Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GXD7

Protein Details
Accession C1GXD7    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-38VSVVRLKKGKKRFELACYKNKLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
279-287GGHKKGKGG
Subcellular Location(s) mito 21, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036786  Ribosome_mat_SBDS_N_sf  
IPR002140  Sdo1/SBDS  
IPR039100  Sdo1/SBDS-like  
IPR046928  SDO1/SBDS_C  
IPR018978  SDO1/SBDS_central  
IPR037188  Sdo1/SBDS_central_sf  
IPR019783  SDO1/SBDS_N  
Gene Ontology GO:0042256  P:cytosolic ribosome assembly  
KEGG pbl:PAAG_03511  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01172  SBDS  
PF20268  SBDS_C  
PF09377  SBDS_domain_II  
Amino Acid Sequences MPVGIIQPSNQIKFTNVSVVRLKKGKKRFELACYKNKLLEYRSGTETDLDNVLQIPTVFLSVSKAQTAPAAELSKAFGPKTSNDEIIQEILRKGEVQVGERERKDILERVEKEVLEIVSARLVDPVSKRVYTTGMISKALDQLSAASGQQGGGSGIVGNGARKGKTTETMTAVPPTAAAGDALIITTQESPAAEEDDKRTKKPTWTGVVTNKSAKSQALDAMKALIAWQPIPVMRARMRLRITCPTSILKQAVKSASGPGGANYGGGGGDQPMSPTKGGGHKKGKGGHAHSKAHDEGYHVEAAAPKATGTVKDRILNYFEQVEEQDVLNADEWEVIGFAEPGAFKGLSEFIGGETKGKGRVEVLDMTVTHEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.32
3 0.28
4 0.31
5 0.37
6 0.41
7 0.45
8 0.5
9 0.55
10 0.54
11 0.63
12 0.68
13 0.69
14 0.74
15 0.74
16 0.77
17 0.81
18 0.8
19 0.81
20 0.78
21 0.72
22 0.67
23 0.63
24 0.58
25 0.51
26 0.51
27 0.48
28 0.45
29 0.45
30 0.42
31 0.4
32 0.37
33 0.34
34 0.27
35 0.22
36 0.17
37 0.14
38 0.13
39 0.13
40 0.11
41 0.1
42 0.08
43 0.07
44 0.08
45 0.07
46 0.06
47 0.11
48 0.13
49 0.15
50 0.16
51 0.15
52 0.15
53 0.18
54 0.19
55 0.16
56 0.18
57 0.18
58 0.17
59 0.17
60 0.19
61 0.2
62 0.21
63 0.19
64 0.16
65 0.17
66 0.2
67 0.26
68 0.27
69 0.27
70 0.26
71 0.27
72 0.26
73 0.26
74 0.25
75 0.2
76 0.17
77 0.15
78 0.14
79 0.13
80 0.12
81 0.14
82 0.14
83 0.15
84 0.22
85 0.28
86 0.35
87 0.35
88 0.36
89 0.32
90 0.31
91 0.32
92 0.3
93 0.29
94 0.32
95 0.34
96 0.38
97 0.41
98 0.39
99 0.37
100 0.35
101 0.29
102 0.19
103 0.18
104 0.12
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.08
109 0.08
110 0.1
111 0.11
112 0.15
113 0.17
114 0.17
115 0.17
116 0.17
117 0.19
118 0.18
119 0.2
120 0.21
121 0.2
122 0.2
123 0.2
124 0.2
125 0.21
126 0.2
127 0.17
128 0.11
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.09
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.03
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.07
147 0.08
148 0.08
149 0.09
150 0.12
151 0.12
152 0.16
153 0.19
154 0.2
155 0.22
156 0.24
157 0.24
158 0.23
159 0.22
160 0.18
161 0.14
162 0.11
163 0.08
164 0.06
165 0.04
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.07
180 0.07
181 0.08
182 0.12
183 0.21
184 0.22
185 0.23
186 0.26
187 0.27
188 0.32
189 0.37
190 0.41
191 0.38
192 0.41
193 0.46
194 0.5
195 0.52
196 0.49
197 0.47
198 0.4
199 0.35
200 0.32
201 0.26
202 0.2
203 0.16
204 0.18
205 0.17
206 0.17
207 0.16
208 0.15
209 0.15
210 0.13
211 0.12
212 0.09
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.09
219 0.09
220 0.12
221 0.14
222 0.22
223 0.24
224 0.3
225 0.34
226 0.36
227 0.4
228 0.44
229 0.46
230 0.39
231 0.4
232 0.36
233 0.35
234 0.35
235 0.34
236 0.28
237 0.25
238 0.28
239 0.27
240 0.25
241 0.23
242 0.21
243 0.19
244 0.18
245 0.17
246 0.13
247 0.13
248 0.12
249 0.11
250 0.09
251 0.07
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.04
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.08
260 0.09
261 0.1
262 0.1
263 0.12
264 0.2
265 0.26
266 0.34
267 0.41
268 0.45
269 0.51
270 0.56
271 0.59
272 0.59
273 0.61
274 0.62
275 0.62
276 0.63
277 0.58
278 0.58
279 0.54
280 0.47
281 0.41
282 0.33
283 0.28
284 0.25
285 0.24
286 0.18
287 0.18
288 0.18
289 0.18
290 0.16
291 0.14
292 0.1
293 0.12
294 0.12
295 0.16
296 0.17
297 0.22
298 0.25
299 0.3
300 0.32
301 0.32
302 0.36
303 0.33
304 0.32
305 0.29
306 0.25
307 0.22
308 0.21
309 0.21
310 0.18
311 0.17
312 0.15
313 0.13
314 0.14
315 0.13
316 0.13
317 0.1
318 0.09
319 0.09
320 0.08
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.05
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.11
330 0.11
331 0.1
332 0.12
333 0.13
334 0.12
335 0.13
336 0.12
337 0.11
338 0.15
339 0.16
340 0.15
341 0.16
342 0.18
343 0.22
344 0.23
345 0.22
346 0.2
347 0.23
348 0.26
349 0.27
350 0.27
351 0.26
352 0.25