.17
236 0.16
237 0.15
238 0.14
239 0.12
240 0.08
241 0.06
242 0.06
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.08
249 0.1
250 0.13
251 0.16
252 0.2
253 0.21
254 0.21
255 0.22
256 0.25
257 0.3
258 0.3
259 0.31
260 0.28
261 0.29
262 0.29
263 0.29
264 0.26
265 0.2
266 0.16
267 0.13
268 0.11
269 0.09
270 0.08
271 0.08
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.08
277 0.11
278 0.14
279 0.17
280 0.18
281 0.22
282 0.27
283 0.31
284 0.3
285 0.32
286 0.3
287 0.3
288 0.32
289 0.28
290 0.23
291 0.19
292 0.16
293 0.12
294 0.13
295 0.11
296 0.13
297 0.16
298 0.16
299 0.17
300 0.2
301 0.21
302 0.23
303 0.25
304 0.21
305 0.18
306 0.2
307 0.21
308 0.19
309 0.18
310 0.15
311 0.12
312 0.12
313 0.12
314 0.11
315 0.1
316 0.09
317 0.09
318 0.08
319 0.09
320 0.09
321 0.1
322 0.09
323 0.11
324 0.13
325 0.16
326 0.19
327 0.17
328 0.17
329 0.15
330 0.21
331 0.2
332 0.18
333 0.2
334 0.19
335 0.23
336 0.26
337 0.29
338 0.31
339 0.38
340 0.43
341 0.43
342 0.45
343 0.42
344 0.43
345 0.41
346 0.34
347 0.27
348 0.27
349 0.21
350 0.18
351 0.18
352 0.13
353 0.13
354 0.11
355 0.09
356 0.05
357 0.04
358 0.04
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.07
366 0.09
367 0.15
368 0.18
369 0.27
370 0.32
371 0.4
372 0.42
373 0.44
374 0.46
375 0.45
376 0.45
377 0.39
378 0.37
379 0.28
380 0.26
381 0.23
382 0.19
383 0.14
384 0.1
385 0.08
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.08
392 0.09
393 0.1
394 0.1
395 0.12
396 0.12
397 0.13
398 0.12
399 0.12
400 0.11
401 0.11
402 0.14
403 0.16
404 0.16
405 0.18
406 0.22
407 0.24
408 0.32
409 0.38
410 0.45
411 0.51
412 0.61
413 0.69
414 0.75
415 0.81
416 0.82
417 0.84
418 0.81
419 0.77
420 0.69
421 0.63
422 0.58
423 0.52
424 0.44
425 0.37
426 0.32
427 0.27
428 0.25
429 0.2
430 0.14
431 0.11
432 0.1
433 0.08
434 0.06
435 0.05
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.05
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.06
450 0.08
451 0.1
452 0.11
453 0.13
454 0.15
455 0.16
456 0.17
457 0.15
458 0.13
459 0.17
460 0.22
461 0.22
462 0.21
463 0.21
464 0.21
465 0.22
466 0.22
467 0.2
468 0.19
469 0.2
470 0.2
471 0.26
472 0.26
473 0.25
474 0.24
475 0.22
476 0.22
477 0.19
478 0.18
479 0.14
480 0.14
481 0.14
482 0.14
483 0.13
484 0.1
485 0.1
486 0.1
487 0.11
488 0.1
489 0.1
490 0.09
491 0.12
492 0.15
493 0.14
494 0.15
495 0.13
496 0.13
497 0.16
498 0.16
499 0.14
500 0.18
501 0.21
502 0.24
503 0.28
504 0.3
505 0.29
506 0.33
507 0.33
508 0.29
509 0.34
510 0.34
511 0.3
512 0.34
513 0.4
514 0.4
515 0.44
516 0.47
517 0.4
518 0.37
519 0.38
520 0.34
521 0.29
522 0.24
523 0.21
524 0.16
525 0.15
526 0.15
527 0.14
528 0.12
529 0.11
530 0.11
531 0.13
532 0.17
533 0.26
534 0.37
535 0.46
536 0.56
537 0.67
538 0.77
539 0.83
540 0.9
541 0.91
542 0.91
543 0.91
544 0.9
545 0.85
546 0.77
547 0.69
548 0.58
549 0.47
550 0.36
551 0.27
552 0.16
553 0.1
554 0.06
555 0.04
556 0.03
557 0.03
558 0.03
559 0.03
560 0.03
561 0.03
562 0.03
563 0.03
564 0.03
565 0.04
566 0.04
567 0.05
568 0.05
569 0.05
570 0.06
571 0.12
572 0.16
573 0.18
574 0.2
575 0.23
576 0.28
577 0.3
578 0.35
579 0.33
580 0.37
581 0.45
582 0.53
583 0.53
584 0.51
585 0.6
586 0.62
587 0.68
588 0.68
589 0.61
590 0.55
591 0.56
592 0.55
593 0.46
594 0.39
595 0.3
596 0.24
597 0.23
598 0.18
599 0.14
600 0.12
601 0.12
602 0.13
603 0.2
604 0.21
605 0.24
606 0.28
607 0.33
608 0.39
609 0.45
610 0.53
611 0.48
612 0.5
613 0.48
614 0.43
615 0.39
616 0.32
617 0.25
618 0.14
619 0.1
620 0.06
621 0.05
622 0.04
623 0.04
624 0.04
625 0.04
626 0.06
627 0.07
628 0.15
629 0.17
630 0.22
631 0.27
632 0.33
633 0.36
634 0.36
635 0.4
636 0.4
637 0.41
638 0.41
639 0.42
640 0.4
641 0.38
642 0.38
643 0.33
644 0.27
645 0.24
646 0.19
647 0.14
648 0.1
649 0.1
650 0.09
651 0.1
652 0.09
653 0.09
654 0.09
655 0.09
656 0.1
657 0.12
658 0.16
659 0.21
660 0.26
661 0.28
662 0.36
663 0.43
664 0.43
665 0.43
666 0.41
667 0.38
668 0.33
669 0.32
670 0.24
671 0.19
672 0.17
673 0.16
674 0.17
675 0.16
676 0.15
677 0.15
678 0.17
679 0.17
680 0.18
681 0.25
682 0.26
683 0.26
684 0.26
685 0.28
686 0.3
687 0.3
688 0.32
689 0.25
690 0.24
691 0.25
692 0.31
693 0.32
694 0.29
695 0.34
696 0.4
697 0.46
698 0.46
699 0.53
700 0.55
701 0.58
702 0.65
703 0.67
704 0.65
705 0.6
706 0.6
707 0.56
708 0.52
709 0.48
710 0.41
711 0.39
712 0.4
713 0.44
714 0.43
715 0.46
716 0.44
717 0.46
718 0.46
719 0.4
720 0.34
721 0.29
722 0.27
723 0.19
724 0.17
725 0.14
726 0.12
727 0.13
728 0.11
729 0.1
730 0.09
731 0.11
732 0.12
733 0.13
734 0.14
735 0.15
736 0.15
737 0.16
738 0.15
739 0.12
740 0.11
741 0.11
742 0.11
743 0.09
744 0.09
745 0.08
746 0.08
747 0.08
748 0.08
749 0.08
750 0.07
751 0.07
752 0.07
753 0.07
754 0.07
755 0.07
756 0.07
757 0.07
758 0.08
759 0.08
760 0.08
761 0.07
762 0.07
763 0.07
764 0.07
765 0.07
766 0.07
767 0.06
768 0.06
769 0.06
770 0.06
771 0.07
772 0.07
773 0.07
774 0.08
775 0.09
776 0.1
777 0.11
778 0.12
779 0.12
780 0.12