Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H2U4

Protein Details
Accession C1H2U4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-52MANYLQRERSRSPRRRSRSPRRGRRSYSPRSRSRSRDDYRRNDRRSRSPVSGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-47RSRSPRRRSRSPRRGRRSYSPRSRSRSRDDYRRNDRRSR
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 6, plas 5, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pbl:PAAG_05087  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MANYLQRERSRSPRRRSRSPRRGRRSYSPRSRSRSRDDYRRNDRRSRSPVSGAAGAPGGHSASGYGGRNPSTRSYEDRSFAKEQMMQAVRESSQQDRRVYVGNLSYDVKWHHLKDFMRQAGEVLFADVLLLPNGMSKVGVNVIVEYATREQAQNAVATLSNQNLMGRLVYVREDREAEPRFTGAPARGDFGGPGRGGYGGGYGSGSGAGGSRQIYVSNLPFSVGWQDLKDLFRQAAQQGAVVRADVHVDPSGRPKGSGIVAFESADDARNAIQQFNGYDWQGRTLEVREDLLRDWAQALVVVAEVVLGAVSADAGADLEEAMVVARGGGAGDGSASVPPNPFTDFATSGGERSAIIFVRNLPWSTCNEDLVDLFSTIGKVERAEIQYEPNGRSRGTGVVEFDSVENAETAISKLYLAHHSISLLISL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.87
3 0.92
4 0.92
5 0.92
6 0.93
7 0.94
8 0.93
9 0.95
10 0.92
11 0.92
12 0.91
13 0.91
14 0.91
15 0.9
16 0.89
17 0.87
18 0.88
19 0.86
20 0.84
21 0.84
22 0.82
23 0.83
24 0.84
25 0.86
26 0.88
27 0.9
28 0.89
29 0.87
30 0.87
31 0.86
32 0.84
33 0.8
34 0.76
35 0.71
36 0.67
37 0.63
38 0.59
39 0.48
40 0.41
41 0.34
42 0.27
43 0.21
44 0.17
45 0.13
46 0.08
47 0.08
48 0.06
49 0.07
50 0.11
51 0.12
52 0.15
53 0.17
54 0.2
55 0.22
56 0.24
57 0.28
58 0.29
59 0.31
60 0.34
61 0.39
62 0.42
63 0.45
64 0.45
65 0.47
66 0.45
67 0.44
68 0.41
69 0.37
70 0.33
71 0.37
72 0.37
73 0.31
74 0.28
75 0.29
76 0.26
77 0.26
78 0.28
79 0.26
80 0.31
81 0.37
82 0.37
83 0.36
84 0.37
85 0.38
86 0.37
87 0.34
88 0.29
89 0.24
90 0.25
91 0.25
92 0.23
93 0.21
94 0.22
95 0.22
96 0.23
97 0.23
98 0.23
99 0.28
100 0.29
101 0.35
102 0.43
103 0.42
104 0.39
105 0.37
106 0.36
107 0.3
108 0.3
109 0.22
110 0.13
111 0.09
112 0.07
113 0.08
114 0.07
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.04
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.06
125 0.06
126 0.08
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.11
139 0.12
140 0.1
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.1
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.07
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.08
157 0.1
158 0.1
159 0.11
160 0.14
161 0.15
162 0.22
163 0.24
164 0.24
165 0.22
166 0.22
167 0.21
168 0.19
169 0.2
170 0.14
171 0.15
172 0.14
173 0.15
174 0.15
175 0.14
176 0.14
177 0.14
178 0.15
179 0.1
180 0.1
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.07
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.08
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.1
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.09
214 0.11
215 0.12
216 0.13
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.13
221 0.12
222 0.13
223 0.12
224 0.13
225 0.13
226 0.14
227 0.12
228 0.11
229 0.11
230 0.07
231 0.09
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.1
237 0.15
238 0.19
239 0.17
240 0.18
241 0.16
242 0.18
243 0.19
244 0.2
245 0.17
246 0.15
247 0.15
248 0.15
249 0.15
250 0.13
251 0.11
252 0.1
253 0.08
254 0.07
255 0.06
256 0.1
257 0.1
258 0.09
259 0.1
260 0.1
261 0.11
262 0.12
263 0.14
264 0.11
265 0.14
266 0.13
267 0.16
268 0.16
269 0.16
270 0.15
271 0.15
272 0.17
273 0.15
274 0.17
275 0.14
276 0.15
277 0.15
278 0.18
279 0.16
280 0.14
281 0.14
282 0.12
283 0.11
284 0.1
285 0.1
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.04
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.02
294 0.02
295 0.02
296 0.02
297 0.02
298 0.02
299 0.02
300 0.02
301 0.02
302 0.02
303 0.02
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.02
318 0.03
319 0.03
320 0.04
321 0.05
322 0.06
323 0.07
324 0.08
325 0.09
326 0.11
327 0.12
328 0.13
329 0.14
330 0.18
331 0.19
332 0.2
333 0.24
334 0.22
335 0.21
336 0.21
337 0.19
338 0.14
339 0.14
340 0.15
341 0.1
342 0.11
343 0.12
344 0.13
345 0.17
346 0.2
347 0.2
348 0.19
349 0.2
350 0.23
351 0.28
352 0.29
353 0.26
354 0.24
355 0.24
356 0.23
357 0.23
358 0.21
359 0.15
360 0.13
361 0.12
362 0.11
363 0.1
364 0.12
365 0.1
366 0.09
367 0.1
368 0.17
369 0.18
370 0.21
371 0.22
372 0.25
373 0.3
374 0.34
375 0.35
376 0.34
377 0.34
378 0.32
379 0.32
380 0.3
381 0.29
382 0.28
383 0.29
384 0.25
385 0.26
386 0.26
387 0.25
388 0.24
389 0.2
390 0.16
391 0.14
392 0.11
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.09
398 0.09
399 0.08
400 0.1
401 0.13
402 0.17
403 0.19
404 0.21
405 0.2
406 0.2
407 0.21