Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H6T4

Protein Details
Accession C1H6T4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
69-88SNSPTSKSSWKNTSNNKTKSHydrophilic
481-508LPIVHLSKRDRRFRKSRRAKMALPRPVNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
111-115GRKSK
488-501KRDRRFRKSRRAKM
Subcellular Location(s) mito 16.5, mito_nucl 13, nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
KEGG pbl:PAAG_06475  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13041  PPR_2  
Amino Acid Sequences MLRCRNVFASGTLATRLVCDGSSIISGNLRGGLLANHITRNGADYRNISTSRFGKRSSDARQGRSRSKSNSPTSKSSWKNTSNNKTKSGGGTKDEELVAADFVRHSRAGAGRKSKPGSVWKQKITGRSTVSRKAIDIELQWAKDRLILAKRVKRMLSKGDLEKALALVRTAQSRRYDCMGAWNMLFDYEMKNDRPVAAFKLYNDMKKRGPKPNTYTYTIMFRGLANSSSKKAVKIALSIYNSLRSPRSGVKPSIHHINAALGVCARHGNMDALWEVAGSLPEHGEDAPDARTFTIILNGLQARVASEIKHLDPRSQEDGITEKKTALVREGKRIWANIMSRWKKGELLLDQNLVSAMGHLLLFGQQRRDCLDVFALLHQAMRVPLLEDLETQLEESRKKEQKKFANQDTPEMVQAQDESSTEIQGMEKRSTDNDETDHTSEGNSKQLSEEPGPVHEAPGLPAEEPEPPSEVEEFKNLFNPLPIVHLSKRDRRFRKSRRAKMALPRPVNAQLSLILAASRTIPNGVAIGRAYWEEYVSRKINPDEHSFHEYLRLLRIARSSSESFQVIRKQMLPRKVVSRKTFVIALSCCSRDRKNPHVFETASKLVGFMDTTLSQPEPEILSRYLDLIRYGISEESVKESISILAGKEDTKSADTLFKKRITDAIATLRPHVDKIISLLAYNSLSRHGNEVDEPARVKAASERVARGSWPHSLRDLPSFEESVYLLKQYKQLHDMLLKERTLSAEERTVFETENKRLKKILSRGPVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.18
3 0.18
4 0.13
5 0.11
6 0.11
7 0.1
8 0.11
9 0.12
10 0.12
11 0.12
12 0.13
13 0.14
14 0.13
15 0.14
16 0.12
17 0.11
18 0.1
19 0.1
20 0.12
21 0.17
22 0.18
23 0.18
24 0.19
25 0.2
26 0.19
27 0.22
28 0.23
29 0.2
30 0.23
31 0.24
32 0.28
33 0.34
34 0.35
35 0.33
36 0.35
37 0.4
38 0.45
39 0.47
40 0.44
41 0.42
42 0.48
43 0.55
44 0.56
45 0.6
46 0.58
47 0.63
48 0.69
49 0.72
50 0.75
51 0.74
52 0.74
53 0.7
54 0.73
55 0.75
56 0.76
57 0.78
58 0.75
59 0.74
60 0.74
61 0.77
62 0.73
63 0.71
64 0.71
65 0.69
66 0.72
67 0.76
68 0.8
69 0.8
70 0.79
71 0.77
72 0.7
73 0.64
74 0.63
75 0.61
76 0.56
77 0.49
78 0.48
79 0.44
80 0.45
81 0.41
82 0.33
83 0.26
84 0.21
85 0.17
86 0.12
87 0.11
88 0.08
89 0.09
90 0.12
91 0.11
92 0.1
93 0.14
94 0.2
95 0.27
96 0.34
97 0.43
98 0.47
99 0.55
100 0.58
101 0.56
102 0.56
103 0.59
104 0.61
105 0.63
106 0.66
107 0.63
108 0.68
109 0.69
110 0.71
111 0.65
112 0.61
113 0.56
114 0.56
115 0.58
116 0.58
117 0.59
118 0.53
119 0.49
120 0.45
121 0.41
122 0.36
123 0.3
124 0.3
125 0.29
126 0.28
127 0.29
128 0.27
129 0.25
130 0.24
131 0.24
132 0.22
133 0.23
134 0.31
135 0.38
136 0.45
137 0.5
138 0.54
139 0.56
140 0.56
141 0.56
142 0.56
143 0.54
144 0.54
145 0.54
146 0.54
147 0.51
148 0.46
149 0.41
150 0.33
151 0.27
152 0.2
153 0.15
154 0.12
