Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GWL7

Protein Details
Accession C1GWL7    Localization Confidence High Confidence Score 24.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
79-110EDEEEARKKKRKEGRREKKIRRKQDNDDRFSGBasic
114-135AEGKRARKRREGGERRSRKVEEBasic
156-178MDEQLKKPTKRRHRRADGIDLADBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
72-132RHKRARNEDEEEARKKKRKEGRREKKIRRKQDNDDRFSGGEEAEGKRARKRREGGERRSRK
161-170KKPTKRRHRR
402-417RRMKARQAAAAKASKR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
KEGG pbl:PAAG_02912  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSASPEPATESPVVDKENEDSQNVPDVDLSDDESLLSDVDDAQFEDFDAANVSIDERPAIAIDEENLKLIGRHKRARNEDEEEARKKKRKEGRREKKIRRKQDNDDRFSGGEEAEGKRARKRREGGERRSRKVEEEVNEEELDPATRRRRALDRMMDEQLKKPTKRRHRRADGIDLADLADAEIEDVRRRMTDAARLDSIARKENRPAMHKLKMLPEVVSLLNRNQYINSLVDPEINLLEAVKFFLEPLDDGSLPAYNIQRDLFAALGRLPINKETLIASGIGKVIVFYTKSKQPEVGIKRQAERLLAEWTRPILQRSDDYSKRVYEEADFDPSQLAARNQGISVQATAAEARARELLPPRLANRARAEGGHTSYTIVPRSTMVQESKFARPLGSSGEDRFRRMKARQAAAAKASKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.22
4 0.29
5 0.29
6 0.27
7 0.25
8 0.25
9 0.33
10 0.31
11 0.28
12 0.21
13 0.21
14 0.21
15 0.2
16 0.21
17 0.14
18 0.13
19 0.13
20 0.13
21 0.12
22 0.1
23 0.09
24 0.06
25 0.06
26 0.07
27 0.08
28 0.08
29 0.08
30 0.08
31 0.08
32 0.1
33 0.09
34 0.08
35 0.1
36 0.09
37 0.09
38 0.09
39 0.11
40 0.1
41 0.1
42 0.1
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.08
48 0.08
49 0.09
50 0.14
51 0.14
52 0.14
53 0.14
54 0.12
55 0.13
56 0.2
57 0.27
58 0.31
59 0.4
60 0.47
61 0.56
62 0.66
63 0.71
64 0.73
65 0.7
66 0.69
67 0.7
68 0.71
69 0.68
70 0.66
71 0.67
72 0.67
73 0.63
74 0.65
75 0.66
76 0.69
77 0.73
78 0.77
79 0.8
80 0.84
81 0.92
82 0.94
83 0.96
84 0.96
85 0.95
86 0.95
87 0.92
88 0.92
89 0.92
90 0.91
91 0.86
92 0.8
93 0.72
94 0.61
95 0.53
96 0.43
97 0.31
98 0.22
99 0.19
100 0.16
101 0.18
102 0.22
103 0.22
104 0.28
105 0.35
106 0.39
107 0.45
108 0.5
109 0.54
110 0.62
111 0.71
112 0.75
113 0.79
114 0.83
115 0.79
116 0.8
117 0.72
118 0.63
119 0.59
120 0.55
121 0.48
122 0.45
123 0.43
124 0.38
125 0.37
126 0.34
127 0.28
128 0.22
129 0.19
130 0.13
131 0.15
132 0.18
133 0.21
134 0.22
135 0.25
136 0.32
137 0.37
138 0.45
139 0.49
140 0.49
141 0.5
142 0.54
143 0.54
144 0.49
145 0.46
146 0.46
147 0.44
148 0.41
149 0.44
150 0.5
151 0.57
152 0.67
153 0.74
154 0.76
155 0.79
156 0.87
157 0.86
158 0.85
159 0.8
160 0.71
161 0.61
162 0.49
163 0.39
164 0.3
165 0.22
166 0.12
167 0.06
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.07
177 0.09
178 0.1
179 0.16
180 0.19
181 0.21
182 0.21
183 0.22
184 0.22
185 0.23
186 0.23
187 0.23
188 0.22
189 0.2
190 0.22
191 0.27
192 0.3
193 0.32
194 0.37
195 0.37
196 0.41
197 0.42
198 0.42
199 0.41
200 0.41
201 0.37
202 0.3
203 0.24
204 0.21
205 0.19
206 0.17
207 0.14
208 0.11
209 0.13
210 0.13
211 0.13
212 0.11
213 0.12
214 0.13
215 0.13
216 0.12
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.09
223 0.08
224 0.07
225 0.05
226 0.05
227 0.04
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.06
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.09
242 0.12
243 0.11
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.09
249 0.1
250 0.08
251 0.07
252 0.08
253 0.07
254 0.09
255 0.09
256 0.1
257 0.11
258 0.11
259 0.13
260 0.12
261 0.12
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.11
266 0.1
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.07
274 0.08
275 0.09
276 0.13
277 0.19
278 0.22
279 0.23
280 0.25
281 0.26
282 0.35
283 0.4
284 0.45
285 0.47
286 0.49
287 0.5
288 0.53
289 0.51
290 0.43
291 0.37
292 0.3
293 0.3
294 0.27
295 0.25
296 0.22
297 0.22
298 0.24
299 0.25
300 0.24
301 0.19
302 0.21
303 0.24
304 0.3
305 0.37
306 0.36
307 0.39
308 0.4
309 0.39
310 0.38
311 0.35
312 0.3
313 0.23
314 0.25
315 0.24
316 0.27
317 0.26
318 0.24
319 0.23
320 0.22
321 0.2
322 0.18
323 0.16
324 0.14
325 0.16
326 0.16
327 0.16
328 0.17
329 0.18
330 0.17
331 0.17
332 0.13
333 0.11
334 0.11
335 0.11
336 0.1
337 0.1
338 0.09
339 0.1
340 0.12
341 0.12
342 0.15
343 0.21
344 0.27
345 0.31
346 0.36
347 0.36
348 0.44
349 0.46
350 0.48
351 0.48
352 0.48
353 0.44
354 0.4
355 0.43
356 0.38
357 0.4
358 0.36
359 0.3
360 0.26
361 0.27
362 0.29
363 0.27
364 0.22
365 0.19
366 0.18
367 0.22
368 0.23
369 0.26
370 0.28
371 0.28
372 0.33
373 0.37
374 0.41
375 0.42
376 0.39
377 0.34
378 0.31
379 0.3
380 0.3
381 0.31
382 0.29
383 0.29
384 0.39
385 0.4
386 0.43
387 0.46
388 0.44
389 0.47
390 0.47
391 0.53
392 0.53
393 0.58
394 0.62
395 0.64
396 0.66
397 0.66