Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

X0BIR9

Protein Details
Accession X0BIR9    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
168-189GAPHERTPKKRKLPAKKGTKAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
173-191RTPKKRKLPAKKGTKAEAR
Subcellular Location(s) mito 17, mito_nucl 12.333, cyto_mito 10.333, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029526  PGBD  
IPR019357  SCOC  
Pfam View protein in Pfam  
PF13843  DDE_Tnp_1_7  
PF10224  DUF2205  
Amino Acid Sequences MVPFTGRSKETTVIKNKPTPLGFKVWVIAQQGYFLQCLWHVKASSYKAVIVELPILKPYGKTGKLRTEIPLNNTQSVVVHLLNKPSTQTYHVFTDNLFSSPQLFRLLRQLGHGATGTARPNCGISTEMKQIKETGKAPNGIALQYNEVIQIAWKDSGIVLFLSTVLGGAPHERTPKKRKLPAKKGTKAEARRLQQVFNGDSFKMIPIPTVAAQYNDEMNHVDRGDQIRYPMYLPVLNDAQLPTTGLVGLSGRQPPSHILTPGQDTSEPLETAIEPDDTQAMSPRMTSEEVEALKCEMHTELRRLVKTIESPHAKALRDSLLLIFNRIEAVEKGNMKLDSNKKALQKYMEDLTSMHQTTTLDSHEKY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.65
3 0.66
4 0.67
5 0.64
6 0.61
7 0.56
8 0.55
9 0.49
10 0.44
11 0.42
12 0.35
13 0.36
14 0.33
15 0.31
16 0.23
17 0.22
18 0.22
19 0.22
20 0.2
21 0.16
22 0.13
23 0.13
24 0.18
25 0.19
26 0.22
27 0.22
28 0.23
29 0.31
30 0.34
31 0.38
32 0.34
33 0.33
34 0.29
35 0.29
36 0.28
37 0.22
38 0.23
39 0.19
40 0.18
41 0.17
42 0.17
43 0.16
44 0.16
45 0.2
46 0.23
47 0.27
48 0.32
49 0.38
50 0.47
51 0.51
52 0.53
53 0.51
54 0.52
55 0.51
56 0.51
57 0.54
58 0.47
59 0.45
60 0.43
61 0.39
62 0.3
63 0.27
64 0.24
65 0.16
66 0.17
67 0.17
68 0.21
69 0.22
70 0.22
71 0.21
72 0.21
73 0.21
74 0.21
75 0.23
76 0.22
77 0.25
78 0.26
79 0.25
80 0.23
81 0.25
82 0.22
83 0.2
84 0.17
85 0.13
86 0.15
87 0.15
88 0.16
89 0.18
90 0.17
91 0.17
92 0.25
93 0.28
94 0.25
95 0.26
96 0.27
97 0.22
98 0.23
99 0.22
100 0.14
101 0.12
102 0.15
103 0.17
104 0.15
105 0.15
106 0.13
107 0.14
108 0.14
109 0.14
110 0.12
111 0.11
112 0.15
113 0.23
114 0.27
115 0.27
116 0.27
117 0.29
118 0.3
119 0.32
120 0.3
121 0.29
122 0.29
123 0.3
124 0.29
125 0.31
126 0.29
127 0.25
128 0.24
129 0.18
130 0.15
131 0.14
132 0.14
133 0.1
134 0.09
135 0.08
136 0.07
137 0.07
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.04
156 0.05
157 0.07
158 0.13
159 0.15
160 0.23
161 0.31
162 0.41
163 0.48
164 0.55
165 0.63
166 0.69
167 0.78
168 0.81
169 0.83
170 0.81
171 0.77
172 0.76
173 0.75
174 0.69
175 0.67
176 0.65
177 0.57
178 0.57
179 0.54
180 0.48
181 0.41
182 0.4
183 0.32
184 0.27
185 0.26
186 0.17
187 0.17
188 0.16
189 0.14
190 0.11
191 0.1
192 0.08
193 0.06
194 0.08
195 0.08
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.11
200 0.12
201 0.13
202 0.11
203 0.11
204 0.1
205 0.11
206 0.12
207 0.11
208 0.1
209 0.11
210 0.14
211 0.15
212 0.15
213 0.15
214 0.14
215 0.15
216 0.16
217 0.14
218 0.13
219 0.13
220 0.12
221 0.14
222 0.14
223 0.13
224 0.13
225 0.12
226 0.11
227 0.1
228 0.1
229 0.07
230 0.07
231 0.06
232 0.05
233 0.06
234 0.05
235 0.06
236 0.08
237 0.11
238 0.12
239 0.12
240 0.13
241 0.15
242 0.2
243 0.23
244 0.21
245 0.2
246 0.22
247 0.26
248 0.26
249 0.26
250 0.2
251 0.18
252 0.2
253 0.21
254 0.18
255 0.14
256 0.14
257 0.12
258 0.13
259 0.13
260 0.11
261 0.08
262 0.09
263 0.1
264 0.09
265 0.09
266 0.12
267 0.12
268 0.11
269 0.11
270 0.12
271 0.13
272 0.15
273 0.15
274 0.13
275 0.18
276 0.19
277 0.19
278 0.19
279 0.17
280 0.16
281 0.16
282 0.14
283 0.1
284 0.16
285 0.19
286 0.23
287 0.29
288 0.36
289 0.37
290 0.37
291 0.37
292 0.36
293 0.37
294 0.39
295 0.42
296 0.41
297 0.41
298 0.47
299 0.51
300 0.47
301 0.43
302 0.41
303 0.35
304 0.31
305 0.3
306 0.25
307 0.26
308 0.25
309 0.26
310 0.22
311 0.18
312 0.18
313 0.17
314 0.17
315 0.11
316 0.15
317 0.19
318 0.21
319 0.22
320 0.27
321 0.27
322 0.27
323 0.35
324 0.39
325 0.41
326 0.44
327 0.49
328 0.51
329 0.55
330 0.58
331 0.56
332 0.53
333 0.51
334 0.51
335 0.46
336 0.4
337 0.36
338 0.35
339 0.36
340 0.31
341 0.26
342 0.22
343 0.21
344 0.22
345 0.25
346 0.26