155 0.13
156 0.19
157 0.2
158 0.24
159 0.29
160 0.32
161 0.35
162 0.36
163 0.35
164 0.29
165 0.37
166 0.36
167 0.31
168 0.28
169 0.26
170 0.22
171 0.21
172 0.21
173 0.12
174 0.1
175 0.12
176 0.16
177 0.16
178 0.18
179 0.18
180 0.19
181 0.21
182 0.2
183 0.21
184 0.22
185 0.23
186 0.21
187 0.3
188 0.31
189 0.36
190 0.38
191 0.38
192 0.4
193 0.48
194 0.56
195 0.57
196 0.62
197 0.65
198 0.68
199 0.74
200 0.73
201 0.69
202 0.64
203 0.55
204 0.53
205 0.45
206 0.38
207 0.28
208 0.23
209 0.2
210 0.18
211 0.18
212 0.16
213 0.18
214 0.18
215 0.23
216 0.24
217 0.23
218 0.24
219 0.25
220 0.23
221 0.24
222 0.26
223 0.27
224 0.28
225 0.29
226 0.29
227 0.28
228 0.26
229 0.25
230 0.23
231 0.17
232 0.19
233 0.23
234 0.29
235 0.31
236 0.35
237 0.39
238 0.42
239 0.44
240 0.5
241 0.44
242 0.37
243 0.32
244 0.29
245 0.27
246 0.23
247 0.19
248 0.11
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.06
263 0.05
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.04
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.06
274 0.07
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.1
282 0.09
283 0.09
284 0.11
285 0.11
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.07
293 0.09
294 0.11
295 0.12
296 0.19
297 0.19
298 0.2
299 0.22
300 0.26
301 0.29
302 0.27
303 0.26
304 0.21
305 0.25
306 0.25
307 0.25
308 0.21
309 0.16
310 0.19
311 0.2
312 0.19
313 0.2
314 0.25
315 0.26
316 0.34
317 0.35
318 0.36
319 0.36
320 0.36
321 0.33
322 0.29
323 0.28
324 0.26
325 0.34
326 0.33
327 0.33
328 0.35
329 0.34
330 0.29
331 0.3
332 0.3
333 0.23
334 0.27
335 0.27
336 0.27
337 0.26
338 0.24
339 0.23
340 0.17
341 0.13
342 0.06
343 0.04
344 0.03
345 0.03
346 0.03
347 0.03
348 0.05
349 0.07
350 0.08
351 0.12
352 0.12
353 0.14
354 0.16
355 0.17
356 0.15
357 0.15
358 0.15
359 0.12
360 0.11
361 0.11
362 0.1
363 0.09
364 0.08
365 0.07
366 0.07
367 0.06
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.06
379 0.08
380 0.09
381 0.1
382 0.11
383 0.19
384 0.25
385 0.31
386 0.37
387 0.44
388 0.52
389 0.62
390 0.69
391 0.69
392 0.72
393 0.67
394 0.64
395 0.59
396 0.5
397 0.39
398 0.31
399 0.22
400 0.13
401 0.13
402 0.09
403 0.07
404 0.06
405 0.08
406 0.07
407 0.07
408 0.07
409 0.07
410 0.08
411 0.1
412 0.12
413 0.11
414 0.12
415 0.12
416 0.13
417 0.17
418 0.18
419 0.16
420 0.15
421 0.17
422 0.2
423 0.21
424 0.2
425 0.16
426 0.15
427 0.17
428 0.16
429 0.18
430 0.14
431 0.13
432 0.14
433 0.16
434 0.19
435 0.17
436 0.2
437 0.16
438 0.17
439 0.2
440 0.19
441 0.18
442 0.15
443 0.14
444 0.11
445 0.13
446 0.12
447 0.09
448 0.09
449 0.09
450 0.11
451 0.12
452 0.11
453 0.11
454 0.1
455 0.12
456 0.13
