Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GZ84

Protein Details
Accession C1GZ84    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
139-165TSPFGGGRPGRVRRKKSKAAEKGGEDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-160GRPGRVRRKKSKAAEK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 14.333, cyto 11, mito_nucl 8.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022801  Ribosomal_S4/S9  
IPR005710  Ribosomal_S4/S9_euk/arc  
IPR001912  Ribosomal_S4/S9_N  
IPR002942  S4_RNA-bd  
IPR036986  S4_RNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0015935  C:small ribosomal subunit  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG pbl:PAAG_03828  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00163  Ribosomal_S4  
PF01479  S4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50889  S4  
CDD cd00165  S4  
Amino Acid Sequences MSDSELKIVGTYGLRNKREVWRVQLTLSKIRRAARELLTLDEKDPKRLFEGNALIRRLVRVGVLDESRMKLDYVLALTVEDFLERRLQTQVYQLGLAKSIHHARVLIKQRHIRVGKQIVNVPSFVVRLDSQKHIDFALTSPFGGGRPGRVRRKKSKAAEKGGEDEEEEDEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.35
3 0.4
4 0.46
5 0.53
6 0.54
7 0.53
8 0.52
9 0.52
10 0.54
11 0.54
12 0.5
13 0.51
14 0.5
15 0.47
16 0.43
17 0.45
18 0.46
19 0.44
20 0.46
21 0.41
22 0.44
23 0.4
24 0.4
25 0.4
26 0.37
27 0.34
28 0.37
29 0.33
30 0.33
31 0.32
32 0.29
33 0.29
34 0.31
35 0.31
36 0.28
37 0.35
38 0.36
39 0.41
40 0.41
41 0.37
42 0.34
43 0.34
44 0.27
45 0.2
46 0.13
47 0.08
48 0.09
49 0.11
50 0.12
51 0.13
52 0.13
53 0.14
54 0.14
55 0.13
56 0.12
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.07
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.05
68 0.04
69 0.04
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.1
74 0.1
75 0.11
76 0.15
77 0.17
78 0.14
79 0.15
80 0.14
81 0.13
82 0.15
83 0.14
84 0.11
85 0.11
86 0.14
87 0.14
88 0.13
89 0.14
90 0.14
91 0.23
92 0.32
93 0.34
94 0.38
95 0.43
96 0.44
97 0.52
98 0.53
99 0.47
100 0.46
101 0.5
102 0.49
103 0.47
104 0.49
105 0.44
106 0.42
107 0.4
108 0.32
109 0.24
110 0.19
111 0.16
112 0.13
113 0.11
114 0.13
115 0.17
116 0.2
117 0.23
118 0.24
119 0.25
120 0.22
121 0.22
122 0.19
123 0.17
124 0.19
125 0.16
126 0.14
127 0.14
128 0.14
129 0.14
130 0.16
131 0.15
132 0.17
133 0.25
134 0.35
135 0.45
136 0.54
137 0.64
138 0.71
139 0.81
140 0.84
141 0.86
142 0.88
143 0.88
144 0.89
145 0.87
146 0.82
147 0.77
148 0.7
149 0.6
150 0.5
151 0.41