457 0.13
458 0.12
459 0.15
460 0.15
461 0.14
462 0.17
463 0.17
464 0.16
465 0.15
466 0.15
467 0.11
468 0.13
469 0.14
470 0.14
471 0.15
472 0.24
473 0.28
474 0.36
475 0.44
476 0.52
477 0.58
478 0.62
479 0.72
480 0.74
481 0.81
482 0.84
483 0.86
484 0.86
485 0.86
486 0.85
487 0.84
488 0.84
489 0.82
490 0.74
491 0.65
492 0.58
493 0.56
494 0.5
495 0.4
496 0.3
497 0.21
498 0.19
499 0.18
500 0.14
501 0.09
502 0.07
503 0.07
504 0.08
505 0.07
506 0.07
507 0.07
508 0.07
509 0.07
510 0.08
511 0.08
512 0.08
513 0.07
514 0.07
515 0.08
516 0.08
517 0.08
518 0.07
519 0.08
520 0.08
521 0.1
522 0.16
523 0.17
524 0.18
525 0.2
526 0.23
527 0.28
528 0.31
529 0.36
530 0.34
531 0.37
532 0.42
533 0.4
534 0.38
535 0.37
536 0.34
537 0.28
538 0.27
539 0.25
540 0.19
541 0.2
542 0.23
543 0.2
544 0.2
545 0.24
546 0.24
547 0.23
548 0.25
549 0.25
550 0.23
551 0.26
552 0.3
553 0.27
554 0.27
555 0.3
556 0.35
557 0.4
558 0.47
559 0.46
560 0.44
561 0.52
562 0.58
563 0.62
564 0.59
565 0.59
566 0.54
567 0.53
568 0.51
569 0.42
570 0.39
571 0.31
572 0.3
573 0.27
574 0.27
575 0.26
576 0.28
577 0.31
578 0.34
579 0.41
580 0.47
581 0.54
582 0.58
583 0.61
584 0.64
585 0.63
586 0.57
587 0.57
588 0.49
589 0.39
590 0.33
591 0.28
592 0.2
593 0.2
594 0.16
595 0.09
596 0.1
597 0.09
598 0.1
599 0.12
600 0.12
601 0.12
602 0.12
603 0.13
604 0.12
605 0.12
606 0.15
607 0.14
608 0.16
609 0.16
610 0.18
611 0.18
612 0.17
613 0.16
614 0.13
615 0.13
616 0.11
617 0.12
618 0.11
619 0.1
620 0.11
621 0.11
622 0.15
623 0.15
624 0.15
625 0.14
626 0.14
627 0.13
628 0.14
629 0.14
630 0.09
631 0.11
632 0.12
633 0.12
634 0.12
635 0.13
636 0.14
637 0.14
638 0.15
639 0.14
640 0.21
641 0.25
642 0.31
643 0.37
644 0.4
645 0.4
646 0.4
647 0.43
648 0.39
649 0.38
650 0.36
651 0.39
652 0.39
653 0.39
654 0.4
655 0.39
656 0.36
657 0.33
658 0.3
659 0.22
660 0.16
661 0.19
662 0.23
663 0.19
664 0.19
665 0.18
666 0.19
667 0.19
668 0.19
669 0.16
670 0.14
671 0.15
672 0.16
673 0.2
674 0.18
675 0.19
676 0.2
677 0.26
678 0.24
679 0.26
680 0.27
681 0.23
682 0.24
683 0.21
684 0.21
685 0.21
686 0.26
687 0.3
688 0.33
689 0.36
690 0.37
691 0.38
692 0.38
693 0.37
694 0.33
695 0.34
696 0.33
697 0.32
698 0.32
699 0.35
700 0.37
701 0.4
702 0.39
703 0.35
704 0.36
705 0.34
706 0.3
707 0.28
708 0.25
709 0.22
710 0.2
711 0.19
712 0.17
713 0.19
714 0.25
715 0.29
716 0.34
717 0.35
718 0.36
719 0.39
720 0.42
721 0.45
722 0.46
723 0.47
724 0.42
725 0.39
726 0.38
727 0.33
728 0.32
729 0.29
730 0.26
731 0.27
732 0.28
733 0.29
734 0.31
735 0.3
736 0.29
737 0.33
738 0.36
739 0.38
740 0.46
741 0.46
742 0.46
743 0.48
744 0.53
745 0.56
746 0.58
747 0.59